Myoviridae были семейством бактериофагов в порядке Caudovirales . Семейство Myoviridae и порядок Caudovirales в настоящее время упразднены, и термин миовирус теперь используется для обозначения морфологии вирусов в этом бывшем семействе. [1] Бактерии и археи служат естественными хозяевами. В этом семействе было 625 видов, отнесенных к восьми подсемействам и 217 родам. [2] [3]
Подсемейство Tevenvirinae (синоним: Tequatrovirinae ) названо в честь его типового вида Enterobacteria phage T4 . Члены этого подсемейства морфологически неотличимы и имеют умеренно удлиненные головы длиной около 110 нанометров (нм), длинные хвосты с воротником длиной 114 нм, базовые пластины с короткими шипами и шестью длинными изогнутыми хвостовыми волокнами. Роды внутри этого подсемейства делятся на основе морфологии головы, при этом род Tequatrovirus (временное название: T4virus ) имеет длину головы 137 нм, а род Schizotequatrovirus — 111 нм. Внутри родов на основе гомологии белков виды были разделены на ряд групп.
Подсемейство Peduovirinae имеет вирионы с головками диаметром 60 нм и хвостами 135 × 18 нм. Эти фаги легко идентифицируются, поскольку сокращенные оболочки имеют тенденцию соскальзывать с хвостового ядра. Фаг P" является типовым видом.
Подсемейство Spounavirinae — это вирулентные фаги с широким спектром хозяев, которые заражают представителей Bacillota . Они обладают изометрическими головками диаметром 87–94 нм и заметными капсомерами , полосатыми хвостами длиной 140–219 нм и двойной базовой пластиной. На кончике хвоста находятся шаровидные структуры, которые теперь известны как шипы базовой пластины и короткие изогнутые хвостовые волокна с шестикратной симметрией. Члены этой группы обычно обладают большими (127–142 кб) непермутированными геномами с избыточностью концевых участков 3,1–20 кб. Название этого подсемейства происходит от SPO плюс una (латинское слово для одного).
Галовирусы HF1 и HF2 принадлежат к одному роду, но поскольку они заражают археи, а не бактерии, их, вероятно, поместят в отдельный род, как только их классификация будет устоявшейся. [4]
На основании морфологических и геномных данных была предложена группа карликовых фагов. В эту группу входят фаги Aeromonas salmonicida phage 56, Vibrio cholerae phages 138 и CP-T1, Bdellovibrio phage φ1422 и Pectobacterium carotovorum phage ZF40. [5] Их общие характеристики включают идентичную морфологию вириона, характеризующуюся обычно короткими сократительными хвостами, и все они имеют размер генома приблизительно 45 килобаз. Порядок генов в структурной единице генома следующий: терминаза — портальный — голова — хвост — базальная пластинка — хвостовые волокна.
Вирусы в прежнем семействе Myoviridae не имеют оболочки, имеют геометрию «голова-хвост» (с шейкой). Геномы представляют собой линейную двухцепочечную ДНК длиной около 33–244 кб. Геном кодирует от 40 до 415 белков. [2] Он имеет терминально избыточные последовательности. Содержание GC составляет ~35%. Геном кодирует 200–300 белков, которые транскрибируются в оперонах. В геноме может присутствовать 5-гидроксиметилцитозин (вместо тимидина ).
Трубчатый хвост имеет спиральную симметрию и составляет 16-20 нм в диаметре. Он состоит из центральной трубки, сократительной оболочки, воротника, базовой пластины, шести хвостовых штифтов и шести длинных волокон. Он похож на Tectiviridae , но отличается тем, что хвост миовируса постоянный.
Для сокращения хвоста требуется АТФ . При сокращении оболочки субъединицы оболочки скользят друг по другу, и хвост укорачивается до 10–15 нм в длину.
Прикрепляясь к клетке-хозяину, вирус использует свою сократительную оболочку как шприц, прокалывая клеточную стенку своей центральной трубкой и вводя генетический материал в хозяина. Инъецированная ДНК берет на себя механизмы транскрипции и трансляции клетки-хозяина и начинает производить новые вирусы. Репликация следует модели репликативной транспозиции. Методом транскрипции является транскрипция с использованием шаблона ДНК. Трансляция происходит путем сдвига рамки считывания рибосом -1 . Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и белков холина / эндолизина /спанина. Бактерии и археи служат естественным хозяином. Путь передачи - пассивная диффузия . [2]
Хотя миовирусы в целом являются литическими и не имеют генов, необходимых для лизогенности , известно несколько видов, обитающих в умеренном климате .
Поскольку большинство Myoviridae являются литическими, а не умеренными фагами, некоторые исследователи изучали их использование в качестве терапии бактериальных заболеваний у людей и других животных. [7]
Выделяют следующие восемь подсемейств: [3]
Кроме того, следующие роды не отнесены к подсемейству: [3]
