stringtranslate.com

Димер белка

Мультипликационная диаграмма димера галактозо-1-фосфатуридилилтрансферазы (GALT) Escherichia coli в комплексе с UDP-галактозой (модели палочек). Ионы калия, цинка и железа видны как фиолетовые, серые и бронзовые сферы соответственно.

В биохимии димер белка — это макромолекулярный комплекс или мультимер, образованный двумя мономерами белка или отдельными белками, которые обычно нековалентно связаны . Многие макромолекулы , такие как белки или нуклеиновые кислоты , образуют димеры. Слово димер имеет корни, означающие «две части», ди- + -мер . Димер белка — это тип четвертичной структуры белка .

Белковый гомодимер образован двумя идентичными белками, тогда как белковый гетеродимер образован двумя разными белками.

Большинство димеров белков в биохимии не связаны ковалентными связями . Примером нековалентного гетеродимера является фермент обратная транскриптаза , который состоит из двух различных аминокислотных цепей. [1] Исключением являются димеры, которые связаны дисульфидными мостиками , такие как гомодимерный белок NEMO . [2]

Некоторые белки содержат специализированные домены, обеспечивающие димеризацию (домены димеризации) и специфичность. [3]

Каннабиноидные рецепторы, связанные с G-белком, обладают способностью образовывать как гомо-, так и гетеродимеры с несколькими типами рецепторов, такими как мю-опиоидные , дофаминовые и аденозиновые А2- рецепторы. [4]

Примеры

Щелочная фосфатаза

Щелочная фосфатаза E. coli , димерный фермент, проявляет внутригенную комплементарность . [5] То есть, когда были объединены определенные мутантные версии щелочной фосфатазы, гетеродимерные ферменты, образованные в результате, проявили более высокий уровень активности, чем можно было бы ожидать на основе относительной активности родительских ферментов. Эти результаты показали, что димерная структура щелочной фосфатазы E. coli допускает кооперативные взаимодействия между составляющими мутантными мономерами, которые могут генерировать более функциональную форму голофермента . Димер имеет два активных центра, каждый из которых содержит два иона цинка и ион магния. [8]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Sluis-Cremer N, Hamamouch N, San Félix A, Velazquez S, Balzarini J, Camarasa MJ (август 2006 г.). «Структурно-активностные связи производных [2',5'-бис-O-(трет-бутилдиметилсилил)-бета-D-рибофуранозил]-3'-спиро-5' '-(4' '-амино-1' ',2' '-оксатиол-2' ',2' '-диоксид)тимина как ингибиторов димеризации обратной транскриптазы ВИЧ-1». J. Med. Chem . 49 (16): 4834–41. doi :10.1021/jm0604575. PMID  16884295.
  2. ^ Herscovitch M, Comb W, Ennis T, Coleman K, Yong S, Armstead B, Kalaitzidis D, Chandani S, Gilmore TD (февраль 2008 г.). «Образование межмолекулярной дисульфидной связи в димере NEMO требует Cys54 и Cys347». Biochemical and Biophysical Research Communications . 367 (1): 103–8. doi :10.1016/j.bbrc.2007.12.123. PMC 2277332. PMID  18164680 . 
  3. ^ Амуциас, Григорис Д.; Робертсон, Дэвид Л.; Ван де Пир, Ив; Оливер, Стивен Г. (2008-05-01). «Выбирайте своих партнеров: димеризация в факторах транскрипции эукариот». Тенденции в биохимических науках . 33 (5): 220–229. doi :10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN  0968-0004. PMID  18406148.
  4. ^ Филипюк, Леонтина Елена; Абабей, Даниэла Кармен; Алекса-Стратулат, Теодора; Прикопе, Космин Василика; Билд, Вероника; Стефанеску, Ралука; Станчу, Габриэла Думитрица; Тамба, Богдан-Ионел (01 ноября 2021 г.). «Основные фитоканнабиноиды и родственные им соединения: следует ли нам искать только лекарства, действующие на каннабиноидные рецепторы?». Фармацевтика . 13 (11): 1823. doi : 10.3390/pharmaceutics13111823 . ISSN  1999-4923. ПМЦ 8625816 . ПМИД  34834237. 
  5. ^ Хехир, Майкл Дж.; Мерфи, Дженнифер Э.; Кантровиц, Эван Р. (2000). «Характеристика гетеродимерных щелочных фосфатаз из Escherichia coli: исследование внутригенной комплементации». Журнал молекулярной биологии . 304 (4): 645–656. doi :10.1006/jmbi.2000.4230. PMID  11099386.

6. Конн. (2013). Моделирование, активация, взаимодействие и виртуальный скрининг рецепторов, сопряженных с G-белком (1-е изд.). Academic Press.

7. Мэтьюз, Жаклин М. Димеризация и олигомеризация белков в биологии . Springer New York, 2012.

8. Хьорлейфссон, Йенс Гу[ет] Мундур и Бьярни Асгейрссон. «Холодная активная щелочная фосфатаза необратимо превращается в неактивный димер при низких концентрациях мочевины». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика , том. 1864, нет. 7, 2016, стр. 755–765, https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2016.03.016.