Бобылев написал 7 опер, 1 балет, 10 концертов, симфонию, симфонические поэмы «De profundis» и «…e poi…», 4 concerti grossi, 9 ораторий и кантат, камерную музыку для солирующих инструментов и ансамблей, а также музыку для театра и кино.
Опера
Григорий Мелехов (1980, либретто А.Медведева по роману М.Шолохова «Тихий Дон», концертное исполнение фрагментов Москва, 1988)
«Утраченная охота» (1981, либретто Татьяны Вершининой и Леонида Бобылева по прозе В. Астафьева, концертное прослушивание Москва, 1983)
«Кто придумал мыльные шары?» (1989, для детей, либретто О. Волозовой);
Привет, Алиса! (1993, для юношества, премьера Москва; 1993)
…С последним поцелуем… (1994, моноопера, либретто Леонида Бобылева по роману Бориса Пастернака «Доктор Живаго», премьера Москва , 2001)