Сезон 1987–88 Кубка обладателей кубков европейских чемпионов завершился неожиданной победой «Мехелена» в финале против действующего чемпиона «Аякса» . Это привело к их титулу чемпиона Европейского Суперкубка 1988 года в первой европейской кампании клуба (1987–89). Как победитель бельгийской лиги следующего сезона, он защитил свой титул в полуфинале Кубка обладателей кубков европейских чемпионов 1988–89 . Финансовые проблемы не позволяли этому последнему бельгийскому обладателю любого европейского кубка снова добиться такого же успеха.
Дунайска Стреда выиграла по сумме двух матчей со счетом 6–1.
1–1 по сумме двух матчей. RoPS выиграл по правилу выездного гола
Влазния выиграла со счетом 6:0 по сумме двух матчей.
Мехелен выиграл со счетом 3–0 по сумме двух матчей.
«Сент-Миррен» выиграл со счетом 1:0 по сумме двух матчей.
«Реал Сосьедад» выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
Минское «Динамо» выиграло со счетом 4:1 по сумме двух матчей.
OFI Crete выиграл со счетом 3–2 по сумме двух матчей.
«Аталанта» выиграла со счетом 3:2 по сумме двух матчей.
«Кальмар ФФ» выиграл со счетом 1:0 по сумме двух матчей.
«Спортинг» выиграл со счетом 6–4 по сумме двух матчей.
«Марсель» выиграл со счетом 1:0 по сумме двух матчей.
1–1 по сумме двух матчей. «Хайдук» (Сплит) выиграл со счетом 4–2 по пенальти.
Ден Хааг выиграл по сумме двух матчей со счетом 3–2.
«Янг Бойз» выиграли со счетом 4–3 по сумме двух матчей.
«Гамбург» выиграл со счетом 8:0 по сумме двух матчей.
«Аякс» выиграл со счетом 6:0 по сумме двух матчей.
Мехелен выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
«Спортинг» выиграл со счетом 5:1 по сумме двух матчей.
RoPS выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
2–2 по сумме двух матчей. «Янг Бойз» выиграли по правилу выездного гола.
«Аякс» выиграл со счетом 3:0 по сумме двух матчей.
1–1 по сумме двух матчей. «Динамо» Минск выиграло по правилу выездного гола.
«Аталанта» выиграла со счетом 2:1 по сумме двух матчей.
Матч был прерван на 10-й минуте при счете 0–0 из-за того, что фанаты «Хайдука» бросили слезоточивый газ на трибуны. Возникший в результате переполох сопровождался теми же фанатами, которые бросали на поле файеры , после чего последовало вторжение на поле . Матч был возобновлен примерно через 15 минут и завершился победой «Хайдука» со счетом 2–0 в тот вечер, а «Марсель» продвинулся вперед со счетом 4–2 по сумме двух матчей. На дисциплинарном слушании несколько дней спустя УЕФА аннулировал матч из-за беспорядков с толпой, присудив победу «Марселю» со счетом 3–0 и отстранив «Хайдук» от участия в европейских соревнованиях на два сезона.
«Марсель» выиграл со счетом 7–0 по сумме двух матчей.
Мехелен выиграл со счетом 2–1 по сумме двух матчей.
«Аталанта» выиграла со счетом 3:1 по сумме двух матчей.
«Марсель» выиграл со счетом 4:0 по сумме двух матчей.
«Аякс» выиграл со счетом 2:0 по сумме двух матчей.
Мехелен выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
«Аякс» выиграл со счетом 4–2 по сумме двух матчей.
Лучшими бомбардирами Кубка обладателей кубков УЕФА 1987–88 годов стали: