stringtranslate.com

Легоглобин

Легоглобин А из сои (PDB: 1BIN)

Легоглобин (также леггемоглобин или легоглобин ) — переносящий кислород фитоглобин, обнаруженный в азотфиксирующих корневых клубеньках бобовых растений . Он вырабатывается этими растениями в ответ на колонизацию корней азотфиксирующими бактериями, называемыми ризобиями , как часть симбиотического взаимодействия между растением и бактерией: корни, не колонизированные ризобиями , не синтезируют леггемоглобин. Легоглобин имеет близкое химическое и структурное сходство с гемоглобином и, как и гемоглобин, имеет красный цвет. Первоначально считалось, что простетическая группа гема для растительного леггемоглобина была предоставлена ​​бактериальным симбионтом в симбиотических корневых клубеньках. [1] [2] Однако последующие исследования показывают, что хозяин растения сильно экспрессирует гены биосинтеза гема в клубеньках, и что активация этих генов коррелирует с экспрессией гена леггемоглобина в развивающихся клубеньках. [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]

У растений, колонизированных Rhizobium , таких как люцерна или соя , присутствие кислорода в корневых клубеньках снижает активность чувствительной к кислороду нитрогеназы , которая является ферментом, ответственным за фиксацию атмосферного азота. Показано, что леггемоглобин буферизует концентрацию свободного кислорода в цитоплазме инфицированных растительных клеток, чтобы обеспечить надлежащее функционирование корневых клубеньков. При этом фиксация азота является чрезвычайно энергетически затратным процессом, поэтому аэробное дыхание , требующее высокой концентрации кислорода, необходимо в клетках корневого клубенька. [11] Легемоглобин поддерживает концентрацию свободного кислорода, которая достаточно низкая, чтобы позволить нитрогеназе функционировать, но достаточно высокую общую концентрацию кислорода (свободного и связанного с леггемоглобином) для аэробного дыхания.

Легоглобин относится к классу симбиотических глобинов , которые также включают корневые клубеньковые глобины актиноризных растений, таких как казуарина . Симбиотический глобин казуарины является промежуточным между леггоглобином и несимбиотическим фитоглобином-2. [12] [13]

Структура

Легоглобины — это мономерные белки с массой около 16 кДа, структурно похожие на миоглобин . [14] Один белок легоглобина состоит из гема, связанного с железом, и одной полипептидной цепи (глобин). [14] Подобно миоглобину и гемоглобину, железо гема находится в своем двухвалентном состоянии in vivo и является частью, которая связывает кислород. [14] Несмотря на сходство в механизме связывания кислорода между легоглобином и животным гемоглобином, а также тот факт, что легоглобины и животный гемоглобин произошли от общего предка, между этими белками существует различие в аминокислотной последовательности примерно в 80% позиций. [14]

Стабилизация леггемоглобина А кислородом (PDB: 1BIN)

Сродство леггемоглобинов к связыванию кислорода в 11–24 раза выше, чем сродство миоглобина кашалота к связыванию кислорода. [15] Различия в сродстве обусловлены разной скоростью ассоциации между двумя типами белков. [15] Одним из объяснений этого явления является то, что в миоглобине связанная молекула воды стабилизируется в кармане, окружающем гемовую группу. Эта водная группа должна быть вытеснена, чтобы кислород связался. Такая вода не связана в аналогичном кармане леггемоглобина, поэтому молекуле кислорода легче приблизиться к гемову леггемоглобина. [14] Легоглобин имеет медленную скорость диссоциации кислорода, как и миоглобин. [16] Подобно миоглобину и гемоглобину, леггемоглобин имеет высокое сродство к оксиду углерода. [16]

В первичной структуре леггемоглобина А в соевых бобах валин (F7) находится на месте, где в миоглобине находится серин (F7). Без водородной связи, фиксирующей ориентацию проксимальной боковой цепи гистидина, имидазольное кольцо может занимать ступенчатую конформацию между атомами азота пиррола и может легко перемещаться вверх к плоскости гема. Это значительно увеличивает реакционную способность атома железа и сродство к кислороду. В леггемоглобине А дистальная боковая цепь гистидина также поворачивается в сторону от связанного лиганда за счет образования водородной связи с тирозином. [17]

