База данных частот аллелей STR человека Земли [ 1] — это научный проект, основанный на динамическом веб-интерфейсе и системе управления реляционными базами данных. Его основная цель — управление популяционными данными STR, полученными со всего мира, предоставление узкоспециализированных инструментов популяционной генетики, а также обзор генетической структуры мировой популяции в глобальном масштабе.
В основе подхода EHSTRAFD лежит тенденция стандартизации рецензируемых журналов при публикации популяционных данных [2] и, что наиболее важно, распределение градиента частот аллелей по обширным географическим территориям. [3] [4] [5]
Глобальное отслеживание частоты аллелей (AFGT) — позволяет искать распределение частоты аллелей на глобальном и региональном уровне. Локусы STR доступны в AFGT, если они зарегистрированы как минимум в десяти популяциях EHSTRAFD. Список локусов AFGT постоянно обновляется с каждым выпуском EHSTRAFD.
Частота регионального профиля (RPF) — позволяет рассчитать частоту генетического профиля на глобальном и региональном уровне на основе текущих записей EHSTRAFD. RPF доступен только для локусов ISSOL ( стандартный набор локусов Интерпола ), ESS (европейский стандартный набор — рекомендован ENFSI) и CODIS (комбинированная система индексации ДНК).
Наиболее вероятное географическое происхождение (MPGO) — позволяет искать наиболее вероятное географическое происхождение заданного генетического профиля STR. Географическое происхождение оценивается по частоте профиля в разных популяциях. MPGO доступен только для локусов ISSOL ( Interpol Standard Set Of Loci), ESS (European Standard Set — рекомендован ENFSI) и CODIS (Combined DNA Index System).