stringtranslate.com

Белок, связывающий одноцепочечную ДНК

Белок, связывающий одноцепочечную ДНК ( SSB ), — это белок , обнаруженный в бактериях Escherichia coli ( E. coli ) , который связывается с одноцепочечными участками дезоксирибонуклеиновой кислоты ( ДНК ). [1] Одноцепочечная ДНК образуется во всех аспектах метаболизма ДНК: репликации, рекомбинации и репарации. Помимо стабилизации этой одноцепочечной ДНК, белки SSB связываются с многочисленными белками, участвующими во всех этих процессах, и модулируют их функцию.

Активный SSB E. coli состоит из четырех идентичных субъединиц 19 кДа . Связывание одноцепочечной ДНК с тетрамером может происходить в разных «режимах», при этом SSB занимает разное количество оснований ДНК в зависимости от ряда факторов, включая концентрацию соли. Например, режим связывания (SSB) 65 , в котором приблизительно 65 нуклеотидов ДНК оборачиваются вокруг тетрамера SSB и контактируют со всеми четырьмя его субъединицами, является предпочтительным при высоких концентрациях соли in vitro . При более низких концентрациях соли имеет тенденцию к образованию режима связывания (SSB) 35 , в котором приблизительно 35 нуклеотидов связываются только с двумя субъединицами SSB. Необходимы дальнейшие исследования для выяснения функций различных режимов связывания in vivo .

Бактериальный SSB

Домены белка SSB в бактериях играют важную роль в поддержании метаболизма ДНК, а именно репликации , репарации и рекомбинации ДНК. [2] Он имеет структуру из трех бета-нитей в одном шестинитевом бета-слое, образуя димер белка . [3]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Shishmarev D, Wang Y, Mason CE, Su XC, Oakley AJ, Graham B и др. (февраль 2014 г.). «Внутримолекулярный режим связывания C-конца белка, связывающего одноцепочечную ДНК Escherichia coli, определенный методом ядерной магнитно-резонансной спектроскопии». Nucleic Acids Research . 42 (4): 2750–2757. doi :10.1093/nar/gkt1238. PMC  3936761. PMID  24288378 .
  2. ^ Meyer RR, Laine PS (декабрь 1990 г.). «Одноцепочечный ДНК-связывающий белок Escherichia coli». Microbiological Reviews . 54 (4): 342–380. doi :10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990. PMC 372786 . PMID  2087220. 
  3. ^ Рагхунатхан С., Рикард С.С., Ломан Т.М., Ваксман Г. (июнь 1997 г.). «Кристаллическая структура гомотетрамерного домена связывания ДНК одноцепочечного белка связывания ДНК Escherichia coli, определенная методом многоволновой рентгеновской дифракции на селенометиониловом белке при разрешении 2,9 А». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (13): 6652–6657. doi : 10.1073/pnas.94.13.6652 . PMC 21213. PMID  9192620 . 
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000635

Внешние ссылки