ПАТЗ1

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Белок 1, содержащий POZ-, AT-крючок и цинковый палец, представляет собой белок , который у человека кодируется геном PATZ1 . ^{[5] [6] [7] [8]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит ДНК-связывающий мотив AT-крючка , который обычно связывается с другими ДНК-связывающими структурами, играя важную роль в моделировании хроматина и регуляции транскрипции. Считается, что его Poz-домен функционирует как сайт белок-белкового взаимодействия и необходим для репрессии транскрипции, а цинковые пальцы составляют ДНК-связывающий домен. Поскольку кодируемый белок имеет типичные черты транскрипционного фактора, предполагается, что он является репрессором экспрессии генов. При мелкокруглоклеточной саркоме этот ген сливается с EWS путем небольшой инверсии 22q, после чего считается, что гибрид транслоцируется (t(1;22)(p36.1;q12). В перестройке хромосомы 22 участвует интрон 8. EWS и экзон 1 этого гена создают химерную последовательность, содержащую домен трансактивации EWS, слитый с доменом цинкового пальца этого белка. Это яркий пример внутрихромосомной перестройки хромосомы 22. Описаны четыре альтернативно сплайсированных варианта транскрипта. этот ген ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что PATZ1 взаимодействует с:

• Андрогенный рецептор , ^[9]
• Транскрипционный фактор, ассоциированный с микрофтальмией , ^[10] и
• РНФ4 . ^{[9] [11]}

Рекомендации

1. GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000100105 - Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020453 - Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Бир Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н., Бизли О., Бёрд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека». Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D. дои : 10.1038/990031 . ПМИД  10591208.
6. Феделе М., Франко Р., Сальваторе Дж., Паронетто М.П., ​​Барбагалло Ф., Перо Р., Кьяриотти Л., Сетте С., Трамонтано Д., Чиффи Дж., Фуско А., Чиффи П. (апрель 2008 г.). «Ген PATZ1 играет решающую роль в сперматогенезе и опухолях яичек». Дж. Патол . 215 (1): 39–47. дои : 10.1002/путь.2323. PMID  18241078. S2CID  19437294.
7. Тянь X, Сунь Д, Чжан Ю, Чжао С, Сюн Х, Фан Дж (апрель 2008 г.). «Белок 278 цинковых пальцев, потенциальный онкоген колоректального рака человека». Acta Biochim Biophys Sin (Шанхай) . 40 (4): 289–96. CiteSeerX 10.1.1.624.619 . дои : 10.1111/j.1745-7270.2008.00405.x. ПМИД  18401526. 
8. «Ген Энтреза: PATZ1 POZ (BTB) и крючок AT, содержащий цинковый палец 1».
9. Перо Р., Лембо Ф., Палмьери Э.А., Витиелло С., Феделе М., Фуско А., Бруни CB, Кьяриотти Л. (февраль 2002 г.). «PATZ ослабляет RNF4-опосредованное усиление транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов». Ж. Биол. Хим . 277 (5): 3280–5. дои : 10.1074/jbc.M109491200 . ПМИД  11719514.
10. Мории Э., Обоки К., Катаока Т.Р., Игараси К., Китамура Ю. (март 2002 г.). «Взаимодействие и сотрудничество фактора транскрипции mi (MITF) и фактора, связанного с белком цинковых пальцев (MAZR), связанного с myc, для транскрипции гена протеазы 6 тучных клеток мыши». Ж. Биол. Хим . 277 (10): 8566–71. дои : 10.1074/jbc.M110392200 . ПМИД  11751862.
11. Феделе М, Бенвенуто Г, Перо Р, Маджелло Б, Баттиста С, Лембо Ф, Воллоно Е, Дэй ПМ, Санторо М, Лания Л, Бруни CB, Фуско А, Кьяриотти Л (март 2000 г.). «Новый член семейства BTB/POZ, PATZ, связывается с белком RING-пальца RNF4 и действует как репрессор транскрипции». Ж. Биол. Хим . 275 (11): 7894–901. дои : 10.1074/jbc.275.11.7894 . ПМИД  10713105.

дальнейшее чтение

• Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (1999). «На пути к полной последовательности генома человека». Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД  9847074.
• Кобаяси А., Ямагива Х., Хосино Х., Муто А., Сато К., Морита М., Хаяси Н., Ямамото М., Игараси К. (2000). «Комбинаторный код экспрессии генов, генерируемый фактором транскрипции Bach2 и MAZR (связанным с MAZ фактором) через домен BTB/POZ». Мол. Клетка. Биол . 20 (5): 1733–46. дои : 10.1128/MCB.20.5.1733-1746.2000. ПМК  85356 . ПМИД  10669750.
• Феделе М, Бенвенуто Дж, Перо Р, Маджелло Б, Баттиста С, Лембо Ф, Воллоно Е, Дэй ПМ, Санторо М, Лания Л, Бруни CB, Фуско А, Кьяриотти Л (2000). «Новый член семейства BTB/POZ, PATZ, связывается с белком RING-пальца RNF4 и действует как репрессор транскрипции». Ж. Биол. Хим . 275 (11): 7894–901. дои : 10.1074/jbc.275.11.7894 . ПМИД  10713105.
• Мастранджело Т., Модена П., Торниелли С., Буллрич Ф., Тести М.А., Мецзелани А., Радиче П., Аззарелли А., Пилотти С., Кроче СМ, Пьеротти М.А., Соцци Г (2000). «Новый ген цинкового пальца слит с EWS в небольшой круглоклеточной опухоли». Онкоген . 19 (33): 3799–804. дои : 10.1038/sj.onc.1203762. PMID  10949935. S2CID  24580332.
• Перо Р., Лембо Ф., Палмиери Э.А., Витиелло С., Феделе М., Фуско А., Бруни С.Б., Кьяриотти Л. (2002). «PATZ ослабляет RNF4-опосредованное усиление транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов». Ж. Биол. Хим . 277 (5): 3280–5. дои : 10.1074/jbc.M109491200 . ПМИД  11719514.
• Митчелмор С., Кьерульф К.М., Педерсен Х.К., Нильсен Й.В., Расмуссен Т.Е., Фискер М.Ф., Финсен Б., Педерсен К.М., Йенсен Н.А. (2002). «Характеристика двух новых ядерных изоформ цинковых пальцев домена BTB/POZ. Ассоциация с дифференцировкой нейронов гиппокампа, зернистых клеток мозжечка и макроглии». Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7598–609. дои : 10.1074/jbc.M110023200 . ПМИД  11744704.
• Мории Э., Обоки К., Катаока Т.Р., Игараси К., Китамура Ю. (2002). «Взаимодействие и сотрудничество фактора транскрипции mi (MITF) и фактора, связанного с белком цинковых пальцев (MAZR), связанного с myc, для транскрипции гена протеазы 6 тучных клеток мыши». Ж. Биол. Хим . 277 (10): 8566–71. дои : 10.1074/jbc.M110392200 . ПМИД  11751862.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома». Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК  545604 . ПМИД  15461802.