stringtranslate.com

Биолаборатории Новой Англии

New England Biolabs ( NEB ) — американская компания в области естественных наук , которая производит и поставляет рекомбинантные и нативные ферментные реагенты для исследований в области естественных наук. [2] Она также предоставляет продукты и услуги, поддерживающие редактирование генома , синтетическую биологию и секвенирование следующего поколения . [3] NEB также предоставляет бесплатный доступ к исследовательским инструментам, таким как REBASE , InBASE и Polbase .

О

Компания была основана в 1974 году Дональдом «Доном» Комбом, профессором Гарвардской медицинской школы , как совместная лаборатория опытных ученых и изначально производила рестриктазы в коммерческих масштабах. [4] Комб занимал должность генерального директора до 2005 года, когда в возрасте 78 лет он перешел из управления обратно в исследовательскую работу в фирме. [5]

В период с 2009 по 2013 год NEB получил около 1,7 млн ​​долларов США в виде грантов на исследования инноваций в малом бизнесе (SBIR) для этого исследования. [2]

NEB производит 230 рекомбинантных и 30 нативных рестриктаз для геномных исследований, а также никирующие ферменты и ДНК-метилазы. Он проводит исследования в областях, связанных с протеомикой , секвенированием ДНК и разработкой лекарств . Ученые NEB также проводят фундаментальные исследования в области молекулярной биологии и паразитологии . [2]

Компания имеет дочерние компании в Сингапуре , Канаде , Китае , Франции , Германии , Японии , Великобритании и Австралии, [2] [6] а также дистрибьюторов в Южной Америке , Австралии и других странах Европы и Азии . [7] Ее штаб-квартира находится в Ипсвиче, штат Массачусетс. Развитие нынешней штаб-квартиры началось в 2000 году и было завершено в 2005 году. [8] Дональд Комб был председателем и генеральным директором компании с момента ее основания в 1974 году до 2005 года. В 2005 году его сменил на посту генерального директора Джеймс Эллард, хотя Комб продолжал выполнять функции председателя совета директоров. В октябре 2020 года Комб скончался в возрасте 93 лет. [9] В штаб-квартире NEB работает более 450 человек. [10] Согласно политике компании, все ученые и некоторые руководители должны работать не менее одного дня в месяц на телефонной линии поддержки клиентов, отвечая на вопросы технической поддержки о продуктах компании. [2] В 2022 году Джим Эллард ушел с поста генерального директора, но остался председателем совета директоров. Его сменил Сальваторе (Сал) Расселло, ранее занимавший должность директора по OEM и индивидуальным решениям NEB. [11]

Сэр Ричард Джон Робертс является главным научным сотрудником компании. [2] [12] Он разделил Нобелевскую премию по физиологии и медицине 1993 года с Филиппом Алленом Шарпом за открытие интронов в эукариотической ДНК и механизма сплайсинга генов.

В 2015 году NEB взяла на себя обязательство создать производственный объект GMP недалеко от своей штаб-квартиры в Ипсвиче, штат Массачусетс, [13] и объект площадью 40 000 кв. футов был завершен в 2018 году. [14] Многопрофильный производственный объект Rowley Cleanroom производит продукцию класса GMP и имеет механический мезонин площадью 10 000 кв. футов. [15]

Приложения и инструменты

Лунные комплекты

В январе 2017 года компания NEB выпустила универсальные наборы Luna для количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени ( qPCR ) и количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией ( RT-qPCR ). [16] Наборы Luna используются для количественного определения ДНК или РНК. [16]

NEBСледующие продукты

В декабре 2017 года компания выпустила набор для подготовки библиотеки ДНК NEBNext Ultra II FS для секвенирования следующего поколения (NGS). [17] В октябре 2019 года NEB выпустила новый продукт для истощения РНК, набор для истощения глобина и рРНК NEBNext (человек/мышь/крыса) и набор для истощения рРНК NEBNext (бактерии). [18] Наборы предлагают специфическое истощение видов РНК, которые мешают анализу кодирующих и некодирующих РНК. [18] [19] В том же месяце компания анонсировала свое решение для прямого генотипирования NEBNext. [20] Продукт обеспечивает однодневный автоматизированный рабочий процесс генотипирования для различных приложений в сельскохозяйственной биотехнологии . [20]

В январе 2020 года NEB подписала соглашение с ERS Genomics Limited, которое предоставило NEB права на продажу инструментов и реагентов CRISPR/Cas9 , используемых для редактирования генов. [21]

