stringtranslate.com

Дэвид С. Уишарт

Дэвид С. Вишарт FRSC (родился 7 декабря 1961 г.) — канадский исследователь и заслуженный университетский профессор факультета биологических наук и факультета вычислительной техники Университета Альберты . Уишарт также имеет перекрестные назначения на факультете фармации и фармацевтических наук и на кафедре лабораторной медицины и патологии факультета медицины и стоматологии . Кроме того, Уишарт работает по совместительству в области метаболомики в Тихоокеанской северо-западной национальной лаборатории в Ричленде, штат Вашингтон. Уишарт хорошо известен своим новаторским вкладом в области ЯМР-спектроскопии белков , биоинформатики , хемоинформатики и метаболомики . [1] [2] [3] В 2011 году Уишарт основал Инновационный центр метаболомики (TMIC), [4] который является национальной лабораторией метаболомики Канады.

Уишарт — успешный серийный предприниматель . С 1995 года он основал 8 успешных стартапов биотехнологических компаний, включая Chenomx, [5] OMx Personal Health Analytics [6] и Molecular You Corp. [7].  За свою карьеру он опубликовал более 500 публикаций и > 100 000 цитирований [8]. он неизменно входит в число 100 лучших ученых мира в любой дисциплине [9] [10] и среди 200 лучших ученых мира в области биологии. [11]

ранняя жизнь и образование

Уишарт родился и вырос в Эдмонтоне, Альберта , Канада, у него есть брат Ян (врач) и сестра Сэнди. Его мать, Патрисия, работала натуралистом и писателем; его отец Уильям был биологом дикой природы в правительстве Альберты. Уишарт идентифицирует себя как Метис . У него есть предки кри и ассинибойны по отцовской линии, а также шотландские предки по материнской линии. В юности Уишарт научился охотиться, ловить рыбу и ловить ловушки у своего отца, который также управлял собственной ловушкой . Этот ранний опыт знакомства с миром природы вдохновил Уишарта на интенсивный интерес к естествознанию. [ нужна цитата ]

Уишарт получил степень бакалавра наук. (с отличием, первая степень) по физике Университета Альберты в 1983 году и степень магистра философии. (1986) и доктор философии . степени (1991) по молекулярной биофизике Йельского университета . Уишарт защитил докторскую диссертацию. под руководством Фредерика М. Ричардса и его постдокторские исследования (1991–1995) под руководством Брайана Д. Сайкса. [12]

Академическая карьера

Уишарт начал свою академическую карьеру в качестве доцента в 1995 году на факультете фармации и фармацевтических наук Университета Альберты, где в течение 10 лет возглавлял кафедру биотехнологии «Бристоль Майерс Сквибб» . В 2002 году он получил звание доцента , а в 2003 году — профессора, поступив на кафедру вычислительной техники и биологических наук факультета естественных наук Университета Альберты. В связи с его растущим участием в клинической химии, Уишарт был назначен адъюнкт-профессором кафедры лабораторной медицины и патологии в 2012 году. В знак признания его выдающегося вклада и стипендий в преподавании, исследованиях и работе в Университете Альберты Уишарт был назначен как заслуженный профессор университета в 2018 году. [13] В 2004–2016 годах Уишарт также работал старшим научным сотрудником и директором по нанобиологии в Национальном исследовательском совете Канады при Национальном институте нанотехнологий , расположенном в кампусе Университета Альберты. .

