Иммигранты-трипунктатная радиация

Видовая группа подрода Drosophila

Излучение immigrans-tripunctata — это отдельная линия мух- дрозофил , включающая более 300 видов. ^[1] Излучение immigrans-tripunctata — это сестринская линия для большинства других членов подрода Drosophila. ^[2] У ряда видов были секвенированы геномы или транскриптомы для эволюционных исследований с использованием Drosophila .

Группы видов

Следующие группы видов и их численность в значительной степени заимствованы из работы О'Грейди (2018). ^[2]

• Группа видов иммигрантов (106 видов) ^[2]
• Видовая группа Tripunctata (83 вида) ^[2]
• Группа видов Quinaria (35 видов) ^{[1] [2]}
• Группа видов гуарани (24 вида) ^{[3] [4]}
• Группа видов Cardini (16 видов) ^[2]
• Видовая группа Calloptera (8 видов) ^[2]
• Группа видов Bizonata (7 видов) ^[2]
• Группа видов Funebris (7 видов) ^[2]
• Группа видов Testacea (4 вида) ^[2]

Секвенированные геномы или транскриптомы

Для следующих видов доступны обширные данные о генетической последовательности. [Последнее обновление: 24 августа 2019 г.]

Группа видов Quinaria

• Дрозофила гуттифера ^[5]
• Дрозофила иннубила ^[6]
• Дрозофила падшая ^[6]
• Дрозофила фалерата ^[6]

Группа видов иммигрантов

• Дрозофила белая ^{[7] [8]}

Группа видов Testacea

• Дрозофила неотестацеа ^[9]

Галерея

• 
  D. immigrans ( группа видов Immigrans )
• 
  D. innubila ( группа видов Quinaria )
• 
  Drosophila funebris ( группа видов Funebris )
• 
  D. neotestacea ( группа видов Testacea )

Ссылки

1. Hanson MA, Hamilton PT, Perlman SJ (октябрь 2016 г.). «Иммунные гены и дивергентные антимикробные пептиды у мух подрода Drosophila». BMC Evolutionary Biology . 16 (1): 228. doi : 10.1186/s12862-016-0805-y . PMC  5078906. PMID  27776480 .
2. o'Grady, Patrick M.; Desalle, Rob (2018). «Филогения рода Drosophila». Genetics . 209 (1): 1–25. doi :10.1534/genetics.117.300583. PMC 5937177. PMID  29716983 . 
3. Пеньяфьель-Винуэса, Ана Даница; Рафаэль, Виолета (2018). «Пять новых видов группы Drosophila guarani из Анд южного Эквадора (Diptera, Drosophilidae)». ZooKeys (781): 141–163. doi : 10.3897/zookeys.781.22841 . PMC 6160839 . PMID  30271239. 
4. "Филогения FlyBase" . Проверено 24 августа 2019 г.
5. Koshikawa, Shigeyuki; Giorgianni, Matt W.; Vaccaro, Kathy; Kassner, Victoria A.; Yoder, John H.; Werner, Thomas; Carroll, Sean B. (2015). «Усиление цис-регуляторной активности лежит в основе новых доменов экспрессии генов бескрылых у дрозофил». Труды Национальной академии наук . 112 (24): 7524–9. Bibcode : 2015PNAS..112.7524K. doi : 10.1073/pnas.1509022112 . PMC 4475944. PMID  26034272 . 
6. Hill, T.; Koseva, BS; Unckless, RL (2019). «Геном Drosophila innubila раскрывает специфические для каждой линии закономерности отбора в иммунных генах | Молекулярная биология и эволюция | Oxford Academic». Молекулярная биология и эволюция . 36 (7): 1405–1417. doi :10.1093/molbev/msz059. PMC 6573480 . PMID  30865231. 
7. Чжоу, Ци; Чжу, Хунмэй; Хуан, Цюань-фэй; Сюань, Чжао-линь; Чжан, Го-цзе; Чжао, Ли; Дин, Юн; Рой, Скотт; Викосо, Беатрис; Жуан, Цзюэ; Чжан, Юэ; Чжао, Жо-Пин; Му, Бо; Мин, Цзю-Мэн; Чжан, Цин-хуэй; Ли, Цзянь-вэнь; Ло, Инь-Лин; Лян, Цзу-Хэн; Йе, Чен; Ли, Жуй-Цян; Чжан, Сю-Цин; Ван, Цзюнь; Ван, Вэнь; Бахтрог, Дорис (2012). «Расшифровка неопола и эволюции B-хромосомы по черновому геному Drosophila albomicans». БМК Геномика . 13 : 109. doi : 10.1186/1471-2164-13-109 . PMC 3353239 . PMID  22439699. 
8. Викосо, Беатрис; Бахтрог, Дорис (2015). «Многочисленные переходы половых хромосом у двукрылых». PLOS Biology . 13 (4): e1002078. doi : 10.1371/journal.pbio.1002078 . PMC 4400102. PMID  25879221 . 
9. Гамильтон, PT; Леонг, JS; Куп, BF; Перлман, SJ (2014). «Транскрипционные ответы в защитном симбиозе дрозофилы — Гамильтон — 2014 — Молекулярная экология». Молекулярная экология . 23 (6): 1558–70. doi :10.1111/mec.12603. PMID  24274471. S2CID  2964885.