stringtranslate.com

Дэвид Бартель

Дэвид П. Бартел — американский молекулярный биолог , наиболее известный своей работой по микроРНК . Бартел — профессор биологии Массачусетского технологического института , член Института Уайтхеда и исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI).

Биография

Бартель получил степень бакалавра по биологии в колледже Гошен в 1982 году и степень доктора философии по вирусологии в Гарвардском университете в 1993 году под руководством Джека В. Шостака . [1]

Работая в лаборатории Шостака, Бартель выделил первые рибозимы непосредственно из случайной последовательности, используя эволюцию in vitro (среди них лигазу класса I). [2] После того, как он стал независимым в Институте Уайтхеда, он продолжил развивать этот рибозим, чтобы он функционировал как РНК-зависимая РНК-полимераза для удлинения праймеров на внешних РНК-матрицах, поддерживая теорию «мира РНК». [3] [4]

Позже Бартель переключил фокус своих исследований на биологию микроРНК и, в частности, на понимание их регуляторных функций. [5] МикроРНК — это короткие фрагменты РНК, длиной около 22 нуклеотидов, которые подавляют экспрессию генов посредством подавления матричных РНК (мРНК). Его лаборатория была одной из трех, которая обнаружила, что у животных есть много таких малых регуляторных РНК, [6] [7] [8] и он был первым, кто описал микроРНК в растениях. [9] [10] Благодаря своей работе с микроРНК он разработал методологию, которая предсказывает их регуляторные цели, и создал веб-инструмент TargetScan , который делает эти прогнозы доступными для исследовательского сообщества. [11] [12] [13] [14] [15] Его исследования также показали, что большинство человеческих мРНК регулируются микроРНК и что микроРНК в основном действуют, снижая уровни своих мРНК-мишеней. [13] [16]

Бартел также открыл несколько других типов регуляторных РНК, включая гетерохроматические siRNA, которые подавляют ДНК вместо РНК. [17] Кроме того, Бартел исследует роль длинных некодирующих РНК (lncRNA) и то, как нетранслируемые области и хвосты мРНК привлекают и опосредуют регуляторные явления. [5]

Бартел является основателем и научным консультантом Alnylam Pharmaceuticals, компании, основанной в 2002 году для продвижения «терапии РНК-интерференцией (RNAi) как нового класса инновационных лекарственных средств». [18]

В 2006 году Бартел занял второе место в рейтинге «цитирований» Thomson Reuters в области молекулярной биологии/генетики. Он получил несколько наград и был избран в Национальную академию наук в 2011 году. [19]

Ссылки

  1. ^ "David P. Bartel '82". Goshen Bulletin . 2007. Получено 8 марта 2014 .
  2. ^ Science . 1993 10 сентября;261(5127):1411-8. «Выделение новых рибозимов из большого пула случайных последовательностей». Bartel DP, Szostak JW.
  3. ^ Trends Cell Biol. 1999 Декабрь;9(12):M9-M13. «Построение мира РНК». Bartel DP, Unrau PJ.
  4. ^ Джонстон, В. К.; Унрау, П. Дж.; Лоуренс, М. С.; Гласнер, М. Э.; Бартель, Д. П. (18 мая 2001 г.). «РНК-катализируемая полимеризация РНК: точное и общее удлинение праймера с использованием шаблона РНК». Science . 292 (5520): 1319–25. Bibcode :2001Sci...292.1319J. CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . doi :10.1126/science.1060786. PMID  11358999. S2CID  14174984. 
  5. ^ ab "David Bartel". HHMI . Получено 7 октября 2016 г. .
  6. ^ "Science". 2001 26 октября;294(5543):853-8. "Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессируемые РНК". Лагос-Кинтана М1, Раухут Р, Лендекель В, Тушл Т.
  7. ^ "Science". 2001 26 октября;294(5543):858-62. "Распространенный класс крошечных РНК с вероятной регуляторной ролью у Caenorhabditis elegans". Lau NC1, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP.
  8. ^ "Science". 2001 26 октября;294(5543):862-4. "Обширный класс малых РНК у Caenorhabditis elegans. Lee RC1, Ambros V.
  9. ^ "Genes Dev." 2002 1 июля;16(13):1616-26. "МикроРНК в растениях". Reinhart BJ1, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP.
  10. ^ "Cell". 2002 23 августа;110(4):513-20. "Прогнозирование целевых микроРНК растений". Rhoades MW1, Reinhart BJ, Lim LP, Burge CB, Bartel B, Bartel DP.
  11. ^ "Cell". 2005 14 января;120(1):15-20. "Консервативное спаривание семян, часто фланкированное аденозинами, указывает на то, что тысячи человеческих генов являются мишенями микроРНК". Льюис BP, Бердж CB, Бартель DP.
  12. ^ "Mol Cell". 2007 6 июля;27(1):91-105. "Специфичность нацеливания микроРНК у млекопитающих: детерминанты, выходящие за рамки спаривания семян". Grimson A1, Farh KK, Johnston WK, Garrett-Engele P, Lim LP, Bartel DP.
  13. ^ ab "Genome Res." 2009 Январь;19(1):92-105. "Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями микроРНК". Фридман RC1, Фарх КК, Бердж КБ, Бартель ДП.
  14. ^ Агарвал, Викрам; Белл, Джордж У.; Нам, Джин-Ву; Бартел, Дэвид П. (2015-08-12). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих». eLife . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ISSN  2050-084X. PMC 4532895 . PMID  26267216. 
  15. ^ Агарвал, В; Субтельный, АО; Тиру, П; Улицкий, И; Бартель, ДП (4 октября 2018 г.). «Предсказание эффективности нацеливания микроРНК у дрозофилы». Genome Biology . 19 (1): 152. doi : 10.1186/s13059-018-1504-3 . PMC 6172730 . PMID  30286781. 
  16. ^ Guo, H; Ingolia, NT; Weissman, JS; Bartel, DP (12 августа 2010 г.). «МикроРНК млекопитающих преимущественно действуют, снижая уровни целевой мРНК». Nature . 466 (7308): 835–40. Bibcode :2010Natur.466..835G. doi :10.1038/nature09267. PMC 2990499 . PMID  20703300. 
  17. ^ Reinhart, BJ; Bartel, DP (13 сентября 2002 г.). «Малые РНК соответствуют гетерохроматическим повторам центромеры». Science . 297 (5588): 1831. doi :10.1126/science.1077183. PMID  12193644. S2CID  42288846.
  18. ^ "Научный консультативный совет". Alnylam.com . Получено 5 октября 2016 г. .
  19. ^ "Уайтхедский член Дэвид Бартел избран в Национальную академию наук" . Получено 25 января 2015 г.

Внешние ссылки