Киммен Шёландер (урожденная Варнов) — почетный профессор Калифорнийского университета в Беркли на кафедре биоинженерии. Она хорошо известна своей работой по анализу белковой последовательности .
Шёландер получила степень бакалавра и магистра в Калифорнийском университете в Санта-Крузе на кафедре компьютерных наук, получив степень бакалавра в 1993 году и степень доктора философии в 1997 году под руководством Дэвида Хаусслера . [1] Она была главным научным сотрудником в Molecular Applications Group с 1997 по 1999 год (компания, соучредителем которой был Майкл Левитт ), а затем главным научным сотрудником по белковой информатике в Celera Genomics с 1999 по 2001 год, где она была членом команды (вместе с Дж. Крейгом Вентером и Джином Майерсом ), которая собрала и аннотировала геном человека. [2] Она присоединилась к факультету Калифорнийского университета в Беркли на кафедре биоинженерии в 2001 году в качестве доцента. Она была принята на постоянную должность в 2006 году и повышена до полного профессора в 2012 году. [1]
В 2003 году Шёландер получил премию NSF CAREER Award [1] и Президентскую премию Early Career Award для учёных и инженеров. [3]
Шёландер наиболее известна своей работой в области филогеномных методов анализа последовательностей белков, включая методы машинного обучения для функционального прогнозирования сайтов и идентификации ортологов, а также методы скрытой марковской модели (HMM) для прогнозирования структуры белков, функциональной классификации подсемейств и ортологов, удаленного обнаружения гомологии, множественного выравнивания последовательностей и оценки филогенетического дерева. Ее алгоритмы использовались в функциональной аннотации генома человека в Celera Genomics , в биоинформатических базах данных и порталах PhyloFacts и вносились в базу данных ModBase .
Сестра-близнец Шёландер, Тэнди Уорнов, является профессором компьютерных наук в Иллинойсском университете в Урбане-Шампейне .