stringtranslate.com

Кэролин Дж. Браун

Кэролин Дж. Браун (родилась в 1961 году, Онтарио ) — канадский генетик и профессор кафедры медицинской генетики в Университете Британской Колумбии . Браун известна своими исследованиями инактивации Х-хромосомы , открыв в 1990 году ген XIST человека .

Образование и начало карьеры

Браун получила степень бакалавра наук в области генетики в 1983 году в Университете Гвельфа , Онтарио. Она начала работу над докторской диссертацией в Университете Торонто в 1983 году под руководством Ханта Уилларда и завершила ее в Стэнфордском университете после переезда лаборатории Уилларда в 1989 году. Браун инициировала исследования Х-хромосомы в лаборатории, и ее докторская диссертация называлась «Исследования инактивации человеческой Х-хромосомы». Ее работа включала анализ генов, которые «избегают» инактивации Х-хромосомы, экспрессируясь с (иначе) неактивной Х-хромосомы, а также молекулярную характеристику центра Х-инактивации, генетического локуса, необходимого для подавления хромосомы. Эти две темы сошлись в открытии в 1990 году гена XIST , который локализуется в центре Х-инактивации и экспрессируется исключительно с неактивной Х-хромосомы. Это открытие было опубликовано в двух статьях в журнале Nature в 1991 году. [1] [2]

Уиллард назвал Браун «важнейшей личностью, которая преобразила изучение инактивации X». [3] Браун стала научным сотрудником в 1990 году на кафедре генетики Стэнфордского университета, а два года спустя перешла с лабораторией Уилларда на кафедру генетики Университета Кейс Вестерн Резерв , штат Огайо, где продолжила изучать длинную некодирующую РНК XIST. Браун стала доцентом (1994) и доцентом (1999) на кафедре медицинской генетики Университета Британской Колумбии в Ванкувере и была повышена до профессора в 2004 году. Она была заведующей кафедрой с 2011 по 2014 год. Она руководила более чем двадцатью постдокторантами и аспирантами в своей лаборатории.

Исследовать

Исследования Браун направлены на процесс инактивации Х-хромосомы у людей. Ее лаборатория выявила критические различия между инактивацией Х-хромосомы у мышей и людей, такие как отсутствие отцовской инактивации Х в человеческих внеэмбриональных тканях, более высокая доля «беглецов» у людей и идентификация различных регуляторных последовательностей XIST человека и Xist мыши. [4] [5] Ее лаборатория каталогизировала гены побега, используя как анализ экспрессии, так и анализ метилирования ДНК r, чтобы определить, какие гены способствуют половым различиям в восприимчивости к болезням, и какие области ДНК восприимчивы или устойчивы к эпигенетическому подавлению генов. [6] [7] [8] [9] Поскольку человеческие эмбриональные стволовые клетки эпигенетически нестабильны, Браун и коллеги разработали альтернативные модельные системы для изучения инактивации у людей, включая индуцируемые трансгены XIST в человеческих соматических клетках , гибриды человеческих соматических клеток, сохраняющие активную или неактивную Х-хромосому, и мышиные клетки с Х-сцепленными трансгенами человеческой ДНК. [10] Ее лаборатория сотрудничает с другими исследовательскими группами в Детской больнице Британской Колумбии и Агентстве по борьбе с раком Британской Колумбии для изучения клинической значимости инактивации и экспрессии Х-хромосомы в предрасположенности к болезням, прогрессировании рака и заболеваниях , связанных с Х- хромосомой, перестройках хромосом и анеуплоидиях . [11] [12] [13] [14] [15] [16]