Гемовые группы одинаковы во всех известных леггемоглобинах, но аминокислотная последовательность глобина немного отличается в зависимости от штамма бактерий и вида бобовых. [14] Даже в пределах одного бобового растения могут существовать множественные изоформы леггемоглобинов. Они часто различаются по сродству к кислороду и помогают удовлетворять потребности клетки в определенной среде внутри клубенька. [18]

Дискуссия о главной функции

Результаты исследования 1995 года показали, что низкая концентрация свободного кислорода в клетках корневых клубеньков на самом деле обусловлена ​​низкой проницаемостью клеток корневых клубеньков для кислорода. [19] Из этого следует, что основная цель леггемоглобина — извлекать ограниченный свободный кислород из клетки и доставлять его в митохондрии для дыхания. Однако ученые из более поздней статьи 2005 года предполагают, что леггемоглобин отвечает как за буферизацию концентрации кислорода, так и за доставку кислорода в митохондрии. [20] Их исследования с нокаутом леггемоглобина показали, что леггемоглобин на самом деле значительно снижает концентрацию свободного кислорода в клетках корневых клубеньков, и что экспрессия нитрогеназы была устранена у мутантов с нокаутом леггемоглобина, предположительно из-за деградации нитрогеназы при высокой концентрации свободного кислорода. Их исследование также показало более высокое соотношение АТФ / АДФ в клетках корневых клубеньков дикого типа с активным леггемоглобином, что позволяет предположить, что леггемоглобин также способствует доставке кислорода для дыхания.

Растения содержат как симбиотические, так и несимбиотические гемоглобины. Считается, что симбиотические гемоглобины важны для симбиотической азотфиксации (SNF). В бобовых SNF происходит в специализированных органах, называемых клубеньками, которые содержат бактероиды, или азотфиксирующие ризобии. Индукция генов растений, специфичных для клубеньков, которые включают те, которые кодируют симбиотические леггемоглобины (Lb), сопровождает развитие клубеньков. Легогемоглобины накапливаются до миллимолярных концентраций в цитоплазме инфицированных растительных клеток до азотфиксации, чтобы буферизировать свободный кислород в наномолярном диапазоне, что позволяет избежать инактивации кислород-лабильной нитрогеназы, сохраняя при этом достаточно высокий поток кислорода для дыхания в клетке. Легогемоглобины необходимы для SNF, но не требуются для роста и развития растений в присутствии внешнего источника фиксированного азота. Легогемоглобины вносят существенный вклад в установление низких концентраций свободного кислорода при сохранении высокого энергетического статуса в клетках. Это условия, необходимые для эффективного SNF. [20]

Другие растительные гемоглобины

С тех пор глобины были идентифицированы как белок, общий для многих таксонов растений, не ограничиваясь симбиотическими. В свете этого открытия было предложено использовать термин фитоглобины для обозначения растительных глобинов в целом. [12]

Фитоглобины можно разделить на две клады. Тип 3/3 содержит классы I и II фитоглобинов покрытосеменных растений и является общим для всех эукариот ( HGT бактериального флавогемоглобина). Леггемоглобин в узком смысле слова является фитоглобином класса II. Тип 2/2 «TrHb2» содержит класс III в номенклатуре покрытосеменных растений и, по-видимому, был приобретен у Chloroflexota (ранее Chloroflexi) предком наземных растений. [12]

