stringtranslate.com

V-АТФаза

Вакуолярная АТФаза ( V-АТФаза ) — высококонсервативный эволюционно древний фермент с удивительно разнообразными функциями в эукариотических организмах. [1] V-АТФазы подкисляют широкий спектр внутриклеточных органелл и перекачивают протоны через плазматические мембраны многочисленных типов клеток. V-АТФазы соединяют энергию гидролиза АТФ с транспортом протонов через внутриклеточные и плазматические мембраны эукариотических клеток. Обычно ее рассматривают как полярную противоположность АТФ-синтазе, поскольку АТФ-синтаза — это протонный канал, который использует энергию из протонного градиента для производства АТФ. Однако V-АТФаза — это протонный насос, который использует энергию из гидролиза АТФ для производства протонного градиента.

Археотипная АТФаза ( А-АТФаза ) — это родственная группа АТФаз, обнаруженных в археях , которые часто работают как АТФ-синтаза . Она образует клад V/A-АТФазу с V-АТФазой. Большинство членов любой из групп перемещают протоны ( H+
), но некоторые члены эволюционировали, чтобы использовать ионы натрия ( Na+
) вместо.

Роли, которые играют V-АТФазы

V-АТФазы обнаружены в мембранах многих органелл, таких как эндосомы , лизосомы и секреторные везикулы, где они играют ряд ролей, имеющих решающее значение для функционирования этих органелл. Например, протонный градиент через вакуолярную мембрану дрожжей, создаваемый V-АТФазами, обеспечивает поглощение кальция в вакуоль через H+
/Калифорния2+
Система антипортера. [2] При синаптической передаче в нейрональных клетках V-АТФаза подкисляет синаптические пузырьки. [3] Норадреналин проникает в пузырьки с помощью V-АТФазы [ требуется ссылка ] .

V-АТФазы также обнаружены в плазматических мембранах самых разных клеток, таких как интеркалированные клетки почек , остеокласты (клетки, резорбирующие кость), макрофаги , нейтрофилы , сперматозоиды , клетки средней кишки насекомых и некоторые опухолевые клетки. [4] V-АТФазы плазматической мембраны участвуют в таких процессах, как гомеостаз pH , сопряженный транспорт и метастазирование опухолей . V-АТФазы в акросомальной мембране спермы подкисляют акросому . Это подкисление активирует протеазы, необходимые для бурения плазматической мембраны яйцеклетки . V-АТФазы в плазматической мембране остеокласта перекачивают протоны на поверхность кости, что необходимо для резорбции кости. В интеркалированных клетках почек V-АТФазы перекачивают протоны в мочу , обеспечивая реабсорбцию бикарбоната в кровь. Кроме того, другие разнообразные биологические процессы, такие как доставка токсинов, проникновение вирусов, мембранное нацеливание, апоптоз, регуляция цитоплазматического pH, протеолитический процесс и подкисление внутриклеточных систем, играют важную роль в V-АТФазах. [5]

V-АТФазы также играют важную роль в развитии морфогенеза клеток. Нарушение гена vma-1, который кодирует каталитическую субъединицу (A) фермента, серьезно ухудшает скорость роста, дифференциации и способность производить жизнеспособные споры у грибка Neurospora crassa. [6]

Структура

Лучше всего охарактеризована дрожжевая V-АТФаза. По крайней мере тринадцать субъединиц идентифицированы для формирования функционального комплекса V-АТФазы, состоящего из двух доменов. Субъединицы принадлежат либо к домену V o ( мембранно-ассоциированные субъединицы, строчные буквы на рисунке), либо к домену V 1 (периферически-ассоциированные субъединицы, заглавные буквы на рисунке).

V 1 включает восемь субъединиц, AH, с тремя копиями каталитических субъединиц A и B, тремя копиями статорных субъединиц E и G и одной копией регуляторных субъединиц C и H. Кроме того, домен V 1 также содержит субъединицы D и F, которые образуют центральную ось ротора. [7] Домен V 1 содержит тканеспецифические изоформы субъединиц, включая B, C, E и G. Мутации в изоформе B1 приводят к человеческому заболеванию дистальный почечный канальцевый ацидоз и сенсоневральная глухота.

Домен V o содержит шесть различных субъединиц, a, d, c, c', c", и e, причем стехиометрия кольца c все еще является предметом споров, поскольку для V-АТФазы табачного бражника ( Manduca sexta ) постулируется декамер. Домен V o млекопитающих содержит тканеспецифические изоформы для субъединиц a и d, в то время как V-АТФаза дрожжей содержит две органеллоспецифические изоформы субъединиц a, Vph1p и Stv1p. Мутации в изоформе a3 приводят к заболеванию человека — младенческому злокачественному остеопетрозу , а мутации в изоформе a4 приводят к дистальному почечному канальцевому ацидозу, в некоторых случаях с сенсоневральной глухотой.

