Руководство Берджи по систематической бактериологии

Руководство по идентификации прокариотических организмов

«Руководство по систематической бактериологии» Берджи является основным ресурсом для определения идентичности прокариотических организмов с акцентом на виды бактерий и использованием всех характеризующих аспектов.

Руководство было опубликовано после « Руководства по детерминативной бактериологии» Берджи , хотя последнее до сих пор публикуется как руководство по идентификации неизвестных бактерий. ^[1] Впервые опубликованный в 1923 году Дэвидом Хендриксом Берджи , он используется для классификации бактерий на основе их структурных и функциональных признаков путем объединения их в определенные семейные порядки. Однако в последние годы этот процесс стал более эмпирическим . ^[2]

« Таксономический обзор бактерий и архей» представляет собой производную публикацию, индексирующую названия таксонов из второй версии руководства. ^[3] До сентября 2018 года он был доступен бесплатно на веб-сайте доверия Берги. ^[4] Университет штата Мичиган предоставляет альтернативную версию, которая индексирует записи NamesforLife. ^[5]

Пятитомный BMSB официально заменен « Руководством по систематике архей и бактерий» Берги (BMSAB), постоянно обновляемой онлайн-книгой с 2015 года. ^[6]

Организация

Изменение объема, установленного на « Систематическую бактериологию », произошло в новом контракте в 1980 году, после чего новый стиль включал «отношения между организмами» и имел «расширенный объем» в целом. Этот новый стиль был использован для четырехтомного набора ^[7] , который впервые начал публиковаться в 1984 году. Информация в томах была разделена следующим образом:

Том 1 включал информацию обо всех типах грамотрицательных бактерий , которые считались имеющими «медицинское и промышленное значение». Во второй том включена информация обо всех видах грамположительных бактерий . Том 3 посвящен всем оставшимся, немного отличающимся грамотрицательным бактериям, а также археям . В четвертом томе содержатся сведения о нитчатых актиномицетах и ​​других подобных бактериях. ^[8]

Текущие тома радикально отличаются от предыдущих томов тем, что многие высшие таксоны определяются не с точки зрения фенотипа, а исключительно на основе 16S-филогении, как в случае с классами внутри Proteobacteria. ^[9]

Текущая группировка:

• Том 1 (2001): Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии ^[10]
• Том 2 (2005 г.): Протеобактерии - разделен на три книги:
  • 2А: Вступительные эссе ^[9]
  • 2B: Гаммапротеобактерии ^[11]
  • 2C: Другие классы протеобактерий ^[12]
• Том 3 (2009): Фирмикуты ^[13]
• Том 4 (2011 г.): Bacteroidetes , Spirochaetes , Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria , Fibrobacteres , Fusobacteria , Dictyoglomi , Gemmatimonadetes , Lentisphaerae , Verrucomicrobia , Chlamydiae и Planctomycetes ^[14]
• Том 5 (в двух частях) (2012): Актинобактерии ^[15]

Ручной трест Берджи

Фонд Берджи был основан в 1936 году для поддержки публикации Руководства Берджи по детерминативной бактериологии и дополнительных справочных материалов. Фонд также отмечает лиц, внесших выдающийся вклад в систематику бактерий, путем вручения Премии Берджи и медали Берджи, при совместной поддержке средств Фонда и Springer, издателей Руководства.

Bergey's Manual Trust и John Wiley & Sons, Inc. совместно публикуют онлайн-энциклопедию «Руководство Берги по систематике архей и бактерий» (BMSAB). В 2019 году Траст решил включить филогеномику в BMSAB, используя классификацию, предоставленную Базой данных таксономии генома (GTDB). ^[16]

Критический прием

В « Анналах внутренней медицины» эти тома описаны как «ясно написанные, точные и легко читаемые» и «предназначенные специально для тех, кто интересуется таксономией». ^[17]