Коммерческое использование

Компания Impossible Foods обратилась в американское Управление по контролю за продуктами и лекарствами (FDA) за одобрением использования рекомбинантного соевого легоглобина в пищевых продуктах в качестве аналога гемоглобина , полученного из мяса . [21] [22] Одобрение FDA поступило в июле 2019 года, [23] было оспорено [a] и позднее, 3 мая 2021 года, поддержано федеральным апелляционным судом Сан-Франциско. [24] [25] В настоящее время он используется в их продуктах для имитации цвета, вкуса и текстуры мяса. [26]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Nadler KD, Avissar YJ (сентябрь 1977 г.). «Синтез гема в корневых клубеньках сои: I. О роли синтазы дельта-аминолевулиновой кислоты и дегидразы дельта-аминолевулиновой кислоты бактероида в синтезе гема леггемоглобина». Физиология растений . 60 (3): 433–6. doi :10.1104/pp.60.3.433. PMC  542631. PMID  16660108 .
  2. ^ O'Brian MR, Kirshbom PM, Maier RJ (декабрь 1987 г.). «Бактериальный синтез гема необходим для экспрессии голопротеина леггемоглобина, но не апопротеина в корневых клубеньках сои». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (23): 8390–3. Bibcode : 1987PNAS...84.8390O. doi : 10.1073 /pnas.84.23.8390 . PMC 299548. PMID  3479799. 
  3. ^ Sangwan I, O'Brian MR (март 1991). «Доказательства межорганизменного пути биосинтеза гема в симбиотических корневых клубеньках сои». Science . 251 (4998): 1220–2. Bibcode :1991Sci...251.1220S. doi :10.1126/science.251.4998.1220. PMID  17799282. S2CID  11471787.
  4. ^ Sangwan I, O'Brian MR (март 1992). "Характеристика образования дельта-аминолевулиновой кислоты в корневых клубеньках сои". Физиология растений . 98 (3): 1074–9. doi :10.1104/pp.98.3.1074. PMC 1080310. PMID  16668729 . 
  5. ^ Sangwan I, O'Brian MR (июль 1993 г.). «Экспрессия гена глутамат 1-полуальдегид аминотрансферазы сои (Glycine max) в симбиотических корневых клубеньках». Физиология растений . 102 (3): 829–34. doi :10.1104/pp.102.3.829. PMC 158853. PMID  8278535 . 
  6. ^ Madsen O, Sandal L, Sandal NN, Marcker KA (октябрь 1993 г.). «Ген соевой копропорфириногеноксидазы сильно экспрессируется в корневых клубеньках». Plant Molecular Biology . 23 (1): 35–43. doi :10.1007/BF00021417. PMID  8219054. S2CID  23011457.
  7. ^ Kaczor CM, Smith MW, Sangwan I, O'Brian MR (апрель 1994 г.). «Дегидратаза дельта-аминолевулиновой кислоты растений. Экспрессия в корневых клубеньках сои и доказательства бактериальной линии гена Alad». Физиология растений . 104 (4): 1411–7. doi :10.1104 / pp.104.4.1411. PMC 159307. PMID  8016269. 
  8. ^ Frustaci JM, Sangwan I, O'Brian MR (март 1995 г.). «gsa1 — универсальный ген синтеза тетрапирролов в сое, регулируемый элементом GAGA». Журнал биологической химии . 270 (13): 7387–93. doi : 10.1074/jbc.270.13.7387 . PMID  7706283.
  9. ^ Сантана MA, Пихакаски-Маунсбах K, Сандал N, Маркер KA, Смит AG (апрель 1998 г.). «Доказательства того, что растение-хозяин синтезирует гемовую часть леггемоглобина в корневых клубеньках». Физиология растений . 116 (4): 1259–69. doi :10.1104/pp.116.4.1259. PMC 35032. PMID  9536042. 
  10. ^ Sangwan I, O'Brian MR (февраль 1999). «Экспрессия гена сои, кодирующего фермент синтеза тетрапиррола глутамил-тРНК редуктазу в симбиотических корневых клубеньках». Физиология растений . 119 (2): 593–8. doi :10.1104/pp.119.2.593. PMC 32136. PMID  9952455 . 
  11. ^ Берг, Дж.; Тимочко, Дж.; Гатто-младший, Г.; Страйер, Л. (2015). Биохимия (8-е изд.). WH & Freeman Company.
  12. ^ abc Becana, Manuel; Yruela, Inmaculada; Sarath, Gautam; Catalán, Pilar; Hargrove, Mark S. (сентябрь 2020 г.). «Растительные гемоглобины: путешествие от одноклеточных зеленых водорослей к сосудистым растениям». New Phytologist . 227 (6): 1618–1635. doi : 10.1111/nph.16444 . hdl : 10261/219101 . PMID  31960995.
