Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ДНК-полимераза тета — это фермент , который у людей кодируется геном POLQ . [ 5] [6] Эта полимераза играет ключевую роль в одном из трех основных путей репарации двухцепочечных разрывов: тета-опосредованном соединении концов (TMEJ). [7] [8] [9] [10] Большинство двухцепочечных разрывов восстанавливаются негомологичным соединением концов (NHEJ) или гомологично-направленной репарацией (HDR). Однако в некоторых контекстах NHEJ и HR недостаточны, и TMEJ является единственным решением для восстановления разрыва. [11] TMEJ часто описывается как альтернативный NHEJ, но отличается тем, что ему не требуется гетеродимер Ku , и он может действовать только на резецированных концах ДНК. [12] После отжига коротких (т. е. нескольких нуклеотидов) участков на выступах ДНК ДНК-полимераза тета катализирует зависимый от матрицы синтез ДНК через разорванные концы, стабилизируя парную структуру. [13] [14]
Мутационная сигнатура полимеразы тета
TMEJ по своей сути мутагенен , поскольку полимераза тета использует гомологичные нуклеотиды с обоих концов разрыва для инициирования репарации, что приводит к потере одного набора этих нуклеотидов в последовательности ДНК. Таким образом, TMEJ является формой микрогомологического опосредованного соединения концов (MMEJ). Более того, когда концы разрыва не стабилизированы должным образом, концы разрыва могут отсоединиться после полимеризации. Когда эти полимеризованные концы снова отжигаются, между соединениями делеции возникает шаблонная вставка . [15]
Обратная транскрипция РНК
Polθ способствует репарации ДНК с использованием РНК-шаблона . Ранее долгое время считалось, что ДНК-полимеразы только транскрибируют ДНК в ДНК или РНК и не способны записывать сегменты РНК в ДНК . [16] [17]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000051341 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000034206 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Sharief FS, Vojta PJ, Ropp PA, Copeland WC (июль 1999 г.). «Клонирование и хромосомное картирование человеческой ДНК-полимеразы тета (POLQ), восьмой человеческой ДНК-полимеразы». Genomics . 59 (1): 90–6. doi :10.1006/geno.1999.5843. PMID 10395804.
- ^ "Ген Энтреза: полимераза POLQ (ДНК-направленная), тета".
- ^ Chan SH, Yu AM, McVey M (июль 2010 г.). «Двойные роли ДНК-полимеразы тета в альтернативном восстановлении двухцепочечных разрывов путем соединения концов у дрозофилы». PLOS Genetics . 6 (7): e1001005. doi : 10.1371/journal.pgen.1001005 . PMC 2895639. PMID 20617203 .
- ^ Yu AM, McVey M (сентябрь 2010 г.). «Зависимое от синтеза микрогомологическое опосредованное соединение концов объясняет множественные типы репарационных соединений». Nucleic Acids Research . 38 (17): 5706–17. doi :10.1093/nar/gkq379. PMC 2943611 . PMID 20460465.
- ^ Koole W, van Schendel R, Karambelas AE, van Heteren JT, Okihara KL, Tijsterman M (2014-02-05). "Полимеразный тета-зависимый путь репарации подавляет обширную геномную нестабильность на эндогенных участках ДНК G4". Nature Communications . 5 (1): 3216. Bibcode :2014NatCo...5.3216K. doi : 10.1038/ncomms4216 . PMID 24496117.
- ^ Roerink SF, van Schendel R, Tijsterman M (июнь 2014). «Полимеразное тета-опосредованное соединение концов разрывов ДНК, связанных с репликацией, у C. elegans». Genome Research . 24 (6): 954–62. doi :10.1101/gr.170431.113. PMC 4032859. PMID 24614976 .
- ^ Schimmel J, van Schendel R, den Dunnen JT, Tijsterman M (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: неопровержимое доказательство для полимеразного тета-опосредованного соединения концов». Trends in Genetics . 35 (9): 632–644. doi :10.1016/j.tig.2019.06.001. PMID 31296341. S2CID 195892718.
- ^ Yousefzadeh MJ, Wyatt DW, Takata K, Mu Y, Hensley SC, Tomida J, et al. (Октябрь 2014 г.). «Механизм подавления хромосомной нестабильности ДНК-полимеразой POLQ». PLOS Genetics . 10 (10): e1004654. doi : 10.1371/journal.pgen.1004654 . PMC 4183433. PMID 25275444 .
- ^ Mateos-Gomez PA, Gong F, Nair N, Miller KM, Lazzerini-Denchi E, Sfeir A (февраль 2015 г.). «Млекопитающая полимераза θ способствует альтернативному NHEJ и подавляет рекомбинацию». Nature . 518 (7538): 254–7. Bibcode :2015Natur.518..254M. doi :10.1038/nature14157. PMC 4718306 . PMID 25642960.
- ^ Ceccaldi R, Liu JC, Amunugama R, Hajdu I, Primack B, Petalcorin MI и др. (февраль 2015 г.). «Опухоли с дефицитом гомологичной рекомбинации зависят от восстановления, опосредованного Polθ». Nature . 518 (7538): 258–62. Bibcode :2015Natur.518..258C. doi :10.1038/nature14184. PMC 4415602 . PMID 25642963.
- ^ Schimmel J, van Schendel R, den Dunnen JT, Tijsterman M (сентябрь 2019 г.). «Шаблонные вставки: неопровержимое доказательство для полимеразного тета-опосредованного соединения концов». Trends in Genetics . 35 (9): 632–644. doi :10.1016/j.tig.2019.06.001. PMID 31296341. S2CID 195892718.
- ^ «Новое открытие показывает, что клетки человека могут записывать последовательности РНК в ДНК». phys.org . Получено 10 июля 2021 г. .
- ^ Чандрамули Г., Чжао Дж., Макдевитт С., Русанов Т., Хоанг Т., Борисонник Н. и др. (июнь 2021 г.). «Polθ обратная транскрипция РНК и способствует восстановлению ДНК с помощью матрицы РНК». Достижения науки . 7 (24): eabf1771. Бибкод : 2021SciA....7.1771C. doi : 10.1126/sciadv.abf1771. ПМЦ 8195485 . ПМИД 34117057.
Дальнейшее чтение
- Hogg M, Sauer-Eriksson AE, Johansson E (март 2012 г.). «Неразборчивый синтез ДНК человеческой ДНК-полимеразой θ». Nucleic Acids Research . 40 (6): 2611–22. doi :10.1093/nar/gkr1102. PMC 3315306. PMID 22135286 .
- Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (сентябрь 1994 г.). «Выделение новых и известных генов из библиотеки ДНК человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Genomics . 23 (1): 42–50. doi :10.1006/geno.1994.1457. PMID 7829101.
- Maga G, Shevelev I, Ramadan K, Spadari S, Hübscher U (май 2002 г.). «ДНК-полимераза тета, очищенная из человеческих клеток, является высокоточным ферментом». Журнал молекулярной биологии . 319 (2): 359–69. doi :10.1016/S0022-2836(02)00325-X. PMID 12051913.
- Seki M, Marini F, Wood RD (ноябрь 2003 г.). "POLQ (Pol theta), ДНК-полимераза и ДНК-зависимая АТФаза в клетках человека". Nucleic Acids Research . 31 (21): 6117–26. doi :10.1093/nar/gkg814. PMC 275456. PMID 14576298 .
- Кавамура К., Бахар Р., Сеймия М., Чиё М., Вада А., Окада С. и др. (март 2004 г.). «ДНК-полимераза тета преимущественно экспрессируется в лимфоидных тканях и активируется при раке человека». Международный журнал рака . 109 (1): 9–16. doi : 10.1002/ijc.11666. PMID 14735462. S2CID 19912440.
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J и др. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных регионах». Genome Research . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316 . PMID 15342556.
- Seki M, Masutani C, Yang LW, Schuffert A, Iwai S, Bahar I, Wood RD (ноябрь 2004 г.). «Высокоэффективный обход повреждения ДНК человеческой ДНК-полимеразой Q». The EMBO Journal . 23 (22): 4484–94. doi :10.1038/sj.emboj.7600424. PMC 526458. PMID 15496986 .
- Chiapperino D, Cai M, Sayer JM, Yagi H, Kroth H, Masutani C и др. (декабрь 2005 г.). «Синтез транслезионных повреждений, подверженный ошибкам, с помощью человеческой ДНК-полимеразы eta на ДНК-содержащих дезоксиаденозиновых аддуктах 7,8-дигидрокси-9,10-эпокси-7,8,9,10-тетрагидробензо[a]пирена». Журнал биологической химии . 280 (48): 39684–92. doi : 10.1074/jbc.M508008200 . PMID 16188888.
- Зан Х., Шима Н., Сюй З., Аль-Кахтани А., Эвинджер Ии А.Дж., Чжун Ю. и др. (ноябрь 2005 г.). «Транслейная ДНК-полимераза тета играет доминирующую роль в соматической гипермутации гена иммуноглобулина». Журнал ЭМБО . 24 (21): 3757–69. дои : 10.1038/sj.emboj.7600833. ПМЦ 1276717 . ПМИД 16222339.
- Cruet-Hennequart S, Coyne S, Glynn MT, Oakley GG, Carty MP (апрель 2006 г.). «УФ-индуцированное фосфорилирование RPA увеличивается при отсутствии ДНК-полимеразы eta и требует DNA-PK». DNA Repair . 5 (4): 491–504. doi :10.1016/j.dnarep.2006.01.008. PMID 16520097.
- Chen YW, Cleaver JE, Hanaoka F, Chang CF, Chou KM (апрель 2006 г.). «Новая роль ДНК-полимеразы eta в модулировании клеточной чувствительности к химиотерапевтическим агентам». Molecular Cancer Research . 4 (4): 257–65. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-05-0118 . PMID 16603639.
- Yuasa MS, Masutani C, Hirano A, Cohn MA, Yamaizumi M, Nakatani Y, Hanaoka F (июль 2006 г.). «Комплекс человеческой ДНК-полимеразы eta, содержащий Rad18, Rad6 и Rev1; протеомный анализ и нацеливание комплекса на связанную с хроматином фракцию клеток, подвергающихся аресту репликативной вилки». Genes to Cells . 11 (7): 731–44. doi :10.1111/j.1365-2443.2006.00974.x. PMID 16824193. S2CID 32695133.
- Choi JY, Stover JS, Angel KC, Chowdhury G, Rizzo CJ, Guengerich FP (сентябрь 2006 г.). «Биохимическая основа генотоксичности гетероциклических ариламиновых пищевых мутагенов: ДНК-полимераза человека eta селективно производит делецию двух оснований при копировании N2-гуанильного аддукта 2-амино-3-метилимидазо[4,5-f]хинолина, но не аддукта C8 на сайте NarI G3». Журнал биологической химии . 281 (35): 25297–306. doi : 10.1074/jbc.M605699200 . PMID 16835218.
- Кино К, Ито Н, Сугасава К, Сугияма Х, Ханаока Ф (2007). «Транслезионный синтез человеческой ДНК-полимеразой eta через окислительные продукты гуанина». Серия симпозиумов по нуклеиновым кислотам . 48 (48): 171–2. doi : 10.1093/nass/48.1.171 . PMID 17150533.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S и др. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .