stringtranslate.com

Роджер Брент

Роджер Брент (родился 28 декабря 1955 года) — американский биолог, известный своими работами по регуляции генов и системной биологии. Он изучает количественное поведение систем клеточной сигнализации, а также происхождение и последствия их вариаций. Он является действительным членом Отделения фундаментальных наук в Центре исследований рака Фреда Хатчинсона и аффилированным профессором геномных наук в Вашингтонском университете .

Ранний период жизни

Брент вырос в Хэттисберге, штат Миссисипи , и получил степень бакалавра в области компьютерных наук и статистики в Университете Южного Миссисипи , где он применил методы искусственного интеллекта к сворачиванию белков. Он защитил докторскую диссертацию (1982) [1] и постдокторскую работу (1985) по биохимии и молекулярной биологии в Гарвардском университете в лаборатории Марка Пташне . В ходе работы он клонировал репрессор E. coli LexA и показал, как он контролирует реакцию клетки на повреждение ДНК, использовал LexA в качестве репрессора в дрожжах [2] [3] и создал слитые белки, которые использовали LexA для переноса частей дрожжевого Gal4 и других регуляторных белков транскрипции в синтетические репортерные гены в дрожжах. [4] Эти эксперименты по замене доменов установили доменную структуру эукариотических регуляторных белков транскрипции. [5] [6] [7] [8]

Карьера

Использование Брентом прокариотических репрессорных белков в эукариотах и ​​разработка химерных белков, содержащих прокариотические ДНК-связывающие домены, позволило идентифицировать другие домены регуляции транскрипции [9] и технологии регуляции генов, включая контролируемую тетрациклиновым репрессором транскрипционную репрессию [10] и системы Gal4 и LexA UAS, используемые в других модельных организмах. [11] Использование ДНК-связывающих доменов для нацеливания привязанных функциональных белковых доменов (например, двухцепочечных эндонуклеаз [12] и ДНК-метилаз [13] ) или фрагментов-приманок в двухгибридных экспериментах на определенных участках ДНК в настоящее время является рутинной процедурой.

В 1985 году Брент перешел на кафедру молекулярной биологии в Массачусетской больнице общего профиля и на кафедру генетики в Гарвардской медицинской школе . Его работа там способствовала разработке двухгибридных методов и разработке крупномасштабных/универсальных функциональных геномных средств (взаимосвязывание [14] и разработка пептидных аптамеров ) для обнаружения и нарушения белок-белковых взаимодействий. [15] В 1997 году вместе с Сидни Бреннером он помог основать Институт молекулярных наук, [16] некоммерческую исследовательскую лабораторию в Беркли, Калифорния , и стал ее генеральным директором, [17] директором по исследованиям и президентом в 2001 году. Там он инициировал исследования своей лаборатории по контролю клеточных сигналов и межклеточной изменчивости. Сейчас он является профессором фундаментальных наук в Онкологическом центре Фреда Хатчинсона и аффилированным профессором геномных наук и биоинженерии в Вашингтонском университете .

Работа Брента посвящена двум основным вопросам: как системы клеточной сигнализации контролируют свои сигналы и информацию, которую они передают [18] [19] , а также происхождение и фенотипические последствия межклеточных различий в передаче сигналов и последующих реакциях. [20]

В 1987 году Брент помог основать и продолжает вносить вклад в Current Protocols in Molecular Biology , «руководство по клонированию» [21], которое положило начало журналам Current Protocols . С 1995 по 2000 год он организовал семинары «После генома» в Санта-Фе, содержание которых внесло вклад в некоторые ранние повестки дня системной биологии. [22] В дополнение к обычной консультативной работе с NIH, NSF и промышленными организациями, в 1997 году он начал консультировать правительство США по тактическим и стратегическим соображениям защиты от биологического нападения и новых заболеваний. [23] [24] [25] [26] В 1998 году в Институте молекулярных наук он участвовал в дискуссиях с Робом Карлсоном и Дрю Энди, которые помогли разработать некоторые идеи, лежащие в основе синтетической биологии . [27] С 2011 по 2014 год он руководил Центром биологического будущего, экспериментальной попыткой лучше понять влияние достижений в области биологических знаний и возможностей на деятельность человека. [28]

Он был стипендиатом благотворительного фонда Pew Charitable Trusts [29] и старшим научным сотрудником медицинского фонда Ellison Medical Foundation . [30] В 2003 году он получил премию Габбея в области биотехнологии и медицины за свою работу над методами взаимодействия белков [31] , а в 2011 году он был назван членом Американской ассоциации содействия развитию науки «за выдающийся вклад в области биохимии, транскрипции, геномики и системной биологии». [32]

