stringtranslate.com

Консорциум по штрихкоду жизни

Консорциум по штрихкоду жизни ( CBOL ) был международной инициативой, направленной на поддержку разработки ДНК-штрихкодирования в качестве глобального стандарта для идентификации видов. [1] Секретариат CBOL находится в Национальном музее естественной истории Смитсоновского института в Вашингтоне, округ Колумбия. Штрихкодирование было предложено в 2003 году профессором Полом Хебертом из Университета Гвельфа в Онтарио как способ различения и идентификации видов с помощью короткой стандартизированной последовательности генов. Хеберт предложил 658 оснований региона Фолмера митохондриального гена цитохром-С-оксидазы-1 в качестве стандартного региона штрихкода. Хеберт является директором Института биоразнообразия Онтарио, Канадского центра ДНК-штрихкодирования и Международного проекта «Штрихкод жизни» (iBOL), все из которых находятся в Университете Гвельфа. Системы данных о штрихкоде жизни (BOLD) также находятся в Университете Гвельфа.

CBOL был создан в мае 2004 года при поддержке Фонда Альфреда П. Слоана после двух встреч в 2003 году, также финансируемых Фондом Слоана, в Центре Банбери, Лаборатории Колд-Спринг-Харбор. С тех пор более 200 организаций из более чем 50 стран присоединились к CBOL и согласились разместить свои данные штрихкодов в общедоступной базе данных. CBOL продвигает ДНК-штрихкодирование посредством семинаров, рабочих групп, международных конференций, выездных встреч в развивающихся странах, плановых встреч для проектов штрихкодирования и производства выездных материалов для повышения осведомленности о штрихкодировании. Рабочая группа по базам данных CBOL разработала стандарт данных, который одобрили GenBank , Европейский институт биоинформатики и Банк данных ДНК Японии . Рабочая группа по растениям CBOL предложила matK и rbcL в качестве стандартных областей штрихкода для наземных растений; CBOL одобрила это предложение в конце 2005 года. Рабочая группа по грибам определила ITS как лучшую область штрихкода для грибов, а рабочая группа CBOL по протистам анализирует области-кандидаты для групп протистов. [2] CBOL помогла спланировать и запустить глобальные кампании по штрихкодированию всех видов рыб и птиц, а также социально-экономически важных групп, таких как плодовые мушки.

Одним из основных вкладов CBOL в успех штрихкодирования стала его работа с государственными учреждениями (сельского хозяйства, охраны окружающей среды, охраны природы и другими) и международными организациями ( СИТЕС , Конвенция о биологическом разнообразии , Продовольственная и сельскохозяйственная организация ), которые могли бы извлечь выгоду из штрихкодирования.

Ссылки

  1. ^ Hebert, PDN; Cywinska, A.; Ball, SL; deWaard, JR (7 февраля 2003 г.). «Биологическая идентификация с помощью ДНК-штрихкодов». Труды Королевского общества B: Биологические науки . 270 (1512): 313–321. doi : 10.1098/rspb.2002.2218. PMC  1691236. PMID  12614582.
  2. ^ Ян Павловски; Стефан Одик; Сина Адл; Дэвид Басс; Лассаад Бельбари; Седрик Берни; Сэмюэл С. Боузер; Иван Чепицка; Йохан Десель; Мика Данторн; Анна Мария Фиоре-Донно; Джиллиан Х. Жиле; Мария Хольцманн; Коломбан де Варгас; и др. (6 ноября 2012 г.). "CBOL Protist Working Group: Barcoding Eukaryotic Richness beyond the Animal, Plant, and Fungal Kingdoms". PLOS Biology . 10 (11): e1001419. doi : 10.1371/journal.pbio.1001419 . PMC 3491025. PMID  23139639 . 

Внешние ссылки