Mycobacteroides — род грамположительных палочковидных бактерий семейства Mycobacteriaceae из порядка Mycobacteriales . [1]
Члены Mycobacteroides были отделены от более крупного рода Mycobacterium в 2018 году Гуптой и др. на основе доказательств из различных филогенетических деревьев, построенных на основе консервативных последовательностей генома, сравнительного геномного анализа и средних значений идентичности аминокислот. [1] В дополнение к этому роду исследование предложило разделение Mycobacterium в общей сложности на пять отдельных родов, что встретило некоторое сопротивление со стороны части научного сообщества. Сопротивление было основано на том, что Mycobacterium содержит некоторые клинически значимые виды, а изменение названия может вызвать путаницу среди врачей и других исследователей. [4]
В 2020 году Ямада и др. проанализировали основные морфологические свойства новых родов, включая диаметр клетки, длину клетки, периметр клетки, округлость клетки и соотношение сторон, и определили, что между пятью родами существуют значительные различия, что подтверждает новое разделение. [5]
Название Mycobacteroides происходит от латинского существительного Mycobacterium (относится к роду бактерий) и латинского суффикса " -oides " (переводится как "похожий"). Вместе название относится к роду, напоминающему Mycobacterium . [1]
Представители рода Mycobacteroides — это быстрорастущие бактерии, образующие колонии менее чем за семь дней. Некоторые характеристики этого рода включают: отрицательный результат на нитратредуктазу, поглощение железа и демонстрацию устойчивости к полимиксину B. Оптимальная температура для роста — 30 °C, хотя рост может происходить и при 35 °C. Представители также демонстрируют положительный результат в 3-дневном тесте на арилсульфатазу. Размер генома видов рода Mycobacteroides составляет от 4,5 до 5,6 Мбн, а содержание G+C — от 63,9 до 64,8 моль%. Некоторые виды являются патогенными и, как было показано, участвуют в инфекциях легких, кожи и мягких тканей. Кроме того, некоторые виды также устойчивы к нескольким противомикробным препаратам.
27 консервативных сигнатурных инделей (CSI) были идентифицированы как уникальные для этого рода белки, такие как: DEAD/DEAH-бокс-хеликаза , переносчик анионов , мембранный белок , никотинат-нуклеотидаденилилтрансфераза , CoA-эстерлиаза, урацилфосфорибозилтрансфераза , L-гистидин N(альфа)-метилтрансфераза, белок, содержащий домен DUF58, субъединица G NADH-хинон оксидоредуктазы , АТФ-зависимая геликаза, тРНК (цитидин(34)-2′- O )-метилтрансфераза , глутамин-фруктозо-6-фосфаттрансаминаза (изомеризующаяся) , подверженная ошибкам ДНК-полимераза и 2-амино-4-гидрокси-6-гидроксиметилдигидроптеридин дифосфокиназа . [1] Эти молекулярные сигнатуры были идентифицированы посредством анализа последовательностей генома видов Mycobacteroides и обеспечивают надежный молекулярный метод для различения этого рода от теоретических других родов в пределах семейства Mycobacteriaceae и всех других бактерий. Кроме того, для этого рода были идентифицированы 24 уникальных консервативных сигнатурных белка (CSP) . [1]
Секвенирование всего генома — лучший способ отличить представителей этого рода друг от друга. [6]
Филогенетика Mycobacteroides основана на анализе всего генома. [1]