HLA-B-ассоциированный транскрипт 3

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Большой богатый пролином белок BAT3 — это белок , который у людей кодируется геном BAT3 . ^{[5] [6]}

Кластер генов , BAT1-BAT5, был локализован в непосредственной близости от генов TNF альфа и TNF бета. Все эти гены находятся в области III класса главного комплекса гистосовместимости человека . Белок, кодируемый этим геном, является ядерным белком . Он участвует в контроле апоптоза и регуляции белка теплового шока . Для этого гена описано три варианта альтернативного сплайсинга транскриптов . ^[6]

Ссылки

1. ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000204463, ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024392 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (апрель 1990 г.). «Пара генов из главного комплекса гистосовместимости человека кодирует большие белки, богатые пролином, с множественными повторяющимися мотивами и одним убиквитин-подобным доменом». Proc Natl Acad Sci USA . 87 (6): 2374–8. Bibcode :1990PNAS...87.2374B. doi : 10.1073/pnas.87.6.2374 . PMC 53689 . PMID  2156268. 
6. "Ген Entrez: транскрипт 3, ассоциированный с BAT3 HLA-B".

Дальнейшее чтение

• Такаяма С., Рид Дж. К. (2001). «Нацеливание и регулирование молекулярных шаперонов белками семейства BAG». Nat. Cell Biol . 3 (10): E237–41. doi :10.1038/ncb1001-e237. PMID  11584289. S2CID  24466133.
• Cross SJ, Tonks S, Trowsdale J, Campbell RD (1992). «Новое обнаружение полиморфизмов длины рестрикционных фрагментов в главном комплексе гистосовместимости человека». Иммуногенетика . 34 (6): 376–84. doi :10.1007/BF01787488. PMID  1684176. S2CID  29262131.
• Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (1989). «Главный комплекс гистосовместимости человека содержит минимум 19 генов между кластером комплемента и HLA-B». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (22): 8955–8. Bibcode :1989PNAS...86.8955S. doi : 10.1073/pnas.86.22.8955 . PMC  298409 . PMID  2813433.
• Spies T, Blanck G, Bresnahan M и др. (1989). «Новый кластер генов в главном комплексе гистосовместимости человека». Science . 243 (4888): 214–7. Bibcode :1989Sci...243..214S. doi :10.1126/science.2911734. PMID  2911734.
• Ozaki T, Hanaoka E, Naka M и др. (1999). «Клонирование и характеристика кДНК крысы BAT3». DNA Cell Biol . 18 (6): 503–12. doi :10.1089/104454999315222. PMID  10390159.
• Тресс К, Сонг Дж, Моримото РИ, Корнблут С (2001). «Обратимое ингибирование функции шаперона Hsp70 с помощью Scythe и Reaper». EMBO J . 20 (5): 1033–41. doi :10.1093/emboj/20.5.1033. PMC  145500 . PMID  11230127.
• Manchen ST, Hubberstey AV (2001). «Human Scythe содержит функциональную последовательность ядерной локализации и остается в ядре во время апоптоза, вызванного стауроспорином». Biochem. Biophys. Res. Commun . 287 (5): 1075–82. doi :10.1006/bbrc.2001.5701. PMID  11587531.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805–11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
• Xie T, Rowen L, Aguado B и др. (2004). «Анализ области III класса главного комплекса гистосовместимости с генной плотностью и ее сравнение с мышью». Genome Res . 13 (12): 2621–36. doi :10.1101/gr.1736803. PMC  403804. PMID  14656967 .
• Lehner B, Semple JI, Brown SE и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, закодированных в области MHC класса III человека». Genomics . 83 (1): 153–67. doi :10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID  14667819.
• Wu YH, Shih SF, Lin JY (2004). «Рицин запускает апоптотические морфологические изменения посредством расщепления BAT3 каспазой-3». J. Biol. Chem . 279 (18): 19264–75. doi : 10.1074/jbc.M307049200 . PMID  14960581.
• Lehner B, Sanderson CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации человеческой мРНК». Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC  442147. PMID  15231747 .
• Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC  442148. PMID  15231748 .
• Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Kumar R, Lutz W, Frank E, Im HJ (2004). «Немедленный ранний ген X-1 взаимодействует с белками, которые модулируют апоптоз». Biochem. Biophys. Res. Commun . 323 (4): 1293–8. doi :10.1016/j.bbrc.2004.09.006. PMC  2895269 . PMID  15451437.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M и др. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.