Тип бактерий
Lentisphaerota — это тип бактерий , тесно связанных с Chlamydiota и Verrucomicrobiota . [2] [3]
Включает два монотипных порядка Lentisphaerales и Victivallales. Члены типа могут быть аэробными или анаэробными и подпадать под два различных фенотипа. Эти фенотипы обитают в водоемах с морской водой, и их было особенно трудно выделить в чистой культуре. [4] Один фенотип, L. marina , состоит из наземной микробиоты кишечника млекопитающих и птиц. Его нашли в Японском море . [4] Другой фенотип ( L. araneosa ) включает морские микроорганизмы : последовательности рыбных и коралловых микробиомов и морских отложений .
Филогения
Филогения основана на работе All-Species Living Tree Project . [5]
Таксономия
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LSPN) [6] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [7]
- Тип Lentisphaerota Cho et al. 2021 год
- Класс Oligosphaeria Qiu et al. 2013
- Отряд Oligosphaerales Qiu et al. 2013
- Семейство Oligosphaeraceae Qiu et al. 2013
- Род Oligosphaera Qiu et al. 2013
- Вид Oligosphaera этанолика Qiu et al. 2013
- Класс Lentisphaeria Cho et al. 2012 год
- Отряд Victivallales Cho et al. 2004 г.
- Семейство Victivallaceae Derrien et al. 2012 год
- Род Victivallis Zoetendal et al. 2003 г.
- Отряд Lentisphaerales Cho et al. 2004 г.
- Семейство Lentisphaeraceae Cho & Hedlund 2012
- Род Lentisphaera Cho et al. 2004 г., поправки. Чой и др. 2013
- Вид L. araneosa Cho et al. 2004 г.
- Вид L. marina Choi et al. 2013
- Вид " L. profunda " ♠
Примечания:
♠ Штамм обнаружен в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не указан в Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN).
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Орен А., генеральный директор Гаррити (2021). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот». Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308.
- ^ Чо Дж., Вергин К., Моррис Р., Джованнони С. (2004). «Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, прозрачный экзополимер, продуцирующий морские бактерии, и описание нового типа бактерий Lentisphaerae». Энвайрон Микробиол . 6 (6): 611–21. дои : 10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x. ПМИД 15142250.
- ^ Лимам Р.Д., Буше Т., Шуари Р. и др. (октябрь 2010 г.). «Обнаружение Lentisphaerae, родственных WWE2, с помощью секвенирования гена 16S рРНК и флуоресцентной гибридизации in situ в фильтрате свалки». Может. Дж. Микробиол . 56 (10): 846–52. дои : 10.1139/w10-065. PMID 20962908. Архивировано из оригинала 16 декабря 2012 г. Проверено 4 ноября 2010 г.
- ^ Аб Чой, Аён; Ян, Сын Джо; Ри, Кван-Хён; Чо, Чан-ЧонYR 2013 (2013). «Lentisphaera marina sp. nov. и исправленное описание рода Lentisphaera». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (Ч_4): 1540–1544 гг. дои : 10.1099/ijs.0.046433-0. ISSN 1466-5034. ПМИД 22888188.
{{cite journal}}
: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ «Выпуск 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Комплексная база данных рибосомальных РНК Сильвы . Проверено 20 марта 2016 г.
- ^ JP Эзеби. «Лентисферы». Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 марта 2016 г.
- ^ Сэйерс; и другие. «Лентисферы». База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 г.
дальнейшее чтение
Лимам, Рим Дрисс; Буше, Теодор; Чуари, Ракия; Ли, Тяньлунь; Баркалла, Инсаф; Ландулси, Ахмед; Сгир, Абдельгани (октябрь 2010 г.). «Обнаружение Lentisphaerae, родственных WWE2, с помощью секвенирования гена 16S рРНК и флуоресцентной гибридизации in situ в фильтрате свалки». Канадский журнал микробиологии . 56 (10): 846–852. дои : 10.1139/W10-065. ПМИД 20962908.