Издания

Руководство Берджи по детерминативной бактериологии

• Берги, Д.Х., Харрисон, ФК, Брид, Р.С., Хаммер, Б.В. и Хантун, FM (ред., 1923). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 1-е изд., The Williams & Wilkins Co, Балтимор, 442 стр.
• Берги, Д.Х., Харрисон, ФК, Брид, Р.С., Хаммер, Б.В. и Хантун, FM (ред., 1925). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 2-е изд., The Williams & Wilkins Co, Балтимор, 462 стр.
• Берги, Д.Х., Харрисон, ФК, Брид, Р.С., Хаммер, Б.В. и Хантун, FM (ред., 1930). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 3-е издание, The Williams and Wilkins Co., Балтимор, 589 стр.
• Берги, Д.Х., Брид, Р.С., Хаммер, Б.В., Хантун, Ф.М., Мюррей, EGD и Харрисон, ФК (ред., 1934). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 4-е изд., The Williams & Wilkins Co, Балтимор.
• Берджи, Д.Х., Брид, Р.С., Мюррей, EGD и Хитченс, AP (ред., 1939). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 5-е изд., The Williams and Wilkins Co., Балтимор.
• Брид, Р.С., Мюррей, EGD и Хитченс, AP (ред., 1948). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 6-е изд., The Williams and Wilkins Co., Балтимор, [1].
• Брид, Р.С., Мюррей, EGD и Смит, Н.Р. (ред., 1957). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 7-е изд., The Williams and Wilkins Co., Балтимор, [2].
• Бьюкенен, Р.Э. и Гиббонс, Н.Р. (ред., 1974). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 8-е изд., Williams & Wilkins. Балтимор.
• Холт, Джон Г. (ред., 1994). Руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 9-е изд., Williams & Wilkins. Балтимор. ISBN  978-0683006032 .

Руководство Берджи по систематической бактериологии, 1-е изд.

• Криг, Н.Р. и Холт, Дж.Г. (ред., 1984). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 1-е изд., том. 1, Уильямс и Уилкинс, Балтимор.
• Снит, PHA, Мэйр, Н.С., Шарп, М.Э. и Холт, Дж.Г. (ред., 1986). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 1-е изд., том. 2, Уильямс и Уилкинс, Балтимор.
• Стейли, Дж.Т., Брайант, член парламента, Пфенниг, Н. и Холт, Дж.Г. (ред., 1989). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 1-е изд., том. 3, Уильямс и Уилкинс, Балтимор.
• Уильямс, С.Т., Шарп, М.Э. и Холт, Дж.Г. (ред., 1989). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 1-е изд., том. 4, Уильямс и Уилкинс, Балтимор.

Руководство Берджи по систематической бактериологии, 2-е изд.

• Гэррити, ГМ, Бун, Д.Р. и Кастенхольц, Р.В. (ред., 2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 1, Спрингер-Верлаг, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк
• Бреннер, DJ, Криг, NR, Стейли, JT и Гаррити, GM (ред., 2005). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 2, части A, B и C, Springer-Verlag, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк.
• Вос, П., Гаррити, Г., Джонс, Д., Криг, Н.Р., Людвиг, В., Рейни, Ф.А., Шлейфер, К.-Х. и Уитмен, ВБ (ред., 2009 г.). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 3, Спрингер-Верлаг, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк.
• Криг Н.Р., Людвиг В., Уитмен В.Б., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Стейли Дж.Т., Уорд Н. и Браун Д. (ред., 2010). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 4, Спрингер-Верлаг, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк.
• Уитмен, В.Б., Гудфеллоу, М., Кемпфер, П., Буссе, Х.-Дж., Трухильо, М.Э., Людвиг, В. и Сузуки, К.-и. (ред., 2012). Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 5, части A и B, Springer-Verlag, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк.

Другой

• Бьюкенен, Р.Э., Холт, Дж.Г. и Лессел-младший, EF (1966). Индекс Бергеяна: аннотированный алфавитный список названий таксонов бактерий . The Williams and Wilkins Co., Балтимор, Мэриленд.
• Холт, Дж. Г. (ред., 1977). Краткое руководство Берджи по детерминативной бактериологии , 8-е изд., The Williams and Wilkins Co., Балтимор, Мэриленд.
• Гиббонс, Н.Е., Патти, К.Б. и Холт, Дж.Г. (ред., 1981). Дополнение к Индексу Бергеяна . The Williams and Wilkins Co., Балтимор, Мэриленд.
• Уитмен, ВБ; ДеВос, П.; Дедыш, С.; Хедлунд, Б.; Кемпфер, П.; Рейни, Ф.; Трухильо, Мэн; Боуман, JP; Браун, доктор медицинских наук; Глекнер, Ф.О.; Орен, А.; Пастер, Би Джей; Уэйд, В.; Уорд, Н.; Буссе, HJ; Рейзенбах, Ал., ред. (2015). Руководство Берджи по систематике архей и бактерий . Хобокен, Нью-Джерси: John Wiley & Sons. ISBN 9781118960608.

