stringtranslate.com

Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека

Распределение гаплогрупп мтДНК современного человека на основе анализа 2054 человек из 26 популяций. [1] (а) Круговые диаграммы на карте. (б) Подсчет гаплогрупп в табличном формате. Подробную информацию о популяциях см. в разделе «Проект 1000 геномов» № Образцы генома человека .

В генетике человека гаплогруппа митохондриальной ДНК человека представляет собой гаплогруппу , определяемую различиями в митохондриальной ДНК человека . Гаплогруппы используются для обозначения основных точек ветвления на филогенетическом дереве митохондрий. Понимание эволюционного пути женской линии помогло популяционным генетикам проследить матрилинейное наследование современных людей вплоть до происхождения человека в Африке и последующего распространения по всему миру.

Буквенные названия гаплогрупп (а не только гаплогрупп митохондриальной ДНК) идут от А до Z. Поскольку гаплогруппы были названы в порядке их открытия, алфавитный порядок не имеет никакого значения с точки зрения реальных генетических связей.

Гипотетическая женщина, лежащая в основе всех этих групп (имеется в виду только гаплогруппы митохондриальной ДНК), является самым недавним общим предком по материнской линии (MRCA) для всех ныне живущих людей . Ее обычно называют Митохондриальной Евой .

Скорость, с которой мутирует митохондриальная ДНК, известна как митохондриальные молекулярные часы . Это область продолжающихся исследований: в одном исследовании сообщается об одной мутации каждые 8000 лет. [2]

Филогения

Дерево гаплогрупп мтДНК и карта распространения. [3] Цифры представляют собой метки гаплогрупп, указанные в соответствии с номенклатурой http://www.phylotree.org/, [4] и указывают местоположение одной из мутаций, приводящих к полученному гаплотипу. (Показан только один маркер, определяющий ветвь, предпочтительно из кодирующего региона.) Основные географические особенности распространения гаплогрупп выделены цветом.
Путь распространения гаплогрупп мтДНК человека

Это филогенетическое древо основано Ван Овеном (2009). [4] В июне 2022 года была предложена альтернативная филогения гаплогруппы L [5]

Основные гаплогруппы мтДНК

Предполагаемая карта мира миграций человека на основе гаплогрупп мтДНК.

Макрогаплогруппа L

Макрогаплогруппа L — самая базальная из гаплогрупп мтДНК человека, от которой происходят все остальные гаплогруппы (в частности, от гаплогруппы L3). Встречается преимущественно в Африке.

Макрогаплогруппа М

Макрогаплогруппа М встречается в основном в Азии и Америке. Ее потомками являются гаплогруппа M , гаплогруппа C , гаплогруппа Z , гаплогруппа D , гаплогруппа E , гаплогруппа G и гаплогруппа Q.

Макрогаплогруппа N

Макрогаплогруппа N встречается в основном в Австралии, Америке и некоторых частях Азии. Ее потомками являются гаплогруппа N , гаплогруппа O , гаплогруппа A , гаплогруппа S , гаплогруппа I , гаплогруппа W , гаплогруппа X и гаплогруппа Y , а также макрогаплогруппа R.

Макрогаплогруппа R

Макрогаплогруппа R встречается в основном в Европе, Северной Африке, Тихоокеанском регионе и некоторых частях Азии и Америки. Ее потомками являются гаплогруппа R , гаплогруппа B , гаплогруппа F , гаплогруппа H , гаплогруппа V , гаплогруппа J , гаплогруппа T , гаплогруппа U и гаплогруппа K.

Хронология

Географическое распределение

В статье 2004 года было высказано предположение, что гаплогруппы, наиболее распространенные в современном населении Западной Азии, Северной Африки и Европы, были: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X и W. [7]

Африканские гаплогруппы: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a.

Австралийские гаплогруппы: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (Ссылки 1, 2, 3, 4, 5, 6).

Азиатские гаплогруппы: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U множество вариантов номеров для каждого раздела.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ришишвар Л., Джордан, ИК (2017). «Последствия эволюции человека и примеси для заместительной митохондриальной терапии». БМК Геномика . 18 (1): 140. дои : 10.1186/s12864-017-3539-3 . ПМК  5299762 . ПМИД  28178941.
  2. ^ Лугвали, Ева-Лийс; Кивисилд, Тоомас; Маргус, Тыну; Виллемс, Ричард (2009), О'Рурк, Деннис (редактор), «Объяснение несовершенства молекулярных часов митохондрий гоминид», PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO...4.8260L, doi : 10.1371/journal.pone.0008260 , PMC 2794369 , PMID  20041137 
  3. ^ Кивисилд Т (2015). «Материнское происхождение и история населения по целым митохондриальным геномам». Расследование Жене . 6 :3. дои : 10.1186/s13323-015-0022-2 . ПМЦ 4367903 . ПМИД  25798216. 
  4. ^ Аб ван Овен М., Кайзер М. (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация . 30 (2): E386–94. дои : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
  5. ^ Майер П., Рунфельдт Г., Эстес Р., Вилар М. (2022). «Африканская митохондриальная гаплогруппа L7: 100 000-летняя человеческая линия по материнской линии, обнаруженная посредством переоценки и нового секвенирования». Природа . 12 (1): 10747. Бибкод : 2022NatSR..1210747M. дои : 10.1038/s41598-022-13856-0 . ПМЦ 9232647 . PMID  35750688. S2CID  250021505.  
  6. ^ «Коррекция очищающего отбора: дополнительные дополнительные усовершенствованные митохондриальные молекулярные часы человека» (PDF) . 2009: 82–83 [89]. Архивировано из оригинала (PDF) 29 декабря 2009 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  7. ^ Виллемс, Ричард; Усанга, Эсьен; Микерези, Илия; Гёльге, Мукаддес; Клаустр, Мирей; Михалодимитракис, Эммануэль Н.; Паппа, Каллиопи И.; Ананью, Николас П.; Шавентре, Андре; Муасан, Жан-Поль; Ричард, Кристель; Гречанина, Елена; Балановская Елена Владимировна; Рудан, Павао; Пузырев Валерий; Степанов Вадим; Хуснутдинова Эльза К.; Гусар, Владислава; Балановский Олег П.; Перичич, Марияна; Барач, Ловорка; Голубенко Мария; Лункина, Арина; Лаос, Сирл; Пеннарун, Эрван; Парик, Юри; Толк, Хелле-Вииви; Рейдла, Маере; Тамбетс, Кристина; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Деренко, Мирослава В.; Малярчук Борис А.; Роосталу, Урмас; Лоогвяли, Ева-Лийс (1 ноября 2004 г.). «Разъединяющее единообразие: пестрая кладистическая картина гаплогруппы H мтДНК в Евразии». Молекулярная биология и эволюция . 21 (11): 2012–2021. дои : 10.1093/molbev/msh209 . PMID  15254257 – через Academic.oup.com.

Внешние ссылки