Вернер Керн (родился 23 февраля 1946 года в Берхтесгадене ) — немецкий футбольный тренер, глава молодежного отдела ФК «Бавария» Мюнхен .
После карьеры в любительском футболе Керн был назначен помощником тренера «Баварии Мюнхен» в 1970 году, где он оставался до 1977 года, работая в золотую эру клуба. Он помогал Удо Латтеку и Деттмару Крамеру , а также управлял резервной командой .
Затем он сам занялся менеджментом, работая в Wormatia Worms , 1. FC Nürnberg , Eintracht Trier и SSV Ulm 1846. В 1998 году он должен был вернуться в Bayern Munich, чтобы возглавить обновленную молодежную структуру , но позже ушел на пенсию.