stringtranslate.com

Дэвид Колкухун

Дэвид Колкухун, FRS MAE (родился 19 июля 1936 г.), британский фармаколог из Университетского колледжа Лондона (UCL). [5] Он внес вклад в общую теорию рецепторных и синаптических механизмов, и в частности в теорию и практику функции одиночного ионного канала . С 1985 по 2004 год он занимал кафедру фармакологии имени Эй. Дж. Кларка в UCL и был достопочтенным. Директор Wellcome лаборатории молекулярной фармакологии. Он был избран членом Королевского общества (FRS) в 1985 году [6] и почетным членом UCL в 2004 году. Колкухун руководит веб-сайтом DC's Improbable Science , [3] который критикует псевдонауку , особенно альтернативную медицину , и менеджеризм . [1]

ранняя жизнь и образование

Колкухун родился 19 июля 1936 года в Биркенхеде, Великобритания. [2] Он получил образование в школе Биркенхед и Ливерпульском техническом колледже . После неудачной работы учеником фармацевта у него возникла мотивация заняться исследованиями. [7] Он получил степень бакалавра наук в Университете Лидса по специализации в области фармакологии, а затем защитил докторскую диссертацию в Эдинбургском университете [8] , где изучал связывание иммуноглобулинов с легочной тканью. Его руководителями были Уолтер Перри и У. Э. Броклхерст. Во время обучения Колкухун развил интерес к статистике и случайным процессам , которые повлияют на его исследования в последующие годы.

После получения докторской степени Колкухун провел дальнейшие исследования (в основном безуспешные) иммунологических проблем в UCL с 1964 по 1969 год. За это время он опубликовал книгу по статистике. [9] После этого он закончил стажировку в Йельском университете и в Университете Саутгемптона . [7] Он вернулся на факультет фармакологии UCL в 1979 году, где и остается с тех пор. В 2007 году Малкольм Грант положил конец деятельности кафедры, положив конец ее выдающейся 102-летней истории (см. Кафедру фармакологии Университетского колледжа Лондона, 1905–2007 ).

Научная карьера

Колкухун исследовал природу молекулярных взаимодействий, которые заставляют одиночные ионные каналы открываться и закрываться, а также то, что контролирует скорость синаптических событий. Изобретение и успешное применение техники патч-зажима Эрвином Неером и Бертом Сакманном позволило наблюдать и фиксировать отдельные открытия и закрытия одиночных ионных каналов. Однако экспериментально наблюдаемые записи носят случайный характер. [10] С помощью статистика Алана Г. Хоукса Колкухун разработал статистический метод для интерпретации данных и проверки предполагаемых количественных механизмов функционирования ионных каналов. [11]

Работа с одноионными каналами

Курсовой дизайн кружки для кафедры фармакологии UCL

В 1977 году Колкухун и Хоукс [12] предсказали, что открытия ионных каналов будут происходить короткими всплесками, а не отдельными открытиями, и это предсказание было подтверждено в экспериментах Берта Сакмана в Геттингене и Лондоне (1981). [13] [14] Эта работа привела к первому решению классической фармакологической проблемы отдельного измерения сродства и эффективности агониста . [15] В контексте ионных каналов эта проблема также известна как проблема связывания/затвора. Эта проблема остается нерешенной для рецепторов, связанных с G-белком, поскольку в 1987 году было показано, что классические методы определения сродства и эффективности основаны на заблуждениях. [16]

Статья 1985 года позже была номинирована журналом «Журнал физиологии» как «классическая» [17] . [18] В 1982 году Колкухун и Хоукс опубликовали статью [19] по теории всплесков (и кластеров всплесков), в которой было дано общее выражение для распределения длины всплеска (показанное здесь на дизайне кружки для тех, кто посещает курс, предназначенный для обучения математике, необходимой для решения уравнения). [20]

Было ясно, что именно длина всплеска контролирует скорость затухания синаптических токов, хотя формальная зависимость не была получена до 1998 года. [21]