Рекомендации

1. Рецензия на книгу «Руководство Берги по систематической бактериологии» Int. Дж. Сист. Бакт.; Июль 1985 г., с. 408
2. История руководства. Архивировано 8 декабря 2008 г. в Wayback Machine.
3. Уитмен В.Б., изд. (2015). «Таксономический очерк бактерий и архей». Руководство Берджи по систематике архей и бактерий . дои : 10.1002/9781118960608.bm00024. ISBN 9781118960608.
4. Гаррити, генеральный директор; Уинтерс, М.; Куо, AW; Сирлз, Д.Б. (2001). Таксономический обзор прокариотов, версия 1.0. Руководство Берджи по систематической бактериологии (второе изд.). Нью-Йорк: Springer-Verlag. п. 320. Архивировано из оригинала 22 июля 2017 г.
5. Гаррити ГМ, Лилберн Т.Г., Коул-младший, Харрисон Ш., Юзеби Дж., Тиндалл Б.Дж. (2007). Лилберн Т., Харрисон С., Эзеби Дж., Тиндалл Б. (ред.). Таксономический обзор бактерий и архей, выпуск 7.7 . Попечительский совет Мичиганского государственного университета. дои : 10.1601/TOBA7.7 .
6. Уитмен В.Б., изд. (2015). Руководство Берджи по систематике архей и бактерий. дои : 10.1002/9781118960608. ISBN 9781118960608.
7. "Новый формат, имеющий расширенную сферу применения и изучающий взаимоотношения между организмами (систематика), называется " Руководство Берги по систематической бактериологии" . Работа над первым томом четырехтомной последовательности началась в 1980 году и была...", " Микробиология» Дэниела В. Лима, Кендалла Ханта, 2003 г.
8. «Руководства Берджи», Шила Шривастава « Понимание бактерий» , Springer, 2003, стр. 40
9. Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вводные эссе. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ИСБН 978-0-387-24143-2. Британская библиотека №. GBA561951.
10. Бун, Дэвид Р.; Кастенхольц, Ричард В. (18 мая 2001 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр. 721. ISBN. 978-0-387-98771-2. Британская библиотека №. GBA561951.
11. Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Гаммапротеобактерии. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 2Б (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 1108. ИСБН 978-0-387-24144-9. Британская библиотека №. GBA561951.
12. Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Протеобактерии. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 2С (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. стр. 1388. ISBN. 978-0-387-24145-6. Британская библиотека №. GBA561951.
13. Вос, П.; Гаррити, Дж.; Джонс, Д.; Криг, Северная Каролина; Людвиг, В.; Рейни, ФА; Шлейфер, К.-Х.; Уитмен, ВБ (15 сентября 2009 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Фирмикуты. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 3 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 1450. ИСБН 978-0-387-95041-9. Британская библиотека №. GBA561951.
14. Криг, Северная Каролина; Людвиг, В.; Уитмен, ВБ; Хедлунд, BP; Пастер, Би Джей; Стейли, Джей Ти; Уорд, Н.; Браун, Д.; Парте, А. (24 ноября 2010 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae и Planctomycetes. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 908. ИСБН 978-0-387-95042-6. Британская библиотека №. GBA561951.
15. Уитмен, ВБ; Гудфеллоу, М.; Кемпфер, П.; Буссе, Х.-Ж.; Трухильо, Мэн; Людвиг, В.; Сузуки, К.-и.; Парте, А. (29 января 2012 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Актинобактерии. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 1750. ISBN 978-0-387-95043-3. Британская библиотека №. GBA561951.
16. ДСМЗ (2019). «Последние новости. Включение филогеномики в BMSAB». Bergeys.org .
17. «Руководство Берджи по систематической бактериологии», Рецензии на книги, примечания и списки , Анналы внутренней медицины

Внешние ссылки

• Домашняя страница руководства Берджи по доверию
• Блок-схемы ручной идентификации Берги
• Информация о книге