stringtranslate.com

Маккензи Вейгандт Матис

Маккензи В. Матис — американский нейробиолог и главный исследователь в Федеральной политехнической школе Лозанны . Ее лаборатория изучает адаптивные механизмы в биологическом и искусственном интеллекте для информирования адаптивных систем ИИ и трансляционных исследований.

Ранняя жизнь и образование

Матис получила высшее образование в Университете Орегона, получив степень бакалавра наук в 2007 году. [1] Затем она работала старшим научным сотрудником и руководителем лаборатории в Лаборатории исследований стволовых клеток проекта БАС в Колумбийском университете с 2007 по 2012 год. [1] [2] Работая под руководством доктора Кристофера Э. Хендерсона и доктора Хайнека Вихтерле, Матис смоделировала боковой амиотрофический склероз (БАС) с использованием двигательных нейронов, полученных из стволовых клеток . [2] За время работы в лаборатории она опубликовала две первые авторские научные статьи, одну в журнале Journal of Neuroscience , в которой предлагался новый протокол для создания подтипов нейронов, иннервирующих конечности человека in vitro, для использования в исследованиях неврологических заболеваний, [3] а другую в журнале Nature Biotechnology по сравнительному анализу способности линий стволовых клеток iPS производить двигательные нейроны. [4] Затем Матис переехала в Бостон и присоединилась к аспирантуре по молекулярной и клеточной биологии (MCB) в Гарвардском университете . [5] На пути к получению степени доктора философии она также получила степень магистра. [1] [5] Во время обучения в докторантуре Матис проводила исследования нейронных цепей, лежащих в основе ошибок прогнозирования вознаграждения, под руководством профессора Наосигэ Учиды в Гарвардском центре изучения мозга. [5] На первом году обучения в аспирантуре Матис получила стипендию Национального научного фонда для финансирования своих исследований в аспирантуре. [6] Матис смогла объединить свои интересы в области управления моторикой с опытом Учиды в области нейронных записей и поведенческого анализа, чтобы сформировать новое научное направление в лаборатории [5] и опубликовать первую авторскую статью в журнале Neuron к концу своей докторской диссертации относительно существенной роли, которую соматосенсорная кора играет в адаптации движений передних конечностей у грызунов. [7] Ближе к концу обучения в докторантуре Матис получила стипендию Роуленда, которая обеспечила пятилетнее финансирование для открытия ее собственной лаборатории в Институте Роуленда Гарварда в Кембридже, штат Массачусетс. [5] До основания лаборатории Матис в Гарварде Матис также получила стипендию Women & the Brain (WATB) за достижения в области науки о мозге, которая предоставила ей финансирование для работы в Германии летом 2017 года под руководством профессора Маттиаса Бетге в Тюбингенском университете . [5] В своей постдокторской работе Матис сосредоточилась на пионерском глубоком обучении.инструменты для нейронного и поведенческого анализа, которые послужили решающим шагом на пути к ее независимой карьере. [8]

Карьера и исследования

В 2017 году Матис открыла свою лабораторию в Институте Роуленда при Гарвардском университете с целью обратного проектирования нейронных цепей, которые управляют адаптивным двигательным поведением. [5] С помощью крупномасштабных нейронных записей и создания новых роботизированных и машинных инструментов обучения лаборатория Матис исследует нейронные цепи и анализирует поведенческие выходы, чтобы лучше понять, как функция мозга связана с поведением. [9] Вместе с Александром Матисом Матис разработал DeepLabCut, инструмент глубокого обучения для отслеживания позы животных с течением времени. Этот инструмент использует трансферное обучение для оптимизации предварительно обученной базовой модели ImageNet и детекторы признаков из DeeperCut, [10] чтобы точно настроить желаемый новый набор данных после достаточного обучения. [11] Теперь пакет включает в себя гораздо больше сетей, включая их собственную DLCRNet с отслеживанием позы и повторной идентификацией животных. [12] Матис продемонстрировал универсальность этого инструмента на многих разнообразных наборах данных, подчеркнув надежную конструкцию и потенциал для широкого использования в областях, даже за пределами нейробиологии. [13] Матис предана идее открытой науки [14] , и поэтому разработанный ею новый инструмент глубокого обучения находится в открытом доступе , так что исследователи по всему миру имеют доступ к коду, чтобы использовать этот инструмент для анализа поведения животных беспристрастным и точным способом, чтобы лучше понять, как нейронная активность управляет определенным поведением. [14] [15] [11] Ее работа была представлена ​​в Nature, [16] Bloomberg Business Week, [17] и The Atlantic. [18]