Домен V 1 отвечает за гидролиз АТФ, тогда как домен V o отвечает за транслокацию протонов. Гидролиз АТФ в каталитических сайтах связывания нуклеотидов на субъединице A запускает вращение центрального стебля, состоящего из субъединиц D и F, который, в свою очередь, запускает вращение ствола субъединиц c относительно субъединицы a. Сложная структура V-АТФазы была выявлена ​​с помощью структуры комплексов M. Sexta и Yeast, которые были решены с помощью одночастичной крио-ЭМ и негативного окрашивания соответственно. [8] [9] [10] Эти структуры показали, что V-АТФаза имеет сеть из 3 статоров, связанных воротником плотности, образованным субъединицами C, H и a, которые, разделяя домены V 1 и V o , не взаимодействуют с центральной осью ротора, образованной субъединицами F, D и d. Вращение этой центральной оси ротора, вызванное гидролизом АТФ в каталитических доменах AB, приводит к движению ствола субъединиц c мимо субъединицы a, что приводит к транспорту протонов через мембрану. Джонсоном была предложена стехиометрия двух протонов, транслоцированных для каждого гидролизованного АТФ. [11]

В дополнение к структурным субъединицам дрожжевой V-АТФазы были идентифицированы ассоциированные белки, необходимые для сборки. Эти ассоциированные белки необходимы для сборки домена V o и называются Vma12p, Vma21p и Vma22p. [12] [13] [14] [15] Два из трех белков, Vma12p и Vma22p, образуют комплекс, который временно связывается с Vph1p (субъединица a), чтобы способствовать ее сборке и созреванию. [14] [16] [17] [18] Vma21p координирует сборку субъединиц V o , а также сопровождает домен V o в везикулы для транспортировки в аппарат Гольджи . [19]

В1

Домен V 1 V-АТФазы является местом гидролиза АТФ. В отличие от V o , домен V 1 является гидрофильным. [5] Этот растворимый домен состоит из гексамера чередующихся субъединиц A и B, центрального ротора D, периферических статоров G и E и регуляторных субъединиц C и H. Гидролиз АТФ приводит к конформационным изменениям в шести интерфейсах A|B и, следовательно, вращению центрального ротора D. В отличие от АТФ-синтазы, домен V 1 не является активной АТФазой при диссоциации.

Субъединица С

V-АТФаза (вакуолярная АТФаза) C представляет собой C-концевую субъединицу, которая является частью комплекса V1 и локализуется на границе между комплексами V1 и Vo. [21]

Функция субъединицы C

Субъединица C играет важную роль в контроле сборки V-АТФазы, выступая в качестве гибкого статора, который удерживает вместе каталитический (V1) и мембранный (VO) секторы фермента. [22] Высвобождение субъединицы C из комплекса АТФазы приводит к диссоциации субкомплексов V1 и Vo, что является важным механизмом в контроле активности V-АТФазы в клетках . По сути, создавая высокий электрохимический градиент и низкий pH, это дает ферменту возможность создавать больше АТФ.

Субъединицы E, G

Эти связанные субъединицы составляют стебель(и) A/V-АТФазы. Они важны для сборки и могут функционировать как толкатели в активности. E имеет колпачок для соединения с A/B, а G — нет. [20] Вероятно, они произошли от одного белка путем дупликации гена . [23]

Субъединица H

Субъединица H участвует только в активности, а не в сборке. Эта субъединица также действует как ингибитор свободных субъединиц V1; она останавливает гидролиз АТФ, когда V1 и Vo диссоциируют. [24]

Во

Домен V o отвечает за транслокацию протонов. В отличие от синтазы АТФ F-типа , домен V o обычно транспортирует протоны против их собственного градиента концентрации. Вращение домена V o транспортирует протоны в движении, скоординированном с доменом V 1 , который отвечает за гидролиз АТФ. Домен V o является гидрофобным и состоит из нескольких диссоциируемых субъединиц. [5] Эти субъединицы присутствуют в домене V o , делая его функциональной транслоказой протонов; они описаны ниже.

Субъединица а/I

Субъединица 116kDa (или субъединица a) и субъединица I находятся в комплексе Vo или Ao V- или A-АТФазы соответственно. Субъединица 116kDa представляет собой трансмембранный гликопротеин, необходимый для сборки и протонной транспортной активности комплекса АТФазы. Существует несколько изоформ субъединицы 116kDa, что обеспечивает потенциальную роль в дифференциальном нацеливании и регуляции V-АТФазы для определенных органелл.