Исследовать

Научные интересы Уишарта охватывают ряд разнообразных областей, включая структурную биологию , вычислительную биологию , биоинформатику, нанобиологию, метаболомику, спектроскопию ядерного магнитного резонанса (ЯМР) и масс-спектрометрию . Общей темой его исследовательской карьеры была разработка методов, технологических ядер, протоколов, ресурсов данных или компьютерных программ, которые делают науку проще, быстрее, дешевле или легче. Эта работа привела к ряду важных открытий, которые фундаментально изменили области биомолекулярного ЯМР, метаболомики и вычислительной биологии. [1] [2] [3]

Биомолекулярный ЯМР

Уишарт начал свою исследовательскую карьеру в области ЯМР белков в начале 1990-х годов, сосредоточившись на использовании ЯМР-спектроскопии для характеристики структуры белков и денатурации белков . В то время структурный анализ белка с помощью ЯМР требовал сотен часов ручного анализа данных и составления таблиц. Стремясь ускорить этот процесс, Уишарт обнаружил интересную тенденцию в отношении того, как химические сдвиги аминокислотных остатков ЯМР систематически изменяются в зависимости от их вторичной структуры . Он приступил к разработке метода, называемого индексом химического сдвига , также известного как CSI, в котором использовался набор простых правил и простых таблиц химического сдвига, которые позволяли ученым напрямую использовать назначения химических сдвигов белков для быстрого определения типа и местоположения вторичных белковых белков. структуры в белках за считанные секунды. [14] [15] Впоследствии Уишарт показал, как химические сдвиги ЯМР можно использовать для простого и быстрого измерения гибкости белка с помощью индекса случайного клубка или RCI . [16] [17] Позже он показал, как можно использовать химические сдвиги для определения углов скручивания основной цепи белка с помощью программы под названием PREDITOR . [18] Уишарт также определил, как химические сдвиги можно использовать для измерения площади поверхности, доступной для остатков, [19] и для идентификации элементов супервторичной структуры. [19] [20] Для дальнейшего расширения этой работы Уишарт разработал инновационные методы определения трехмерной структуры белков, используя метод, называемый химическим сдвигом, с такими программами, как GeNMR, CS23D и E-Thrifty. [21] [22] [23] Чтобы помочь сравнить и оценить существующие структуры ЯМР белков, Уишарт также разработал методы точного прогнозирования химических сдвигов белков по трехмерным координатам с использованием таких программ, как ShiftX и ShiftX2. [24] [25] В то же время он также разработал методы повторной ссылки на неправильно присвоенные химические сдвиги белков с использованием таких программ, как SHIFTCOR и PANAV . [26] Эти программы использовались для создания баз данных ЯМР белков, таких как RefDB, которые содержат тысячи повторных химических сдвигов. [27] Статьи Уишарта, описывающие эти методы ЯМР, цитировались более 15 000 раз и в настоящее время рассматриваются [ кем? ] быть основополагающими методами для большей части современного ЯМР белков.

Метаболомика

В начале 2000-х годов Уишарт переключил свое внимание с больших молекул, таких как белки, на малые молекулы (метаболиты). В 2001 году он разработал, а затем запатентовал методы на основе ЯМР (что привело к созданию дочерней компании Chenomx [5] ), которые позволили быстро идентифицировать и количественно определять метаболиты с помощью ЯМР в биожидкостях. [28] В 2005 году он задумал проект «Метаболом человека» (HMP) [29] – метаболомный эквивалент проекта «Геном человека» . Уишарту удалось привлечь более 10 миллионов долларов финансирования от Genome Canada и запустить межинституциональную общеканадскую программу по систематическому выявлению всех метаболитов , лекарств и ксенобиотиков в клинически важных биожидкостях человека . Цель HMP — предоставить научному сообществу легкодоступные справочные данные о метаболитах человека, тем самым сделав анализ метаболомических данных более полным и намного более простым. По состоянию на 2022 год HMP все еще продолжается и привел к идентификации > 240 000 метаболитов человека, > 6 000 лекарств и метаболитов лекарств, > 70 000 пищевых компонентов и > 3 000 токсинов и загрязняющих веществ. [30] [31] [32] Эта информация, а также множество инструментов для облегчения идентификации и интерпретации метаболитов были заархивированы в нескольких общедоступных базах данных, созданных лабораторией Уишарта. К ним относится База данных метаболомов человека (HMDB), которая содержит данные о метаболитах человека и их структурах, а также описания, спектры ЯМР и спектры МС. [33] Еще одним ресурсом, разработанным в рамках проекта, является DrugBank , [31] база данных всех известных, одобренных лекарств и их целевых молекул. Другие базы данных, разработанные лабораторией Wishart, включают FooDB , [32] базу данных о пищевых компонентах и ​​пищевых добавках; и T3DB , [34] база данных токсичных соединений и загрязнителей, а также их токсикологического воздействия. Ресурсы метаболомной базы данных HMP широко используются: более 60 миллионов просмотров страниц в год, а статьи, связанные с HMP, цитировались более 30 000 раз за последние 10 лет. [ нужна цитата ]