Клонирование и синтетическая биология

Набор для клонирования и мастер-микс NEBuilder HiFi DNA Assembly Cloning Kit и Master Mix позволяют производить одношаговое клонирование и сборку нескольких фрагментов ДНК. Запатентованная ДНК-полимераза в ферментной смеси NEBuilder HiFi может собирать фрагменты ДНК размером от 100 п.н. до 19 к.н. NEB также предлагает мастер-микс Gibson Assembly. [22]

Очистка нуклеиновых кислот Монарха

NEB предоставляет наборы для очистки как ДНК, так и РНК. [23] [24] В мае 2019 года NEB выпустил набор для очистки геномной ДНК Monarch, который предназначен для минимизации загрязнения РНК и обеспечения высокоэффективной очистки крупных фрагментов ДНК. [23] Продукты для очистки нуклеиновых кислот NEB использовались в различных исследованиях, включая:

Ответ на COVID-19

Компания New England Biolabs разработала колориметрический анализ изотермической амплификации с петлевой опосредованностью (LAMP) для исследовательских целей. [29] [30] Этот анализ можно использовать для проверки наличия вируса путем обнаружения нуклеиновой кислоты, получая результаты всего за 30 минут. [29] В 2020 году метод LAMP был одним из нескольких молекулярных тестов, используемых для обнаружения РНК SARS-CoV-2 , штамма коронавируса, вызывающего COVID-19 . [31]

Наборы для выделения РНК также использовались для разработки анализов для обнаружения SARS-CoV-2. Набор Monarch Total RNA Miniprep Kit от NEB не был разработан специально для извлечения вирусной РНК, но он успешно использовался различными компаниями для извлечения вирусной РНК из биологических образцов. [32] NEB также выпустил дополнительный протокол для обработки слюны, буккальных мазков и образцов из носоглотки. [32]

В феврале 2021 года были выпущены три набора для секвенирования нового поколения для поддержки мониторинга SARS-CoV-2. Эти наборы, основанные на протоколах сети ARTIC, предоставляют информацию о передаче и эволюции вируса. [33]

В апреле 2021 года диагностический тест Color SARS-CoV-2 RT-LAMP с использованием реагентов New England Biolabs был одобрен для экстренного использования в Color Health Inc в Берлингейме, Калифорния. [34]

Базы данных

Компания управляет бесплатными научными базами данных. REBASE , база данных рестриктаз, содержит сведения о коммерческих и исследовательских эндонуклеазах. [35] В 2011 году компания основала Polbase, онлайн-базу данных, которая предоставляет информацию, в частности, о полимеразах. [36] [37] Еще одна бесплатная база данных NEB — InBase, база данных интеинов, которая включает реестр интеинов и информацию о каждом интеине. [35]

Партнерства

В 2001 году NEB стал соучредителем библиотеки морской ДНК Ocean Genome Legacy (OGL), которая, по данным Boston Globe , «каталогизирует образцы организмов со всего мира, чтобы предоставить их ученым для исследований». Хотя изначально библиотека располагалась в кампусе NEB, в 2014 году она переехала в кампус Нахант Северо-Восточного университета. [36] [37] [38] Чтобы обеспечить продажу своих реагентов в местах их использования, NEB создала цифровой интерфейс для морозильников с ферментами, которые будут использоваться на складах клиентов, в рамках партнерства с Ionia Corp. и Salesforce.com. Данные используются компанией как для логистики продаж, так и в рамках будущих исследований ферментов. [39] [40] Она также сотрудничает с Гарвардским университетом в рамках инициатив по переработке и утилизации, когда ее продукты и упаковка подходят к концу своего срока службы или жизненного цикла. [41] По состоянию на 2015 год у NEB также было дистрибьюторское соглашение с VWR . [3]

В июне 2019 года компании NEB, Waters и Genos объявили о совместной работе над проектом Human Glycome Project — глобальной инициативой по картированию структуры и функций человеческих гликанов . [42] NEB предоставит версию своей технологии Rapid PNGase F для улучшения подготовки образцов и повышения производительности процесса. [42]

В том же месяце NEB заключила партнерство с Bioz, Inc., компанией, занимающейся технологиями искусственного интеллекта, чтобы предоставить своим клиентам доступ к примерам реального применения ее продукции. [43]