Пропущенные короткие события

Хотя общая теория одноканального поведения была завершена в 1982 году, ее нельзя было использовать на практике для подгонки механизмов к данным, поскольку записывающее устройство неспособно обнаруживать события короче, чем в лучшем случае около 20 микросекунд. Отсутствие коротких ставней приводит к тому, что проемы кажутся длиннее, чем они есть на самом деле (то же самое касается и ставней). Чтобы использовать метод максимального правдоподобия, было важно получить распределение продолжительности того, что действительно видно, кажущегося времени открытия и кажущегося времени закрытия. Хотя преобразование Лапласа этих распределений было известно, считалось, что они не обратимы, пока Хоукс и Джалали не нашли точное решение в 1990 году. [22] Точное решение представляло собой кусочное выражение, которое становилось все более сложным по мере увеличения длины открытия. (или закрытие) увеличилось. Решение стало пригодным для использования на практике после того, как Хоукс и Джалали обнаружили элегантное асимптотическое решение в 1992 году. [23] Применение точного решения для совместных и условных распределений в 1996 году [24] открыло дверь для аппроксимации методом максимального правдоподобия, которая была реализована в компьютерная программа HJCFIT [25] , которая легла в основу последующих экспериментальных работ. Распределения кажущегося времени открытия и закрытия часто называют распределениями HJC (по Хоуксу, Джалали, Колкухуну). [11]

Промежуточные закрытые состояния

Все ранние работы были основаны на механизмах, которые, по сути, были обобщением простой схемы, предложенной дель Кастильо и Кацем в 1957 году [26] , в которой рецептор существовал только в двух конформациях: открытой и закрытой. И только когда рецептор глицина был исследован, стало понятно, что можно обнаружить промежуточное закрытое состояние (названное «перевернутой» конформацией) между конформацией покоя и открытым состоянием. [27] Впоследствии было обнаружено, что эта дополнительная «перевернутая» конформация также обнаруживается в никотиновом рецепторе ацетилхолина . Лапе и др. (2008) [28] обнаружили, что частичные агонисты были частичными не из-за дефицита самой открытой реакции, как предполагалось с 1957 года, а из-за дефицита на более ранней стадии, нежелания двигаться из конформации покоя. в промежуточное закрытое состояние, предшествующее открытию. Фактическое изменение конформации «закрыто-открыто» оказалось почти таким же для частичных агонистов, как и для полных агонистов. В первоначальной формулировке реакция переворота предполагалась как согласованный переход. Суть этого нового механизма была подтверждена Мухтасимовой и др. (2009), [29] , которые обобщили это на случай, когда субъединицы могут переворачиваться независимо.

Статистические выводы

После ухода из работы с одиночными ионными каналами Колкухун сохранил интерес к статистическим выводам. Его статья 2014 года «Исследование частоты ложных открытий и неправильной интерпретации p- значений» [30] внесла свой вклад в дебаты о p-значениях и в обсуждение воспроизводимости в науке. За этой статьей последовали другие, в которых исследовались основы индуктивного вывода [31] и более глубоко исследовались альтернативы использованию значений p . [32] [4] Опасность зависимости от значений p была подчеркнута в [32] , указав, что даже наблюдение p = 0,001 не обязательно является убедительным доказательством против нулевой гипотезы. Несмотря на то, что отношение правдоподобия в пользу альтернативной гипотезы по сравнению с нулевой близко к 100, если бы гипотеза была неправдоподобной, а априорная вероятность реального эффекта была бы равна 0,1, даже наблюдение p = 0,001 имело бы ложноположительный результат. риск 8 процентов. Он не достигнет даже 5-процентного уровня. Было рекомендовано не использовать термины «значительный» и «незначительный». Значения P и доверительные интервалы по-прежнему должны быть указаны, но они должны сопровождаться указанием риска ложноположительного результата. Было высказано предположение, что лучший способ сделать это — вычислить априорную вероятность, в которую нужно было бы поверить, чтобы достичь ложноположительного риска, скажем, 5%. Или, возможно, проще, значение p можно дополнить минимальным ложноположительным риском FPR 50 , рассчитанным для априорной вероятности 0,5. [4] Хотя это было бы безопасно только для правдоподобных гипотез, это было бы большим улучшением в предоставлении значений p и доверительных интервалов. Расчеты можно выполнять с помощью прилагаемых R-скриптов [32] [4] или, проще говоря, с помощью веб-калькулятора. [33]

