Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Субъединица бета ядерного фактора транскрипции Y — это белок , который у людей кодируется геном NFYB . [ 5] [6]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является одной субъединицей тримерного комплекса, образуя высококонсервативный фактор транскрипции, который связывается с высокой специфичностью с мотивами CCAAT в промоторных областях в различных генах. Этот генный продукт, субъединица B, образует плотный димер с субъединицей C, что является предпосылкой для ассоциации субъединицы A. Полученный тример связывается с ДНК с высокой специфичностью и сродством. Субъединицы B и C содержат гистон-подобный мотив. Наблюдение за гистоновой природой этих субъединиц подтверждается двумя типами доказательств: выравниваниями белковых последовательностей и экспериментами с мутантами. [7]
Взаимодействия
Было показано, что NFYB взаимодействует с:
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000120837 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020248 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, Hooft van Huijsduijnen R, Figueroa F, Nadeau J, Benoist C, Mathis D (март 1992). «Одна субъединица фактора транскрипции NF-Y картируется близко к главному комплексу гистосовместимости в мышиных и человеческих хромосомах». Genomics . 11 (3): 630–4. doi :10.1016/0888-7543(91)90070-U. PMID 1774067.
- ^ Maity SN, de Crombrugghe B (июнь 1998 г.). «Роль белка CCAAT-связывания CBF/NF-Y в транскрипции». Trends Biochem Sci . 23 (5): 174–8. doi :10.1016/S0968-0004(98)01201-8. PMID 9612081.
- ^ "Ген Энтреза: ядерный фактор транскрипции Y NFYB, бета".
- ^ Имбриано С, Болоньезе Ф, Гуртнер А, Пьяджио Г, Мантовани Р (июль 2001 г.). «HSP-CBF — зависимый от NF-Y коактиватор промоутеров теплового шока CCAAT-боксов». J. Biol. Chem . 276 (28): 26332–9. doi : 10.1074/jbc.M101553200 . hdl : 11380/303761 . PMID 11306579.
- ^ Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997). "Физическое и функциональное взаимодействие между белком Tax1 лимфотропного вируса Т-клеток человека типа 1 и связывающим белком CCAAT NF-Y". Mol. Cell. Biol . 17 (3): 1236–43. doi :10.1128/mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250 .
- ^ Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (апрель 2001 г.). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». J. Cell Sci . 114 (Pt 8): 1533–44. doi :10.1242/jcs.114.8.1533. PMID 11282029.
- ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (июнь 1997 г.). "CCAAT связывает взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновой складки для ассоциации с основными остатками TBP". Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093 /nar/25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
Дальнейшее чтение
- Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). «Механизмы репрессии гена IA beta главного комплекса гистосовместимости». Иммунобиология . 198 (1–3): 249–63. doi :10.1016/s0171-2985(97)80045-9. PMID 9442396.
- Мантовани Р. (1999). «Молекулярная биология фактора связывания CCAAT NF-Y». Gene . 239 (1): 15–27. doi :10.1016/S0378-1119(99)00368-6. PMID 10571030.
- Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, Andre I, Benoist C, Mathis D (1992). "Эволюционная вариация фактора транскрипции NF-Y, связывающего CCAAT". Nucleic Acids Res . 20 (5): 1087–91. doi :10.1093/nar/20.5.1087. PMC 312095. PMID 1549471 .
- Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, Benoist C, Mathis D (1992). «Интронно-экзонная организация генов NF-Y. Тканеспецифический сплайсинг изменяет домен активации». J. Biol. Chem . 267 (13): 8984–90. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50377-5 . PMID 1577736.
- Lloberas J, Maki RA, Celada A (1995). "Подавление экспрессии гена главного комплекса гистосовместимости IA бета белками dbpA и dbpB (mYB-1)". Mol. Cell. Biol . 15 (9): 5092–9. doi :10.1128/mcb.15.9.5092. PMC 230756. PMID 7651426 .
- Chang ZF, Liu CJ (1994). "Человеческий белок, связывающий тимидинкиназу CCAAT, — это NF-Y, экспрессия субъединицы A которого зависит от сыворотки в диплоидных фибробластах IMR-90 человека". J. Biol. Chem . 269 (27): 17893–8. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32393-1 . PMID 8027044.
- Мантовани Р., Ли XY, Пессара У., Хоофт ван Хуисждуйнен Р., Бенуа С., Матис Д. (1994). «Доминантно-негативные аналоги НФ-Я». Ж. Биол. Хим . 269 (32): 20340–6. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31997-X . ПМИД 8051128.
- Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (1997). "Физическое и функциональное взаимодействие между белком Tax1 лимфотропного вируса Т-клеток человека типа 1 и связывающим белком CCAAT NF-Y". Mol. Cell. Biol . 17 (3): 1236–43. doi :10.1128/mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250 .
- Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (1997). "CCAAT связывание взаимодействий NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновой складки для ассоциации с основными остатками TBP". Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093/nar/25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
- Currie RA (1998). "Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I(Y)". J. Biol. Chem . 272 (49): 30880–8. doi : 10.1074/jbc.272.49.30880 . PMID 9388234.
- Currie RA (1998). "NF-Y связан с гистонацетилтрансферазами GCN5 и P/CAF". J. Biol. Chem . 273 (3): 1430–4. doi : 10.1074/jbc.273.3.1430 . PMID 9430679.
- Currie RA (1998). «Биохимическая характеристика комплекса факторов транскрипции NF-Y во время развития В-лимфоцитов». J. Biol. Chem . 273 (29): 18220–9. doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID 9660784.
- Bemark M, Olsson H, Heinegård D, Leanderson T (1998). «Очистка и характеристика связывания белка с промотором каппа SP6. Потенциальная роль фактора связывания CArG-box-A в транскрипции каппа». J. Biol. Chem . 273 (30): 18881–90. doi : 10.1074/jbc.273.30.18881 . PMID 9668064.
- Faniello MC, Bevilacqua MA, Condorelli G, de Crombrugghe B, Maity SN, Avvedimento VE, Cimino F, Costanzo F (1999). "B-субъединица CAAT-связывающего фактора NFY связывает центральный сегмент коактиватора p300". J. Biol. Chem . 274 (12): 7623–6. doi : 10.1074/jbc.274.12.7623 . PMID 10075648.
- Hake SB, Masternak K, Kammerbauer C, Janzen C, Reith W, Steimle V (2000). "CIITA лейцин-богатые повторы контролируют ядерную локализацию, in vivo рекрутинг в главный комплекс гистосовместимости (MHC) класса II энхансеосомы и трансактивацию генов MHC класса II". Mol. Cell. Biol . 20 (20): 7716–25. doi :10.1128/MCB.20.20.7716-7725.2000. PMC 86349. PMID 11003667 .
- Liang F, Schaufele F, Gardner DG (2001). «Функциональное взаимодействие NF-Y и Sp1 необходимо для транскрипции гена рецептора натрийуретического пептида типа A». J. Biol. Chem . 276 (2): 1516–22. doi : 10.1074/jbc.M006350200 . PMID 11022037.
- Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (2001). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». J. Cell Sci . 114 (Pt 8): 1533–44. doi :10.1242/jcs.114.8.1533. PMID 11282029.
Внешние ссылки
В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .