stringtranslate.com

Археопластида

Archaeplastida (или царство Plantae sensu lato «в широком смысле»; произносится / ɑːr k ɪ ˈ p l æ s t ɪ d ə / ) — основная группа эукариот , включающая фотоавтотрофные красные водоросли (Rhodophyta), зеленые водоросли , наземные растения и малая группа глаукофитов . [6] Он также включает нефотосинтезирующую линию Rhodelphidia , хищную (эукариотрофную) жгутиконосцу, родственную Rhodophyta, и, вероятно, микроскопических пикозойных . [7] У архепластид есть хлоропласты , окруженные двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены непосредственно в результате одного эндосимбиоза путем фагоцитоза цианобактерий . [8] Все другие группы, имеющие хлоропласты, кроме амебоидного рода Paulinella , имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены вторично из красных или зеленых водорослей. [примечание 1] В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных событиях эндосимбиоза. [10]

В клетках Archaeplastida обычно отсутствуют центриоли и имеются митохондрии с плоскими кристами . Обычно у них есть клеточная стенка , содержащая целлюлозу , а пища хранится в виде крахмала . Однако эти характеристики присущи и другим эукариотам. Основное свидетельство того, что архепластиды образуют монофилетическую группу, получено в результате генетических исследований, которые указывают на то, что их пластиды, вероятно, имели единое происхождение. Это свидетельство оспаривается. [11] [12] На основании имеющихся на сегодняшний день данных невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные эволюционные сценарии единственному первичному эндосимбиозу . [13] Фотосинтезирующие организмы с пластидами различного происхождения (например, бурые водоросли ) не относятся к архепластидам.

Археопластиды делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофиллом а и фикобилипротеинами , как и большинство цианобактерий, и накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения, известные как Viridiplantae (лат. «зеленые растения») или Chloroplastida, пигментированы хлорофиллами a и b , но лишены фикобилипротеинов, а крахмал накапливается внутри хлоропластов. [14] Глаукофиты имеют типичные цианобактериальные пигменты, но их пластиды (называемые цианеллами) отличаются наличием внешнего слоя пептидогликана. [1]

Не следует путать Archaeplastida со старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактериям и другим группам бактерий. [15] [16]

Таксономия

Консенсус в 2005 году, когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Археопластидой», [1] заключался в том, что это клада , то есть монофилетическая . Многие исследования, опубликованные с тех пор, предоставили подтверждающие доказательства. [17] [18] [19] [20] Однако другие исследования показали, что эта группа является парафилетической . [21] [22] [23] [12] [24] На сегодняшний день ситуация кажется неразрешенной, но в недавнем исследовании был продемонстрирован сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) (с обогащением генов красных водорослей). [25] Здесь делается предположение, что Archaeplastida является действительной кладой.

Группе давались разные названия. Некоторые авторы просто называют эту группу растениями или Plantae. [26] [27] Однако название Plantae неоднозначно, поскольку оно также применялось к менее инклюзивным кладам , таким как Viridiplantae и эмбриофиты . Чтобы различать, большую группу иногда называют Plantae sensu lato («растения в широком смысле»).

Во избежание двусмысленности были предложены другие названия. Primoplantae, появившееся в 2004 году, кажется, является первым новым названием, предложенным для этой группы. [5] Другое название, применяемое к этому узлу, - пластида, определяемое как группа, разделяющая «пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Magnolia Virginiana Linnaeus 1753». [28]

Хотя многие исследования предполагают, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, [29] в статье 2009 года утверждается, что они на самом деле являются парафилетическими . [23] Обогащение новыми генами красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал о монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал об истории совместного использования генов между красными/зелеными водорослями и другими линиями. [25] Это исследование дает представление о том, насколько богатые данные о генах мезофильных красных водорослей имеют решающее значение для проверки спорных вопросов эволюции эукариот и для понимания сложных закономерностей наследования генов у простейших.

Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большой международной группой авторов (Адл и др. ), целью которых было создание классификации эукариот , учитывающей морфологию, биохимию и филогенетику и обладающей «некоторой стабильностью в ближайшем будущем». срок." Они отвергли использование формальных таксономических рангов в пользу иерархической структуры, в которой названия клад не обозначают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» находятся на одном уровне в их классификации. Предложенные подразделения Archaeplastida показаны ниже как в табличной, так и в схематической форме . [1]

Археопластида :

Глаукофит Glaucocystis .
  • Глаукофиты — небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллами , имеют слой пептидогликана , что делает их более похожими на цианобактерии, чем на таковые у остальных архепластид.
Родофит Лауренсия
Красные водоросли образуют одну из крупнейших групп водорослей. Большинство из них — морские водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет обусловлен фикобилипротеинами , которые используются в качестве вспомогательных пигментов при захвате света для фотосинтеза.
Хлоропластида — это термин, выбранный Adl et al. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением случаев вторичной потери, все хлоропласты имеют слой пептидогликана и лишены фикобилипротеинов.
Хлорофит стигеоклониум
  • Chlorophyta Pascher, 1914, исправить. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
Адл и др. использовать узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
  • Chlorodendrales Fritsch, 1917 - зеленые водоросли (часть)
  • Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, исправлено. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
  • Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., исправлено. МакКорт в Adl et al. , 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis и Lemieux, 2002 )
  • Charophyta Karol et al. , 2001, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, исправлено Mattox and Stewart 1984 ) – зеленые водоросли (часть) и наземные растения.
Charophyta sensu lato , использованный Adl et al. , представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, в том числе костяных (Charophyta sensu stricto ), а также наземных растений (эмбриофитов).
  • Другие подразделения, кроме Streptophytina (ниже), Adl et al. не указали.
Другие источники включают группы зеленых водорослей Chlorokybales , Klebsormidiales , Zygnematales и Coleochaetales . [30]
  • Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 - костянки и наземные растения.
  • Харалес Линдли 1836 (Charophytae Engler, 1887 ) - каменницы.
  • Plantae Haeckel 1866 (Cormophyta Endlicher, 1836 ; Embryophyta Endlicher, 1836, исправлено Lewis & McCourt, 2004 ) – наземные растения (эмбриофиты)

Внешняя филогения

Ниже представлена ​​консенсусная реконструкция взаимоотношений Archaeplastida с ее ближайшими соседями, основанная главным образом на молекулярных данных. [31] [32] [33] [34]

Были разногласия относительно корня Archaeplastida, например, возникла ли Cryptista внутри Archaeplastida. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий. [35] Положение Telonemia и Picozoa не ясно. Также Hacrobia (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматривают как гибриды эукариот-эукариот, что приводит к путанице в генетическом анализе. Сестра Gloeomargaritalitophora была поглощена предком Archaeplastida, что привело к появлению пластид , которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомственных линий. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные цианобактерии, а также самые примитивные архепластиды, живут в пресной воде, кажется, что Archaeplastida возникла в пресной воде и колонизировала океаны только в позднем протерозое. [36] [37]

Внутренняя филогения

В 2019 году была предложена филогения Archaeplastida на основе геномов и транскриптомов 1153 видов растений. [38] Расположение групп водорослей подтверждается филогениями, основанными на геномах Mesostigmatophyceae и Chlorokybophyceae, которые с тех пор были секвенированы. В этом анализе как «хлорофитные водоросли», так и «стрептофитные водоросли» рассматриваются как парафилетические (вертикальные полосы рядом с филогенетической древовидной диаграммой). [39] [40] Классификация Bryophyta поддерживается Puttick et al. 2018, [41] и филогениями, включающими геномы роголистника, которые с тех пор также были секвенированы. [42] [43]

Недавние исследования нефотосинтезирующих водорослей считают родельфидию сестрой родофиты; [44] и Picozoa, сестра этой пары групп. [45]

Морфология

Все архепластиды имеют пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, происходят от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных представителей группы, хлоропласт называется цианеллой и имеет некоторые общие черты с цианобактериями, включая клеточную стенку пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями подтверждает эндосимбиотическую теорию .

Клетки большинства архепластид имеют стенки, обычно, но не всегда, состоящие из целлюлозы.

Археопластиды широко различаются по степени клеточной организации: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми и сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли и зеленые водоросли, давшие начало каменщикам и наземным растениям.

Эндосимбиоз

Поскольку предполагается, что предковый архепластидан приобрел свои хлоропласты непосредственно путем поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Археепластида», то есть «древние пластиды»). В 2013 году было обнаружено, что один вид зеленых водорослей, Cymbomonas Tetramitiformis из отряда Pyramimonadales , является миксотрофом и способен поддерживать себя как за счет фаготрофии , так и за счет фототрофии . Пока неизвестно, является ли это примитивным признаком и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, что могло бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это признак, восстановленный в результате горизонтального переноса генов . [46] С тех пор было обнаружено больше видов миксотрофных зеленых водорослей, таких как Pyramimonas tychotreta и Mantoniella antarctica . [47]

Доказательства первичного эндосимбиоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая захватившему ее эукариоту. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро ​​клетки-хозяина посредством эндосимбиотического переноса генов (EGT). Подсчитано, что 6–20% генома архепластидана состоят из генов, переданных от эндосимбионта. [48] ​​Присутствие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов позволяет предположить, что этот перенос произошел на ранних этапах эволюции группы. [49]

Другие эукариоты с хлоропластами, по-видимому, получили их, поглотив одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами бактериального происхождения. Поскольку эти события включают эндосимбиоз клеток, имеющих собственных эндосимбионтов, этот процесс называется вторичным эндосимбиозом . Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю множественного поглощения. Хлоропласты эвгленид , хлорарахниофитов и небольшой группы динофлагеллят , по-видимому, захватывают зеленые водоросли, [50] тогда как хлоропласты остальных фотосинтезирующих эукариот, таких как гетероконтные водоросли, криптофиты , гаптофиты и динофлагелляты, по-видимому, захватывают красные водоросли.

Окаменелости

Вероятно, самыми древними остатками Archaeplastida являются предполагаемые красные водоросли ( Rafatazmia ) в строматолитах в горных породах возрастом 1600 млн лет назад в Индии, [51] а также возможные окаменелости водорослей ( Tuanshanzia ) из китайской биоты Гаоючжуан того же возраста. [52] Несколько более поздними являются микроокаменелости из группы Ропер в северной Австралии. Структура этих одноклеточных окаменелостей напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются мезопротерозойской эрой, примерно 1500–1300 млн лет назад. [53] Эти окаменелости согласуются с исследованием молекулярных часов , которое подсчитало, что эта клада разошлась около 1500 млн лет назад. [54] Самая старая окаменелость, которую можно отнести к определенной современной группе, — это красная водоросль Bangiomorpha , возраст которой составляет 1200 млн лет назад. [55]

В поздней неопротерозойской эре окаменелости водорослей стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в палеозойскую эру растения появились на суше и продолжают процветать до настоящего времени.

Примечания

  1. ^ Исключительные две пластидные мембраны страменопильной водоросли Chrysoparadoxa , вероятно, являются результатом вторичной редукции. [9]

Рекомендации

  1. ^ abcd Адл, С.М.; и другие. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с упором на таксономию протистов». Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. дои : 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x . PMID  16248873. S2CID  8060916.
  2. ^ аб Язаки, Юки; Ябуки, Акинори; Имаидзуми, Аяка; Куме, Кейтаро; Хасимото, Тецуо; Инагаки, Юдзи (31 августа 2021 г.). «Филогеномика обращается к кладе, в которой обитают Cryptista, Archaeplastida и Microheliella maris». дои : 10.1101/2021.08.29.458128. S2CID  237393558 . Проверено 25 ноября 2021 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  3. ^ Шен, Мэн; Златогурский В.В.; Сингх, РП; и другие. (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей». Природные коммуникации . 12:6651 (1):6651. Бибкод :2021NatCo..12.6651S. дои : 10.1038/s41467-021-26918-0. ISSN  2041-1723. ПМК 8599508 . ПМИД  34789758. 
  4. ^ Кавалер-Смит, Т. (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?»". BioSystems . 14 (3–4): 461–481. doi : 10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  5. ^ Аб Палмер, Джеффри Д.; Солтис, Дуглас Э.; Чейз, Марк В. (2004). «Растительное древо жизни: обзор и некоторые точки зрения». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1437–1445. дои : 10.3732/ajb.91.10.1437 . ПМИД  21652302.
  6. ^ Болл, С.; Коллеони, К. (январь 2011 г.). Ченчи, У.; Радж, Дж. Н.; Тиртьо, К. «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные ключи к пониманию возникновения пластидного эндосимбиоза». Журнал экспериментальной ботаники . 62 (6): 1775–1801. дои : 10.1093/jxb/erq411 . ПМИД  21220783.
  7. ^ В конце концов, пикозои - это водоросли: исследование | Журнал «Ученый»®
  8. ^ Институт биологии внутренних вод имени Папанина РАН; Тихоненков, Денис В. (2020). «Хищные жгутиконосцы – новые, недавно обнаруженные глубокие ветви эукариотического дерева и их эволюционное и экологическое значение» (PDF) . Протистология . 14 (1). дои : 10.21685/1680-0826-2020-14-1-2 .
  9. ^ Уэтерби, Ричард; Джексон, Кристофер Дж.; Репетти, Соня И.; Клементсон, Лесли А.; Коста, Джоана Ф.; ван де Мин, Эллисон; Кроуфорд, Саймон; Вербрюгген, Хероен (9 декабря 2018 г.). «Золотой парадокс - новая линия гетероконтов с хлоропластами, окруженными двумя мембранами». Журнал психологии . 22 (2): 257–278. дои : 10.1111/jpy.12822. hdl : 11343/233613 . PMID  30536815. S2CID  54477112.
  10. ^ Справочник по морским микроводорослям: достижения биотехнологии
  11. ^ Парфри. ЛВ; Барберо, Э.; Лассер, Э; и другие. (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия». ПЛОС Генетика . 2 (12): е220. дои : 10.1371/journal.pgen.0020220 . ПМЦ 1713255 . ПМИД  17194223. 
  12. ^ аб Ким, Э; Грэм, Луизиана (июль 2008 г.). Редфилд, Розмари Джин (ред.). «Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata». ПЛОС ОДИН . 3 (7): е2621. Бибкод : 2008PLoSO...3.2621K. дои : 10.1371/journal.pone.0002621 . ПМК 2440802 . ПМИД  18612431. 
  13. ^ Мацкевич, П.; Гагат, П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
  14. ^ Виола, Р.; Нивалл, П.; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности метаболизма крахмала у красных водорослей». Труды Королевского общества B: Биологические науки . 268 (1474): 1417–1422. дои :10.1098/rspb.2001.1644. ПМЦ 1088757 . ПМИД  11429143. 
  15. ^ Коупленд, HF (1956). Классификация низших организмов . Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1].
  16. ^ Бесси, CE (1907). «Краткий обзор типов растений». унив. Исследования Небраски . 7 : 275–358.