Критика научного мошенничества, альтернативной медицины и менеджериализма

Колкухун на протяжении многих лет был откровенным критиком лженауки и научного мошенничества . Он много писал на эту тему, включая статьи и письма в журналах Nature [34] [35] [36] и The Guardian . [37] Он особенно критически относится к альтернативной медицине , а также к решению ряда британских университетов предлагать научные степени, включающие курсы по дополнительной и альтернативной медицине, такой как гомеопатия и иглоукалывание . [34] заявляя, что они « антинаучны » и что «университетам, которые ими управляют, должно быть стыдно за себя». [38] Его интерес к выводам распространяется на методы, которые используются для оценки и управления наукой, а также на критическую оценку исследовательских « метрик ». [39] В декабре 2009 года Колкухун выиграл решение по делу о свободе информации после трехлетней кампании, требующей от Университета Центрального Ланкашира обнародовать подробности своего курса бакалавриата по гомеопатии. [40] [41]

Веб-сайт Improbable Science округа Колумбия

Колкухун создал свой личный веб-сайт DC's Improbable Science [3] , посвященный критике лженауки , в 2001 году. Особое внимание он уделяет альтернативной медицине (АМ), включая такие практики, как гомеопатия , традиционная китайская медицина , фитотерапия и другие. называя их «чистой тарабарщиной». Помимо своего откровенного неодобрения АМ в академических кругах, Колкухун часто выступает на своем веб-сайте против искажения АМ как науки в средствах массовой информации, а также против государственной поддержки АМ. В его блоге обсуждаются также более широкие проблемы науки, медицины и высшего образования. В 2009 году он был включен в число 100 лучших блогов. [42] Это был блог недели в журнале New Statesman (30 мая 2010 г.). А в 2012 году он стал одним из лауреатов первой премии британских научных блогов, присуждаемой Обществом хорошего мышления. [43] Самый читаемый пост в его блоге , однако, не связан с альтернативной медициной, а посвящен смерти Стефана Гримма : «Опубликуй и погибни в Имперском колледже Лондона: смерть Стефана Гримма», [44] просмотрено более 200 000 раз.

Споры по поводу хостинга веб-сайтов

В мае 2007 года Колкухун объявил на своем веб-сайте, что недавние комментарии, которые он сделал, ставящие под сомнение обоснованность заявлений Энн Уокер, преподавателя диетологии в Университете Рединга и травника , привели к жалобе Малкольму Гранту , ректору UCL. . [45] В ответ на юридические угрозы со стороны Алана Лейкина, мужа Уокер, Грант потребовал от Колкухуна удалить его веб-сайт с сервера UCL. Это вызвало протест научного сообщества, сославшегося на нарушение академической свободы Колкухуна . В конечном итоге Грант пересмотрел свое решение, и 13 июня 2007 года он и Колкухун опубликовали совместное заявление о том, что веб-сайт Колкухуна будет восстановлен с некоторыми изменениями, внесенными по совету адвоката. [46] К тому времени веб-страницы были перенесены в соответствующий блог и так и не вернулись на сервер UCL.

Альтернативная медицина и правительство

Колкухун был членом Комитета по вопросам поведения и компетентности Совета по дополнительному и естественному здравоохранению (CNHC), регулирующего органа альтернативной медицины в Великобритании. Колкухун заявил, что был удивлен тем, что его приняли на эту должность. Однако в августе 2010 года он был уволен. [47]

Колкухун продолжает писать об опасности того, что индустрия альтернативной медицины использует государственное регулирование в своих целях. В статье 2012 года из Медицинского журнала шотландского университета он написал: [48]

Существуют различные уровни регулирования. «Высший» уровень – это законодательное регулирование остеопатии и хиропрактики. Генеральный совет хиропрактики (GCC) имеет тот же правовой статус, что и Генеральный медицинский совет (GMC). Такое нелепое положение дел возникло потому, что никто в правительстве Джона Мейджора не обладал достаточными научными знаниями, чтобы понять, что хиропрактика и некоторые разделы остеопатии являются чистым шарлатанством. Проблема в том, что такие организации, как GCC, больше занимаются продвижением своей дисциплины, а не ее регулированием.

Награды и почести

Колкухун был избран членом Королевского общества (FRS) в 1985 году [6] [2] и награжден премией Гумбольдта в 1990 году.

Личная жизнь

В 1976 году он женился на Маргарет Энн Бултвуд. У них есть сын и две внучки.

За пределами академических кругов Колкухун увлекался (в хронологическом порядке) боксом, парусным спортом (21-футовый, а затем и 31-футовый шлюп), пилотированием легких самолетов, бегом на длинные дистанции (10 км, полумарафон и марафон) и ходьбой по горам. [49] В 1988 году он пробежал Лондонский марафон за 3 часа 57 минут. К своему 65-летию в 2001 году он прошёл через Альпы (Оберстдорф, Германия, до Мерано, Италия). [50]

Рекомендации

  1. ^ Публикации ab Дэвида Колкухуна, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ abc Анон (2015). «Колкухун, профессор Дэвид» . Кто есть кто (онлайн- изд. Oxford University Press  ). А&С Черный. дои : 10.1093/ww/9780199540884.013.U11583. (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании.)
  3. ^ abc «Невероятная наука Дэвида Колкухуна: правда, ложь и доказательства, исследования сомнительной и нечестной науки». Архивировано из оригинала 2 марта 2013 года.
  4. ^ abcd Колкухун, Дэвид (2019). «Риск ложноположительного результата: предложение относительно того, что делать с p-значениями». Американский статистик . 73 (Sup 1): 192–201. arXiv : 1802.04888 . дои : 10.1080/00031305.2018.1529622. S2CID  85530643.
  5. ^ «Фармакология UCL: профессор Дэвид Колкухун». Университетский колледж Лондона . 14 февраля 2019 г.
  6. ^ ab "Профессор Дэвид Колкухун, FRS". Лондон: Королевское общество . Архивировано из оригинала 17 ноября 2015 года.
  7. ^ ab «Необычный ученый с большим количеством здравого смысла» (PDF) . Университетский колледж Лондона . {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  8. ^ Колкухун, Дэвид (1964). «Характеристика и адсорбция сенсибилизирующих антител». {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  9. ^ Колкухун, Дэвид (1971). Лекции по биостатистике: введение в статистику с приложениями в биологии и медицине . Оксфорд: Кларендон Пресс. ISBN 978-0-19-854119-6.
  10. ^ «Ученые: Дэвид Колкухун» (PDF) . Университетский колледж Лондона . {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  11. ^ аб Колкухун, Д.; Хаттон, CJ; Хоукс, AG (2003). «Качество оценок максимального правдоподобия констант скорости ионных каналов». Журнал физиологии . 547 (3): 699–728. doi : 10.1113/jphysicalol.2002.034165. ПМК 2342730 . ПМИД  12562901. 
  12. ^ Колкухун, Д.; Хоукс, АГ (1977). «Релаксация и колебания мембранных токов, протекающих через каналы, управляемые лекарствами». Труды Королевского общества B: Биологические науки . 199 (1135): 231–262. Бибкод : 1977RSPSB.199..231C. дои :10.1098/rspb.1977.0137. PMID  22856. S2CID  6060354.
  13. ^ Колкухун, Д.; Сакманн, Б. (1981). «Колебания в микросекундном временном диапазоне тока через одиночные ионные каналы рецептора ацетилхолина». Природа . 294 (5840): 464–466. Бибкод : 1981Natur.294..464C. дои : 10.1038/294464a0. PMID  6273743. S2CID  4353962.
  14. ^ Колкухун, Д.; Сакманн, Б. (1985). «Быстрые события в одноканальных токах, активируемых ацетилхолином и его аналогами на концевой пластинке мышцы лягушки». Журнал физиологии . 369 : 501–557. doi : 10.1113/jphysical.1985.sp015912. ПМК 1192660 . ПМИД  2419552. 
