stringtranslate.com

Импортин α

Импортин альфа , или кариоферин альфа, относится к классу адаптерных белков , которые участвуют в импорте белков в ядро ​​клетки . Они являются подсемейством белков кариоферина . [1]

Известно, что импортин α связывается с последовательностью сигнала ядерной локализации (NLS) ядерно-ориентированных белков. [2] После этого распознавания импортин α связывает белок с импортином β, который транспортирует содержащий NLS белок через ядерную оболочку к месту назначения. [3] Из-за их дополнительных функциональных взаимоотношений импортин α и импортин β часто называют гетеродимером импортина α/β, но они функционально разделены и обычно не существуют в сопряжении друг с другом, а только ассоциируются для процессов клеточного импорта, таким образом, белки импортина α представляют собой независимый класс адаптерных белков.

Структура

Импортин α — небольшой белок, состоящий из трех функционально различных доменов: домена IBB, домена ARM и домена связывания экспортина CAS. [3]

N-концевая область белков состоит из домена импортин-β-связывания, или IBB. Эта область белка отвечает за взаимодействие с импортином β. [3] Эта область была описана как серия из по меньшей мере 41 незаменимых аминокислотных остатков, в частности, позиций 10-50 белка. Было показано, что удаление одной из этих аминокислот снижает активность ядерного импорта примерно на 50%. Более крупные делеции коррелируют с еще большими потерями функции тройного импортного комплекса, состоящего из импортина α, импортина β и целевого белка. [4]

Большая часть белка импортина α состоит из серии из десяти тандемных повторов броненосца, или ARM. Централизованный домен ARM, состоящий из девяти повторов ARM, отвечает за регулирование связывания NLS для прямого взаимодействия с нацеленными на ядро ​​белками. [3] Эти повторы ARM распознают основные остатки, характерные для последовательностей NLS. Последовательности NLS могут быть однокомпонентными (один кластер основных аминокислот) или двухкомпонентными (два кластера основных аминокислот с линкерной последовательностью). Домен ARM содержит два сайта связывания внутри, что позволяет одной молекуле импортина α взаимодействовать с двумя однокомпонентными белками, содержащими NLS, или одним двухкомпонентным белком NLS. [5]

С-концевой домен импортина α, включающий десятый повтор ARM, отвечает за взаимодействие с экспортином CAS, другим белком кариоферина, который функционирует в рециркуляции импортина α из ядра обратно в цитоплазму клетки. Ассоциация этого домена связывания экспортина CAS зависит от Ran-GTP, а гидролиз GTP приводит к диссоциации импортина α из комплекса экспортина CAS-Ran. [3]

Связывание NLS с доменом ARM и, таким образом, формирование импортного комплекса регулируется доменом IBB импортина α. Домен IBB молекул импортина α содержит много основных аминокислотных остатков, подобных тем, которые встречаются в последовательностях NLS. [4] Это сходство в структуре приводит к способности домена IBB складываться внутрь и занимать сайты связывания NLS, когда нет молекулы импортина β, связанной с импортином α. Этот механизм автоингибирования не позволяет импортину α связывать белки, содержащие NLS, если только уже нет связанного импортина β, гарантируя, что связывание не произойдет до того, как будут доступны все необходимые механизмы импорта. [6] Из-за этого импортин α сам по себе имеет довольно низкое сродство к последовательностям NLS, а более высокое сродство к NLS наблюдается, когда присутствуют как импортин α, так и импортин β. [7]

Функции

Основная функция импортина α заключается в его роли в ядерном импорте белков, содержащих последовательность NLS. [2] Ядерный импорт через путь импортина α можно суммировать следующим шестишаговым циклом: [3]

  1. Повторы ARM свободного импортина α в цитоплазме связывают NLS ядерно-направленных белков, в то время как домен IBB одновременно присоединяется к белку импортина β, образуя тройной комплекс.
  2. Тройной комплекс связан в месте стыковки с ядерным поровым комплексом (NPC)
  3. Импортин β опосредует транспорт через ядерную оболочку
  4. Тройной комплекс диссоциирует из-за связывания импортина β с Ran-GTP
  5. Свободный импортин α образует экспортный комплекс вместе с экспортином CAS и Ran-GTP и транспортируется из ядра.
  6. ГТФ гидролизуется, и экспортный комплекс распадается, высвобождая свободный импортин α в цитоплазму.