  17. ^ Бурки, Фабьен; Кямран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетилл С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет супергруппы эукариот». ПЛОС ОДИН . 2 (8): е790. Бибкод : 2007PLoSO...2..790B. дои : 10.1371/journal.pone.0000790 . ЧВК 1949142 . ПМИД  17726520. 
  18. ^ Бурки, Ф.; Инагаки, Ю.; Брейт, Дж.; Арчибальд, Дж. М.; Килинг, П.Дж.; Кавальер-Смит, Т.; и другие. (2009). «Крупномасштабный филогеномический анализ показывает, что две загадочные линии протистов, телонемия и центрогелиозоа, связаны с фотосинтетическим хромальвеолатами». Геномная биология и эволюция . 1 : 231–238. doi : 10.1093/gbe/evp022. ПМК 2817417 . ПМИД  20333193. 
  19. ^ Кавалер-Смит, Томас (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева». Письма по биологии . 6 (3): 342–345. дои : 10.1098/rsbl.2009.0948. ПМК 2880060 . ПМИД  20031978. 
  20. ^ Рогозин, И.Б.; Басу, МК; Чюрёш М. и Кунин Е.В. (2009). «Анализ редких геномных изменений не подтверждает филогению Униконт-Биконт и предполагает цианобактериальный симбиоз как точку первичного излучения эукариот». Геномная биология и эволюция . 1 : 99–113. doi : 10.1093/gbe/evp011. ПМК 2817406 . ПМИД  20333181. 
  21. ^ Балдауф, С.Л., Роджер, А.Дж., Венк-Зиферт, И., Дулитл, В.Ф. 2000. Филогения эукариот на уровне царства, основанная на комбинированных данных о белках. Science 290: 972-977 (researchgate.net)
  22. ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Паразитические простейшие, Vol. 1, 2-е изд., Дж. П. Крейер, Дж. Р. Бейкер (ред.), стр. 81–136. Академическое издательство, Сан-Диего.
  23. ^ аб Нодзаки, Х.; Маруяма, С.; Мацузаки, М.; Накада, Т.; Като, С.; Мисава, К. (декабрь 2009 г.). «Филогенетические положения Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata), выведенные на основе медленно развивающихся ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция . 53 (3): 872–80. doi :10.1016/j.ympev.2009.08.015. ПМИД  19698794.
  24. ^ Палмгрен М., Соренсен Д.М., Халльстрем Б.М., Салл Т., Броберг К. (август 2019 г.). «Эволюция АТФаз P2A и P5A: повторение древних дупликаций генов и связи красных водорослей с зелеными растениями». Физиол. Растение . 168 (3): 630–647. дои : 10.1111/чел.13008. ПМК 7065118 . ПМИД  31268560. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  25. ^ Аб Чан, CX; Ян, ЕС; Банерджи, Т.; Юн, HS; Мартоне, ПТ; Эстевес, Дж. М.; Бхаттачарья, Д. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов, обнаруженное в богатом репертуаре генов красных водорослей». Современная биология . 21 (4): 328–333. дои : 10.1016/j.cub.2011.01.037 . PMID  21315598. S2CID  7162977.
  26. ^ Т. Кавальер-Смит (1981). «Королевства эукариот: семь или девять?». БиоСистемы . 14 (3–4): 461–481. дои : 10.1016/0303-2647(81)90050-2. ПМИД  7337818.
  27. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Иеремия (2003). «Фотосинтезирующие эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». Биоэссе . 26 (1): 50–60. дои : 10.1002/bies.10376. ПМИД  14696040.
  28. ^ Симпсон, AGB (2004). «Таксоны высшего уровня среди эукариот». Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля .
  29. ^ Виноградов С.Н.; Фернандес, И.; Хогевейс, Д.; Арредондо-Питер, Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические связи 3/3 и 2/2 гемоглобинов в геномах архепластид с бактериальными и другими эукариотными гемоглобинами». Молекулярный завод . 4 (1): 42–58. дои : 10.1093/mp/ssq040 . ПМИД  20952597.
