Бета-актин

Актин бета (сокращение ACTB / ACTB Комитета по номенклатуре генов HUGO ) является одной из шести различных изоформ актина , которые были идентифицированы у людей. Это один из двух актинов немышечного цитоскелета . Актины являются высококонсервативными белками ^[5]^[6] , которые участвуют в подвижности, структуре и целостности клеток. Альфа-актины являются основным компонентом сократительного аппарата. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что актин бета взаимодействует с SPTBN2 . ^[8]^[9] Кроме того, было обнаружено, что РНК-связывающий белок Sam68 взаимодействует с мРНК, кодирующей актин бета, который регулирует синаптическое образование дендритных шипиков с его цитоскелетными компонентами.

Было показано, что актин бета активирует eNOS , тем самым увеличивая выработку NO. Было показано, что мотив из восьми аминокислот (326-333) в eNOS опосредует взаимодействие между актином и eNOS. ^[10]

Клиническая значимость

Повторные мутации в этом гене были связаны со случаями диффузной В-крупноклеточной лимфомы . ^[11]

Приложения

Актин бета часто используется в вестерн-блоттинге в качестве контроля загрузки , чтобы нормализовать общее количество белка и проверить возможную деградацию белка в образцах. Его транскрипт также обычно используется в качестве стандарта гена домашнего хозяйства в qPCR . Его молекулярный вес составляет приблизительно 42 кДа. ^{[ необходима цитата ]}

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000075624 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029580 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых филаментов». Journal of Cell Science . 128 (11): 2009–2019. doi : 10.1242/jcs.165563 . PMID 25788699.
^ Ханукоглу И, Танезе Н, Фукс Э (февраль 1983 г.). «Комплементарная последовательность ДНК цитоплазматического актина человека. Межвидовая дивергенция 3'-некодирующих областей». Журнал молекулярной биологии . 163 (4): 673–8. doi :10.1016/0022-2836(83)90117-1. PMID 6842590.
^ "Ген Энтреза: актин ACTB, бета".
^ Mao B, Wu W, Li Y, Hoppe D, Stannek P, Glinka A, Niehrs C (май 2001 г.). «LDL-рецептор-связанный белок 6 является рецептором для белков Диккопфа». Nature . 411 (6835): 321–5. Bibcode :2001Natur.411..321M. doi :10.1038/35077108. PMID 11357136. S2CID 4323027.
^ Holleran EA, Ligon LA, Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (сентябрь 2001 г.). "beta III spectrin связывается с субъединицей Arp1 dynactin". The Journal of Biological Chemistry . 276 (39): 36598–605. doi : 10.1074/jbc.M104838200 . PMID 11461920.
^ Kondrikov D, Fonseca FV, Elms S, Fulton D, Black SM, Block ER, Su Y (февраль 2010 г.). «Связь бета-актина с эндотелиальной синтазой оксида азота модулирует образование оксида азота и супероксида ферментом». Журнал биологической химии . 285 (7): 4319–27. doi : 10.1074/jbc.M109.063172 . PMC 2836036. PMID 19946124.
^ Лор Дж.Г., Стоянов П., Лоуренс М.С., Оклер Д., Чапуи Б., Суньез С., Круз-Гордилло П., Кночел Б., Асманн Ю.В., Слагер С.Л., Новак А.Дж., Доган А., Анселл С.М., Линк Б.К., Зу Л., Гулд Дж. , Саксена Г, Странски Н, Ранхель-Эскареньо С, Фернандес-Лопес Х.К., Идальго-Миранда А., Мелендес-Зайгла Дж., Эрнандес-Лемус Е., Шварц-Круз и Селис А., Имаз-Росшандлер И., Охесина А.И., Юнг Дж., Педамаллу К.С., Ландер Э.С., Хаберманн Т.М., Серхан Дж.Р., Шипп М.А., Гетц Г., Голуб Т.Р. (март 2012 г.). «Обнаружение и определение приоритетов соматических мутаций при диффузной В-крупноклеточной лимфоме (DLBCL) методом секвенирования всего экзома». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (10): 3879–84. Bibcode : 2012PNAS ..109.3879L. doi : 10.1073/pnas.1121343109 . PMC 3309757. PMID 22343534 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека ACTB и страница с подробностями гена ACTB в браузере геномов UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P60709 (Actin, cytoplasmic 1) в PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Vandekerckhove J, Leavitt J, Kakunaga T, Weber K (1980). «Коэкспрессия мутантного бета-актина и двух нормальных бета- и гамма-цитоплазматических актинов в стабильно трансформированной линии клеток человека». Cell . 22 (3): 893–9. doi :10.1016/0092-8674(80)90566-8. PMID 6893954. S2CID 54299848.
Leavitt J, Gunning P, Porreca P, Ng SY, Lin CS, Kedes L (1984). «Молекулярное клонирование и характеристика мутантных и диких генов бета-актина человека». Молекулярная и клеточная биология . 4 (10): 1961–9. doi :10.1128/mcb.4.10.1961. PMC 369012. PMID 6095033.
Ng SY, Gunning P, Eddy R, Ponte P, Leavitt J, Shows T, Kedes L (1985). «Эволюция функционального гена бета-актина человека и его мультипсевдогенного семейства: сохранение некодирующих областей и хромосомная дисперсия псевдогенов». Молекулярная и клеточная биология . 5 (10): 2720–32. doi :10.1128/mcb.5.10.2720. PMC 367010. PMID 3837182.
Snásel J, Pichová I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Folia Biologica . 42 (5): 227–30. doi :10.1007/BF02818986. PMID 8997639. S2CID 7617882.
Gunning P, Weinberger R, Jeffrey P (апрель 1997 г.). «Изоформы актина и тропомиозина в морфогенезе». Анатомия и эмбриология . 195 (4): 311–5. doi :10.1007/s004290050050. PMID 9108196. S2CID 9692297.
Кимура Т., Хашимото И., Нишикава М., Фудзисава ДЖИ (1997). «Роль Rev в ассоциации мРНК gag ВИЧ-1 с экспрессией бета-актина цитоскелета и вирусного белка». Biochimie . 78 (11–12): 1075–80. doi :10.1016/S0300-9084(97)86732-6. PMID 9150887.
Szentirmay MN, Sawadogo M (май 2000). «Пространственная организация транскрипции РНК-полимеразы II в ядре». Nucleic Acids Research . 28 (10): 2019–25. doi :10.1093/nar/28.10.2019. PMC 105382. PMID 10773068 .
Anderson JL, Hope TJ (апрель 2004 г.). «Вспомогательные белки ВИЧ и выживание клетки-хозяина». Current HIV/AIDS Reports . 1 (1): 47–53. doi :10.1007/s11904-004-0007-x. PMID 16091223. S2CID 34731265.
Педерсон Т., Эби У. (ноябрь 2005 г.). «Ядерный актин расширяется, сокращения не наблюдается». Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5055–60. doi : 10.1091/mbc.E05-07-0656. PMC 1266405. PMID 16148048.
Perrin BJ, Ervasti JM (октябрь 2010 г.). «Семейство генов актина: функция следует за изоформой». Cytoskeleton . 67 (10): 630–4. doi :10.1002/cm.20475. PMC 2949686 . PMID 20737541.