stringtranslate.com

Гаплогруппа R (Y-ДНК)

Гаплогруппа R , или R-M207 , — это гаплогруппа ДНК Y-хромосомы . Она многочисленна и широко распространена среди современных популяций.

Некоторые субклады- потомки были обнаружены еще в доисторические времена в Европе , Центральной Азии и Южной Азии . Другие уже давно присутствуют, на более низких уровнях, в некоторых частях Западной Азии и Африки . Некоторые специалисты также предположили, что более спорно, что R-M207 уже давно присутствует среди коренных американцев в Северной Америке — теория, которая пока не получила широкого признания. [5]

По словам генетика Спенсера Уэллса , гаплогруппа K возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии . [6] Однако Карафет и др. (2014) предположили, что «быстрая диверсификация ... K-M526 », также известной как K2, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии (около Индонезии ) и позже распространилась на материковую Азию, хотя они не могли исключить, что она могла возникнуть в Евразии и позже вымерла там, и что любой из этих сценариев «одинаково экономичен». [7] По словам Бергсторма и др., гаплогруппа K2b1 (Y-гаплогруппа S/M), обнаруженная у коренных австралийцев и предков гаплогрупп R и Q (Y-гаплогруппа K2b2 / корень P), разделилась в Юго-Восточной Азии около Сахула. [8]

Структура

Происхождение

Генетик Спенсер Уэллс предполагает, что гаплогруппа K, вероятно, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии , возможно, в регионе Ирана или Пакистана . [6] Согласно Бергсторму и др., глубоко укоренившаяся гаплогруппа K2b1 (Y-гаплогруппа S/M), обнаруженная у коренных австралийцев и предков гаплогрупп R и Q (Y-гаплогруппа K2b2 /корень P), разделилась в Юго-Восточной Азии около Сахула. [8] Гаплогруппа P1 могла возникнуть в Юго-Восточной Азии , однако, по словам Карафета и др., эта гипотеза «экономна», и столь же вероятно, что она возникла в другом месте Евразии. [7] Считается, что SNP M207, который определяет гаплогруппу R, возник в эпоху верхнего палеолита , около 27 000 лет назад. [2] [1]

Останки мальчика Мальты (МА-1) с артефактами гробницы, Эрмитаж, Санкт-Петербург. [9]

Только один подтвержденный пример базального R* был обнаружен в останках возрастом 24 000 лет, известных как MA1 , найденных в культуре Мальта-Буреть недалеко от озера Байкал в Сибири . [2] (Хотя живой пример R-M207(xM17,M124) был зарегистрирован в 2012 году, он не был протестирован на SNP M478; рассматриваемый мужчина — среди выборки из 158 этнических таджикских мужчин из Бадахшана , Афганистан — может, следовательно, принадлежать к R2.)

Возможно, что ни одна из первичных ветвей R-M207, а именно R1 (R-M173) и R2 (R-M479) не существует в своих базальных, исходных формах, т.е. R1* и R2*. Ни один подтвержденный случай, ни живой, ни мертвый, не был описан в научной литературе. (Хотя в случае R2* было проведено сравнительно мало исследований.)

Несмотря на редкость R* и R1*, часто отмечалось относительно быстрое расширение – как в географическом, так и в численном отношении – субкладов, в частности, от R1: «и R1a, и R1b включают молодые, звездообразные расширения» (Karafet 2008).

В частности, также было отмечено широкое географическое распространение R1b. Халласт и др. (2014) отметили, что живые примеры, найденные в Центральной Азии, включают:

(Хотя Халласт и др. предположили, что R-PH155 «почти такой же старый, как и разделение R1a/R1b», позже было обнаружено, что R-PH155 является субкладом R-L278 (R1b1) и получил филогенетическое название R1b1b.)

Распределение

Y-гаплогруппа R-M207 распространена по всей Европе , Южной Азии и Центральной Азии (Kayser 2003). Она также встречается на Кавказе и в Сибири . Некоторые меньшинства в Африке также несут субклады R-M207 с высокой частотой.

Предполагаемые пути миграции гаплогруппы P и др. [10]

Хотя у некоторых коренных народов Америки и Австралазии также наблюдается высокий уровень R-M207, неясно, являются ли эти изменения глубоко укоренившимися или следствием европейской колонизации в начале современной эпохи .

Р (Р-М207)

Гаплогруппа R* Y-ДНК (xR1,R2) была обнаружена в останках возрастом 24 000 лет из Мальты в Сибири, недалеко от озера Байкал. [11] В 2013 году R-M207 была обнаружена у одного из 132 мужчин киргизов Восточного Кыргызстана. [12]

Р1 (Р-М173)

Существует множество нисходящих мутаций гаплогруппы R (Semino 2000 и Rosser 2000).

