Биоинформатик
Авив Регев (родился 11 июля 1971 г.) [3] — компьютерный биолог и системный биолог, исполнительный вице-президент и руководитель отдела исследований и ранних разработок Genentech в Genentech/Roche. [4] Она является основным членом (в отпуске) в Институте Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда и профессором (в отпуске) на кафедре биологии Массачусетского технологического института . [5] Регев является пионером в области геномики одиночных клеток , а также в области вычислительной и системной биологии схем регуляции генов . Она основала и возглавляет проект «Атлас человеческих клеток» [6] вместе с Сарой Тейхманн .
Образование
Регев училась в Междисциплинарной программе Ади Лаутмана для выдающихся студентов Тель -Авивского университета , где защитила докторскую диссертацию под руководством Евы Яблонки [7] и Эхуда Шапиро . [8]
Карьера и исследования
В 2020 году Регев стал главой и исполнительным вице-президентом подразделения исследований и ранних разработок Genentech в Южном Сан-Франциско, а также членом расширенного корпоративного исполнительного комитета Roche. [9] [10] Ранее она была членом основного института (сейчас в отпуске), заведующим факультетом, директором-основателем Обсерватории клеток Клармана и содиректором программы клеточных цепей в Институте Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда. Она также была профессором кафедры биологии Массачусетского технологического института (сейчас в отпуске), а также исследователем в Медицинском институте Говарда Хьюза. Исследования Регева [11] включают работу по экспрессии генов [12] [13] (совместно с Эраном Сигалом и Дэвидом Ботштейном ) и использование π-исчисления для представления биохимических процессов. [14] [15] [16] Команда Регева была ведущим пионером экспериментальных и вычислительных методов геномики одиночных клеток. [17] В 2014 году она выдвинула идею создания Атласа клеток человека, [18] проекта по описанию всех типов клеток в организме человека . Регев основал Атлас клеток человека вместе с Сарой Тейхманн и коллегами со всего мира. [ нужна цитата ]
Геномика одиночных клеток
Лаборатория Регева стала пионером в разработке и применении многих ключевых экспериментальных и вычислительных достижений в области одноклеточной и пространственной геномики, особенно в области секвенирования одноклеточной РНК (scRNA-seq).
Награды и отличия
Регев является членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB) (2017 г.), [19] научным сотрудником Гельмгольца (2020 г.), [20] и членом Американской ассоциации исследований рака (AACR) (2021 г.). [21] Она является членом Национальной академии наук США (NAN, избрана в 2019 г.) [22] и Национальной медицинской академии США (NAM, избрана в 2020 г.). [23]
- 25-я премия L'Oréal-ЮНЕСКО «Для женщин в науке» (лауреат от Северной Америки), 2023 г. [24]
- Избран в Американскую академию искусств и наук в 2022 г. [25]
- Лекция Андерсона, Университет Вирджинии, 2022 г. [26]
- Премия Накасоне от научной программы Human Frontiers (2022 г.) [27]
- Почетный доктор ETH Zurich (2021 г.) [28]
- Премия Эрнста Шеринга (2021 г.) [29]
- Премия Джеймса в области интеграции науки и технологий, Национальная академия наук (2021 г.) [30]
- Премия Вандербильта (2021) [31]
- В 2020 году она была удостоена 25-й премии Кейо в области медицинских наук .
- Выдающаяся лекция Фонда AACR-Ирвинга Вайнштейна (2021 г.) [34]
- Премия Лурье Фонда НИЗ (FNIH) (2020) [35]
- Лекция Менделя, Европейское общество генетики человека (2020 г.) [36]
- Премия Джонатана Крафта от Массачусетской больницы общего профиля (2020 г.) [37]
- Премия FASEB за выдающиеся достижения в области науки для исследователей среднего звена (2019) [38]
- В 2019 году она была избрана членом Национальной академии наук ( НАН ).
- Она также входила в состав жюри премии Infosys в области наук о жизни в 2018 году.
