stringtranslate.com

Pasteurellaceae

Pasteurellaceae — большое семейство грамотрицательных бактерий . Большинство представителей живут как комменсалы на слизистых оболочках птиц и млекопитающих, особенно в верхних дыхательных путях. [3] Pasteurellaceae обычно имеют палочковидную форму и являются заметной группой факультативных анаэробов . Их биохимические характеристики можно отличить от родственных Enterobacteriaceae по наличию оксидазы , а от большинства других подобных бактерий — по отсутствию жгутиков .

Бактерии семейства Pasteurellaceae были классифицированы на ряд родов на основе метаболических свойств, но эти классификации, как правило, не являются точным отражением эволюционных отношений между различными видами. Haemophilus influenzae был первым организмом, геном которого был секвенирован, и интенсивно изучался с помощью генетических и молекулярных методологий. Род Haemophilus является печально известным человеческим патогеном, связанным с бактериемией , пневмонией , менингитом и мягким шанкром . Другие патогенные члены семейства Pasteurellaceae включают виды Aggregatibacter , Mannheimia , Pasteurella и Actinobacillus .

Молекулярные сигнатуры и филогенетическое положение

Сравнительный анализ геномов Pasteurellaceae выявил большое количество (>20) консервативных сигнатурных инделей (CSI) в различных важных белках, которые являются уникальными для всех секвенированных видов/штаммов Pasteurellaceae, но не обнаружены ни в каких других бактериях. На основе многих других CSI, которые являются специфичными для подгрупп видов Pasteurellaceae, было предложено разделить семейство по крайней мере на две клады. [4] Одна из предложенных клад включает Aggregatibacter , Pasteurella , Actinobacillus succinogenes , Haemophilus influenzae , Haemophilus somnus и Mannheimia succiniciproducens , в то время как другая включает Actinobacillus minor , Actinobacillus pleuropneumoniae , Haemophilus ducreyi , Haemophilus parasuis и Mannheimia haemolytica .

Молекулярные подписи в форме CSI также использовались для помощи в разрешении полифилетического распределения трех основных родов в семействе Pasteurellaceae: Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella . [5] [6] [7] Эти роды демонстрируют обширную полифилию в пределах семейства, однако было обнаружено, что CSI последовательно разделяются определенными видами, которые образуют монофилетическую группу в пределах каждого соответствующего рода. [5] Распределение CSI соответствует кладам sensu stricto «истинных» видов Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella соответственно. Поскольку они указывают на общее происхождение, было постулировано, что распределение CSI может быть использовано для определения идентичности рода, где виды, которые не разделяют CSI, могут быть переклассифицированы как другой род. Также были обнаружены CSI, которые являются специфичными для Aggregatibacter и Mannheimia , двух клинически значимых родов. [5]

Pasteurellales, наряду с Enterobacterales , являются одними из самых последних отделившихся порядков внутри Gammaproteobacteria . [8] Их отличие от всех других порядков подтверждается наличием нескольких консервативных сигнатурных белков (CSP), которые являются общими для этих двух порядков и отсутствуют у всех других бактерий. [8] Pasteurellales также разделяют дополнительные CSP с Enterobacterales, Vibrionales , Aeromonadales и Alteromonadales , что добавляет дополнительное разрешение их эволюционному ветвлению и филогенетическому положению среди большого класса Gammaproteobacteria. [8]

Этимология

Эта таксономическая группа бактерий была названа в честь Луи Пастера , название было официально принято в 1981 году. Обозначение было задумано для того, чтобы охватить коллекцию грамотрицательных организмов, в настоящее время представляющих 34 рода и 105 видов, описываемых как «специализированные комменсалы, в первую очередь и потенциальные патогены позвоночных, в основном млекопитающих и птиц». [9]

Ссылки

  1. ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономия рода Caviibacterium Adhikary et al. 2018». doi :10.1601/tx.31260 (неактивен 2024-04-17). {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка )
  2. ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономия рода Conservatibacter Adhikary et al. 2018». doi :10.1601/tx.31262 (неактивен 2024-04-17). {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка )
  3. ^ Кокотович, Бранко; Фриис, Нильс Ф; Аренс, Питер (2007). «Mycoplasma alkalescens, обнаруженная при бронхоальвеолярном лаваже крупного рогатого скота в Дании». Acta Veterinaria Scandinavica . 49 (1): 2. дои : 10.1186/1751-0147-49-2 . ISSN  1751-0147. ПМЦ 1766361 . ПМИД  17204146. 
  4. ^ Naushad, HS; Gupta, RS (январь 2012). «Молекулярные подписи (консервативные индели) в последовательностях белков, которые специфичны для порядка Pasteurellales и отличают две его основные клады». Antonie van Leeuwenhoek . 101 (1): 105–24. doi :10.1007/s10482-011-9628-4. PMID  21830122. S2CID  15114511.
  5. ^ abc Naushad S, Adeolu M, Goel N, Khadka B, Al-Dahwi A, Gupta RS (2015). "Филогеномная и молекулярная демаркация основных членов полифилетических родов pasturellaceae actinobacillus, haemophilus и pasteurella". Int J Genom . 2015 : 198560. doi : 10.1155 /2015/198560 . PMC 4363679. PMID  25821780. 
  6. ^ Olsen I, Dewhirst FE, Paster BJ, Busse HJ (2005) Семейство I. Pasteurellaceae. В: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, изд. 2, т. 2, стр. 851–856. Ред. Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT Springer-: New York.
  7. ^ Dewhirst FE, Paster BJ, Olsen I, Fraser GJ (1992). «Филогения 54 репрезентативных штаммов видов семейства Pasteurellaceae, определенная путем сравнения последовательностей 16S рРНК». J Bacteriol . 174 (6): 2002–2013. doi : 10.1128 /jb.174.6.2002-2013.1992. PMC 205807. PMID  1548238. 
  8. ^ abc Gao B, Mohan R, Gupta RS (2009). «Филогеномика и белковые сигнатуры, объясняющие эволюционные связи между гаммапротеобактериями». Int J Syst Evol Microbiol . 59 (Pt 2): 234–247. doi : 10.1099/ijs.0.002741-0 . PMID  19196760.
  9. ^ Партин, Клайд (октябрь 2024 г.). «Этимология - Pasteurellaceae [пась-тəр-ə-ла'-се-и]». Экстренное заражение Dis . 30 (10). дои : 10.3201/eid3010.240735 . Проверено 2 октября 2024 г. цитирует текст, являющийся общественным достоянием, из CDC