Использование Брентом прокариотических репрессорных белков и их использование в химерных белках для регулирования экспрессии генов у эукариот было предметом основных патентов (включая патент США 4,833,080 , «Регулирование экспрессии эукариотических генов», совместно с Марком Пташне). Доктор Брент является изобретателем 16 дополнительных патентов США и четырех ожидающих патентов США. [33]

Личный

В 2006 году Брент женился на биологе и лауреате Нобелевской премии по физиологии и медицине 2004 года Линде Б. Бак . [34]

Ссылки

  1. ^ «Регуляция клеточного ответа на повреждение ДНК» (1982)
  2. ^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1984). «Бактериальный репрессорный белок или дрожжевой терминатор транскрипции могут блокировать восходящую активацию дрожжевого гена». Nature . 312 (5995): 612–615. Bibcode :1984Natur.312..612B. doi :10.1038/312612a0. PMID  6390216. S2CID  4309764.
  3. ^ Норт, Г. (1984). «Последние уроки лямбды и лака». Nature . 308 (5961): 687–688. doi : 10.1038/308687a0 . PMID  6232462. S2CID  4240047.
  4. ^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1985). «Эукариотический транскрипционный активатор, несущий ДНК-специфичность прокариотического репрессора». Cell . 43 (3): 729–736. doi : 10.1016/0092-8674(85)90246-6 . PMID  3907859.
  5. ^ Альбертс, А.; Брей, Д.; Льюис, Дж.; Рафф, М.; Робертс, К. (1989). «Структура мембраны». Молекулярная биология клетки (6-е изд.). Garland Science. стр. 568: Рисунок 10–24. ISBN 978-0-8153-4432-2.
  6. ^ Франкель, AD; Ким, PS (1991). «Модульная структура факторов транскрипции: значение для регуляции генов». Cell . 65 (5): 717–719. doi :10.1016/0092-8674(91)90378-c. PMID  2040012. S2CID  6632853.
  7. ^ "Генетика: Лекция 21" (PDF) . MIT OpenCourseWare . Массачусетский технологический институт. hdl :1721.1/34953. Архивировано (PDF) из оригинала 18 мая 2020 г. . Получено 15 декабря 2014 г. .
  8. ^ Гротеволд, Э.; Келлог, Э.; Чаппелл, Л. (июнь 2015 г.). Гены растений, геномы и генетика (1-е изд.). John Wiley and Sons. ISBN 978-1-119-99887-7.
  9. ^ Годовски, П. Дж.; Пикард, Д.; Ямамото, К. Р. (август 1988 г.). «Трансдукция сигнала и регуляция транскрипции белками слияния глюкокортикоидного рецептора и LexA». Science . 241 (4867): 812–816. Bibcode :1988Sci...241..812G. doi :10.1126/science.3043662. PMID  3043662.
  10. ^ Deuschle, U.; Meyer, WK; Thiesen, HJ (апрель 1995 г.). «Обратимое тетрациклином подавление эукариотических промоторов». Molecular Cell Biology . 15 (4): 1907–1914. doi :10.1128/mcb.15.4.1907. PMC 230416. PMID  7891684 . 
  11. ^ Родригес, AD V; Диданиол, Д.; Десплан, К. (2012). «Мощные инструменты для экспрессии генов и клонального анализа у дрозофилы». Nature Methods . 9 (1): 47–55. doi :10.1038/nmeth.1800. PMC 3574576 . PMID  22205518. 
  12. ^ Бибикова, М. Дж.; Кэрролл, Д.; Сегал, Д. Дж.; Траутман, Дж. К.; Смит, Дж.; Ким, Ю. Г.; Чандрасегаран, С. (январь 2001 г.). «Стимулирование гомологичной рекомбинации посредством направленного расщепления химерными нуклеазами». Mol Cell Biol . 21 (1): 289–297. doi :10.1128/MCB.21.1.289-297.2001. PMC 88802. PMID 11113203  . 
  13. ^ Ван Стенсель, Б.; Хеникофф, С. (апрель 2000 г.). «Идентификация in vivo ДНК-мишеней хроматиновых белков с использованием связанной дамбы метилтрансферазы». Nat. Biotechnol . 18 (4): 424–428. doi :10.1038/74487. PMID  10748524. S2CID  30350384.
  14. ^ Финли, младший, Р. Л. младший; и Брент, Р. (1994). «Спаривание взаимодействия выявляет бинарные и тернарные взаимодействия между регуляторами клеточного цикла дрозофилы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (26): 12980–12984. doi : 10.1073/pnas.91.26.12980 . PMC 45564. PMID  7809159 . 
