stringtranslate.com

Онтология растений

Онтология растений (PO) — это коллекция онтологий , разработанных Консорциумом онтологии растений. Эти онтологии описывают анатомические структуры, стадии роста и развития Viridiplantae . [2] [3] [4] [5] [6] [7] PO предназначена для множества приложений, включая генетику , геномику , феномику и развитие , таксономию и систематику , семантические приложения и образование. [1] [8]

Участники проекта

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Walls, RL; Athreya, B.; Cooper, L.; Elser, J.; Gandolfo, MA; Jaiswal, P.; Mungall, CJ; Preece, J.; Rensing, S.; Smith, B.; Stevenson, DW (2012). «Онтологии как интегративные инструменты для науки о растениях». American Journal of Botany . 99 (8): 1263–1275. doi :10.3732/ajb.1200222. PMC  3492881 . PMID  22847540.
  2. ^ ab The Plant Ontology Consortium, C. (2002). "The Plant Ontology™ Consortium и онтологии растений". Сравнительная и функциональная геномика . 3 (2): 137–142. doi :10.1002/cfg.154. PMC 2447263. PMID  18628842 . 
  3. ^ Ilic, Katica (2008). Albert, Burger (ред.). Plant Structure Ontology (PSO) - Морфологическая и анатомическая онтология цветковых растений. Springer. стр. 27–42 . Получено 22 августа 2012 г.
  4. ^ Авраам, С.; Тунг, К. -В.; Илич, К.; Джайсвал, П.; Келлог, Е.А.; МакКоуч, С .; Пуджар, А.; Рейзер, Л.; Ри, С.Й.; Сакс, М.М.; Шеффер, М.; Стайн, Л.; Стивенс, П.; Винсент, Л.; Запата, Ф.; Уэр, Д. (2007). «База данных онтологии растений: общественный ресурс для контролируемого словаря и аннотаций по структуре растений и стадиям развития». Nucleic Acids Research . 36 (выпуск базы данных): D449–D454. doi :10.1093/nar/gkm908. PMC 2238838 . PMID  18194960. 
  5. ^ Ilic, K.; Kellogg, EA; Jaiswal, P.; Zapata, F.; Stevens, PF; Vincent, LP; Avraham, S.; Reiser, L.; Pujar, A.; Sachs, MM; Whitman, NT; McCouch, SR; Schaeffer, ML; Ware, DH; Stein, LD; Rhee, SY (2006). «Онтология структуры растений, унифицированный словарь анатомии и морфологии цветковых растений». Физиология растений . 143 (2): 587–599. doi :10.1104/pp.106.092825. PMC 1803752. PMID  17142475 . 
  6. ^ Pujar, A.; Jaiswal, P.; Kellogg, EA; Ilic, K.; Vincent, L.; Avraham, S.; Stevens, P.; Zapata, F.; Reiser, L.; Rhee, SY; Sachs, MM; Schaeffer, M.; Stein, L.; Ware, D.; McCouch, S. (2006). «Онтология стадии роста всего растения для покрытосеменных и ее применение в биологии растений». Физиология растений . 142 (2): 414–428. doi :10.1104/pp.106.085720. PMC 1586063. PMID  16905665 . 
  7. ^ Jaiswal, P.; Avraham, S.; Ilic, K.; Kellogg, EA; McCouch, S.; Pujar, A.; Reiser, L.; Rhee, SY; Sachs, MM; Schaeffer, M.; Stein, L.; Stevens, P.; Vincent, L.; Ware, D.; Zapata, F. (2005). «Онтология растений (PO): контролируемый словарь структур и стадий роста растений». Сравнительная и функциональная геномика . 6 (7–8): 388–397. doi :10.1002/cfg.496. PMC 2447502. PMID  18629207 . 
  8. ^ «Информационная перегрузка в эпоху «больших данных». Science Daily . Получено 23 августа 2012 г.

Внешние ссылки


  • в
  • т
  • е