- Лекция Weatherall, Оксфордский университет, Великобритания (2018 г.) [40]
- Лекция Харви, Общество Харви, Нью-Йорк (2018) [41]
- Лекция Маккормика, Стэнфордский университет (2018) [42]
- Премия Пола Маркса за исследования рака (2017). [43]
- Премия ISCB Innovator в 2017 году. [2] [44]
- Стипендиальная премия Эрла и Трессы Штадтман от Американского общества биохимии и молекулярной биологии (ASBMB) (2014 г.) [45]
- Карьерная премия Фонда Берроуза Велкома . [46]
- В 2008 году она также была награждена премией директора НИЗ «Пионер» . [47] [48]
- Регев был награжден премией Овертона в 2008 году за «выдающиеся достижения ученого на раннем и среднем этапе его или ее карьеры». [1]
Рекомендации
- ^ Аб Сансом, К.; Моррисон Маккей, Би Джей (2008). Борн, Филип Э. (ред.). «ISCB чтит Дэвида Хаусслера и Авива Регева». PLOS Вычислительная биология . 4 (7): e1000101. Бибкод : 2008PLSCB...4E0101S. дои : 10.1371/journal.pcbi.1000101 . ПМК 2536508 . ПМИД 18795145.
![Значок открытого доступа](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
- ^ Аб Фогг, Кристиана Н.; Ковац, Дайан Э.; Бергер, Бонни (2017). «Премия новатора ISCB 2017: Авив Регев». PLOS Вычислительная биология . 13 (6): e1005558. Бибкод : 2017PLSCB..13E5558F. дои : 10.1371/journal.pcbi.1005558 . ISSN 1553-7358. ПМЦ 5493285 . ПМИД 28665936.
![Значок открытого доступа](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
- ^ аб «Авив Регев» (PDF) . Broadinstitute.org . Архивировано из оригинала (PDF) 16 ноября 2017 года . Проверено 2 декабря 2021 г.
- ^ ИСПОЛНИТЕЛЬНЫЙ КОМИТЕТ GENENTECH, по состоянию на 6 августа 2020 г.
- ^ «Авив Регев в Массачусетском технологическом институте» . biology.mit.edu . Архивировано из оригинала 6 апреля 2017 года . Проверено 5 ноября 2017 г.
- ^ Новогродский, Анна (5 июля 2017 г.). «Как построить атлас клеток человека». Природа . 547 (7661): 24–26. Бибкод : 2017Natur.547...24N. дои : 10.1038/547024а . PMID 28682347. S2CID 211067156.
- ^ Регев, А.; Лэмб, MJ; Яблонка, Э. (1998). «Роль метилирования ДНК у беспозвоночных: регуляция развития или защита генома?». Молекулярная биология и эволюция . 15 (7): 880. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025992 . ISSN 0737-4038.
- ^ Регев, А.; Шапиро, Э. (2002). «Клеточные абстракции: ячейки как вычисления». Природа . 419 (6905): 343. Бибкод : 2002Natur.419..343R. дои : 10.1038/419343а. ПМЦ 3842595 . ПМИД 12353013.
![Значок закрытого доступа](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
- ↑ Тейлор, Ник Пол (11 мая 2020 г.). «Genentech переманивает Регева из Института Броуда, чтобы тот возглавил исследования и ранние разработки». www.fightbiotech.com . Проверено 25 мая 2020 г.
- ^ «Изменения в расширенном корпоративном исполнительном комитете Roche» (пресс-релиз). Базель, Швейцария: F. Hoffmann-La Roche Ltd. globalnewswire. 11 мая 2020 г. Проверено 25 мая 2020 г.
- ^ Результаты поиска автора Регева А на PubMed .
- ^ Сигал, Э.; Шапира, М.; Регев, А.; Пеер, Д.; Ботштейн, Д.; Коллер, Д.; Фридман, Н. (2003). «Сети модулей: идентификация регуляторных модулей и их регуляторов, зависящих от состояния, на основе данных об экспрессии генов». Природная генетика . 34 (2): 166–176. дои : 10.1038/ng1165. PMID 12740579. S2CID 6146032.
- ^ Сигал, Э.; Фридман, Н.; Коллер, Д.; Регев, А. (2004). «Карта модулей, показывающая условную активность модулей экспрессии при раке». Природная генетика . 36 (10): 1090–1098. дои : 10.1038/ng1434 . ПМК 2271138 . ПМИД 15448693.
![Значок закрытого доступа](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
- ^ Регев, А.; Сильверман, В.; Шапиро, Э. (2001). «Представление и моделирование биохимических процессов с использованием алгебры процессов пи-исчисления». Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 459–470. дои : 10.1142/9789814447362_0045. ISBN 978-981-02-4515-3. ПМИД 11262964.
- ^ Приами, К.; и другие. (2001). «Применение стохастического исчисления передачи имен для представления и моделирования молекулярных процессов» (PDF) . Письма об обработке информации . 80 : 25–31. дои : 10.1016/S0020-0190(01)00214-9.
![Значок закрытого доступа](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)
- ^ Исследование дает представление о регенеративном потенциале предстательной железы, News Medical, по состоянию на 4 мая 2020 г.
- ^ "Авив Регев". HHMI.org . Проверено 11 мая 2020 г.
- ^ Атлас клеток человека - Авив Регев , получено 30 мая 2022 г.
- ^ «Премия новатора ISCB 2017: Авив Регев» . www.iscb.org . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ "Мероприятие - Центр Гельмгольца в Мюнхене" . www.helmholtz-munich.de . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Авив Регев, доктор философии, FAACR | Научные награды | AACR» . Американская ассоциация исследований рака (AACR) . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ "Авив Регев". www.nasonline.org . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Национальная медицинская академия избирает 100 новых членов» . Национальная Медицинская Академия . 19 октября 2020 г. Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Познакомьтесь с лауреатами 25-й Международной премии L'Oréal-ЮНЕСКО «Для женщин в науке» | ЮНЕСКО» . www.unesco.org . Проверено 2 июня 2023 г.
- ^ «Новые участники». Американская академия искусств и наук . Проверено 30 мая 2022 г.
- ^ «Календарь событий».
- ^ «Пресс-релиз – Премия HFSP Накасоне 2022 года» .
- ^ телефон +41 61 387 33 00, Работа; контакты V-Card (vcf, 1кб) (22 ноября 2021). «Пионер в области биоинформатики получил степень почетного доктора ETH». bsse.ethz.ch. _ Проверено 18 марта 2022 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ «Премия Эрнста Шеринга 2021 – Фонд Шеринга» . Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ «Премия Джеймса в области интеграции науки и технологий». www.nasonline.org . Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ Снайдер, Билл. «Регев получает премию Вандербильта в области биомедицинских наук». Университет Вандербильта . Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ "Церемония награждения 25-й премии Кейо в области медицинских наук" . keio.ac.jp. _ Проверено 22 декабря 2020 г.
- ^ «Объявление о 25-й премии Кейо в области медицинских наук - Новости - Фонд медицинских наук Университета Кейо» . www.ms-fund.keio.ac.jp . Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ «Авив Регев, доктор философии, FAACR | Научные награды | AACR» . Американская ассоциация исследований рака (AACR) . Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ «Победитель премии FNIH Лурье 2020 года в области биомедицинских наук впервые разработал инновационные методы, которые прольют новый свет на здоровье человека | Фонд национальных институтов здравоохранения» . fnih.org . 18 июня 2020 г. Проверено 18 марта 2022 г.
- ^ Виммер, Дорис. «Авив Регев». Конференция ESHG 2020 . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ "Симпозиум премии Крафт" . Массачусетская больница общего профиля . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Предыдущие получатели». www.faseb.org . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Выборы НАН 2019» . nasonline.org . Проверено 30 апреля 2019 г.
- ^ "Лекции Weatherall - Институт молекулярной медицины MRC Weatherall" . www.imm.ox.ac.uk. _ Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Общество Харви: Серия 113, Лекция 5». harveysociety.org . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Авив Регев из MIT представит ежегодную лекцию Маккормика 1 февраля» . Центр новостей (на самоанском языке) . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «Лауреаты премии 2017 года». Мемориальный онкологический центр Слоана-Кеттеринга . Проверено 12 декабря 2017 г.
- ^ «9 февраля 2017 г.: ISCB объявляет лауреатов премии 2017 г.» . iscb.org . Проверено 10 февраля 2017 г. .
- ^ «Регев получил признание за строгую интеграцию экспериментальных и вычислительных подходов» . www.asbmb.org . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ Динамическая визуализация отдельных клеток прямого перепрограммирования выявляет раннее уточняющее событие - Природная биотехнология: Авив Регев, доктор философии. – Карьерные награды в Scientific Interface; Ab initio реконструкция транскриптомов, специфичных для типа клеток, у мышей выявляет консервативную мультиэкзонную структуру lincRNAs – Природная биотехнология: Авив Регев, доктор философии. – Карьерные награды в Scientific Interface.
- ^ «Три факультета выиграли премию NIH Pioneer Awards '08» . Новости Массачусетского технологического института | Массачусетский Институт Технологий . 22 сентября 2008 года . Проверено 6 марта 2022 г.
- ^ "Премия пионера директора НИЗ 2008" . Архивировано из оригинала 30 июля 2019 года . Проверено 30 июля 2019 г.