Награды и почести

Ссылки

На сайте Scholia имеется профиль автора Кэролин Дж. Браун .
  1. ^ Браун, Кэролин Дж.; Баллабио, Андреа; Руперт, Джеймс Л.; Лафреньер, Рональд Г.; Громпе, Маркус; Тонлоренци, Россана; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Ген из области центра инактивации человеческой Х-хромосомы экспрессируется исключительно из неактивной Х-хромосомы». Nature . 349 (6304): 38–44. Bibcode :1991Natur.349...38B. doi :10.1038/349038a0. PMID  1985261. S2CID  4332325.
  2. ^ Браун, Кэролин Дж.; Лафреньер, Рональд Г.; Пауэрс, Вики Э.; Себастио, Джанфранко; Баллабио, Андреа; Петтигрю, Аняна Л.; Ледбеттер, Дэвид Х.; Леви, Элейн; Крейг, Ян В.; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Локализация центра инактивации Х на человеческой Х-хромосоме в Xq13». Nature . 349 (6304): 82–84. Bibcode :1991Natur.349...82B. doi :10.1038/349082a0. PMID  1985270. S2CID  4360783.
  3. ^ Уиллард, Хантингтон Ф. (2010). «Речь на церемонии вручения премии Уильяма Аллана 2009 года: Жизнь в песочнице: незаконченное дело». Американский журнал генетики человека . 86 (3): 318–327. doi :10.1016/j.ajhg.2010.01.037. PMC 2833390 . 
  4. ^ Йен, З.К.; Мейер, ИМ; Каралик, С.; Браун, К.Дж. (2007). «Межвидовое сравнение инактивации Х-хромосомы у Eutheria». Genomics . 90 (4): 453–63. doi : 10.1016/j.ygeno.2007.07.002 . PMID  17728098.
  5. ^ Чанг, SC; Браун, CJ (2010). «Идентификация регуляторных элементов, фланкирующих человеческий XIST, выявляет видовые различия». BMC Molecular Biology . 11 : 20. doi : 10.1186/1471-2199-11-20 . PMC 2841178. PMID  20211024 . 
  6. ^ Kutsche, R.; Brown, CJ (2000). «Определение статуса инактивации X-хромосомы с использованием X-сцепленных выраженных полиморфизмов, идентифицированных с помощью поиска в базе данных». Genomics . 65 (1): 9–15. doi :10.1006/geno.2000.6153. PMID  10777660.
  7. ^ Коттон, AM; Лам, L.; Аффлек, JG; Уилсон, IM; Пеньяэррера, MS; Макфадден, DE; Кобор, MS; Лам, WL; Робинсон, WP; Браун, CJ (2011). «Анализ метилирования ДНК по всей хромосоме предсказывает специфическую для тканей человека инактивацию X». Генетика человека . 130 (2): 187–201. doi :10.1007/s00439-011-1007-8. PMC 3132437. PMID  21597963 . 
  8. ^ Коттон, AM; Ge, B.; Light, N.; Adoue, V.; Pastinen, T.; Brown, CJ (2013). «Анализ выраженных SNP выявляет различные степени экспрессии из неактивной X-хромосомы человека». Genome Biology . 14 (11): R122. doi : 10.1186/gb-2013-14-11-r122 . PMC 4053723 . PMID  24176135. 
  9. ^ Коттон, AM; Прайс, EM; Джонс, MJ; Балатон, BP; Кобор, MS; Браун, CJ (2015). «Пейзаж метилирования ДНК на Х-хромосоме отражает плотность CpG, функциональное состояние хроматина и инактивацию Х-хромосомы». Human Molecular Genetics . 24 (6): 1528–39. doi :10.1093/hmg/ddu564. PMC 4381753 . PMID  25381334. 
  10. ^ Тинкер, AV; Браун, CJ (1998). «Индукция экспрессии XIST из активной Х-хромосомы человека в гибридах соматических клеток мыши/человека путем деметилирования ДНК». Nucleic Acids Research . 26 (12): 2935–40. doi :10.1093/nar/26.12.2935. PMC 147638 . PMID  9611238. 
  11. ^ Доусон, А. Дж.; Викстром, Д. Э.; Риордан, Д.; Кардвелл, С.; Кейси, Р.; Болдри, С.; Браун, К. (2004). «Уникальный пациент с вариантом синдрома Ульриха-Тернера и мозаицизмом для крошечного r(X) и частичной проксимальной дупликации 1q». Американский журнал медицинской генетики. Часть A. 124A ( 3): 303–6. doi : 10.1002/ajmg.a.20302. PMID  14708105. S2CID  13408738.
  12. ^ Гибб, EA; Вучич, EA; Энфилд, KS; Стюарт, GL; Лонерган, KM; Кеннетт, JY; Беккер-Сантос, DD; Маколей, CE; Лэм, S.; Браун, CJ; Лэм, WL (2011). "Длинные некодирующие РНК-транскриптомы человеческого рака". PLOS ONE . 6 (10): e25915. Bibcode : 2011PLoSO...625915G. doi : 10.1371/journal.pone.0025915 . PMC 3185064. PMID  21991387 . 
  13. ^ Cheung, KJ; Johnson, NA; Affleck, JG; Severson, T.; Steidl, C.; Ben-Neriah, S.; Schein, J.; Morin, RD; Moore, R.; Shah, SP; Qian, H.; Paul, JE; Telenius, A.; Relander, T.; Lam, W.; Savage, K.; Connors, JM; Brown, C.; Marra, MA; Gascoyne, RD; Horsman, DE (2010). «Приобретенные мутации TNFRSF14 при фолликулярной лимфоме связаны с худшим прогнозом». Cancer Research . 70 (22): 9166–74. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-10-2460 . PMID  20884631.
  14. ^ Джонсон, NA; Аль-Тура, A.; Браун, CJ; Коннорс, JM; Гаскойн, RD; Хорсман, DE (2008). «Прогностическое значение вторичных цитогенетических изменений при фолликулярных лимфомах». Гены, хромосомы и рак . 47 (12): 1038–48. doi :10.1002/gcc.20606. PMID  18720523. S2CID  20432234.
  15. ^ Хатакеяма, C.; Андерсон, CL; Бивер, CL; Пеньяэррера, MS; Браун, CJ; Робинсон, WP (2004). «Динамика перекоса X-инактивации с возрастом женщин». Клиническая генетика . 66 (4): 327–32. doi :10.1111/j.1399-0004.2004.00310.x. PMID  15355435. S2CID  23931974.
  16. ^ Бивер, CL; Стивенсон, MD; Пеньяэррера, MS; Цзян, RH; Калоусек, DK; Хайден, M.; Филд, L.; Браун, CJ; Робинсон, WP (2003). «Перекошенная инактивация Х-хромосомы связана с трисомией у женщин, установленной на основе повторных спонтанных абортов или хромосомно аномальных беременностей». Американский журнал генетики человека . 72 (2): 399–407. doi :10.1086/346119. PMC 379232. PMID  12497247 .