stringtranslate.com

Генетический маркер

Генетический маркер — это ген или последовательность ДНК с известным местоположением на хромосоме , которая может быть использована для идентификации особей или видов . Его можно описать как вариацию (которая может возникнуть из-за мутации или изменения в геномных локусах), которую можно наблюдать. Генетический маркер может быть короткой последовательностью ДНК, например, последовательностью, окружающей изменение одной пары оснований ( однонуклеотидный полиморфизм , SNP), или длинной, например, минисателлиты .

Фон

В течение многих лет картирование генов ограничивалось идентификацией организмов по традиционным маркерам фенотипов. Сюда входили гены, кодирующие легко наблюдаемые характеристики, такие как группы крови или формы семян. Недостаточное количество этих типов характеристик у нескольких организмов ограничивало возможные усилия по картированию. Это побудило к разработке маркеров генов, которые могли бы идентифицировать генетические характеристики, которые нелегко наблюдать у организмов (например, вариации белков). [1]

Типы

Принцип обнаружения SFP для генного зондирования

Некоторые часто используемые типы генетических маркеров:

Молекулярно-генетические маркеры можно разделить на два класса: а) биохимические маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне генного продукта, такие как изменения в белках и аминокислотах, и б) молекулярные маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне ДНК, такие как изменения нуклеотидов: делеция, дупликация, инверсия и/или вставка. Маркеры могут демонстрировать два типа наследования, т. е. доминантный/рецессивный или кодоминантный. Если генетический паттерн гомозигот можно отличить от паттерна гетерозигот, то маркер называется кодоминантным. Обычно кодоминантные маркеры более информативны, чем доминантные маркеры. [3]

Использует

Генетические маркеры могут быть использованы для изучения связи между наследственным заболеванием и его генетической причиной (например, определенная мутация гена , которая приводит к дефектному белку ). Известно, что фрагменты ДНК, которые лежат рядом друг с другом на хромосоме, имеют тенденцию наследоваться вместе. Это свойство позволяет использовать маркер, который затем может быть использован для определения точной модели наследования гена, который еще не был точно локализован .

Генетические маркеры используются в генеалогическом ДНК-тестировании для генетической генеалогии , чтобы определить генетическое расстояние между индивидуумами или популяциями. Однородительские маркеры (на митохондриальной или Y-хромосомной ДНК) изучаются для оценки материнских или отцовских линий . Аутосомные маркеры используются для всех родословных.

Генетические маркеры должны быть легко идентифицируемыми, связанными с определенным локусом и высокополиморфными , поскольку гомозиготы не предоставляют никакой информации. Обнаружение маркера может быть прямым с помощью секвенирования РНК или косвенным с помощью аллозимов .

Некоторые из методов, используемых для изучения генома или филогенетики, — это RFLP, AFLP, RAPD, SSR. Они могут быть использованы для создания генетических карт любого изучаемого организма.

Был спор о том, что является трансмиссивным агентом CTVT ( собачья трансмиссивная венерическая опухоль ). Многие исследователи выдвинули гипотезу, что вирусоподобные частицы были ответственны за трансформацию клетки, в то время как другие считали, что сама клетка была способна заражать других собак в качестве аллотрансплантата . С помощью генетических маркеров исследователи смогли предоставить убедительные доказательства того, что раковая опухолевая клетка эволюционировала в трансмиссивного паразита. Кроме того, молекулярно-генетические маркеры использовались для решения вопроса естественной передачи, породы происхождения ( филогенетика ) и возраста опухоли у собаки. [4]

Генетические маркеры также использовались для измерения геномного ответа на селекцию у скота. Естественный и искусственный отбор приводит к изменению генетического состава клетки. Наличие различных аллелей из-за искаженной сегрегации в генетических маркерах указывает на разницу между отобранным и неотобранным скотом. [5]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Бенджамин А. Пирс (2013-12-27). Генетика: Концептуальный подход . Macmillan Learning. ISBN 978-1-4641-0946-1.
  2. ^ ab Mehta, Sahil; Singh, Baljinder; Dhakate, Priyanka; Rahman, Mehzabin; Islam, Muhammad Aminul (2019). "5 Рис, селекция с помощью маркеров и устойчивость к болезням". В Wani, Shabir Hussain (ред.). Устойчивость к болезням сельскохозяйственных культур: молекулярные, генетические и геномные перспективы . Cham, Швейцария : Springer . стр. 83–112/xii+307. ISBN 978-3-030-20727-4. OCLC  1110184027. ISBN  978-3-030-20728-1 .
  3. ^ N Manikanda Boopathi (2012-12-12). Генетическое картирование и селекция с помощью маркеров: основы, практика и преимущества. Springer Science & Business Media. стр. 60–. ISBN 978-81-322-0958-4.
  4. ^ Murgia C, Pritchard JK , Kim SY, Fassati A, Weiss RA. Клональное происхождение и эволюция трансмиссивного рака. Cell. 2006 11 августа;126(3):477-87.
  5. ^ Gomez-Raya L, Olsen HG, Lingaas F, Klungland H, Våge DI, Olsaker I, Talle SB, Aasland M, Lien S (ноябрь 2002 г.). «Использование генетических маркеров для измерения геномного ответа на селекцию у скота». Genetics . 162 (3): 1381–8. doi :10.1093/genetics/162.3.1381. PMC 1462338 . PMID  12454081. 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

Медиа, связанные с генетическими маркерами на Wikimedia Commons