  15. ^ Колкухун, Д. (1998). «Связывание, ворота, сродство и эффективность: интерпретация отношений структура-активность агонистов и эффектов мутирующих рецепторов». Британский журнал фармакологии . 125 (5): 923–947. дои : 10.1038/sj.bjp.0702164. ПМЦ 1565672 . ПМИД  9846630. 
  16. ^ Колкухун Д. (1987). Сродство, эффективность и классификация рецепторов: полезна ли еще классическая теория? В книге «Перспективы классификации гормональных рецепторов» под ред. Блэк Дж.В., Дженкинсон Д.Х. и В.П. Герскович, стр. 103–114. Алан Р. Лисс Инк., Нью-Йорк.
  17. ^ Классические перспективы: «Классические перспективы — это комментарии к «классическим» статьям в журнале, которые стимулировали новые направления исследований и по-прежнему высоко цитируются. Статьи написаны признанными экспертами в области, охватываемой статьей, и должны указывать, как статья внесла свой вклад в текущие разработки в этой области». Журнал физиологии
  18. ^ Колкухун, Д. (2007). «Чему мы научились благодаря одиночным ионным каналам?». Журнал физиологии . 581 (2): 425–427. doi : 10.1113/jphysyol.2007.131656. ПМК 2075201 . ПМИД  17363381. 
  19. ^ Колкухун, Д.; Хоукс, АГ (1982). «О стохастических свойствах всплесков одиночных отверстий ионных каналов и кластеров всплесков». Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 300 (1098): 1–59. Бибкод : 1982RSPTB.300....1C. дои : 10.1098/rstb.1982.0156 . ПМИД  6131450.
  20. ^ Семинар UCL Анализ и интерпретация записей одиночных ионных каналов и макроскопических токов с использованием матричных методов.
  21. ^ Уилли, DJA; Бехе, П.; Колкухун, Д. (1998). «Одноканальные активации и скачки концентрации: сравнение рекомбинантных NR1a/NR2A и NR1a/NR2D NMDA-рецепторов». Журнал физиологии . 510 (Часть 1): 1–18. дои : 10.1111/j.1469-7793.1998.001bz.x. ПМК 2231013 . ПМИД  9625862. 
  22. ^ Хоукс, AG; Джалали, А.; Колкухун, Д. (1990). «Распределение кажущегося времени открытия и времени закрытия в одноканальной записи, когда краткие события не могут быть обнаружены». Философские труды Королевского общества A: Математические, физические и технические науки . 332 (1627): 511–538. Бибкод : 1990RSPTA.332..511H. дои : 10.1098/rsta.1990.0129. S2CID  122883551.
  23. ^ Колкухун, Д.; Джалали, А.; Хоукс, AG (1992). «Асимптотическое распределение кажущегося времени открытия и закрытия в записи одного канала с учетом пропуска кратких событий». Философские труды Лондонского королевского общества Б. 337 (1282): 383–404. Бибкод : 1992RSPTB.337..383H. дои : 10.1098/rstb.1992.0116. ПМИД  1279733.
  24. ^ Колкухун, Д.; Хоукс, АГ; Сродзинский, К. (1996). «Совместное распределение кажущегося времени открытия и закрытия одноионных каналов и подбор механизмов максимального правдоподобия». Философские труды Королевского общества A: Математические, физические и технические науки . 354 (1718): 2555–2590. Бибкод : 1996RSPTA.354.2555C. дои : 10.1098/rsta.1996.0115. S2CID  118010415.
  25. Сивилотти, Люсия (10 марта 2011 г.). «Описание программ». OneMol.org.uk.
  26. ^ Кастильо, JD; Кац, Б. (1957). «Взаимодействие на рецепторах концевой пластинки между различными производными холина». Труды Королевского общества B: Биологические науки . 146 (924): 369–381. Бибкод : 1957RSPSB.146..369C. дои :10.1098/rspb.1957.0018. PMID  13431862. S2CID  6302752.
  27. ^ Бурзомато, В.; Беато, М.; Грут-Кормелинк, П.Дж.; Колкухун, Д.; Сивилотти, LG (2004). «Одноканальное поведение гетеромерных 1-глициновых рецепторов: попытка обнаружить конформационное изменение до открытия канала». Журнал неврологии . 24 (48): 10924–10940. doi : 10.1523/JNEUROSCI.3424-04.2004 . ПМК 6730200 . ПМИД  15574743. 
  28. ^ Лапе, Р.; Колкухун, Д.; Сивилотти, LG (2008). «О природе частичного агонизма в суперсемействе никотиновых рецепторов». Природа . 454 (7205): 722–727. Бибкод : 2008Natur.454..722L. дои : 10.1038/nature07139. ПМЦ 2629928 . ПМИД  18633353. 
  29. ^ Мухтасимова, Н.; Ли, Вайоминг; Ван, Х.Л.; Сине, С.М. (2009). «Обнаружение и улавливание промежуточных состояний, запускающих открытие каналов никотиновых рецепторов». Природа . 459 (7245): 451–454. Бибкод : 2009Natur.459..451M. дои : 10.1038/nature07923. ПМЦ 2712348 . ПМИД  19339970. 
  30. ^ Колкухун, Дэвид (2015). «Расследование частоты ложных открытий и неправильной интерпретации p-значений». Королевское общество открытой науки . 1 (3): 140216. arXiv : 1407.5296 . Бибкод : 2014RSOS....140216C. дои : 10.1098/rsos.140216. ПМЦ 4448847 . ПМИД  26064558. 
  31. ^ Колкухун, Дэвид. «Проблема с p-значениями». Журнал Эон . Проверено 11 декабря 2016 г.
  32. ^ abc Колкухун, Дэвид (2017). «Воспроизводимость исследований и неверная интерпретация p-значений». Королевское общество открытой науки . 4 (12): 171085. doi :10.1098/rsos.171085. ПМК 5750014 . ПМИД  29308247. 
  33. ^ Лонгстафф, Колин; Колкухун, Дэвид. «Калькулятор риска ложного срабатывания (FPR)». УКЛ.
  34. ^ аб Колкухун, Д. (2007). «Научные степени без науки». Природа . 446 (7134): 373–374. Бибкод : 2007Natur.446..373C. дои : 10.1038/446373a. PMID  17377563. S2CID  29071826.
  35. ^ Колкухун, Д. (2009). «Высокомерие попыток суммировать способности в цифрах». Природа . 458 (7235): 145. Бибкод : 2009Natur.458..145C. дои : 10.1038/458145c . ПМИД  19279607.
  36. ^ Колкухун, Д. (2003). «Бросая вызов тирании импакт-факторов». Природа . 423 (6939): 479. Бибкод : 2003Natur.423..479C. дои : 10.1038/423479а . ПМИД  12774093.
  37. Колкухун, Дэвид (15 августа 2007 г.). «Эпоха затмения». Хранитель .
  38. ^ «Рост числа заявок на «мягкие» предметы подвергается критике, поскольку традиционные курсы проигрывают» . 27 июля 2007 г.
  39. ^ Колкухун, Дэвид (2007). «Как получить хорошую науку». Новости физиологии . 69 : 12–14.
  40. ^ Апелляционное решение Информационного трибунала
  41. ^ Ответ Колкухуна на приговор
  42. Эпплярд, Брайан (22 февраля 2009 г.). «Путеводитель по 100 лучшим блогам: часть II». Санди Таймс . Архивировано из оригинала 28 мая 2015 года . Проверено 5 февраля 2013 г.
  43. ^ Научный блог Великобритании. Общество доброго мышления.
  44. Колкухун, Дэвид (1 декабря 2014 г.). «Опубликовать и погибнуть в Имперском колледже Лондона: смерть Стефана Гримма». DCscience.net . Проверено 25 сентября 2015 г.
  45. ^ «Свобода слова и спорные травники».
  46. ^ «Совместное заявление профессора Колкухуна и UCL». Университетский колледж Лондона . 12 июня 2007 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  47. ^ «Почему Совет по дополнительному и естественному здравоохранению (CNHC) не может добиться успеха (в результате чего DC увольняют)» . 11 августа 2010 г.
  48. ^ Колкухун, Дэвид (2012). «Регулирование альтернативной медицины – почему это не работает» (PDF) . Медицинский журнал шотландских университетов .
  49. ^ "Спорт округа Колумбия" . Дэвид Колкухун . Проверено 3 декабря 2019 г.
  50. ^ «Прогулка по Альпам, 2001». Дэвид Колкухун . Проверено 2 июня 2019 г.

Внешние ссылки