Хотя этот процесс ядерного импорта составляет большую часть функциональной роли белков импортина α, было показано, что импортин α опосредует несколько других важных функций, включая гаметогенез, развитие, реакцию на тепловой шок, деградацию белка и инфицирование вирусным патогеном. [3] [8] [9] [10] [11] [12] [13] [14] [15] [16]

Было показано, что гаметогенез во многом зависит от белков импортина α несколькими различными способами. Животные модели с использованием Caenorhabditis elegans , Drosophila melanogaster и млекопитающих более высокого порядка показали, что импортин α в изобилии присутствует в развивающихся гаметах, а мутации, вызывающие функциональные изменения, могут привести к дефектам гамет и бесплодию. [3] [8] [10] [12] [13] В моделях крупного рогатого скота было показано, что нокаут генов, кодирующих импортин α, предотвращает развитие оплодотворенных эмбрионов до стадии бластоцисты, тем самым предотвращая правильное эмбриональное развитие и приводя к гибели организма. [11] Импортин α также участвует в развитии реакции на тепловой шок у эмбрионов Drosophila . [9] Кроме того, было показано, что импорт импортина α регулирует функцию протеазы, включая функцию Taspase1, деградатора белков лейкемии. [13]

В целом становится ясно, что белки импортина α абсолютно необходимы для правильного функционирования клеток, а мутации этих белков могут иметь множество катастрофических и потенциально смертельных последствий.

Роль в патогенности вирусов

Исследования связывают импортин α с распознаванием и импортом некоторых вирусных нуклеопротеинов, включая нуклеопротеины вируса гриппа А. [15] Было обнаружено, что вирус гриппа А получает доступ к этому механизму хозяина через последовательность, подобную NLS, по направлению к N-концу вирусного нуклеопротеина, который может быть распознан белками класса импортина α. Эта последовательность встречается в первых 20 аминокислотных позициях вирусного нуклеопротеина и содержит кластеры основных аминокислот, очень похожие на те, которые обнаруживаются в последовательностях NLS хозяина и домене импортина α IBB. Из-за этого структурного сходства вирусный нуклеопротеин гриппа А может импортироваться в ядро ​​своего хозяина и брать на себя репликационный аппарат для размножения. Известно, что вирус иммунодефицита обезьян (SIV) также использует путь импортина α через последовательность, подобную NLS. [16]

