Киммен Шёландер (урожденная Варнов) — почетный профессор факультета биоинженерии Калифорнийского университета в Беркли . Она хорошо известна своей работой по анализу последовательностей белков .
Шёландер работала как в бакалавриате, так и в аспирантуре Калифорнийского университета в Санта-Крус на факультете компьютерных наук, получив степень бакалавра в 1993 году и доктора философии в 1997 году под руководством Дэвида Хаусслера . [1] Она была главным научным сотрудником группы молекулярных приложений с 1997 по 1999 год (соучредителем компании является Майкл Левитт ), а затем главным научным сотрудником в области белковой информатики в Celera Genomics с 1999 по 2001 год, где она была членом команды ( вместе с Дж. Крейгом Вентером и Джином Майерсом ), которые собрали и аннотировали геном человека. [2] Она поступила на факультет биоинженерии Калифорнийского университета в Беркли в 2001 году в качестве доцента. В 2006 году она получила должность профессора, а в 2012 году получила звание профессора. [1]
В 2003 году Шёландер получил премию NSF CAREER Award [1] и президентскую премию за раннюю карьеру для ученых и инженеров. [3]
Шёландер наиболее известна своей работой в области филогеномных методов анализа последовательностей белков, включая методы машинного обучения для предсказания функциональных сайтов и идентификации ортологов, а также методы скрытой модели Маркова (HMM) для предсказания структуры белка, классификации функциональных подсемейств и ортологов, дистанционного обнаружения гомологии. , множественное выравнивание последовательностей и оценка филогенетического дерева. Ее алгоритмы использовались при функциональной аннотации генома человека в Celera Genomics , в биоинформатических базах данных и порталах PhyloFacts, а также вносились в базу данных ModBase .
Сестра-близнец Шёландера Тэнди Варнов — профессор информатики в Университете Иллинойса Урбана-Шампейн .