  30. ^ Турмель, М.; Отис, К.; Лемье, К. (2005). «Полные последовательности ДНК хлоропластов харовых зеленых водорослей Staurastrum и Zygnema показывают, что геном хлоропластов претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales». БМК Биология . 3:22 . дои : 10.1186/1741-7007-3-22 . ПМЦ 1277820 . ПМИД  16236178. 
  31. ^ Лелиарт, Фредерик; Смит, Дэвид Р.; Моро, Эрве; Херрон, Мэтью Д.; Вербрюгген, Хероен; Делвич, Чарльз Ф.; Де Клерк, Оливье (2012). «Филогения и молекулярная эволюция зеленых водорослей» (PDF) . Критические обзоры по наукам о растениях . 31 : 1–46. дои : 10.1080/07352689.2011.615705. S2CID  17603352. Архивировано из оригинала (PDF) 24 сентября 2015 г. Проверено 15 октября 2017 г.
  32. ^ Кук, Марта Э.; Грэм, Линда Э. (2017). «Chlorokybophyceae, Klebsormidiophyceae, Coleochaetophyceae». В Арчибальде, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник протистов . Международное издательство Спрингер. стр. 185–204. дои : 10.1007/978-3-319-28149-0_36. ISBN 9783319281476.
  33. ^ Льюис, Луиза А.; МакКорт, Ричард М. (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–1556. дои : 10.3732/ajb.91.10.1535. ПМИД  21652308.
  34. ^ Адл, Сина М.; Симпсон, Аластер ГБ; Лейн, Кристофер Э.; Лукеш, Юлиус; Басс, Дэвид; Баузер, Сэмюэл С.; Браун, Мэтью В.; Бурки, Фабьен; Данторн, Мика (1 сентября 2012 г.). «Пересмотренная классификация эукариот». Журнал эукариотической микробиологии . 59 (5): 429–514. дои : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. ПМЦ 3483872 . ПМИД  23020233. 
  35. ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
  36. ^ де Врис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: эволюционировали ли пластиды из пресноводной цианобактерии?». Современная биология . 27 (3): Р103–Р105. дои : 10.1016/j.cub.2016.12.006 . ПМИД  28171752.
  37. ^ Льюис, Луизиана (2017). «Держи соль: пресноводное происхождение первичных пластид». ПНАС . 114 (37): 9759–9760. Бибкод : 2017PNAS..114.9759L. дои : 10.1073/pnas.1712956114 . ПМК 5604047 . ПМИД  28860199. 
  38. ^ Либенс-Мак, М.; Баркер, М.; Карпентер, Э.; и другие. (2019). «Тысяча растительных транскриптомов и филогеномика зеленых растений». Природа . 574 (7780): 679–685. дои : 10.1038/s41586-019-1693-2 . ПМК 6872490 . ПМИД  31645766. 
  39. ^ Лян, Чжэ; и другие. (2019). «Геном и транскриптом Mesostigma viride дают представление о происхождении и эволюции Streptophyta». Передовая наука . 7 (1): 1901850. doi : 10.1002/advs.201901850 . ПМК 6947507 . ПМИД  31921561. 
  40. ^ Ван, Сибо; и другие. (2020). «Геномы рано дивергентных водорослей-стрептофитов проливают свет на наземность растений». Природные растения . 6 (2): 95–106. дои : 10.1038/s41477-019-0560-3 . ПМК 7027972 . ПМИД  31844283. 
  41. ^ Путтик, Марк; и другие. (2018). «Взаимоотношения наземных растений и природа предкового эмбриофита». Современная биология . 28 (5): 733–745. дои : 10.1016/j.cub.2018.01.063 . hdl : 1983/ad32d4da-6cb3-4ed6-add2-2415f81b46da . ПМИД  29456145.
  42. ^ Чжан, Цзянь; и другие. (2020). «Геном роголистника и ранняя эволюция наземных растений». Природные растения . 6 (2): 107–118. дои : 10.1038/s41477-019-0588-4 . ПМК 7027989 . ПМИД  32042158. 
  43. ^ Ли, Фэй Вэй; и другие. (2020). «Геномы Anthoceros освещают происхождение наземных растений и уникальную биологию роголистников». Природные растения . 6 (3): 259–272. дои : 10.1038/s41477-020-0618-2 . ПМЦ 8075897 . ПМИД  32170292. 
