stringtranslate.com

Локус β-глобина человека

Человеческий β-глобиновый локус состоит из пяти генов , расположенных на коротком участке хромосомы 11 , отвечающих за создание бета-частей (примерно половины) белка-переносчика кислорода гемоглобина . Этот локус содержит не только ген бета-глобина, но также дельта , гамма-A , гамма-G и эпсилон- глобин. Экспрессия всех этих генов контролируется областью контроля одного локуса (LCR), и гены дифференциально экспрессируются на протяжении всего развития. [1]

Порядок генов в кластере бета-глобина следующий: 5' - эпсилон – гамма-G – гамма-A – дельта – бета - 3'. [ необходима цитата ]

Расположение генов напрямую отражает временную дифференциацию их экспрессии во время развития, при этом версия гена на ранней эмбриональной стадии расположена ближе всего к LCR. Если гены перестроены, продукты генов экспрессируются на неправильных стадиях развития. [ необходима цитата ]

Экспрессия этих генов регулируется в эмбриональном эритропоэзе многими факторами транскрипции , включая KLF1 [2] , который связан с повышением уровня взрослого гемоглобина в зрелых дефинитивных эритроцитах , и KLF2 [3], который жизненно важен для экспрессии эмбрионального гемоглобина .

комплекс ГББ

Многие CRM были картированы в кластере генов, кодирующих β-подобные глобины, экспрессируемые в эмбриональных (HBE1), фетальных (HBG1 и HBG2) и взрослых (HBB и HBD) эритроидных клетках. Все они отмечены гиперчувствительными к ДНКазе I участками и следами , и многие связаны с GATA1 в эритробластах, полученных из периферической крови (PBDE). Сегмент ДНК, расположенный между генами HBG1 и HBD, является одним из сегментов ДНК, связанных с BCL11A и несколькими другими белками для негативной регуляции HBG1 и HBG2. Он чувствителен к ДНКазе I , но не сохраняется у млекопитающих . Энхансер, расположенный 3′ от гена HBG1, связан с несколькими белками в PBDE и клетках K562 и чувствителен к ДНКазе I, но почти не показывает сигнала для ограничения млекопитающих. [4]

Ссылки

  1. ^ Levings PP, Bungert J (март 2002). "The human beta-globin locus control region". European Journal of Biochemistry . 269 (6): 1589–99. doi : 10.1046/j.1432-1327.2002.02797.x . PMID  11895428.
  2. ^ Hodge D, Coghill E, Keys J, Maguire T, Hartmann B, McDowall A, Weiss M, Grimmond S, Perkins A (апрель 2006 г.). «Глобальная роль EKLF в окончательном и примитивном эритропоэзе». Blood . 107 (8): 3359–70. doi :10.1182/blood-2005-07-2888. PMC 1895762 . PMID  16380451. 
  3. ^ Basu P, Morris PE, Haar JL, Wani MA, Lingrel JB, Gaensler KM, Lloyd JA (октябрь 2005 г.). «KLF2 необходим для примитивного эритропоэза и регулирует гены человеческого и мышиного эмбрионального бета-глобина in vivo». Blood . 106 (7): 2566–2571. doi :10.1182/blood-2005-02-0674. PMC 1895257 . PMID  15947087. 
  4. ^ Келлис М., Уолд Б., Снайдер М.П., ​​Бернштейн Б.Е., Кундадже А., Маринов Г.К., Уорд Л.Д., Бирни Э., Кроуфорд Г.Э., Деккер Дж., Данхэм И., Ельницки Л.Л., Фарнем П.Дж., Фейнгольд Э.А., Герштейн М., Гиддингс М.К., Гилберт ДМ, Гингерас Т.Р., Грин ЭД, Гуйго Р., Хаббард Т., Кент Дж., Либ Дж.Д., Майерс Р.М., Пазин М.Дж., Рен Б., Стаматояннопулос Дж.А. , Венг З., Уайт К.П., Хардисон Р.К. (апрель 2014 г.). «Определение функциональных элементов ДНК в геноме человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (17): 6131–8. Бибкод : 2014PNAS..111.6131K. doi : 10.1073/pnas.1318948111 . PMC 4035993. PMID  24753594 . 

Дальнейшее чтение