В 2011 году Уишарт основал Инновационный центр метаболомики (TMIC) и был его первым директором (2011–2019). TMIC широко известна как национальная лаборатория метаболомики Канады. Лаборатория Уишарта в составе TMIC располагает современным оборудованием для ЖХ-МС , ГХ-МС и ЯМР стоимостью более 8 миллионов долларов. Его лаборатория регулярно обрабатывает более 20 000 образцов каждый год. Используя этот широкий набор оборудования, Уишарт помог разработать ряд методов количественной метаболомики для ЯМР [35] [36] и жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии. [37] [38]   Используя эти методы, Уишарт и его команда провели комплексный количественный анализ метаболома человеческой сыворотки, [39] мочи, [40] слюны, [41] спинномозговой жидкости [42] и кала. [43]

Вычислительная биология и открытая наука

Уишарт отмечен [ кем? ] за то, что он сделал все ресурсы своей лаборатории данными, компьютерные программы, алгоритмы и методы общедоступными. Эта инициатива открытой науки/открытого доступа была направлена ​​на предоставление инструментов и методов, которые сделают биомолекулярный ЯМР, метаболомику, структурную биологию и ряд связанных с ними методов более доступными для всех ученых. На данный момент эта инициатива привела лабораторию Уишарта к разработке и выпуску более 100 общедоступных веб-серверов и веб-баз данных, [44] включая NP-MRD [45] и CFM-ID. [46] Для дальнейшего развития своих усилий в области открытой науки Уишарт стал соучредителем нескольких образовательных программ по биоинформатике, таких как Канадские семинары по биоинформатике, и активно участвовал в других международных инициативах по стандартизации и открытому исходному коду, чтобы сделать ресурсы вычислительной биологии более широко доступными.

Личная жизнь

Уишарт женат на Дебби Уолдман, писателе и редакторе-фрилансере из Ютики, Нью-Йорк . У него двое детей: Элизабет, эпидемиолог; и Ной, инженер-строитель. Все они живут и работают в Эдмонтоне, Альберта. [ нужна цитата ]

