stringtranslate.com

5 МАРТА

E3 убиквитин-протеинлигаза MARCH5 , также известная как мембранно-ассоциированный кольцевой палец (C3HC4) 5 , является ферментом , который у людей кодируется геном MARCH5 . Он локализован во внешней мембране митохондрий и имеет четыре трансмембранных домена. [5] [6] [7]

Структура

Ген

Человеческий ген MARCH5 , также известный как MITOL или RNF153 , имеет 7 экзонов и расположен в хромосомном участке 10q23.32-q23.33. [6]

Белок

Человеческий белок MARCH5 убиквитин-протеинлигазы E3, член семейства трансмембранных белков RING-finger [8], имеет размер 31 кДа и состоит из 278 аминокислот с N-концевым доменом цинкового пальца в аминокислотной последовательности 6-75 и четырьмя C-концевыми трансмембранными участками. [7] Теоретический PI этого белка составляет 9,00. [9]

Функция

Как E3 убиквитинлигаза , фермент MARCH 5 катализирует перенос убиквитина от E2 убиквитин-конъюгирующего фермента к идентифицированному белковому субстрату. MARCH5 был впервые идентифицирован как белок, связывающий митофузин 2 и Drp1 . [7] MARCH5 способствует убиквитинированию Drp1, а нокдаун MARCH5 с помощью РНК-интерференции приводит к аномальному слиянию митохондрий. [10] Дополнительные доказательства показывают, что MARCH 5 специфически взаимодействует с митофузином 1 , снижая его уровни во время определенных фаз клеточного цикла . [11] Учитывая тот факт, что MARCH5 регулирует белковый протеостаз Drp1 , митофузина 1 и митофузина 2 , которые являются ключевыми регуляторами слияния и деления митохондрий , MARCH5 имеет решающее значение для регуляции стандартной морфологии митохондрий, а его дефицит способствует клеточному старению. [12]

Клиническое значение

Учитывая, что и Drp1 , и MAP1B являются субстратами для MITOL, считается, что MITOL играет защитную роль против опосредованного нитрозативным стрессом нарушения динамики митохондрий, такой как морфологическая стабильность и транспорт митохондрий. Поскольку значительное снижение экспрессии MITOL происходит в ответ на старение в нормальных тканях, MITOL может контролировать старение, регулируя выработку ROS в митохондриях. [13] С патологической точки зрения, в модели нейрональных клеток доминантно-негативный MARCH5 предотвращает фрагментацию митохондрий во время нейродегенеративного стресса, вызванного нейронспецифическим реактивным генератором кислорода 6-гидроксидофамином, ингибитором комплекса I ротеноном или связанным с болезнью Альцгеймера амилоидным бета-пептидом. MARCH5 также участвует в удалении белков, связанных с определенными нейродегенеративными расстройствами, такими как атаксин-3 при болезни Мачадо-Джозефа или mSOD1 при боковом амиотрофическом склерозе, вероятно, поддерживая функцию митохондрий. [14] MARCH5 также был связан с толл-подобными рецепторами (TLR), которые распознают отдельные молекулярные паттерны, связанные с патогенами , и играют важную роль во врожденном иммунном ответе . [15]

Убиквитин-зависимые пути деградации имеют очевидную связь с раком из-за их неотъемлемой роли в контроле качества белка, регуляции иммунных реакций, передаче сигнала и регуляции клеточного цикла. [16]

Ошибка имени гена в Excel

Как и в случае с другими генами MARCH и септина , необходимо проявлять осторожность при анализе генетических данных, содержащих ген MARCH5 в Microsoft Excel . [17] Это связано с тем, что функция автокоррекции Excel обрабатывает ген MARCH как дату и преобразует его в стандартный формат даты. Исходный текст не может быть восстановлен в результате преобразования. Исследование 2016 года показало, что до 19,6% всех статей в выбранных журналах затронуты ошибкой имени гена. [18] Эту проблему можно предотвратить, используя псевдоним, например MARCHF5, добавив апостроф (') или предварительно отформатировав ячейку как текст.