Первоначально шли споры о происхождении гаплогруппы R1b у коренных американцев. Два ранних исследования предположили, что эта гаплогруппа могла быть одной из основополагающих сибирских линий коренных американцев, однако сейчас это считается маловероятным, поскольку линии R1b, обычно встречающиеся у коренных американцев, в большинстве случаев идентичны линиям у западных европейцев, и ее самая высокая концентрация обнаружена среди различных культурно не связанных племен на востоке Северной Америки. [13]

Таким образом, по мнению ряда авторов, R1b, скорее всего, был привнесен посредством смешения во время европейского заселения Северной Америки после 1492 года. [14] [15] [16]

Р2 (Р-М479)

Гаплогруппа R-M479 определяется наличием маркера M479. Парагруппа для линии R-M479 встречается преимущественно в Южной Азии, хотя глубоко укоренившиеся примеры также были обнаружены среди португальского, испанского, татарского (Башкортостан, Россия) и осетинского (Кавказ) населения (Myres 2010).

Один редкий субклад может встречаться только среди евреев-ашкенази , возможно, в результате эффекта основателя .

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК R-M207

Y-ДНК остовное дерево

Ссылки

  1. ^ abc ISOGG , Y-ДНК гаплогруппа R и ее субклады – 2016 (12 декабря 2016 г.).
  2. ^ abc Рагхаван, М. и др. 2014. Геном сибиряков верхнего палеолита выявляет двойное происхождение коренных американцев, Nature, 505, 87–91.
  3. ^ Driem, George L. van (25 мая 2021 г.). Этнолингвистическая предыстория: заселение мира с точки зрения языка, генов и материальной культуры. BRILL. стр. 204. ISBN 978-90-04-44837-7.
  4. ^ Махал, Дэвид Г.; Мацукас, Янис Г. (2018). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: исследование древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК». Frontiers in Genetics . 9 : 4. doi : 10.3389/fgene.2018.00004 . ISSN  1664-8021. PMC 5787057. PMID 29410676.  Это одна из крупнейших гаплогрупп в Индии и Пакистане. Это также самая большая гаплогруппа в наборе данных, использованном в этом исследовании. Она возникла в Северной Азии около 27 000 лет назад (ISOGG, 2016). Это одна из самых распространенных гаплогрупп в Европе, ее ветви достигают 80 процентов населения в некоторых регионах (Eupedia, 2017). Откуда-то из Центральной Азии некоторые потомки человека, несущего мутацию M207 в Y-хромосоме, направились на юг и прибыли в Индию около 10 000 лет назад (Уэллс, 2007). 
  5. ^ Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех различных отцовских линий среди северных индийцев: исследование 560 Y-хромосом». Annals of Human Biology . 36 (1): 46–59. doi :10.1080/03014460802558522. ISSN  0301-4460. PMC 2755252 . PMID  19058044. Рисунок 3 
  6. ^ ab Wells, Spencer (20 ноября 2007 г.). Глубокое происхождение: эпохальный поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого. National Geographic Books. стр. 79. ISBN 978-1-4262-0211-7.«Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».
  7. ^ ab Karafet TM, Mendez FL, Sudoyo H, Lansing JS, Hammer MF (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». European Journal of Human Genetics . 23 (3): 369–73. doi :10.1038/ejhg.2014.106. PMC 4326703 . PMID  24896152. «Эта закономерность приводит нас к гипотезе о юго-восточно-азиатском происхождении P-P295 и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q на материковую Азию. Альтернативное объяснение включало бы вымирание предковых хромосом P-P295* по всей Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо миграцию (хромосомы P* из Индонезии на материковую Азию), либо вымирание парагруппы P-P295* в Евразии».
  8. ^ ab Bergström, Anders; Nagle, Nano; Chen, Yuan; McCarthy, Shane; Pollard, Martin O.; Ayub, Qasim; Wilcox, Stephen; Wilcox, Leah; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Xue, Yali; Mitchell, R. John; Tyler-Smith, Chris (март 2016 г.). "Глубокие корни Y-хромосом австралийских аборигенов". Current Biology . 26 (6): 809–813. Bibcode : 2016CBio ...26..809B. doi : 10.1016/j.cub.2016.01.028. PMC 4819516. PMID  26923783. «Применяя частоту точечных мутаций 0,76 × 10−9 на участок в год, выведенную из числа отсутствующих мутаций на Y-хромосоме ~45-тысячелетнего образца Евразии, датированного радиоуглеродным методом [18], мы делаем вывод о времени расхождения 54,3 тыс. лет (95% доверительный интервал [ДИ]: 48,0–61,6 тыс. лет) между хромосомами K∗/M в Сахуле и их ближайшими родственниками в гаплогруппах R и Q (рисунок 1B)» - (рисунок 1B): «Филогения Y-хромосом в гаплогруппах K∗ и M. Этот подробный вид части большего дерева, показанного на (A), фокусируется на хромосомах в гаплогруппах K∗ и M. Гаплогруппы Q и R, которые являются ближайшими родственниками K∗ и M в филогении, представлены схематически, поскольку они содержат очень большое количество образцов. Австралийские аборигены и Папуасские образцы окрашены в два разных оттенка красного для более легкого визуального разделения».