Ссылки

Примечания

  1. ^ "В память о Дональде Г. Комбе, основателе New England Biolabs, Inc". New England Biolabs . Получено 5 октября 2020 г. .
  2. ^ abcdef Филиппидис, Алекс (15 марта 2013 г.). «New England Biolabs Looks Past Enzymes». Genetic Engineering & Biotechnology News . 33 (6): 08–09. doi :10.1089/gen.33.6.02 . Получено 8 июня 2016 г.
  3. ^ ab Staff (1 апреля 2015 г.). "Новости: Продукты и услуги". Genetic Engineering & Biotechnology News (Paper). 35 (7): 8. doi :10.1089/gen.35.21.05.
  4. Автор, Джули Манганис Сотрудники (13 октября 2020 г.). "Основатель New England Biolabs умер в возрасте 93 лет". Salem News . Получено 2023-02-03 .
  5. Эллис, Сэм (7 августа 2005 г.). «Морской квест». The Berkshire Eagle . стр. A6 . Получено 24 января 2023 г. – через Newspapers.com.
  6. ^ "New England Biolabs, Inc. открывает восьмую дочернюю компанию в Австралии". Biospace . Получено 20 февраля 2020 г. .
  7. ^ "Обзор компании New England BioLabs". Business Week. Архивировано из оригинала 1 ноября 2009 г. Получено 7 мая 2014 г.
  8. Билл Арчамбо (27 ноября 2000 г.). «Фирма планирует проект стоимостью 70 млн долларов в «великом поместье» Ипсвича». Boston Business Journal . Получено 7 мая 2014 г.
  9. ^ Хагерти, Джеймс Р. (30 октября 2020 г.). «Дональд Комб создал инструменты для сплайсинга генов». The Wall Street Journal . Получено 30 октября 2020 г.
  10. ^ «Reforest the Tropics и New England Biolabs, Inc. заключили соглашение о посадке 100 гектаров леса для компенсации выбросов углерода» (пресс-релиз). 15 августа 2019 г.
  11. ^ "New England Biolabs: Джим Эллард, Сэл Расселло". GenomeWeb . 2022-07-07 . Получено 2023-01-25 .
  12. Майкл Хикенс (24 апреля 2014 г.). «Утренняя загрузка: технологические гиганты действуют, чтобы остановить «следующее кровотечение»». Wall Street Journal.
  13. Сотрудники (12 июня 2015 г.). «New England Biolabs объявляет о планах по производству по стандарту GMP». Фармацевтическая обработка .
  14. ^ «Система охлаждения процесса экономит воду и энергию в New England BioLabs». HPAC Engineering . 2 мая 2018 г.
  15. ^ "New England Biolabs, Inc". Колумбия . Получено 3 февраля 2020 г.
  16. ^ ab "Универсальные наборы, оптимизированные для количественного определения ДНК и РНК". Clinical Lab Products . 3 января 2017 г. Получено 18.02.2020 .
  17. ^ "New England Biolabs выпускает набор для подготовки к секвенированию нового поколения". Clinical Lab Products . 20 декабря 2017 г. Получено 25.02.2020 .
  18. ^ ab "Bio-IT World". www.bio-itworld.com . Получено 2020-03-12 .
  19. ^ "New England Biolabs помогает исследователям решать проблемы транскриптомики бактерий и крови". Журнал Scientist . Получено 25.03.2020 .
  20. ^ ab "New England Biolabs запускает решение NEBNext Direct Genotyping". The Scientist . Получено 2020-03-19 .
  21. ^ "ERS Genomics и New England Biolabs подписывают соглашение о коммерциализации инструментов и реагентов CRISPR/Cas9". News-Medical.net . 2020-01-09 . Получено 2020-02-06 .
  22. ^ "New England Biolabs, Inc. представляет новый метод клонирования и сборки ДНК: NEBuilder® HiFi". BioSpace . Получено 10 июля 2020 г.
  23. ^ ab "New England Biolabs Monarch Genomic DNA Purification Kit". GenomeWeb . 17 мая 2019 г. Получено 16 сентября 2020 г.
  24. ^ ab Типтон, Крейг Д.; Уолкотт, Рэндалл Д.; Сэнфорд, Николас Э.; Миллер, Клинт; Патхак, Гита; Силзер, Талиса К.; Сан, Джи; Флеминг, Дерек; Рамбо, Кендра П.; Литтл, Тодд Д.; Филлипс, Николь (18.06.2020). «Генетика пациента связана с составом микробиома хронической раны и ее заживлением». PLOS Pathogens . 16 (6): e1008511. doi : 10.1371/journal.ppat.1008511 . ISSN  1553-7374. PMC 7302439. PMID 32555671  . 