Функция субъединицы 116 кДа не определена, но ее предполагаемая структура состоит из 6–8 трансмембранных секторов, что позволяет предположить, что она может функционировать аналогично субъединице a FO.

Субъединица d/C

Субъединица d в ​​V-АТФазах, называемая субъединицей C в A-АТФазах, является частью комплекса Vo. Они помещаются в середину кольца c, поэтому считаются функционирующими как ротор. У эукариот существуют две версии этой субъединицы, d/d1 и d2. [25]

У млекопитающих d1 ( ATP6V0D1 ) является повсеместно экспрессируемой версией, а d2 ( ATP6V0D2 ) экспрессируется только в определенных типах клеток. [25]

Субъединица c

Подобно АТФ-синтазе F-типа, трансмембранная область V-АТФазы включает кольцо трансмембранных субъединиц, которые в первую очередь отвечают за транслокацию протонов. Однако, в отличие от АТФ-синтазы F-типа, V-АТФаза имеет несколько связанных субъединиц в c-кольце; у грибов, таких как дрожжи, есть три связанных субъединицы (с различной стехиометрией), а у большинства других эукариот их две.

Сборка V-АТФазы

Дрожжевые V-АТФазы не собираются, если какой-либо из генов, кодирующих субъединицы, удален, за исключением субъединиц H и c". [26] [27] [28] Без субъединицы H собранная V-АТФаза неактивна, [13] [29] а потеря субъединицы c" приводит к рассоединению ферментативной активности. [27]

Точные механизмы, посредством которых собирается V-АТФаза, все еще остаются спорными, с доказательствами, предполагающими две различные возможности. Мутационный анализ и анализы in vitro показали, что предварительно собранные домены V o и V 1 могут объединяться, образуя один комплекс в процессе, называемом независимой сборкой. Поддержка независимой сборки включает выводы о том, что собранный домен V o может быть обнаружен в вакуоли при отсутствии домена V 1 , тогда как свободные домены V 1 могут быть обнаружены в цитоплазме , а не в вакуоли . [30] [31] Напротив, эксперименты с импульсным преследованием in vivo выявили ранние взаимодействия между субъединицами V o и V 1 , а именно субъединицами a и B, что предполагает, что субъединицы добавляются поэтапно, образуя единый комплекс в согласованном процессе сборки. [32]

Эволюция V-АТФазы

Относительно новая техника, называемая воскрешением предкового гена, пролила новый свет на эволюционную историю V-АТФазы. Было показано, как структура V-АТФазы предковой формы, состоящая из двух различных белков, эволюционирует в версию грибов с тремя различными белками. [33] [34] [35] АТФаза V-типа похожа на архейную (так называемую) АТФ-синтазу А-типа, факт, который подтверждает архейное происхождение эукариот (как гипотеза эоцитов , см. также Lokiarchaeota ). Исключительное возникновение некоторых линий архей с F-типом и некоторых линий бактерий с A-типом АТФазы соответственно рассматривается как результат горизонтального переноса генов . [36]

Регуляция активности V-АТФазы

Известно, что V-АТФазы специфически ингибируются макролидными антибиотиками, такими как конканамицин (CCA) и балифомицин A 1 . [37] In vivo регуляция активности V-АТФазы осуществляется путем обратимой диссоциации домена V 1 от домена V o . После первоначальной сборки как насекомые Manduca sexta , так и дрожжевые V-АТФазы могут обратимо разбираться на свободные домены V o и V 1 после 2-5-минутной депривации глюкозы. [30] Обратимая разборка может быть общим механизмом регуляции активности V-АТФазы, поскольку она существует у дрожжей и насекомых. Предполагается, что повторная сборка может осуществляться с помощью комплекса, называемого RAVE (регулятор H+
-АТФаза вакуолярных и эндосомальных мембран). [38] Разборка и повторная сборка V-АТФаз не требует синтеза нового белка, но требует неповрежденной сети микротрубочек . [39]

Болезни человека

Остеопетроз

Остеопетроз — это общее название, которое представляет собой группу наследственных состояний, при которых наблюдается дефект остеокластической резорбции кости . У людей встречается как доминантный, так и рецессивный остеопетроз. [40] [41] Аутосомно-доминантный остеопетроз проявляется легкими симптомами у взрослых, испытывающих частые переломы костей из-за хрупкости костей. [40] Более тяжелая форма остеопетроза называется аутосомно-рецессивным инфантильным злокачественным остеопетрозом. [41] [42] [43] Были идентифицированы три гена, которые отвечают за рецессивный остеопетроз у людей. Все они напрямую участвуют в путях генерации и секреции протонов, которые необходимы для резорбции кости. Один ген — карбоангидраза II (CAII), который при мутации вызывает остеопетроз с почечным канальцевым ацидозом (тип 3). [44] Мутации гена хлоридного канала ClC7 также приводят как к доминантному, так и к рецессивному остеопетрозу. [40] Примерно у 50% пациентов с рецессивным младенческим злокачественным остеопетрозом имеются мутации в изоформе субъединицы a3 V-АТФазы. [42] [45] [46] У людей было выявлено 26 мутаций в изоформе субъединицы V-АТФазы a3, обнаруженной в остеокластах, которые приводят к заболеванию костей аутосомно-рецессивному остеопетрозу. [42] [41] [45] [47]

Дистальный почечный канальцевый ацидоз (дРТА)

Важность активности V-АТФазы в секреции протонов в почках подчеркивается наследственным заболеванием дистальным почечным канальцевым ацидозом . Во всех случаях почечный канальцевый ацидоз является результатом нарушения нормальных почечных механизмов, которые регулируют системный pH. Существует четыре типа почечного канальцевого ацидоза. Тип 1 — дистальный почечный канальцевый ацидоз, который является результатом неспособности кортикального собирательного протока подкислять мочу ниже pH 5. [48] У некоторых пациентов с аутосомно-рецессивным dRTA также наблюдается сенсоневральная потеря слуха . [49] Наследование этого типа RTA является результатом либо мутаций в изоформе B1 субъединицы V-АТФазы или изоформе a4, либо мутаций полосы 3 (также называемой AE1), обменника Cl-/HCO3-. [49] [50] [51] Двенадцать различных мутаций в изоформе B1 V-АТФазы [52] и двадцать четыре различных мутации в a4 приводят к dRTA. [52] [49] Исследования полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией показали экспрессию субъединицы a4 в интеркалированной клетке почки и в улитке . [52] dRTA, вызванный мутациями в гене субъединицы a4, в некоторых случаях может быть связан с глухотой из-за неспособности нормально подкислять эндолимфу внутреннего уха . [ 51]

Х-сцепленная миопатия с избыточной аутофагией (XMEA)

X-сцепленная миопатия с избыточной аутофагией — редкое генетическое заболевание, возникающее в результате мутаций в гене VMA21. [53] Заболевание начинается в детстве и приводит к медленно прогрессирующей мышечной слабости, обычно начинающейся в ногах, и некоторым пациентам в конечном итоге может потребоваться помощь в инвалидной коляске с возрастом. Белок Vma21 помогает в сборке V-АТФазы, а мутации, связанные с XMEA, приводят к снижению активности V-АТФазы и повышению лизосомального pH. [53]