  13. ^ Хилл Р., Харгроув М.С., Арредондо-Питер Р. (2016). «Фитоглобин: новая номенклатура для растительных глобинов, принятая сообществом глобинов на XVIII конференции по кислородсвязывающим и чувствительным белкам 2014 года». F1000Research . 5 : 212. doi : 10.12688/f1000research.8133.1 . PMC 4792203. PMID  26998237 . 
  14. ^ abcdef Singh S., Varma A. (2017) Структура, функция и оценка леггемоглобина. В: Hansen A., Choudhary D., Agrawal P., Varma A. (ред.) Rhizobium Biology and Biotechnology. Soil Biology, т. 50. Springer, Cham
  15. ^ ab Арутюнян Э.Х., Сафонова Т.Н., Куранова ИП, Попов АН, Тепляков А.В., Обмолова Г.В., Русаков А.А., Вайнштейн Б.К., Додсон Г.Г., Уилсон Дж.К. «Строение дезокси- и оксилеггемоглобина люпина». {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь ) [ необходима полная цитата ]
  16. ^ ab Wittenberg JB, Appleby CA, Wittenberg BA (январь 1972). «Кинетика реакций леггемоглобина с кислородом и оксидом углерода». Журнал биологической химии . 247 (2): 527–531. doi : 10.1016/S0021-9258(19)45734-7 . PMID  4333266.
  17. ^ Smagghe, Benoit J.; Hoy, Julie A.; Percifield, Ryan; Kundu, Suman; Hargrove, Mark S.; Sarath, Gautam; Hilbert, Jean-Louis; Watts, Richard A.; Dennis, Elizabeth S.; Peacock, W. James; Dewilde, Sylvia; Moens, Luc; Blouin, George C.; Olson, John S.; Appleby, Cyril A. (декабрь 2009 г.). «Обзор: корреляции между сродством к кислороду и классификациями последовательностей растительных гемоглобинов». Biopolymers . 91 (12): 1083–1096. doi :10.1002/bip.21256. ISSN  0006-3525. PMID  19441024. S2CID  1891302.
  18. ^ Кавашима К, Суганума Н, Тамаоки М, Коучи Х (2001). «Два типа генов леггемоглобина гороха, демонстрирующих различное сродство к связыванию O2 и различные паттерны пространственной экспрессии в клубеньках». Plant Physiol . 125 (2): 641–651. doi :10.1104/pp.125.2.641. PMC 64866. PMID 11161022  . 
  19. ^ Ludwig RA, de Vries GE (1986). "Биохимическая физиология фиксации азота Rhizobium". В Broughton WJ, Pühler S (ред.). Фиксация азота, т. 4: Молекулярная биология . Оксфорд, Великобритания: Clarendon University Press. стр. 50–69. ISBN 978-0-19-854575-0.
  20. ^ ab Ott, Thomas; van Dongen, Joost T.; Günther, Catrin; Krusell, Lene; Desbrosses, Guilhem; Vigeolas, Helene; Bock, Vivien; Czechowski, Tomasz; Geigenberger, Peter; Udvardi, Michael K. (2005-03-29). "Симбиотические леггемоглобины имеют решающее значение для фиксации азота в корневых клубеньках бобовых, но не для общего роста и развития растений". Current Biology . 15 (6): 531–535. Bibcode :2005CBio...15..531O. doi : 10.1016/j.cub.2005.01.042 . ISSN  0960-9822. PMID  15797021.
  21. ^ "GRAS Notice 540". www.accessdata.fda.gov . Архивировано из оригинала 2017-06-30 . Получено 2018-01-21 .
  22. ^ "GRAS Notice 737". www.accessdata.fda.gov . Получено 22.08.2018 .[ постоянная мертвая ссылка ]
  23. ^ "Конкурент Beyond Meat Impossible Foods планирует запустить его в продуктовых магазинах в сентябре после получения одобрения FDA". CNBC . 31 июля 2019 г. . Получено 31 июля 2019 г. .
  24. ^ Джастин Кальма (3 мая 2021 г.). «Impossible Foods завершила судебную тяжбу по поводу ингредиента, из-за которого ее мясо «кровоточит». theverge.com . Архивировано из оригинала 2021-05-07.
  25. ^ Салли Хо (6 мая 2021 г.). «Impossible Foods выигрывает судебную тяжбу за гемовый ингредиент, используемый в «кровоточащем» бургере на растительной основе». greenqueen.com.hk . Архивировано из оригинала 06.05.2021.
  26. ^ Bandoim, L. (20 декабря 2019 г.). «Что означает решение FDA о соевом леггемоглобине для невыполнимого бургера». Forbes . Получено 4 марта 2020 г.

Примечания

  1. ^ подано некоммерческой правозащитной организацией Центр безопасности пищевых продуктов

Дальнейшее чтение