Рекомендации

  1. ^ ab «Уишарт, доктор Дэвид - Фонд ASTech» . Проверено 8 апреля 2022 г.
  2. ^ ab "Дэвид Уишарт - Directory@UAlberta". apps.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
  3. ^ ab «Почетные стипендии - Общество метаболомики» . Проверено 08 апреля 2022 г.
  4. ^ «Люди». Инновационный центр метаболомики . Проверено 8 апреля 2022 г.
  5. ^ ab «Chenomx Inc | Открытие и измерение метаболитов» . Проверено 8 апреля 2022 г.
  6. ^ «ДругБанк | О ДругБанке» . www.drugbank.com . Проверено 08 апреля 2022 г.
  7. ^ «Наша команда - молекулярный ты» . молекулярный you.com . Проверено 08 апреля 2022 г.
  8. ^ "Дэвид Уишарт". ученый.google.com . Проверено 08 апреля 2022 г.
  9. ^ Иоаннидис, Джон Пенсильвания; Баас, Йерун; Клаванс, Ричард; Бояк, Кевин В. (12 августа 2019 г.). «Стандартизированная база данных авторов показателей цитирования, аннотированная для научной области». ПЛОС Биология . 17 (8): e3000384. дои : 10.1371/journal.pbio.3000384 . ISSN  1545-7885. ПМК 6699798 . ПМИД  31404057. 
  10. ^ Баас, Йерун; Бояк, Кевин; Иоаннидис, Джон П.А. (19 октября 2021 г.). «Обновление данных за август 2021 г. для «Обновленных общенаучных баз данных авторов стандартизированных показателей цитирования»». 3 . Эльзевир Б.В. дои :10.17632/btchxktzyw.3 . Проверено 17 декабря 2022 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  11. ^ «Высоко цитируемые исследователи». publons.com . Проверено 08 апреля 2022 г.
  12. ^ «Брайан Сайкс | Биохимия». www.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
  13. ^ «Заслуженный профессор Университета Альберты | Офис проректора и вице-президента (академический)» . www.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
  14. ^ Уишарт, Д.С.; Сайкс, Б.Д.; Ричардс, FM (18 февраля 1992 г.). «Индекс химического сдвига: быстрый и простой метод определения вторичной структуры белка с помощью ЯМР-спектроскопии». Биохимия . 31 (6): 1647–1651. дои : 10.1021/bi00121a010. ISSN  0006-2960. ПМИД  1737021.
  15. ^ Уишарт, Дэвид С.; Сайкс, Брайан Д. (март 1994 г.). «Индекс химического сдвига 13C: простой метод идентификации вторичной структуры белка с использованием данных о химическом сдвиге 13C». Журнал биомолекулярного ЯМР . 4 (2): 171–180. дои : 10.1007/BF00175245. ISSN  0925-2738. PMID  8019132. S2CID  42323147.
  16. ^ Бержанский, Марк В.; Уишарт, Дэвид С. (1 ноября 2005 г.). «Простой метод прогнозирования гибкости белка с использованием вторичных химических сдвигов». Журнал Американского химического общества . 127 (43): 14970–14971. дои : 10.1021/ja054842f. ISSN  0002-7863. ПМИД  16248604.
  17. ^ Бержанский, Марк В.; Уишарт, Дэвид С. (январь 2008 г.). «Применение индекса случайной катушки для изучения гибкости белка». Журнал биомолекулярного ЯМР . 40 (1): 31–48. дои : 10.1007/s10858-007-9208-0. ISSN  0925-2738. PMID  17985196. S2CID  40798448.
  18. ^ Бержанский, М.В.; Нил, С.; Уишарт, DS (1 июля 2006 г.). «PREDITOR: веб-сервер для прогнозирования ограничений угла скручивания белка». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Веб-сервер): W63–W69. дои : 10.1093/nar/gkl341. ISSN  0305-1048. ПМЦ 1538894 . ПМИД  16845087. 
  19. ^ Аб Хафса, Нур Э.; Уишарт, Дэвид С. (ноябрь 2014 г.). «CSI 2.0: значительно улучшенная версия индекса химического сдвига». Журнал биомолекулярного ЯМР . 60 (2–3): 131–146. doi : 10.1007/s10858-014-9863-x. ISSN  0925-2738. PMID  25273503. S2CID  24871947.
  20. ^ Хафса, Нур Э.; Арндт, Дэвид; Уишарт, Дэвид С. (1 июля 2015 г.). «CSI 3.0: веб-сервер для идентификации вторичной и супервторичной структуры белков с использованием химических сдвигов ЯМР». Исследования нуклеиновых кислот . 43 (П1): Ж370–Ж377. дои : 10.1093/nar/gkv494. ISSN  0305-1048. ПМЦ 4489240 . ПМИД  25979265. 
  21. ^ Бержанский, М.; Тан, П.; Лян, Дж.; Круз, Дж.А.; Чжоу, Дж.; Чжоу, Ю.; Бассетт, Э.; МакДонелл, К.; Лу, П.; Лин, Г.; Уишарт, DS (1 июля 2009 г.). «GeNMR: веб-сервер для быстрого определения структуры белка на основе ЯМР». Исследования нуклеиновых кислот . 37 (Веб-сервер): W670–W677. дои : 10.1093/nar/gkp280. ISSN  0305-1048. ПМК 2703936 . ПМИД  19406927. 
  22. ^ Уишарт, Д.С.; Арндт, Д.; Бержанский, М.; Тан, П.; Чжоу, Дж.; Лин, Г. (19 мая 2008 г.). «CS23D: веб-сервер для быстрого создания структуры белка с использованием химических сдвигов ЯМР и данных о последовательностях». Исследования нуклеиновых кислот . 36 (Веб-сервер): W496–W502. дои : 10.1093/нар/gkn305. ISSN  0305-1048. ПМЦ 2447725 . ПМИД  18515350. 
  23. ^ Хафса, Нур Э.; Бержанский, Марк В.; Арндт, Дэвид; Уишарт, Дэвид С. (январь 2018 г.). «Быстрое и надежное определение структуры белка с помощью химического сдвига». Журнал биомолекулярного ЯМР . 70 (1): 33–51. дои : 10.1007/s10858-017-0154-1. ISSN  0925-2738. PMID  29196969. S2CID  3495790.
  24. ^ Нил, Стивен (2003). «Быстрый и точный расчет химических сдвигов белков 1H, 13C и 15N». Журнал биомолекулярного ЯМР . 26 (3): 215–240. дои : 10.1023/А: 1023812930288. PMID  12766419. S2CID  29425090.
  25. ^ Хан, Бомсу; Лю, Ифэн; Гинзингер, Саймон В.; Уишарт, Дэвид С. (май 2011 г.). «SHIFTX2: значительно улучшено предсказание химического сдвига белка». Журнал биомолекулярного ЯМР . 50 (1): 43–57. дои : 10.1007/s10858-011-9478-4. ISSN  0925-2738. ПМК 3085061 . ПМИД  21448735. 
  26. ^ Ван, Боуэй; Ван, Юнджун; Уишарт, Дэвид С. (июнь 2010 г.). «Вероятностный подход к проверке присвоения химического сдвига белков ЯМР». Журнал биомолекулярного ЯМР . 47 (2): 85–99. doi : 10.1007/s10858-010-9407-y. ISSN  0925-2738. PMID  20446018. S2CID  22564072.
  27. ^ Чжан, Хайян; Нил, Стивен; Уишарт, Дэвид С. (2003). «RefDB: База данных единых химических сдвигов белков». Журнал биомолекулярного ЯМР . 25 (3): 173–195. дои : 10.1023/А: 1022836027055. PMID  12652131. S2CID  12786364.
  28. ^ "Сводка патентов правительства Канады" .
  29. ^ Уишарт, Дэвид С. (июнь 2007 г.). «Протеомика и проект метаболома человека». Экспертное обозрение по протеомике . 4 (3): 333–335. дои : 10.1586/14789450.4.3.333. ISSN  1478-9450. PMID  17552914. S2CID  9501798.
  30. ^ Уишарт, Дэвид С; Го, Анчи; Олер, Эпонина; Ван, Фэй; Анджум, Афия; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Сайида, Зинат; Тянь, Сыян; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк (07 января 2022 г.). «HMDB 5.0: База данных метаболомов человека на 2022 год». Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д622–Д631. дои : 10.1093/nar/gkab1062. ISSN  0305-1048. ПМЦ 8728138 . ПМИД  34986597. 
  31. ^ Ab Лоу, Вивиан; Нокс, Крейг; Джумбу, Янник; Джуисон, Тим; Го, Ань Чи; Лю, Ифэн; Мациевский, Адам; Арндт, Дэвид; Уилсон, Майкл; Невё, Ванесса; Тан, Александра (январь 2014 г.). «DrugBank 4.0: проливает новый свет на метаболизм лекарств». Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д1091–Д1097. дои : 10.1093/нар/gkt1068. ISSN  0305-1048. ПМЦ 3965102 . ПМИД  24203711. 
  32. ^ аб Скальберт, Огюстен; Андрес-Лакуэва, Кристина; Арита, Масанори; Крун, Пол; Манах, Клодин; Урпи-Сарда, Мирейя; Уишарт, Дэвид (11 мая 2011 г.). «Базы данных по пищевым фитохимическим веществам и их влиянию на здоровье». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 59 (9): 4331–4348. дои : 10.1021/jf200591d. ISSN  0021-8561. ПМИД  21438636.
  33. ^ Уишарт, Дэвид С; Го, Анчи; Олер, Эпонина; Ван, Фэй; Анджум, Афия; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Сайида, Зинат; Тянь, Сыян; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк (07 января 2022 г.). «HMDB 5.0: База данных метаболомов человека на 2022 год». Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д622–Д631. дои : 10.1093/nar/gkab1062. ISSN  0305-1048. ПМЦ 8728138 . ПМИД  34986597. 
  34. ^ Уишарт, Дэвид; Арндт, Дэвид; Пон, Эллисон; Саджед, Танвир; Го, Ань Чи; Джумбу, Янник; Нокс, Крейг; Уилсон, Майкл; Лян, Юнцзе; Грант, Джейсон; Лю, Ифэн (28 января 2015 г.). «T3DB: база данных токсичных экспозомов». Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Д1): Д928–Д934. дои : 10.1093/nar/gku1004. ISSN  1362-4962. ПМЦ 4383875 . ПМИД  25378312. 
  35. ^ Липферт, Матиас; Раут, Манодж Кумар; Бержанский, Марк; Уишарт, Дэвид С. (2019), Гауда, Г. А. Нагана; Рафтери, Дэниел (ред.), «Автоматизированные инструменты для анализа спектров 1D-ЯМР и 2D-ЯМР», Метаболомика на основе ЯМР , Методы молекулярной биологии, том. 2037, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer New York, стр. 429–449, номер документа : 10.1007/978-1-4939-9690-2_24, ISBN. 978-1-4939-9689-6, PMID  31463859, S2CID  201665386 , получено 8 апреля 2022 г.
  36. ^ Раванбахш, Сиамак; Лю, Филип; Бьёрдал, Трент К.; Мандал, Рупасри; Грант, Джейсон Р.; Уилсон, Майкл; Эйснер, Роман; Синельников Игорь; Ху, Сяоюй; Лучинат, Клаудио; Грейнер, Рассел (27 мая 2015 г.). Монлеон, Дэниел (ред.). «Точное, полностью автоматизированное спектральное профилирование ЯМР для метаболомики». ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0124219. arXiv : 1409.1456 . Бибкод : 2015PLoSO..1024219R. дои : 10.1371/journal.pone.0124219 . ISSN  1932-6203. ПМК 4446368 . ПМИД  26017271. 
  37. ^ Чжэн, Цзямин; Чжан, Лунь; Джонсон, Мэтью; Мандал, Рупасри; Уишарт, Дэвид С. (04 августа 2020 г.). «Комплексный целевой метаболомный анализ мочи». Аналитическая химия . 92 (15): 10627–10634. doi : 10.1021/acs.analchem.0c01682. ISSN  0003-2700. PMID  32634308. S2CID  220405141.
  38. ^ Чжэн, Цзямин; Мандал, Рупасри; Уишарт, Дэвид С. (декабрь 2018 г.). «Чувствительный высокопроизводительный метод ЖХ-МС/МС для измерения катехоламинов в сыворотке малого объема». Аналитика Химика Акта . 1037 : 159–167. Бибкод : 2018AcAC.1037..159Z. дои : 10.1016/j.aca.2018.01.021. PMID  30292290. S2CID  52931501.
  39. ^ Психогиос, Николаос; Хау, Дэвид Д.; Пэн, Цзюнь; Го, Ань Чи; Мандал, Рупасри; Буатра, Сухайла; Синельников Игорь; Кришнамурти, Раманарайан; Эйснер, Роман; Гаутам, Биджая; Янг, Нельсон (16 февраля 2011 г.). Флауэр, Даррен (ред.). «Метаболом человеческой сыворотки». ПЛОС ОДИН . 6 (2): e16957. Бибкод : 2011PLoSO...616957P. дои : 10.1371/journal.pone.0016957 . ISSN  1932-6203. ПМК 3040193 . ПМИД  21359215. 
  40. ^ Буатра, Сухайла; Азиат, Фарид; Мандал, Рупасри; Го, Ань Чи; Уилсон, Майкл Р.; Нокс, Крейг; Бьорндаль, Трент К.; Кришнамурти, Раманарайан; Салим, Фозия; Лю, Филип; Дам, Зерихун Т. (4 сентября 2013 г.). Дзея, Пятрас (ред.). «Метаболом мочи человека». ПЛОС ОДИН . 8 (9): e73076. Бибкод : 2013PLoSO...873076B. дои : 10.1371/journal.pone.0073076 . ISSN  1932-6203. ПМЦ 3762851 . ПМИД  24023812. 
  41. ^ Дама, Зерихун Т.; Азиат, Фарид; Мандал, Рупасри; Кришнамурти, Рам; Буатра, Сухайла; Борзуи, Сима; Го, Ань Чи; Саджед, Танвир; Дэн, Лу; Лин, Хонг; Лю, Филип (декабрь 2015 г.). «Метаболом слюны человека». Метаболомика . 11 (6): 1864–1883. дои : 10.1007/s11306-015-0840-5. ISSN  1573-3882. S2CID  18794642.
  42. ^ Мандал, Рупасри; Го, Ань Чи; Чаудхари, Крути К; Лю, Филип; Яллоу, Файзат С; Донг, Эдисон; Азиат, Фарид; Уишарт, Дэвид С. (2012). «Мультиплатформенная характеристика метаболома спинномозговой жидкости человека: комплексное и количественное обновление». Геномная медицина . 4 (4): 38. дои : 10,1186/gm337 . ISSN  1756-994Х. ПМК 3446266 . ПМИД  22546835. 
  43. ^ Кару, Наама; Дэн, Лу; Слае, Мордехай; Го, Ань Чи; Саджед, Танвир; Хюнь, Хиен; Вино, Эйтан; Уишарт, Дэвид С. (ноябрь 2018 г.). «Обзор метаболомики фекалий человека: методы, приложения и база данных метаболомов фекалий человека». Аналитика Химика Акта . 1030 : 1–24. Бибкод : 2018AcAC.1030....1K. дои : 10.1016/j.aca.2018.05.031. PMID  30032758. S2CID  51710218.
  44. ^ «Веб-серверы - Исследовательская группа Wishart» . www.wishartlab.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
  45. ^ Уишарт, Дэвид С; Сайида, Зинат; Будински, Закари; Го, Анчи; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк; Рут, Манодж; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Ма, Роберт; Торрес-Кальсада, Клаудия (07 января 2022 г.). «NP-MRD: База данных магнитного резонанса натуральных продуктов». Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д665–Д677. дои : 10.1093/nar/gkab1052. ISSN  0305-1048. ПМЦ 8728158 . ПМИД  34791429. 
  46. ^ Ван, Фэй; Лийганд, Яанус; Тянь, Сыян; Арндт, Дэвид; Грейнер, Рассел; Уишарт, Дэвид С. (31 августа 2021 г.). «CFM-ID 4.0: более точный спектральный прогноз ESI-MS/MS и идентификация соединений». Аналитическая химия . 93 (34): 11692–11700. doi : 10.1021/acs.analchem.1c01465. ISSN  0003-2700. ПМК 9064193 . PMID  34403256. S2CID  237197237.