Номенклатура

Термин V o имеет строчную букву "o" (а не цифру "ноль") в нижнем индексе. "o" обозначает олигомицин , который связывается с гомологичной областью в F-АТФазе . Стоит отметить, что обозначения человеческих генов в NCBI обозначают его как "ноль", а не букву "o". Например, ген человеческой субъединицы c Vo указан в базе данных генов NCBI как "ATP6V0C" (с нулем), а не "ATP6VOC" (с "o"). Во многих литературных источниках также делают эту ошибку.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Nelson N, Perzov N, Cohen A, Hagai K, Padler V, Nelson H (январь 2000 г.). «Клеточная биология генерации протон-движущей силы V-АТФазами». Журнал экспериментальной биологии . 203 (Pt 1): 89–95. doi :10.1242/jeb.203.1.89. PMID  10600677.
  2. ^ Ohya Y, Umemoto N, Tanida I, Ohta A, Iida H, Anraku Y (июль 1991 г.). «Чувствительные к кальцию cls-мутанты Saccharomyces cerevisiae, демонстрирующие фенотип Pet-, можно отнести к дефектам активности H(+)-АТФазы вакуолярной мембраны». Журнал биологической химии . 266 (21): 13971–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92798-5 . PMID  1830311.
  3. ^ Wienisch M, Klingauf J (август 2006 г.). «Везикулярные белки, экзоцитированные и впоследствии извлеченные путем компенсаторного эндоцитоза, неидентичны». Nature Neuroscience . 9 (8): 1019–27. doi :10.1038/nn1739. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E436-F . PMID  16845386. S2CID  12808314.
  4. ^ Izumi H, Torigoe T, Ishiguchi H, Uramoto H, Yoshida Y, Tanabe M, Ise T, Murakami T, Yoshida T, Nomoto M, Kohno K (декабрь 2003 г.). «Клеточные регуляторы pH: потенциально перспективные молекулярные мишени для химиотерапии рака». Cancer Treatment Reviews . 29 (6): 541–9. doi :10.1016/S0305-7372(03)00106-3. PMID  14585264.
  5. ^ abc Emma B, Forest O, Barry B (июнь 1997 г.). «Мутации pma-1, гена, кодирующего плазматическую мембранную H+АТФазу Neurospora crassa, подавляют ингибирование роста конканамицином A, специфическим ингибитором вакуолярных АТФаз». Журнал биологической химии . 272 ​​(23): 14776–14786. doi : 10.1074/jbc.272.23.14776 . PMID  9169444. S2CID  29865381.
  6. ^ Боуман, Э. Дж. и Боуман, Б. Дж. (2000). Клеточная роль V-АТФазы в Neurospora crassa: анализ мутантов, устойчивых к конканамицину или лишенных каталитической субъединицы A. Журнал экспериментальной биологии, 203 (Pt 1), 97–106.
  7. ^ Kitagawa N, Mazon H, Heck AJ, Wilkens S (февраль 2008 г.). «Стехиометрия периферических стебельных субъединиц E и G дрожжевой V1-АТФазы, определенная с помощью масс-спектрометрии». Журнал биологической химии . 283 (6): 3329–37. doi : 10.1074/jbc.M707924200 . PMID  18055462. S2CID  27627066.
  8. ^ Muench SP, Huss M, Song CF, Phillips C, Wieczorek H, Trinick J, Harrison MA (март 2009). «Криоэлектронная микроскопия вакуолярного мотора АТФазы выявляет его механическую и регуляторную сложность». Журнал молекулярной биологии . 386 (4): 989–99. doi :10.1016/j.jmb.2009.01.014. PMID  19244615.
  9. ^ Diepholz M, Börsch M, Böttcher B (октябрь 2008 г.). «Структурная организация V-АТФазы и ее влияние на регуляторную сборку и разборку». Biochemical Society Transactions . 36 (Pt 5): 1027–31. doi :10.1042/BST0361027. PMID  18793183. S2CID  23852611.
  10. ^ Zhang Z, Zheng Y, Mazon H, Milgrom E, Kitagawa N, Kish-Trier E, Heck AJ, Kane PM, Wilkens S (декабрь 2008 г.). «Структура дрожжевой вакуолярной АТФазы». Журнал биологической химии . 283 (51): 35983–95. doi : 10.1074/jbc.M805345200 . PMC 2602884. PMID  18955482 . 
  11. ^ Джонсон РГ, Бирс МФ, Скарпа А (сентябрь 1982 г.). «H+ АТФаза хромаффинных гранул. Кинетика, регуляция и стехиометрия». Журнал биологической химии . 257 (18): 10701–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)33879-1 . PMID  6213624.
  12. ^ Hirata R, Umemoto N, Ho MN, Ohya Y, Stevens TH, Anraku Y (январь 1993 г.). "VMA12 необходим для сборки субъединиц вакуолярной H(+)-АТФазы на вакуолярной мембране в Saccharomyces cerevisiae". Журнал биологической химии . 268 (2): 961–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)54027-8 . PMID  8419376.
  13. ^ ab Ho MN, Hirata R, Umemoto N, Ohya Y, Takatsuki A, Stevens TH, Anraku Y (август 1993 г.). "VMA13 кодирует 54-кДа вакуолярную субъединицу H(+)-АТФазы, необходимую для активности, но не сборки ферментного комплекса в Saccharomyces cerevisiae". Журнал биологической химии . 268 (24): 18286–92. doi : 10.1016/S0021-9258(17)46842-6 . PMID  8349704.
  14. ^ ab Hill KJ, Stevens TH (сентябрь 1994 г.). "Vma21p — это белок дрожжевой мембраны, удерживаемый в эндоплазматическом ретикулуме с помощью мотива дилизина и необходимый для сборки вакуолярного комплекса H(+)-АТФазы". Молекулярная биология клетки . 5 (9): 1039–50. doi :10.1091/mbc.5.9.1039. PMC 301125. PMID 7841520  . 
  15. ^ Jackson DD, Stevens TH (октябрь 1997 г.). «VMA12 кодирует белок эндоплазматического ретикулума дрожжей, необходимый для сборки вакуолярной H+-АТФазы». Журнал биологической химии . 272 ​​(41): 25928–34. doi : 10.1074/jbc.272.41.25928 . PMID  9325326. S2CID  38400074.
  16. ^ Hill KJ, Stevens TH (сентябрь 1995 г.). «Vma22p — это новый белок, ассоциированный с эндоплазматическим ретикулумом, необходимый для сборки комплекса дрожжевой вакуолярной H(+)-АТФазы». Журнал биологической химии . 270 (38): 22329–36. doi : 10.1074/jbc.270.38.22329 . PMID  7673216. S2CID  34639779.
  17. ^ Graham LA, Hill KJ, Stevens TH (июль 1998 г.). «Сборка дрожжевой вакуолярной H+-АТФазы происходит в эндоплазматическом ретикулуме и требует комплекса сборки Vma12p/Vma22p». The Journal of Cell Biology . 142 (1): 39–49. doi :10.1083/jcb.142.1.39. PMC 2133036 . PMID  9660861. 
  18. ^ Graham LA, Flannery AR, Stevens TH (август 2003 г.). «Структура и сборка дрожжевой V-АТФазы». Журнал биоэнергетики и биомембран . 35 (4): 301–12. doi :10.1023/A:1025772730586. PMID  14635776. S2CID  37806912.
  19. ^ Malkus P, Graham LA, Stevens TH, Schekman R (ноябрь 2004 г.). «Роль Vma21p в сборке и транспорте дрожжевой вакуолярной АТФазы». Молекулярная биология клетки . 15 (11): 5075–91. doi :10.1091/mbc.E04-06-0514. PMC 524777. PMID  15356264 . 
  20. ^ abc Stewart AG, Laming EM, Sobti M, Stock D (апрель 2014). "Вращающиеся АТФазы — динамические молекулярные машины". Current Opinion in Structural Biology . 25 : 40–8. doi : 10.1016/j.sbi.2013.11.013 . PMID  24878343.
  21. ^ Inoue T, Forgac M (июль 2005 г.). «Цистеин-опосредованное перекрестное связывание указывает на то, что субъединица C V-АТФазы находится в непосредственной близости от субъединиц E и G домена V1 и субъединицы a домена V0». Журнал биологической химии . 280 (30): 27896–903. doi : 10.1074/jbc.M504890200 . PMID  15951435. S2CID  23648833.
  22. ^ Drory O, Frolow F, Nelson N (декабрь 2004 г.). «Кристаллическая структура субъединицы C дрожжевой V-АТФазы раскрывает ее статорную функцию». EMBO Reports . 5 (12): 1148–52. doi :10.1038/sj.embor.7400294. PMC 1299189. PMID  15540116 . 
  23. ^ Имада К, Минамино Т, Учида Й, Киносита М, Намба К (март 2016 г.). «Взгляд на экспорт жгутиков типа III, выявленный сложной структурой АТФазы типа III и ее регулятора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (13): 3633–8. Bibcode : 2016PNAS..113.3633I. doi : 10.1073/pnas.1524025113 . PMC 4822572. PMID  26984495 . 
  24. ^ Jefferies KC, Forgac M (февраль 2008 г.). «Субъединица H вакуолярной (H+) АТФазы ингибирует гидролиз АТФ свободным доменом V1 путем взаимодействия с вращающейся субъединицей F». Журнал биологической химии . 283 (8): 4512–9. doi : 10.1074/jbc.M707144200 . PMC 2408380. PMID  18156183 . 
  25. ^ ab Toei M, Saum R, Forgac M (июнь 2010 г.). «Регулирование и изоформная функция V-АТФаз». Биохимия . 49 (23): 4715–23. doi :10.1021/bi100397s. PMC 2907102. PMID  20450191 . 
  26. ^ Forgac M (январь 1999). «Вакуолярная H+-АТФаза везикул, покрытых клатрином, обратимо ингибируется S-нитрозоглутатионом». Журнал биологической химии . 274 (3): 1301–5. doi : 10.1074/jbc.274.3.1301 . PMID  9880499. S2CID  21784089.
  27. ^ ab Whyteside G, Gibson L, Scott M, Finbow ME (июнь 2005 г.). «Сборка дрожжевой вакуолярной H+-АТФазы и гидролиз АТФ происходят в отсутствие субъединицы c». FEBS Letters . 579 (14): 2981–5. doi : 10.1016/j.febslet.2005.04.049 . PMID  15907326. S2CID  32086585.
  28. ^ Стивенс TH, Форгак M (1997). «Структура, функция и регуляция вакуолярной (H+)-АТФазы». Annual Review of Cell and Developmental Biology . 13 : 779–808. doi :10.1146/annurev.cellbio.13.1.779. PMID  9442887.
  29. ^ Parra KJ, Keenan KL, Kane PM (июль 2000 г.). «Субъединица H (Vma13p) дрожжевой V-АТФазы ингибирует активность АТФазы цитозольных комплексов V1». Журнал биологической химии . 275 (28): 21761–7. doi : 10.1074/jbc.M002305200 . PMID  10781598. S2CID  46127337.
  30. ^ ab Kane PM (июль 1995). «Разборка и повторная сборка дрожжевой вакуолярной H(+)-АТФазы in vivo». Журнал биологической химии . 270 (28): 17025–32. doi : 10.1016/S0021-9258(17)46944-4 . PMID  7622524.
  31. ^ Sumner JP, Dow JA, Earley FG, Klein U, Jäger D, Wieczorek H (март 1995). «Регуляция активности V-АТФазы плазматической мембраны путем диссоциации периферических субъединиц». Журнал биологической химии . 270 (10): 5649–53. doi : 10.1074/jbc.270.10.5649 . PMID  7890686. S2CID  38963775.
  32. ^ Kane PM, Tarsio M, Liu J (июнь 1999). «Ранние шаги в сборке дрожжевой вакуолярной H+-АТФазы». Журнал биологической химии . 274 (24): 17275–83. doi : 10.1074/jbc.274.24.17275 . PMID  10358087. S2CID  42610386.
  33. ^ Pearson H (9 января 2012 г.). «Воскрешение вымерших белков показывает, как эволюционирует машина». Блог Nature.com News .
  34. ^ Finnigan GC, Hanson-Smith V, Stevens TH, Thornton JW (январь 2012 г.). «Эволюция повышенной сложности в молекулярной машине». Nature . 481 (7381): 360–4. Bibcode :2012Natur.481..360F. doi :10.1038/nature10724. PMC 3979732 . PMID  22230956. 
  35. ^ Обзор молекулярной машины V-АТФазы: животные против грибов. Архивировано 28 апреля 2012 г. в Wayback Machine , Университет Орегона (дата обращения 11 января 2012 г.)
  36. ^ Hilario E, Gogarten JP (1993). «Горизонтальный перенос генов АТФазы — дерево жизни становится сетью жизни» (PDF) . Bio Systems . 31 (2–3): 111–9. doi :10.1016/0303-2647(93)90038-E. PMID  8155843.
  37. ^ Bowman EJ, O'Neill FJ, Bowman BJ (июнь 1997 г.). «Мутации pma-1, гена, кодирующего плазматическую мембранную H+-АТФазу Neurospora crassa, подавляют ингибирование роста конканамицином А, специфическим ингибитором вакуолярных АТФаз». Журнал биологической химии . 272 ​​(23): 14776–86. doi : 10.1074/jbc.272.23.14776 . PMID  9169444. S2CID  29865381.
  38. ^ Kane PM, Smardon AM (август 2003 г.). «Сборка и регуляция дрожжевой вакуолярной H+-АТФазы». Журнал биоэнергетики и биомембран . 35 (4): 313–21. doi :10.1023/A:1025724814656. PMID  14635777. S2CID  7535580.
  39. ^ Холлидей Л.С., Лу М., Ли Б.С., Нельсон Р.Д., Соливан С., Чжан Л., Глюк С.Л. (октябрь 2000 г.). «Аминоконцевой домен субъединицы В вакуолярной Н+-АТФазы содержит нитевидный сайт связывания актина». Журнал биологической химии . 275 (41): 32331–7. doi : 10.1074/jbc.M004795200 . PMID  10915794. S2CID  2601649.
  40. ^ abc Michigami T, Kageyama T, Satomura K, Shima M, Yamaoka K, Nakayama M, Ozono K (февраль 2002 г.). «Новые мутации в субъединице a3 вакуолярной H(+)-аденозинтрифосфатазы у японского пациента с инфантильным злокачественным остеопетрозом». Bone . 30 (2): 436–9. doi :10.1016/S8756-3282(01)00684-6. PMID  11856654.
  41. ^ abc Frattini A, Orchard PJ, Sobacchi C, Giliani S, Abinun M, Mattsson JP, Keeling DJ, Andersson AK, Wallbrandt P, Zecca L, Notarangelo LD, Vezzoni P, Villa A (июль 2000 г.). «Дефекты субъединицы TCIRG1 вакуолярного протонного насоса ответственны за подмножество аутосомно-рецессивного остеопетроза человека». Nature Genetics . 25 (3): 343–6. doi :10.1038/77131. PMID  10888887. S2CID  21316081.
  42. ^ abc Sobacchi C, Frattini A, Orchard P, Porras O, Tezcan I, Andolina M и др. (август 2001 г.). «Мутационный спектр злокачественного аутосомно-рецессивного остеопетроза у человека». Human Molecular Genetics . 10 (17): 1767–73. doi : 10.1093/hmg/10.17.1767 . PMID  11532986.
