stringtranslate.com

Гидрогенофиловые

Hydrogenophilaceae — семейство класса Hydrogenophilalia в типе Pseudomonadota (« Proteobacteria »), с двумя родами — Hydrogenophilus и Tepidiphilus . Как и все Pseudomonadota , они являются грамотрицательными . Все известные виды термофильны , растут при температуре около 50 °C и используют молекулярный водород или органические молекулы в качестве источника электронов для поддержания роста; некоторые виды являются автотрофами .

Род Thiobacillus ранее считался членом этого семейства, но был переклассифицирован в порядок Nitrosomonadales в то же время, когда Hydrogenophilales были удалены из Betaproteobacteria, чтобы сформировать класс Hydrogenophilalia . [2]

Hydrogenophilus thermoluteolus — факультативный хемолитоавтотроф , первоначально выделенный из горячего источника ; однако он был обнаружен в 2004 году в образцах ледяного керна, извлеченных с глубины около 3 км из льда, покрывающего озеро Восток в Антарктиде . [3] Присутствие ДНК (и потенциально живых клеток) термофильных бактерий во льду предполагает, что под холодным водоемом озера Восток может существовать геотермальная система или просто что нетермофильные штаммы Hydrogenophilus существуют и присутствовали во льду.

Гидрогенофилия

Класс Hydrogenophilalia в бактериях был ограничен в 2017 году, когда было продемонстрировано, что порядок Hydrogenophilales отличается от Betaproteobacteria на основе физиологии, биохимии, профилей жирных кислот и филогенетического анализа на основе гена 16S рРНК и 53 последовательностей рибосомальных белков, объединенных с использованием платформы rMLST для мультилокусного типирования последовательностей . [2]

Класс включает один порядок, Hydrogenophilales (типовой порядок), который содержит термофильные организмы - как автотрофы , так и гетеротрофы , первые из которых используют молекулярный водород в качестве донора электронов, связывая его окисление с восстановлением НАД + с помощью фермента гидрогеназы . Очень высокая доля ω-циклогексил жирных кислот (в частности, C19:0 цикло и C17:0 цикло ) по сравнению с прямыми аналогами была главной отличительной чертой по сравнению с Betaproteobacteria и, вероятно, участвует в обеспечении стабильности мембраны при высоких температурах роста. [2] Все члены класса могут использовать молекулярный кислород в качестве конечного акцептора электронов (т. е. являются аэробными ), а также нитрат , который может использоваться некоторыми членами во время денитрификации . Автотрофные члены класса не используют карбоксисомы для концентрации углекислого газа или повышения эффективности RuBisCO как карбоксилазы по сравнению с оксигеназой . Доминирующим дыхательным хиноном этого класса является убихинон-8, а менахиноны или родохиноны не наблюдаются, хотя они присутствуют в соседних бетапротеобактериях . [2]

Ссылки

  1. ^ ab Parker, Charles Thomas; Wigley, Sarah; Garrity, George M (11 мая 2009 г.). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (ред.). «Таксономический реферат для семейств». NamesforLife, LLC. doi :10.1601/tx.1868 (неактивен 1 ноября 2024 г.). {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
  2. ^ abcd Boden R, Hutt LP, Rae AW (2017). «Реклассификация Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) как Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov., перенос Thiobacillus (Beijerinck, 1904) из Hydrogenophilales в Nitrosomonadales, предложение класса Hydrogenophilalia. nov. в пределах «Proteobacteria» и четыре новых семейства в пределах порядков Nitrosomonadales и Rhodocyclales». Int J Syst Evol Microbiol . 67 (5): 1191–1205. doi : 10.1099/ijsem.0.001927 . hdl : 10026.1/8740 . PMID  28581923.
  3. ^ Сергей А. Булат; Ирина А. Алехина; Мишель Блот; Жан-Робер Пети; Мартин де Анжелис; Дитмар Вагенбах; Владимир Я. Липенков; Лада П. Васильева; Доминика М. Влох; Доминик Рейно; Валерий В. Лукин (август 2004 г.). «ДНК-сигнатура термофильных бактерий из старого аккреционного льда озера Восток, Антарктида: значение для поиска жизни в экстремальных ледяных условиях». Международный журнал астробиологии . 3 (1): 1–12. Bibcode : 2004IJAsB...3....1B. doi : 10.1017/S1473550404001879 .