  25. ^ Ли, Янь-Джиун; Дай, Нан; Уолш, Шеннон Э.; Мюллер, Стефани; Фрейзер, Морган Э.; Кауффман, Кэтрин М.; Гуан, Чуди; Корреа, Иван Р.; Вайгеле, Питер Р. (2018). «Идентификация и биосинтез гипермодификаций тимидина в геномной ДНК распространенных бактериальных вирусов». PNAS . 115 (14): E3116–E3125. Bibcode :2018PNAS..115E3116L. doi : 10.1073/pnas.1714812115 . PMC 5889632 . PMID  29555775. 
  26. ^ Кроуфорд, Карен; Кирос, Хуан Ф. Диас; Кениг, Кристен М.; Ахуджа, Намрата; Альбертин, Кэролайн Б.; Розенталь, Джошуа Дж. К. (2020-09-07). «Высокоэффективный нокаут гена пигментации кальмара». Current Biology . 30 (17): 3484–3490.e4. Bibcode : 2020CBio...30E3484C. doi : 10.1016/j.cub.2020.06.099. ISSN  0960-9822. PMC 7484294. PMID 32735817  . 
  27. ^ Ван, Гохао; Сюй, Цзюньцзи; Чжао, Цзянша; Инь, Вэйцинь; Лю, Дайонг; Чэнь, Ваньцзюнь; Хоу, Стивен X. (10.01.2020). «Липидный метаболизм, опосредованный Arf1, поддерживает раковые клетки, а его абляция вызывает противоопухолевые иммунные ответы у мышей». Nature Communications . 11 (1): 220. Bibcode :2020NatCo..11..220W. doi : 10.1038/s41467-019-14046-9 . ISSN  2041-1723. PMC 6954189 . PMID  31924786. 
  28. ^ Albaqami, Maria; Hammad, Merfat; Pooam, Marrootpong; Procopio, Maria; Sameti, Mahyar; Ritz, Thorsten; Ahmad, Margaret; Martino, Carlos F. (2020-07-09). "Arabidopsis cryptochrome is response to Radiofrequency (RF) electromagnetic fields". Scientific Reports . 10 (1): 11260. doi : 10.1038/s41598-020-67165-5 . ISSN  2045-2322. PMC 7347919 . PMID  32647192. 
  29. ^ ab "Ученые Нью-Йорка берут пробы в метро в поисках SARS-CoV-2". GEN . 2020-04-01 . Получено 2020-04-23 .
  30. ^ Таннер, NA; Эванс, TC (2014). "Изотермическая амплификация с петлей для обнаружения нуклеиновых кислот". Curr Protoc Mol Biol . 105 : Unit 15.14. doi :10.1002/0471142727.mb1514s105. PMID  24510439. S2CID  31241082.
  31. ^ Шен, Минжэ; Чжоу, Ин; Да, Цзявэй; Абдулла Аль-Маскри, Абду Ахмед; Канг, Ю; Цзэн, Су; Цай, Шэн (2020). «Последние достижения и перспективы обнаружения нуклеиновых кислот коронавируса». Журнал фармацевтического анализа . 10 (2): 97–101. дои : 10.1016/j.jpha.2020.02.010 . ПМК 7102540 . ПМИД  32292623. 
  32. ^ ab «Ситуация с доступностью наборов для выделения РНК не так плоха, как сообщалось».
  33. ^ "New England Biolabs поддерживает мониторинг SARS-CoV-2 с помощью наборов NGS". Science Board . Получено 26 февраля 2021 г.
  34. ^ "КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ РАЗРЕШЕНИЯ НА ЭКСТРЕННОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ (EUA) ДЛЯ ДИАГНОСТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ЦВЕТНОЙ ОТ-ЛАМПЫ SARS-COV-2". FDA . Получено 7 июля 2021 г. .
  35. ^ ab Terence A. Brown (1998). Молекулярная биология Labfax, том 1. Elsevier. стр. 41. ISBN 9780121360559. Получено 7 мая 2014 г. .
  36. ^ ab "Обзор продукта: система PikoReal компании Thermo Fisher; Polbase компании New England Biolabs". Genome Web. 10 ноября 2011 г.
  37. ^ ab Родни Х. Браун (10 ноября 2011 г.). "New England Biolabs создает базу данных полимеразы Polbase". Boston Business Journal . Получено 7 мая 2014 г.
  38. ^ «Исследователи собирают ДНК из глубин океана». The Boston Globe . 2014-04-17.
  39. ^ Найджел Фенвик (7 апреля 2014 г.). «ИТ-директора: выбирайте свое цифровое будущее». Wall Street Journal . Получено 7 мая 2014 г.
  40. Курт Вудворд (6 мая 2014 г.). «LogMeIn приобретает Ionia за 12 млн долларов, усиливая фокус на «Интернете вещей». Xconomy . Получено 7 мая 2014 г.
  41. ^ Мишель Тейлор (8 апреля 2014 г.). «Совместная устойчивость». Лабораторное оборудование . Получено 7 мая 2014 г.
  42. ^ ab "Введение в анализ гликанов". www.biocompare.com . Получено 2020-02-11 .
  43. ^ «Bioz объединилась с NEB, чтобы расширить возможности исследователей в области естественных наук». BioSpace. 13 июня 2019 г. Получено 2 марта 2020 г.