С августа 2020 года Матис перешёл в Швейцарский федеральный технологический институт , где работает в Институте мозга и разума, Центре интеллектуальных систем и Институте Neuro-X в качестве штатного профессора. [19] [20] Лаборатория располагается в кампусе Biotech в Женеве, Швейцария , где Матис занимает должность заведующего кафедрой интегративной нейронауки Фонда Бертарелли. [21] [20]

Награды и почести

Публикации

Публикации Маккензи Вейгандт Матис, проиндексированные Google Scholar

Личная жизнь

Матис замужем за нейробиологом доктором Александром Матисом , который является доцентом Швейцарского федерального технологического института . [11] [29] В юности она участвовала в соревнованиях по верховой езде в США. [30]

Ссылки

  1. ^ abcd "Люди". адаптивная лаборатория управления двигателем . Получено 25 марта 2020 г.
  2. ^ ab "Маккензи Вейгандт Матис". ученый.harvard.edu . Проверено 25 марта 2020 г.
  3. ^ Аморозо, Маккензи В.; Крофт, Гист Ф.; Уильямс, Дамиан Дж.; О'Киф, Шон; Карраско, Моника А.; Дэвис, Энн Р.; Ройбон, Лоран; Окли, Дерек Х.; Маниатис, Том; Хендерсон, Кристофер Э.; Вихтерле, Хайнек (9 января 2013 г.). «Ускоренное высокопроизводительное получение двигательных нейронов, иннервирующих конечности, из стволовых клеток человека». Журнал нейронауки . 33 (2): 574–586. doi :10.1523/JNEUROSCI.0906-12.2013. ISSN  1529-2401. PMC 3711539. PMID 23303937  . 
  4. ^ Boulting, GL*, Kiskinis, E.*, Croft, GF*, Amoroso, MW*, Oakley, DH*, Wainger, BJ, Williams, DJ, Kahler, DJ, Yamaki, M., Davidow, LS, Rodolfa, CT, Dimos, JT, Mikkilineni, S., Macdermott, AB, Woolf, CJ, Henderson, CE, Wichterle, H., & Eggan, KC (2011). Функционально охарактеризованный тестовый набор человеческих индуцированных плюрипотентных стволовых клеток. Nature Biotechnology, 29, 279-286.
  5. ^ abcdefgh "MCO Graduate to Open Lab Through the Rowland Institute at Harvard". Гарвардский университет - Кафедра молекулярной и клеточной биологии . 14 марта 2017 г. Получено 25 марта 2020 г.
  6. ^ ab "ЧЕТЫРЕ ВЫПУСКНИКА MCB ПОЛУЧИЛИ СТИПЕНДИИ NSF В 2013 ГОДУ". Гарвардский университет - Кафедра молекулярной и клеточной биологии . 11 апреля 2013 г. Получено 25 марта 2020 г.
  7. ^ Матис, Маккензи Вейгандт; Матис, Александр; Учида, Наосигэ (22 марта 2017 г.). «Соматосенсорная кора играет существенную роль в адаптации моторики передних конечностей у мышей». Neuron . 93 (6): 1493–1503.e6. doi :10.1016/j.neuron.2017.02.049. ISSN  0896-6273. PMC 5491974 . PMID  28334611. 
  8. ^ Матис, Александр; Мамиданна, Пранав; Абе, Тайга; Кьюри, Кевин М.; Мурти, Венкатеш Н.; Матис, Маккензи В.; Бетге, Маттиас (9 апреля 2018 г.). «Безмаркерное отслеживание определяемых пользователем признаков с помощью глубокого обучения». arXiv : 1804.03142 [cs.CV].
  9. ^ "Mackenzie Mathis". Harvard Brain Science Initiative . Получено 25 марта 2020 г.
  10. ^ Инсафутдинов, Эльдар; Пищулин Леонид; Андрес, Бьорн; Андрилука, Михаил; Шиле, Бернт (2016). «DeeperCut: более глубокая, сильная и быстрая модель оценки позы нескольких человек. Эльдар Инсафутдинов, Леонид Пищулин, Бьорн Андрес, Михаил Андрилука, Бернт Шиле». arXiv : 1605.03170 [cs.CV].