  15. ^ Брент, Роджер; Пташне, Марк. "Регулирование экспрессии эукариотических генов. Патент США 4,833,080 (1989)" . Получено 6 января 2015 г.
  16. ^ Фридберг, Эррол (октябрь 2010 г.). Сидней Бреннер: Биография . CSHL Press . ISBN 978-0-87969-947-5.
  17. ^ "Протеомика: текущее состояние и будущие направления - интервью с Роджером Брентом, доктором философии" . Получено 5 июля 2010 г.
  18. ^ Ю, Р.; Гордон, А.; Колман-Лернер, А.; Бенджамин, КР; Пинкус, Д.; Серра, Э.; Холл, М.; Брент, Р. (2008). «Отрицательная обратная связь оптимизирует передачу информации в системе сигнализации клетки». Nature . 456 (7223): 755–761. doi :10.1038/nature07513. PMC 2716709 . PMID  19079053. 
  19. ^ Брент, Р. (2009). «Что такое сигнал и какую информацию он несет?». FEBS Letters . 583 (24): 4019–24. doi :10.1016/j.febslet.2009.11.029. PMID  19917282. S2CID  15873809.
  20. ^ Колман-Лернер, А.; Гордон, А.; Серра, Э.; Холл, Э.; Брент, Р. (2005). «Регулируемая межклеточная вариация в системе принятия решений о судьбе клетки». Nature . 437 (7059): 699–706. Bibcode :2005Natur.437..699C. doi :10.1038/nature03998. PMID  16170311. S2CID  4398874.
  21. ^ Ausubel, FM; Brent, R.; Kingston, RE; Moore, DD; Seidman, JG; Smith, JA; Struhl, K (2012). "Предисловие". Current Protocols in Molecular Biology . Vol. 98. pp. iii–v. doi : 10.1002/0471142727.mbprefs98 . ISBN 978-0-471-14272-0. S2CID  221604713.
  22. ^ Грубер, М. «Карта генома, взлом генома». Wired.com . Получено 2 февраля 2010 г.
  23. ^ Маршалл, Э. (1997). «Слишком радикально для NIH? Попробуйте DARPA». Science . 275 (5301): 744–746. doi :10.1126/science.275.5301.744. PMID  9036531. S2CID  5825319.
  24. ^ Миллер, Дж.; Брод, У.Дж.; Энгельберг, С. (2001). Микробы: биологическое оружие и секретная война Америки . Нью-Йорк: Simon and Schuster. ISBN 978-0-684-87159-2.
  25. ^ Бхаттачарджи, И. (2007). «Группа экспертов проводит экспертную оценку исследований в области разведки». Science . 318 (5856): 1538. doi : 10.1126/science.318.5856.1538 . PMID  18063763. S2CID  41060126.
  26. ^ Брент, Р. (2006-11-22). В долине смертной тени. DSpace@MIT (Черновик). hdl :1721.1/34914.
  27. ^ Карлсон, Р. и др. "Компоненты и инструменты проектирования BIO-IO" (PDF) . Получено 5 августа 2010 г.
  28. ^ Вудворд, Кристин (13 октября 2011 г.). «Центр биологического будущего для решения проблем, вызванных взрывом биологических знаний в 21 веке». Центр исследований рака Фреда Хатчинсона . Центр исследований рака Фреда Хатчинсона . Получено 6 января 2014 г.
  29. ^ "Программа Pew Scholars в области биомедицинских наук". Благотворительные фонды PEW . Получено 10 октября 2011 г.
  30. ^ "HOME::Senior Scholar Award in Aging::2000::Stem Cells". The Ellison Medical Foundation . The Ellison Medical Foundation . Получено 8 августа 2011 г.
  31. ^ "ПОБЕДИТЕЛИ ПРОШЛЫХ 2003 "за разработку дрожжевых двугибридных и дрожжевых ловушек для взаимодействия при спаривании"". Исследовательский центр основных медицинских наук Rosenstiel . Университет Брандейса Исследовательский центр основных медицинских наук Rosenstiel . Получено 13 июня 2012 г.
  32. ^ Sausville, EA (2011). «Награды, назначения, объявления». J Natl Cancer Inst . 103 (4): 295. doi : 10.1093/jnci/djr038 .
  33. ^ "Патентный поиск на USPTO.gov" . Получено 20 декабря 2022 г.
  34. ^ Badge, Peter (2008). Nobel Faces. John Wiley & Sons . стр. 180. ISBN 978-3-527-40678-4. Получено 2 декабря 2015 г. .