  44. ^ Гаврилюк, Райан М.Р.; Тихоненков Денис Владимирович; Хехенбергер, Элизабет; Гусник, Филип; Мыльников Александр П.; Килинг, Патрик Дж. (17 июля 2019 г.). «Нефотосинтезирующие хищники — сестры красных водорослей». Природа . 572 (7768): 240–243. дои : 10.1038/s41586-019-1398-6. PMID  31316212. S2CID  197542583.
  45. ^ Шён, Макс Э.; Златогурский Василий Владимирович; Сингх, Рохан П.; Пуарье, Камилла; Уилкен, Сюзанна; Матур, Варша; Штрассерт, Юрген Ф.Х.; Пинхасси, Хароне; Уорден, Александра З.; Килинг, Патрик Дж.; Эттема, Тейс Дж.Г.; Уайдман, Джереми Г.; Бурки, Фабьен (17 ноября 2021 г.). «Одноклеточная геномика показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей». Природные коммуникации . 12 (1): 6651. Бибкод : 2021NatCo..12.6651S. дои : 10.1038/s41467-021-26918-0. ПМК 8599508 . ПМИД  34789758. 
  46. ^ Рэйвен, Джон А. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия». Современная биология . 23 (12): 530–531 р. дои : 10.1016/j.cub.2013.05.006 . ПМИД  23787050.
  47. ^ Бок, Николас А.; Шарве, Софи; Бернс, Джон; Гьялтшен, Янгтшо; Розенберг, Андрей; Дюамель, Соланж; Ким, Ынсу (2021). «Экспериментальная идентификация и прогнозирование in silico бактериозности зеленых водорослей». Журнал ISME . 15 (7): 1987–2000. doi : 10.1038/s41396-021-00899-w. ПМЦ 8245530 . ПМИД  33649548. 
  48. ^ Цю, Хуан; Юн, Хван Су; Бхаттачарья, Дебашиш (2013). «Эндомибионты водорослей как векторы горизонтального переноса генов у фотосинтезирующих эукариот». Границы в науке о растениях . 4 : 366. дои : 10.3389/fpls.2013.00366 . ПМК 3777023 . ПМИД  24065973. 
  49. ^ Андерссон, Ян О.; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерий у нефотосинтезирующих простейших - раннее приобретение хлоропластов у эукариот?». Современная биология . 12 (2): 115–119. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00649-2 . PMID  11818061. S2CID  18809784.
  50. ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндсимбиотическое происхождение, диверсификация и судьба пластид». Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 365 (1541): 729–748. дои : 10.1098/rstb.2009.0103. ПМК 2817223 . ПМИД  20124341. 
  51. ^ Бенгтсон, Стефан; Сальштедт, Тереза; Беливанова, Венета; Уайтхаус, Мартин (2017). «Трехмерная сохранность клеточных и субклеточных структур позволяет предположить, что красным водорослям коронной группы возрастом 1,6 миллиарда лет». ПЛОС Биология . 15 (3): e2000735. doi : 10.1371/journal.pbio.2000735 . ПМК 5349422 . ПМИД  28291791. 
  52. ^ Чен, К.; Мяо, Л.; Чжао, Ф.; Чжу, М. (2023). «Углеродистые макрофоссилии из ранней мезопротерозойской формации Гаоючжуан в хребте Яньшань, Северный Китай». Докембрийские исследования . 392 . 107074. doi :10.1016/j.precamres.2023.107074.
  53. ^ Яво, Эммануэль Дж.; Нолл, Эндрю Х.; Уолтер, Малкольм Р. (2004). «Доказательства TEM эукариотического разнообразия в среднепротерозойских океанах». Геобиология . 2 (3): 121–132. Бибкод : 2004Gbio....2..121J. дои : 10.1111/j.1472-4677.2004.00027.x. S2CID  53600639.
  54. ^ Юн, Хван Су; Хакетт, Джеремия Д.; Чинилья, Клаудия; Пинто, Габриэле; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярная хронология происхождения фотосинтезирующих эукариот». Молекулярная биология и эволюция . 21 (5): 809–818. дои : 10.1093/molbev/msh075 . ПМИД  14963099.
  55. ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). « Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойской/неопротерозойской радиации эукариот». Палеобиология . 26 (3): 386–404. doi :10.1666/0094-8373(2000)026<0386:BPNGNS>2.0.CO;2. S2CID  36648568.

Внешние ссылки