Ссылки

  1. ^ Кёлер, Маттиас; Шпек, Кристиан; Кристиансен, Маррет; Бишофф, Ф. Ральф; Прен, Зигфрид; Халлер, Герман; Герлих, Дирк; Хартманн, Энно (1 ноября 1999 г.). «Доказательства отчетливой субстратной специфичности членов семейства импортина α в импорте ядерного белка». Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7782–7791. doi :10.1128/MCB.19.11.7782. ISSN  0270-7306. PMC 84838.  PMID 10523667  .
  2. ^ ab Moroianu, J; Blobel, G; Radu, A (14 марта 1995 г.). «Ранее идентифицированный белок с неопределенной функцией — это кариоферин альфа, который вместе с кариоферином бета стыкуется с импортируемым субстратом в комплексах ядерных пор». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (6): 2008–2011. Bibcode : 1995PNAS...92.2008M. doi : 10.1073/pnas.92.6.2008 . ISSN  0027-8424. PMC 42412. PMID 7892216  . 
  3. ^ abcdefgh Голдфарб, Дэвид С.; Корбетт, Анита Х.; Мейсон, Д. Адам; Харреман, Мишель Т.; Адам, Стивен А. (2004). «Импортин α: многоцелевой ядерный транспортный рецептор». Trends in Cell Biology . 14 (9): 505–514. doi :10.1016/j.tcb.2004.07.016. PMID  15350979.
  4. ^ ab Görlich, D; Henklein, P; Laskey, RA; Hartmann, E (15 апреля 1996 г.). «Мотив из 41 аминокислоты в импортине-альфа обеспечивает связывание с импортином-бета и, следовательно, транзит в ядро». The EMBO Journal . 15 (8): 1810–1817. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00530.x. ISSN  0261-4189. PMC 450097 . PMID  8617226. 
  5. ^ Ланге, Эллисон; Миллс, Райан Э.; Ланге, Кристофер Дж.; Стюарт, Мюррей; Девайн, Скотт Э.; Корбетт, Анита Х. (23 февраля 2007 г.). «Классические сигналы ядерной локализации: определение, функция и взаимодействие с импортином α». Журнал биологической химии . 282 (8): 5101–5105. doi : 10.1074/jbc.R600026200 . ISSN  0021-9258. PMC 4502416. PMID 17170104  . 
  6. ^ Кобе, Бостьян (1 апреля 1999 г.). «Автоингибирование с помощью внутреннего сигнала ядерной локализации, выявленное кристаллической структурой импортина α млекопитающих». Nature Structural & Molecular Biology . 6 (4): 388–397. doi :10.1038/7625. ISSN  1072-8368. PMID  10201409. S2CID  20026752.
  7. ^ Moroianu, J; Blobel, G; Radu, A (25 июня 1996 г.). «Сайт связывания кариоферина альфа для кариоферина бета перекрывается последовательностью ядерной локализации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6572–6576. Bibcode : 1996PNAS...93.6572M. doi : 10.1073/pnas.93.13.6572 . ISSN  0027-8424. PMC 39066. PMID  8692858 . 
  8. ^ аб Джарре, Марианна; Тёрёк, Иштван; Шмитт, Рольф; Горьянач, Матьяш; Поцелуй, Иштван; Мехлер, Бернард М. (1 октября 2002 г.). «Закономерности экспрессии импортина-α во время сперматогенеза дрозофилы». Журнал структурной биологии . 140 (1–3): 279–290. дои : 10.1016/S1047-8477(02)00543-9. ПМИД  12490175.
  9. ^ ab Fang, Xiang-dong; Chen, Tianxin; Tran, Kim; Parker, Carl S. (1 сентября 2001 г.). «Регулирование развития реакции на тепловой шок ядерным транспортным фактором кариоферином-α3». Development . 128 (17): 3349–3358. doi : 10.1242/dev.128.17.3349 . ISSN  0950-1991. PMID  11546751.
  10. ^ ab Geles, KG; Adam, SA (15 мая 2001 г.). "Germline and developmental roles of the nuclear transport factor importin (α)3 in C. elegans". Development . 128 (10): 1817–1830. doi :10.1242/dev.128.10.1817. ISSN  0950-1991. PMID  11311162.
  11. ^ ab Tejomurtula, Jyothsna; Lee, Kyung-Bon; Tripurani, Swamy K.; Smith, George W.; Yao, Jianbo (1 августа 2009 г.). "Роль импортина альфа-8, нового члена семейства импортина альфа ядерных транспортных белков, в раннем эмбриональном развитии крупного рогатого скота". Biology of Reproduction . 81 (2): 333–342. doi : 10.1095/biolreprod.109.077396 . ISSN  0006-3363. PMID  19420384.
  12. ^ аб Ясухара, Норико; Ямагиси, Рёске; Арай, Ёсиюки; Мехмуд, Рашид; Кимото, Тихиро; Фудзита, Тошихару; Тома, Кеничи; Канеко, Азуми; Камикава, Ясунао (2013). «Подтипы импортина альфа определяют локализацию дифференциального транскрипционного фактора при поддержании эмбриональных стволовых клеток». Развивающая клетка . 26 (2): 123–135. дои : 10.1016/j.devcel.2013.06.022 . ПМИД  23906064.
  13. ^ abc Hogarth, Cathryn A.; Calanni, Sophina; Jans, David A.; Loveland, Kate L. (1 января 2006 г.). «Импортин α мРНК имеют различные профили экспрессии во время сперматогенеза». Developmental Dynamics . 235 (1): 253–262. doi : 10.1002/dvdy.20569 . ISSN  1097-0177. PMID  16261624. S2CID  86703945.
  14. ^ Бир, Кэролин; Кнауэр, Ширли К.; Доктер, Доминик; Шнайдер, Гюнтер; Кремер, Оливер Х.; Стаубер, Роланд Х. (1 июня 2011 г.). «Переключатель импортин-альфа/нуклеофосмин контролирует функцию протеазы таспазы 1». Трафик . 12 (6): 703–714. дои : 10.1111/j.1600-0854.2011.01191.x . ISSN  1600-0854. PMID  21418451. S2CID  205841729.
  15. ^ ab Wang, P.; Palese, P.; O'Neill, RE (1 марта 1997 г.). "Сайт связывания NPI-1/NPI-3 (кариоферин альфа) на нуклеопротеине вируса гриппа А NP является нетрадиционным сигналом ядерной локализации". Journal of Virology . 71 (3): 1850–1856. doi :10.1128/JVI.71.3.1850-1856.1997. ISSN  0022-538X. PMC 191255 . PMID  9032315. 
  16. ^ ab Singhal, Prabhat K.; Kumar, P. Rajendra; Rao, Malireddi RK Subba; Kyasani, Mahesh; Mahalingam, Sundarasamy (1 января 2006 г.). «Вирус иммунодефицита обезьян Vpx импортируется в ядро ​​через импортин альфа-зависимые и -независимые пути». Journal of Virology . 80 (1): 526–536. doi :10.1128/JVI.80.1.526-536.2006. ISSN  0022-538X. PMC 1317556 . PMID  16352576.