  43. ^ Fasth A, Porras O (1999). «Злокачественный остеопетроз человека: патофизиология, лечение и роль трансплантации костного мозга». Детская трансплантология . 3 (Приложение 1): 102–7. doi :10.1034/j.1399-3046.1999.00063.x. PMID  10587979. S2CID  31745272.
  44. ^ Sly WS, Hewett-Emmett D, Whyte MP, Yu YS, Tashian RE (май 1983 г.). «Дефицит карбоангидразы II, идентифицированный как первичный дефект при аутосомно-рецессивном синдроме остеопетроза с почечным канальцевым ацидозом и церебральной кальцификацией». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 80 (9): 2752–6. Bibcode : 1983PNAS...80.2752S. doi : 10.1073/pnas.80.9.2752 . PMC 393906. PMID  6405388 . 
  45. ^ ab Корнак У, Шульц А, Фридрих В, Ульхас С, Кременс Б, Войт Т, Хасан С, Боде Ю, Йенч Т.Дж., Кубиш С (август 2000 г.). «Мутации в субъединице а3 вакуолярной H (+)-АТФазы вызывают детский злокачественный остеопетроз». Молекулярная генетика человека . 9 (13): 2059–63. дои : 10.1093/hmg/13.09.2059 . ПМИД  10942435.
  46. ^ Фраттини А, Панграцио А, Сусани Л., Собакки С, Мироло М, Абинун М, Андолина М, Фланаган А, Хорвиц Э.М., Мичи Э., Нотаранджело Л.Д., Раменги Ю, Тети А., Ван Хов Дж., Вуйич Д., Янг Т., Альбертини А., Орчард П.Дж., Веццони П., Вилла А (октябрь 2003 г.). «Мутации хлоридного канала ClCN7 ответственны за тяжелый рецессивный, доминантный и промежуточный остеопетроз». Журнал исследований костей и минералов . 18 (10): 1740–7. дои : 10.1359/jbmr.2003.18.10.1740 . PMID  14584882. S2CID  20966489.
  47. ^ Сусани Л., Панграцио А., Собакки С., Таранта А., Мортье Г., Саварираян Р., Вилла А., Орчард П., Веццони П., Альбертини А., Фраттини А., Пагани Ф. (сентябрь 2004 г.). «TCIRG1-зависимый рецессивный остеопетроз: анализ мутаций, функциональная идентификация дефектов сплайсинга и спасение in vitro с помощью мяРНК U1». Человеческая мутация . 24 (3): 225–35. дои : 10.1002/humu.20076 . PMID  15300850. S2CID  31788054.
  48. ^ Alper SL (2002). «Генетические заболевания транспортеров кислот и оснований». Annual Review of Physiology . 64 : 899–923. doi :10.1146/annurev.physiol.64.092801.141759. PMID  11826292.
  49. ^ abc Karet FE, Finberg KE, Nelson RD, Nayir A, Mocan H, Sanjad SA и др. (январь 1999 г.). «Мутации в гене, кодирующем субъединицу B1 H+-АТФазы, вызывают почечный канальцевый ацидоз с нейросенсорной глухотой». Nature Genetics . 21 (1): 84–90. doi :10.1038/5022. PMID  9916796. S2CID  34262548.
  50. ^ Karet FE, Gainza FJ, Györy AZ, Unwin RJ, Wrong O, Tanner MJ и др. (май 1998 г.). «Мутации в гене хлорид-бикарбонатного обменника AE1 вызывают аутосомно-доминантный, но не аутосомно-рецессивный дистальный почечный канальцевый ацидоз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (11): 6337–42. Bibcode : 1998PNAS...95.6337K. doi : 10.1073/pnas.95.11.6337 . PMC 27686. PMID  9600966 . 
  51. ^ ab Stehberger PA, Schulz N, Finberg KE, Karet FE, Giebisch G, Lifton RP, Geibel JP, Wagner CA (декабрь 2003 г.). «Локализация и регуляция субъединицы вакуолярной H+-АТФазы ATP6V0A4 (a4), дефектной при наследственной форме дистального почечного канальцевого ацидоза». Журнал Американского общества нефрологии . 14 (12): 3027–38. doi : 10.1097/01.ASN.0000099375.74789.AB . PMID  14638902.
  52. ^ abc Stover EH, Borthwick KJ, Bavalia C, Eady N, Fritz DM, Rungroj N, et al. (Ноябрь 2002 г.). «Новые мутации ATP6V1B1 и ATP6V0A4 при аутосомно-рецессивном дистальном почечном канальцевом ацидозе с новыми доказательствами потери слуха». Журнал медицинской генетики . 39 (11): 796–803. doi :10.1136/jmg.39.11.796. PMC 1735017 . PMID  12414817. 
  53. ^ ab Ramachandran N, Munteanu I, Wang P, Ruggieri A, Rilstone JJ, Israelian N и др. (март 2013 г.). «Дефицит VMA21 предотвращает сборку вакуолярной АТФазы и вызывает аутофагическую вакуолярную миопатию». Acta Neuropathologica . 125 (3): 439–57. doi :10.1007/s00401-012-1073-6. PMID  23315026. S2CID  20528180.

Внешние ссылки