  9. ^ Лбова, Людмила (2021). «Сибирская палеолитическая стоянка Мальта: уникальный источник для изучения детской археологии». Эволюционные науки о человеке . 3 : 8, Рис. 6-1. doi : 10.1017/ehs.2021.5 . PMC 10427291. PMID  37588521 . 
  10. ^ Wang CC, Li H (июнь 2013 г.). «Вывод истории человечества в Восточной Азии из Y-хромосом». Investigative Genetics . 4 (1): 11. doi : 10.1186/2041-2223-4-11 . PMC 3687582. PMID  23731529 . 
  11. ^ Raghavan M, Skoglund P, Graf KE, Metspalu M, Albrechtsen A, Moltke I и др. (январь 2014 г.). «Верхний палеолитический сибирский геном раскрывает двойное происхождение коренных американцев». Nature . 505 (7481): 87–91. Bibcode :2014Natur.505...87R. doi :10.1038/nature12736. PMC 4105016 . PMID  24256729. 
  12. ^ Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: место, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». ПЛОС ОДИН . 8 (10): е76748. Бибкод : 2013PLoSO...876748D. дои : 10.1371/journal.pone.0076748 . ПМЦ 3799995 . ПМИД  24204668. 
  13. ^ Bolnick, Deborah; Bolnick, Daniel; Smith, David (2006). «Асимметричные мужские и женские генетические истории среди коренных американцев из восточной части Северной Америки». Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2161–2174. doi :10.1093/molbev/msl088. PMID  16916941.«В большинстве случаев существует широко распространенное согласие относительно того, представляет ли конкретная гаплогруппа древнюю индейскую линию или примесь после 1492 года, но статус гаплогруппы R-M173 недавно стал предметом некоторых дебатов. Некоторые авторы утверждают, что эта гаплогруппа представляет собой основополагающую индейскую линию (Lell et al. 2002; Bortolini et al. 2003), тогда как другие предполагают, что она вместо этого отражает недавнюю европейскую примесь (Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003; Zegura et al. 2004). В восточной части Северной Америки картина вариации гаплотипов в пределах этой гаплогруппы подтверждает последнюю гипотезу: гаплотипы R-M173 не группируются по населению или культурной области, как гаплотипы в других основополагающих гаплогруппах, и большинство из них совпадают или тесно связаны с гаплотипами R-M173, которые распространены в Европе, но редки в Азия. Эта картина противоположна ожидаемой, если бы гаплотипы коренных американцев R-M173 произошли от азиатских гаплотипов, и предполагает, что недавнее европейское смешение ответственно за присутствие гаплогруппы R-M173 на востоке Северной Америки».
  14. ^ Bolnick, Deborah Ann (2005). Генетическая предыстория восточной части Северной Америки: доказательства древней и современной ДНК. Калифорнийский университет, Дэвис. стр. 83.«Гаплогруппа R - M173, вероятно, представляет собой недавнюю (после 1492 г.) европейскую примесь, как и P-M45* (Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003...»
  15. ^ Рафф, Дженнифер (8 февраля 2022 г.). Происхождение: Генетическая история Америки. Grand Central Publishing. С. 59–60. ISBN 978-1-5387-4970-8.«Гаплогруппы-основатели Y-хромосомы у коренных американцев включают Q-M3 (и ее подгаплогруппы, Q-CTS1780) и C3-MPB373 (потенциально C-P39-Z30536). Другие гаплогруппы, обнаруженные у коренных американцев, такие как R1b, вероятно, являются результатом постевропейского контактного смешения (44)».
  16. ^ Малхи, Рипан Сингх; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; и др. (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски». Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883. ПМК 2584155 . ПМИД  18618732. «Все лица, не принадлежащие к гаплогруппам Q и C, были исключены из набора данных гаплотипов, поскольку эти гаплотипы, вероятно, являются результатом неместной примеси (Tarazona-Santos and Santos, 2002; Zegura et al., 2004; Bolnick et al, 2006)... Частота гаплогруппы C наиболее высока на северо-западе Северной Америки, а частота гаплогруппы R, присутствие которой приписывается европейской примеси, достигает максимума на северо-востоке Северной Америки».

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа R Y-ДНК .

Обсуждение и проекты