stringtranslate.com

Майкл Эйзен

Майкл Брюс Эйзен (родился 13 апреля 1967 года) — американский вычислительный биолог и бывший [2] главный редактор журнала eLife . [3] Он является профессором генетики , геномики и развития в Калифорнийском университете в Беркли . [4] [5] [6] [7] [8] Он является ведущим сторонником открытого доступа к научным публикациям и соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS) . В 2018 году Эйзен выдвинул свою кандидатуру в Сенат США от Калифорнии в качестве независимого кандидата , хотя он не прошел отбор на выборах. [9]

Ранняя жизнь и образование

Родившись в Бостоне, Эйзен и его брат Джонатан выросли в семье ученых. Их дедушка был рентгеновским кристаллографом , их отец, Говард Эйзен, был врачом, а мать, Лора [10] , биохимиком. Они переехали в Бетесду, штат Мэриленд, когда Эйзену было четыре или пять лет. Братья проводили лето на Лонг-Айленде со своими бабушкой и дедушкой. Эйзен утверждает, что он любил лягушек и саламандр: «Даже больше, чем у меня фетиш на лягушек, у меня фетиш на болота. Мне очень нравится бывать на болотах». Он также очень интересовался математикой и был капитаном школьной математической команды. Эйзен окончил среднюю школу имени Уолта Уитмена в 1985 году. Намереваясь специализироваться на математике в Гарвардском университете, он понял, что там [он может встретить] других более блестящих студентов-математиков, это был момент Умницы Уилла Хантинга , и он решил, что не хочет специализироваться на математике, «Вы же не хотите быть Сальери для Моцарта». Во время учебы в Гарварде Эйзен работал над «раскрытием трехмерных структур белков». Ему показали ДНК-микрочип , который научил его «новому способу заниматься биологией». [11]

Эйзен получил докторскую степень в области биофизики в Гарвардском университете и степень бакалавра (также в Гарварде) по математике. [12] Он находился под руководством Дона Крейга Уайли [13] во время изучения белков вируса гриппа А. [14]

Есть вещи, которые действительно очень сложны, это те проблемы, над которыми вы хотите работать. Не так-то просто отличить невозможные проблемы от проблемы, которая действительно очень сложна. Но научиться делать это критически важно. - То, чему я научился, работая с Пэтом Брауном ( Патрик О. Браун ) - 2015 [13]

Получив докторскую степень, Эйзен был научным сотрудником Стэнфордского университета в лаборатории Дэвида Ботштейна , где он, в частности, разработал метод интерпретации данных экспрессии генов из микрочипов. Основополагающая исследовательская публикация, которую Эйзен написал об этом проекте, была процитирована более 16 000 раз. [15]

Бейсбол и биология

Когда Эйзен жил в Теннесси, он работал комментатором игр в бейсбольной команде низшей лиги [12] Columbia Mules. Он самопровозглашенный фанат Red Sox . [11] Он и вычислительный биолог Джеймс Фрейзер записали видео для iBiology о роли бейсбольной статистики, которая повлияла на их исследования. Их аргумент заключается в том, что секвенирование ДНК похоже на подсчет очков в бейсбольном матче, и что многие вычислительные биологи научились думать о научных вычислениях из-за навязчивого интереса к бейсбольной статистике. Упражнение по сравнению статистики конкретного игрока с базой данных других похожих игроков позволяет фанату бейсбола предсказывать будущие результаты. Эта же система работает с белками и функциями прогнозирования. По мере разработки инструментов, которые разбивают и отслеживают всю статистику, касающуюся бейсболистов, так же будут совершенствоваться технологии с генетикой. И в бейсболе, и в генетике разрабатываются инструменты, которые совершенствуют модели. [16] В своей лекции в 2015 году Эйзен заявил, что получил компьютер от своего дедушки на свой двенадцатый день рождения и провел следующие пять лет, самостоятельно изучая программирование, чтобы иметь возможность отслеживать статистику бейсбола. [13]

Исследовать

Его академические исследования сосредоточены на эволюции регуляции генов . [ 17] [18] [19] [20] Несмотря на эту направленность, работа Эйзена исторически охватывала очень разные дисциплины. Например, его 5 наиболее цитируемых статей охватывают широкий спектр тем, включая методы иерархической кластеризации , [17] применение к раку молочной железы человека (совместно с Дэвидом Ботштейном и Чарльзом Перу), [6] и открытие подтипов опухолей при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (совместно с Эшем Ализаде и Луисом Штаудтом ). [18] Его более поздняя исследовательская работа была посвящена плодовым мушкам и дрозофилам [21] и тому, как они «развиваются из крошечного одноклеточного яйца в зрелую взрослую особь. Он говорит, что они содержат понимание того, что происходит не так у людей по мере их старения». [12] Он получает финансирование от Медицинского института Говарда Хьюза для своих исследований. [21]

Гонка за место в Сенате США в 2018 году

25 января Эйзен объявил в Twitter о своем намерении баллотироваться в Сенат США от Калифорнии в 2018 году на место сенатора-демократа Дайанны Файнстайн , зарегистрировав в Twitter псевдоним SenatorPhD . [22] Его предвыборным лозунгом было «Свобода, равенство, реальность». Причины, по которым Эйзен баллотировался в Конгресс, включали его мнение о том, что администрация Трампа не реагирует на изменение климата и другие вопросы, связанные с наукой. Еще одной причиной, по которой Эйзен решил баллотироваться, стал его опыт наблюдения за тем, как назначенцы кабинета министров дают интервью Сенату об изменении климата. Он подумал: «Было бы очень неплохо, если бы ученые задавали вопросы членам кабинета министров, потому что сенаторы, похоже, не понимают сути проблемы и не задают правильных вопросов». [12] Он считает, что если наука должна быть на переднем крае разработки политики, «ученым нужно баллотироваться на выборах». Он считал, что праймериз в джунглях Калифорнии 2018 года дали ему больше шансов попасть в два финала всеобщих выборов, но он не попал в два финала (а именно Дайан Файнстайн и Кевин де Леон ). [12]

Ученые долгое время наблюдали, как политические процессы разрушаются, и наблюдали, как политики открыто высмеивают науку, отрицая роль, которую наука играет в нашей повседневной жизни. Ученые сидели здесь и надеялись, что кто-то придет и защитит эти принципы. Политика, по моему мнению, должна функционировать так же, как и наука. Мы должны попытаться выяснить, что происходит в мире, а затем обсудить наилучший способ сделать это, чтобы сделать мир лучше. Лучшие инструменты, которые у нас есть для характеристики реальности, — это инструменты наблюдения, которые наука использует постоянно. Слишком много политики отвергло этот базовый принцип, что ученые живут и дышат постоянно. [12]

Эйзен выбыл из гонки, когда не смог пройти отбор на первичные выборы в июне 2018 года. [23]

электронная жизньредактирование и увольнение

В 2019 году Эйзен был назначен вторым главным редактором научного журнала открытого доступа eLife .

В 2020 году в ответ на вопрос в Twitter Эйзен пошутил, что круглый червь C. elegans был самым разрекламированным животным, потому что «они извиваются вперед. Они извиваются назад. И иногда они трахают себя. Вот и все». Некоторым исследователям эта шутка не понравилась, и совет директоров eLife попросил Эйзена следить за своим языком в Twitter. [24] [25] Также в 2020 году Эйзен был вовлечен в историю, связанную со смертью от SARS-CoV-2 анонимной женщины-профессора из племени хопи, с которой он общался в Twitter. Аккаунт оказался мистификацией, созданной и управляемой нейробиологом БетЭнн Маклафлин , которая основала MeTooSTEM. Эйзен был одним из трех человек, посетивших мемориал вымышленного человека в Zoom . [26]

В 2023 году под его руководством журнал отошел от традиционной модели « рецензировать, затем опубликовать », вместо этого требуя от авторов предоставления препринтов , а затем публикации рецензий редакторов журнала вместе с рукописями, что означает, что журнал не принимал и не отклонял заявки. [27] Эйзен сказал, что этот шаг был направлен на то, чтобы снизить значимость издателя и вместо этого сосредоточить внимание на авторах и их работе. Этот шаг вызвал как восторженные похвалы от некоторых, включая некоторых редакторов eLife , так и резкую негативную реакцию от других внутри организации, включая некоторых старших редакторов и редакторов. Новостная статья в журнале Nature описывала «раздор в eLife». По крайней мере один из пяти заместителей редактора ушел в отставку. В частном письме Эйзену в январе 2023 года 30 редакторов пригрозили уйти в отставку после полной реализации изменений. В марте 2023 года 29 редакторов eLife , включая главного редактора-основателя и лауреата Нобелевской премии Рэнди Шекмана , призвали немедленно заменить Эйзена в письме к исполнительному редактору издателя журнала. Эйзен отклонил это в интервью, назвав это «могущественными учеными, не желающими менять систему, которая приносила им пользу». 12 марта 2023 года Эйзен написал в Твиттере, что ученые «усиленно лоббируют мое увольнение», пост, который впоследствии был удален. [28] Позже он описал свои отношения с советом директоров как «довольно вспыльчивые» и что некоторые «имели на меня зуб». [25]

13 октября 2023 года, вскоре после того, как ХАМАС напал на Израиль, Эйзен опубликовал в Твиттере историю сатирического сайта The Onion с заголовком: «Умирающие жители Газы подверглись критике за то, что не использовали последние слова, чтобы осудить ХАМАС». Эйзен сказал: «The Onion говорит с большей смелостью, проницательностью и моральной ясностью, чем лидеры всех академических учреждений вместе взятых. Хотелось бы, чтобы был университет @TheOnion». [29] Пост вызвал некоторую критику, в том числе со стороны израильских исследователей, которые попросили коллег не публиковаться в eLife , пока он является редактором. Председатель правления eLife попросил Эйзена удалить его пост в Twitter, но он отказался сделать это, «потому что это было бы капитуляцией перед тем, что я считал действительно неверно направленной попыткой заставить замолчать любое выражение поддержки палестинцев». 23 октября 2023 года Эйзен был уволен из eLife . В ответ на увольнение по меньшей мере пять редакторов eLife подали в отставку, а другие ученые заявили, что прекратят участвовать в мероприятиях eLife в знак солидарности с Эйзеном. Было организовано письмо-петиция в знак протеста против увольнения Эйзена. В петиции, которую подписали более 2000 ученых, преподавателей и исследователей, говорится, что действия eLife оказывают «сдерживающий эффект» на свободу слова в академической среде. [30]

eLife опубликовала заявление, в котором говорится: «Майк получил четкую обратную связь от правления, что его подход к лидерству, коммуникации и социальным сетям в ключевые моменты был пагубным для сплоченности сообщества, которое мы пытаемся построить, и, следовательно, для миссии eLife . Именно на этом фоне дальнейший случай такого поведения способствовал решению правления». [29] Ответ Эйзена был: «Они имели в виду эту чертову штуку с червями. Я даже не шучу!». [25] Представитель eLife пояснил в электронном письме The Hindu , что «Мы ценим и уважаем право каждого на свободу слова, включая политическое выражение и законное право на протест. Особенно для тех, кто занимает руководящие должности, осуществление этого права сопряжено с обязанностями: ожиданием проявления здравого смысла и обязанностью заботиться о сообществах, которым они служат. Мы не считаем, что эти качества были продемонстрированы». [31]

В годовом отчете eLife за 2023 год председатель совета директоров сказал: «В октябре мы расстались с нашим главным редактором Майклом Эйзеном и хотим признать его выдающееся видение и лидерство, которые он привнес в eLife, что позволяет нам развивать его наследие по мере развития нашей издательской модели». [32]

10 ноября 2023 года в ответ на твит «Как сделать заседание факультета более захватывающим? Только неправильные ответы» Эйзен написал в Твиттере: «Посадите меня рядом с Рэнди Шекманом», что указывает на продолжающийся личный конфликт с предыдущим главным редактором . [33]

Пропаганда открытого доступа

На протяжении всей своей карьеры он был сторонником « открытой науки », которая представляет собой свободный выпуск материального и интеллектуального продукта научных исследований. Он является ведущим сторонником открытого доступа к научным публикациям [34] [35] [36] и является соучредителем Публичной научной библиотеки (PLOS), а также входит в совет PLOS, Академический руководящий и пропагандистский комитет Открытой библиотеки гуманитарных наук [37] и является советником Science Commons .

В 2012 году Эйзен начал протестовать против Закона об исследовательских работах в рамках своего призыва содействовать открытому доступу к информации. [38]

Награды и почести

В 2002 году Эйзен был удостоен первой премии Бенджамина Франклина в области биоинформатики за свою работу над PLOS и открытый доступ к своему программному обеспечению для анализа кластеров микрочипов. [39]

Ссылки

  1. ^ Публикации Майкла Эйзена, проиндексированные Google Scholar
  2. ^ Science News Staff (24 октября 2023 г.). «Ведущий редактор журнала уволен за одобрение сатирической статьи о конфликте Израиля и ХАМАС». Science . Архивировано из оригинала 24 октября 2023 г. . Получено 24 октября 2023 г. .
  3. ^ "eLife приветствует Майкла Эйзена в качестве главного редактора". eLife . 2019-03-05 . Получено 2019-03-05 .
  4. ^ "Майкл Б. Эйзен, доктор философии". Медицинский институт Говарда Хьюза . Получено 23 сентября 2013 г.
  5. ^ Публикации Майкла Эйзена, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  6. ^ аб Перу, CM; Сёрли, Т; Эйзен, МБ; Ван Де Рейн, М; Джеффри, СС; Рис, Калифорния; Поллак-младший; Росс, DT; Джонсен, Х; Акслен, Луизиана; Флюге, О; Пергаменщиков А; Уильямс, К; Чжу, SX; Лённинг, ЧП; Борресен-Дейл, Алабама; Браун, ПО; Ботштейн, Д. (2000). «Молекулярные портреты опухолей молочной железы человека». Природа . 406 (6797): 747–52. Бибкод : 2000Natur.406..747P. дои : 10.1038/35021093. PMID  10963602. S2CID  1280204.
  7. ^ Айер, В. Р. (1999). «Транскрипционная программа в ответе человеческих фибробластов на сыворотку». Science . 283 (5398): 83–7. Bibcode :1999Sci...283...83I. doi :10.1126/science.283.5398.83. PMID  9872747.
  8. ^ Росс, DT; Шерф, У; Эйзен, МБ; Перу, КМ; Рис, К; Спеллман, П; Айер, В; Джеффри, СС; Ван Де Рейн, М; Уолтем, М; Пергаменщиков А; Ли, Джей Си; Лашкари, Д; Шалон, Д; Майерс, Т.Г.; Вайнштейн, Дж. Н.; Ботштейн, Д; Браун, ПО (2000). «Систематические изменения в моделях экспрессии генов в линиях раковых клеток человека». Природная генетика . 24 (3): 227–35. дои : 10.1038/73432. PMID  10700174. S2CID  1135137.
  9. ^ Коэн, Джон (27.01.2017). «Вопросы и ответы: Майкл Эйзен претендует на должность первого биолога по мухам в Сенате США». Наука | AAAS . Получено 13.04.2020 .
  10. ^ Оки, Сьюзан. «УЧЕНЫЙ NIH ПОКОНЧИЛ С САМОУБИЙСТВОМ НА ФОНЕ ПРОВЕРКИ БУМАГИ». Washington Post . Получено 7 февраля 2017 г.
  11. ^ ab Mechanic, Michael. "Укради эту исследовательскую работу! (Ты уже заплатил за нее.)". Mother Jones . Получено 7 февраля 2017 г.
  12. ^ abcdef Кригер, Лиза (2017-02-04). "Молекулярный биолог из Bay Area Майкл Эйзен объявляет о своей заявке на место в Сенате США". San Jose Mercury News . Получено 7 февраля 2017 г.
  13. ^ abc "Майкл Эйзен: Бейсбол, математика и биология". India Bio Science. Архивировано из оригинала 2021-12-21 . Получено 7 февраля 2017 .
  14. ^ Эйзен, Майкл Брюс (1996). Структурные исследования белков вируса гриппа А (диссертация на соискание степени доктора философии). Гарвардский университет. OCLC  48938206.
  15. ^ Eisen, MB; Spellman, PT; Brown, PO; Botstein, D (8 декабря 1998 г.). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии в масштабе генома». Proc Natl Acad Sci USA . 95 (25): 14863–8. Bibcode : 1998PNAS...9514863E. doi : 10.1073/pnas.95.25.14863 . PMC 24541. PMID  9843981. 
  16. ^ "Джеймс Фрейзер и Майкл Эйзен: бейсбол встречает биологию". Образование . iBiology . Получено 7 февраля 2017 г. .
  17. ^ ab Eisen, M.; Spellman, P.; Brown, P .; Botstein, D. (1998). «Кластерный анализ и отображение паттернов экспрессии по всему геному». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (25): 14863–14868. Bibcode : 1998PNAS...9514863E. doi : 10.1073/pnas.95.25.14863 . PMC 24541. PMID  9843981 . 
  18. ^ ab Alizadeh, AA; Eisen, MB; Davis, RE; Ma, C.; Lossos, IS; Rosenwald, A.; Boldrick, JC; Sabet, H.; Tran, T.; Yu, X.; Powell, JI; Yang, L.; Marti, GE; Moore, T.; Hudson Jr, J.; Lu, L.; Lewis, DB; Tibshirani, R.; Sherlock, G.; Chan, WC; Greiner, TC; Weisenburger, DD; Armitage, JO; Warnke, R.; Levy, R.; Wilson, W.; Grever, MR; Byrd, JC; Botstein, D.; Brown, PO (2000). «Отдельные типы диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы, идентифицированные с помощью профилирования экспрессии генов». Nature . 403 (6769): 503–511. Bibcode : 2000Natur.403..503A. doi : 10.1038/35000501. PMID  10676951. S2CID  4382833.
  19. ^ Кларк, АГ; и др. (2007). «Эволюция генов и геномов в филогении дрозофилы». Nature . 450 (7167): 203–18. Bibcode :2007Natur.450..203C. doi : 10.1038/nature06341 . PMID  17994087.
  20. ^ Spellman, PT; Sherlock, G.; Zhang, MQ; Iyer, VR; Anders, K.; Eisen, MB; Brown, PO; Botstein, D.; Futcher, B. (1998). «Комплексная идентификация генов, регулируемых клеточным циклом, дрожжей Saccharomyces cerevisiae с помощью гибридизации на микрочипах». Молекулярная биология клетки . 9 (12): 3273–97. doi :10.1091/mbc.9.12.3273. PMC 25624. PMID  9843569. 
  21. ^ ab Harmon, Amy; Henry Fountain (2017-02-06). «В эпоху Трампа ученые демонстрируют признаки политического импульса». The New York Times . Получено 7 февраля 2017 г.
  22. ^ Рирдон, Сара (2017). «Генетик запускает заявку на место в Сенате США». Nature . doi : 10.1038/nature.2017.21381 . S2CID  78431422 . Получено 7 февраля 2017 г. .
  23. ^ "Майкл Эйзен". Ballotpedia . Получено 2020-04-13 .
  24. ^ Джонс, Эшер; Элбейн, Тайлер О. (2 августа 2020 г.). «Шутка о червях вызвала в Twitter жаркую войну из-за обвинений в сексизме и расизме». The Daily Beast . Получено 22 августа 2024 г.
  25. ^ abc Mechanic, Майкл (17 ноября 2023 г.). «Ведущий научный журнал уволил своего редактора из-за пропалестинского твита. Он ни о чем не сожалеет». Mother Jones . Получено 31 августа 2024 г.
  26. ^ Бромвич, Джона Э.; Маркус, Эзра (4 августа 2020 г.). «Анонимный профессор, которого не было». The New York Times . Получено 22 августа 2024 г.
  27. ^ Брэйнард, Джеффри (20 октября 2022 г.). «Журнал стремится перевернуть научную публикацию, только рецензируя, а не принимая рукописи». Science News . Получено 24 октября 2023 г.
  28. ^ Эбботт, Элисон (17 марта 2023 г.). «Раздор в eLife: изнутри стремления журнала перевернуть научную публикацию». Nature . Получено 27 августа 2024 г. .
  29. ^ ab "Известный редактор журнала уволен за одобрение сатирической статьи о конфликте Израиля и ХАМАС". Science . 23 октября 2023 г. Получено 22 августа 2024 г.
  30. ^ «Увольнение редактора научного журнала после сообщения о Газе вызвало раскол в свободе слова». NBC News . 2023-10-26 . Получено 2023-11-01 .
  31. ^ Прасад, Р. (28 октября 2023 г.). «„eLife скорбит о трагических потерях гражданских жизней, как израильтян, так и палестинцев“». The Hindu . Получено 18 сентября 2024 г. .
  32. ^ Хакетт, Джоанн (5 сентября 2024 г.). «Годовой отчет: обзор 2023 года». eLife . Получено 18 сентября 2024 г. .
  33. Эйзен, Майкл (10 ноября 2023 г.). «Twitter». Twitter . Получено 24 октября 2024 г. .
  34. Эйзен, Майкл (8 октября 2003 г.). «Опубликуйте и получите похвалу». Guardian . Получено 23 сентября 2013 г.
  35. ^ Браун, PO ; Эйзен, MB; Вармус, HE (2003). «Почему PLoS стал издателем». PLOS Biology . 1 (1): E36. doi : 10.1371/journal.pbio.0000036 . PMC 212706. PMID  14551926 . 
  36. ^ Сотрудники WIRED. "The Wired Rave Awards 2004". Wired . ISSN  1059-1028 . Получено 11 августа 2023 г.
  37. ^ Говард, Дженнифер (29 января 2013 г.). «Проект направлен на то, чтобы привнести открытость в стиле PLoS в гуманитарные науки». The Chronicle of Higher Education . Получено 19 ноября 2013 г.
  38. ^ Доббс, Дэвид (6 января 2012 г.). «Конгресс рассматривает возможность платного доступа к науке, за которую вы уже заплатили». wired.com . Получено 12 февраля 2012 г.
  39. ^ "Премия Бенджамина Франклина - Bioinformatics.org". www.bioinformatics.org . Получено 7 февраля 2017 г. .

Внешние ссылки