Королевское Богемское общество наук ( лат . Regia Societas Scientiarum Bohemica ; нем . Königliche böhmische Gesellschaft der Wissenschaften ; чеш . Královská česká společnost nauk ) было основано в 1784 году — изначально без прилагательного «королевский» — которое было предоставлено только в 1790 году королем и императором Леопольдом II — в качестве научного центра земель Богемской короны . В 1952 году его сменила Чехословацкая академия наук , и в 1992 году оно окончательно стало тем, что известно сегодня как Чешская академия наук .
Общество основали филолог Йозеф Добровский , историк Геласиус Добнер и математик, основатель Пражской университетской обсерватории Йозеф Степлинг . Позднее его возглавил историк и политик Франтишек Палацкий .
Еще в 1861–1863 годах анатом Ян Евангелиста Пуркине в своем трактате Academia предложил создать автономное неуниверситетское научное учреждение, объединяющее научно-исследовательские институты, представляющие основные области науки того времени. Эта идея учреждения, занимающегося междисциплинарными исследованиями, соответствует концепции и структуре нынешней Академии наук.
К концу XIX века в этой стране возникли научные учреждения, дифференцированные по языковому признаку: Чешская академия наук и искусств ( чеш . Česká akademie věd a umění , 1890–1952) и Общество содействия немецкой науке, искусству и литературе в Богемии ( нем . Gesellschaft zur Förderung deutscher Wissenschaft, Kunst und Literatur in Böhmen , 1891–1945). Чешская академия наук и искусств была основана благодаря значительной финансовой поддержке чешского архитектора, предпринимателя и филантропа Йозефа Главки , который стал ее первым президентом. Целью этого учреждения было содействие развитию чешской науки и литературы, а также поддержка чешского искусства. Важнейшей работой этой Академии была ее издательская деятельность. Также предоставлялись стипендии и финансовая поддержка, а также по его инициативе возникли небольшие исследовательские подразделения.
После основания независимой Чехословацкой Республики (1918) были созданы другие научные учреждения, такие как Масарикова академия труда ( Masarykova akademie práce ) и автономные государственные институты, такие как Славянский, Восточный и Археологический институты. Международные связи чешских научно-исследовательских учреждений развивались с их присоединением к Международному союзу академий и Международному исследовательскому совету.
После прихода к власти тоталитарного режима в Чехословакии в 1948 году все научные, неуниверситетские учреждения и научные общества были распущены, и вместо них была создана Чехословацкая академия наук. В 1992 году Законом № 283/1992 была создана Академия наук Чешской Республики.