Турнир по бейсболу NCAA Division I 1999 года проводился в конце бейсбольного сезона NCAA Division I 1999 года для определения национального чемпиона по бейсболу среди колледжей . Турнир был расширен до 64 команд в 1999 году, добавив Суперрегион. Турнир завершился тем, что восемь команд соревновались в College World Series , турнире с двойным выбыванием в пятьдесят третий год. Было проведено шестнадцать региональных соревнований для определения участников финального события, при этом каждый победитель выходил в серию из трех матчей против другого регионального чемпиона за право играть в College World Series. Каждый регион состоял из четырех команд, в результате чего в турнире по завершении своего регулярного сезона, а в некоторых случаях и после турнира конференции, приняли участие 64 команды. [1] Чемпионом пятьдесят третьего турнира стал Майами (Флорида) , тренером которого был Джим Моррис . Самым выдающимся игроком стал Маршалл Макдугалл из Университета штата Флорида .
Жирным шрифтом выделен участник CWS.
Жирным шрифтом выделен победитель.
Ведущий: Райс в Астродоме
Следующие игроки вошли в состав сборной всех турниров Мировой серии колледжей.