  11. ^ abc Йонг, Эд (3 июля 2018 г.). «Инструмент искусственного интеллекта, меняющий правила игры для отслеживания перемещений животных». The Atlantic . Получено 25 марта 2020 г. .
  12. ^ Лауэр, Дж.; Чжоу, М.; Йе, С.; и др. (2022). «Оценка, идентификация и отслеживание позы нескольких животных с помощью DeepLabCut». Nature Methods . 19 (4): 496–504. doi :10.1038/s41592-022-01443-0. PMC 9007739 . 
  13. ^ «Инструмент ИИ с открытым исходным кодом, доступный для изучения движения в зависимости от поведения и вида». Harvard Gazette . 30 августа 2018 г. Получено 25 марта 2020 г.
  14. ^ ab "Интервью: более глубокий анализ поведения с Маккензи Матис". Neuroscience from Technology Networks . Получено 25 марта 2020 г. .
  15. ^ «Apple, Google и Facebook совершают набеги на лаборатории по исследованию животных». Bloomberg.com . 18 июня 2019 г. Получено 25 марта 2020 г.
  16. ^ Квок, Роберта (30 сентября 2019 г.). «Глубокое обучение — движущая сила революции в отслеживании движения». Nature . 574 (7776): 137–138. Bibcode :2019Natur.574..137K. doi : 10.1038/d41586-019-02942-5 . PMID  31570871.
  17. ^ «Apple, Google и Facebook совершают набеги на лаборатории по исследованию животных». Bloomberg.com . 18 июня 2019 г.
  18. ^ «Инструмент искусственного интеллекта, меняющий правила игры для отслеживания перемещений животных». The Atlantic . 3 июля 2018 г.
  19. ^ abc "адаптивная лаборатория управления двигателем". адаптивная лаборатория управления двигателем . Получено 25 марта 2020 г.
  20. ^ ab Evangelista, Sandy (27 сентября 2019 г.). «Номинации профессоров EPFL». {{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  21. ^ ab "News". адаптивная лаборатория управления двигателем . Получено 25 марта 2020 г.
  22. ^ «Объявлены лауреаты премии Эрика Кандела для молодых нейробиологов 2023 года». www.fens.org . 29 июля 2023 г. . Получено 26 сентября 2023 г. .
  23. ↑ Лион, Нильс (23 августа 2021 г.). "FENS 2022 Young Investigator Prize" . Получено 23 августа 2021 г.
  24. ^ "CZI – Essential Open Source Software for Science". Chan Zuckerberg Initiative . Получено 25 марта 2020 г.
  25. ^ "Гранты на поездки для начинающих исследователей 2018: выбраны первые семь авторов". eLife . 3 апреля 2018 г. Получено 25 марта 2020 г.
  26. ^ "BETHGE LAB · Финансирование". bethgelab.org . Получено 25 марта 2020 г. .
  27. ^ "Архив наград". Гарвардский университет - Кафедра молекулярной и клеточной биологии . Получено 25 марта 2020 г.
  28. ^ "Архивы премии Фонда Эрнеста Перальты". Гарвардский университет - Кафедра молекулярной и клеточной биологии . Получено 25 марта 2020 г.
  29. ^ "Александр Матис | О нас". www.people.fas.harvard.edu . Получено 25 марта 2020 г. .
  30. ↑ Маркс, Вивьен (1 апреля 2022 г.). «Маккензи Вейгандт Матис». Природные методы . 19 (4): 373. doi : 10.1038/s41592-022-01438-x. ISSN  1548-7105.