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198060 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000023307 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Барти Э., Мансури М., Хови Неренберг Б.Т., Гувейя К., Фрю К. (февраль 2004 г.). «Понижение регуляции главного комплекса гистосовместимости класса I с помощью убиквитинлигаз человека, связанного с белками уклонения от вирусного иммунитета». Журнал вирусологии . 78 (3): 1109–20. doi :10.1128/JVI.78.3.1109-1120.2004. ПМК 321412 . ПМИД  14722266. 
  6. ^ ab "Ген Энтреза: MARCH5 мембранно-ассоциированный безымянный палец (C3HC4) 5".
  7. ^ abc Nakamura N, Kimura Y, Tokuda M, Honda S, Hirose S (октябрь 2006 г.). "MARCH-V — это новый белок, связывающий митофузин 2 и Drp1, способный изменять морфологию митохондрий". EMBO Reports . 7 (10): 1019–22. doi :10.1038/sj.embor.7400790. PMC 1618377. PMID  16936636 . 
  8. ^ Lehner PJ, Hoer S, Dodd R, Duncan LM (октябрь 2005 г.). «Понижение регуляции рецепторов клеточной поверхности семейством K3 вирусных и клеточных убиквитин E3 лигаз». Immunological Reviews . 207 : 112–25. doi :10.1111/j.0105-2896.2005.00314.x. PMID  16181331. S2CID  25567313.
  9. ^ "Uniprot: Q9NX47 - MARH5_HUMAN".
  10. ^ Йонаширо Р., Исидо С., Кё С., Фукуда Т., Гото Э., Мацуки Ю., Омура-Хосино М., Сада К., Хотта Х., Ямамура Х., Инатоме Р., Янаги С. (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитинлигаза играет решающую роль в динамике митохондрий». Журнал ЭМБО . 25 (15): 3618–26. дои : 10.1038/sj.emboj.7601249. ПМЦ 1538564 . ПМИД  16874301. 
  11. ^ Park YY, Cho H (2012). «Митофузин 1 деградирует в фазе G2/M через убиквитинирование MARCH5». Cell Division . 7 (1): 25. doi : 10.1186/1747-1028-7-25 . PMC 3542011 . PMID  23253261. 
  12. ^ Park YY, Lee S, Karbowski M, Neutzner A, Youle RJ, Cho H (февраль 2010 г.). «Потеря митохондриальной убиквитин-лигазы E3 MARCH5 индуцирует клеточное старение через связанный с динамином белок 1 и митофузин 1». Journal of Cell Science . 123 (Pt 4): 619–26. doi :10.1242/jcs.061481. PMC 2818198 . PMID  20103533. 
  13. ^ Nagashima S, Tokuyama T, Yonashiro R, Inatome R, Yanagi S (май 2014). «Роли митохондриальной убиквитинлигазы MITOL/MARCH5 в митохондриальной динамике и заболеваниях». Журнал биохимии . 155 (5): 273–9. doi : 10.1093/jb/mvu016 . PMID  24616159.
  14. ^ Fang L, Li J, Flammer J, Neutzner A (2013 ) . «Инактивация MARCH5 поддерживает митохондриальную функцию во время нейродегенеративного стресса». Frontiers in Cellular Neuroscience . 7 : 176. doi : 10.3389/fncel.2013.00176 . PMC 3794199. PMID  24133412. 
  15. ^ Shi HX, Liu X, Wang Q, Tang PP, Liu XY, Shan YF, Wang C (май 2011 г.). «Митохондриальная убиквитинлигаза MARCH5 стимулирует сигнализацию TLR7, ослабляя действие TANK». PLOS Pathogens . 7 (5): e1002057. doi : 10.1371/journal.ppat.1002057 . PMC 3098239. PMID  21625535 . 
  16. ^ Wang X, Herr RA, Hansen T (декабрь 2008 г.). «Вирусные и клеточные убиквитинлигазы MARCH и рак». Семинары по биологии рака . 18 (6): 441–50. doi :10.1016/j.semcancer.2008.09.002. PMC 2636702. PMID  18948196 . 
  17. ^ Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan WM и др. (июнь 2004 г.). «Ошибочные идентификаторы: ошибки в названиях генов могут быть непреднамеренно введены при использовании Excel в биоинформатике». BMC Bioinformatics . 5 (1): 80. doi : 10.1186/1471-2105-5-80 . PMC 459209 . PMID  15214961. 
  18. ^ Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (август 2016 г.). «Ошибки в названии генов широко распространены в научной литературе». Genome Biology . 17 (1): 177. doi : 10.1186/s13059-016-1044-7 . PMC 4994289. PMID  27552985 . 

[ мертвая ссылка ]

Дальнейшее чтение