Генетипы — это таксономическая концепция, предложенная в 2010 году для описания любых генетических последовательностей из типовых образцов . [1] [2] Эта номенклатура объединяет молекулярную систематику и термины, используемые в биологической таксономии . Эта номенклатура предназначена для маркировки или пометки генетических последовательностей, которые были отобраны из типовых образцов. Номенклатура генетипов предполагает, что генетические последовательности из голотипа следует называть «хологенетип» (от «голотип» и «генетип»), последовательности из топотипа — «топогенетип» и т. д. Кроме того, используемые генетические маркеры должны быть включены в номенклатуру (например, парагенетип ND2).
Система номенклатуры генотипов может быть использована для обозначения последовательностей «золотого стандарта», которые из-за их прямой связи с типовыми образцами будут более достоверными, чем стандартные последовательности, идентификация видов которых может быть проблематичной. Неправильные идентификации преследуют многие последовательности в GenBank [ требуется ссылка ] , и наличие некоторых последовательностей, которые связаны с типовыми образцами, поможет обнаружить и управлять неправильными идентификациями и создать положительно идентифицированные последовательности «золотого стандарта», доступные для сравнения. Предлагается использовать эту номенклатуру в публикациях и базах данных, которые отображают или обсуждают последовательности из типовых образцов. [3] [2]
Примеры генотипов включают в себя:
Концепция генотипов была заменена концепцией GenSeq, предложенной в 2013 году из-за некоторой путаницы среди исследователей, которые считали, что генотипы эквивалентны номенклатурным типам . [6] [ необходимо разъяснение ]