ПКБП1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Поли(rC)-связывающий белок 1 — это белок , который у людей кодируется геном PCBP1 . [ ^5]

Этот ген без интронов, как полагают, был получен путем ретротранспозиции полностью обработанной мРНК PCBP-2. Этот ген и PCBP-2 имеют паралоги (PCBP3 и PCBP4), которые, как полагают, возникли в результате событий дупликации целых генов. Белок, кодируемый этим геном, по-видимому, является многофункциональным. Он вместе с PCBP2 и HNRNPK соответствует основному клеточному белку, связывающему поли(rC). Он содержит три домена K-гомологичных (KH), которые могут участвовать в связывании РНК. Этот кодируемый белок вместе с PCBP-2 также функционирует как трансляционные коактиваторы РНК полиовируса через специфическое для последовательности взаимодействие со стеблем-петлей IV IRES и способствует репликации РНК полиовируса, связываясь с его 5'-концевой структурой клеверного листа.

Он также участвует в трансляционном контроле мРНК 15-липоксигеназы, мРНК L2 вируса папилломы человека типа 16 и РНК вируса гепатита А. Предполагается, что кодируемый белок также играет роль в формировании комплекса мРНП альфа-глобина, специфичного для последовательности, который связан со стабильностью мРНК альфа-глобина . ^[6]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000169564 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000051695 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Tommerup N, Leffers H (май 1997). «Распределение генов, содержащих KH-box человека, с помощью гибридизации in situ: HNRNPK отображается на 9q21.32-q21.33, PCBP1 на 2p12-p13 и PCBP2 на 12q13.12-q13.13, дистальнее FRA12A». Genomics . 32 (2): 297–8. doi :10.1006/geno.1996.0121. PMID  8833161.
6. "Ген Entrez: PCBP1 поли(rC) связывающий белок 1".

Дальнейшее чтение

• Kiledjian M, Wang X, Liebhaber SA (1995). «Идентификация двух белков домена KH в комплексе стабильности мРНП альфа-глобина». EMBO J . 14 (17): 4357–64. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb00110.x. PMC  394520 . PMID  7556077.
• Leffers H, Dejgaard K, Celis JE (1995). "Характеристика двух основных клеточных поли(rC)-связывающих человеческих белков, каждый из которых содержит три K-гомологичных (KH) домена". Eur. J. Biochem . 230 (2): 447–53. doi :10.1111/j.1432-1033.1995.tb20581.x. PMID  7607214.
• Aasheim HC, Loukianova T, Deggerdal A, Smeland EB (1994). «Тканеспецифическая экспрессия и структура кДНК человеческого транскрипта, кодирующего белок, связывающий нуклеиновую кислоту [oligo(dC)], связанный с пре-мРНК-связывающим белком K». Nucleic Acids Res . 22 (6): 959–64. doi :10.1093/nar/22.6.959. PMC  307915. PMID  8152927 .
• Blyn LB, Swiderek KM, Richards O и др. (1996). "Poly(rC) binding protein 2 binds to stem-loop IV of the poliovirus RNA 5' noncoding region: identifying by automatic liquidchromat-tandem mass spectrometry". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (20): 11115–20. Bibcode :1996PNAS...9311115B. doi : 10.1073/pnas.93.20.11115 . PMC  38293 . PMID  8855318.
• Kiledjian M, DeMaria CT, Brewer G, Novick K (1997). «Идентификация AUF1 (гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина D) как компонента комплекса стабильности мРНК альфа-глобина». Mol. Cell. Biol . 17 (8): 4870–6. doi : 10.1128/MCB.17.8.4870. PMC  232339. PMID  9234743.
• Wang Z, Day N, Trifillis P, Kiledjian M (1999). «Комплекс стабильности мРНК функционирует с поли(А)-связывающим белком для стабилизации мРНК in vitro». Mol. Cell. Biol . 19 (7): 4552–60. doi :10.1128/MCB.19.7.4552. PMC  84253. PMID  10373504 .
• Макеев АВ, Чхеидзе АН, Либхабер СА (1999). «Набор высококонсервативных РНК-связывающих белков, alphaCP-1 и alphaCP-2, участвующих в стабилизации мРНК, коэкспрессируется из гена без интрона и его паралога, содержащего интрон». J. Biol. Chem . 274 (35): 24849–57. doi : 10.1074/jbc.274.35.24849 . PMID  10455157.
• Макеев АВ, Либхабер СА (2000). «Идентификация двух новых генов млекопитающих устанавливает подсемейство белков, связывающих РНК с доменом KH». Геномика . 67 (3): 301–16. doi :10.1006/geno.2000.6244. PMID  10936052.
• Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I и др. (2001). «Панель взаимодействия белок-белок с использованием полноразмерных кДНК мыши». Genome Res . 11 (10): 1758–65. doi :10.1101/gr.180101. PMC  311163. PMID  11591653 .
• Andersen JS, Lyon CE, Fox AH и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Yeap BB, Voon DC, Vivian JP и др. (2002). «Новое связывание HuR и поли(C)-связывающего белка с консервативным мотивом, богатым UC, в пределах 3'-нетранслируемой области РНК-мессенджера андрогенового рецептора». J. Biol. Chem . 277 (30): 27183–92. doi : 10.1074/jbc.M202883200 . PMID  12011088.
• Walter BL, Parsley TB, Ehrenfeld E, Semler BL (2002). «Отдельные детерминанты домена KH поли(rC)-связывающего белка для инициации трансляции полиовируса и репликации вирусной РНК». J. Virol . 76 (23): 12008–22. doi :10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002. PMC  136902 . PMID  12414943.
• Giles KM, Daly JM, Beveridge DJ и др. (2003). «3'-нетранслируемая область мРНК p21WAF1 представляет собой составную цис-действующую последовательность, связанную РНК-связывающими белками из клеток рака молочной железы, включая HuR и поли(C)-связывающий белок». J. Biol. Chem . 278 (5): 2937–46. doi : 10.1074/jbc.M208439200 . PMID  12431987.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Pickering BM, Mitchell SA, Evans JR, Willis AE (2003). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, и белок, связывающий поли r(C) 1, взаимодействуют с BAG-1 IRES и стимулируют его активность in vitro и in vivo». Nucleic Acids Res . 31 (2): 639–46. doi : 10.1093/nar/gkg146. PMC  140511. PMID  12527772.
• Pillai MR, Chacko P, Kesari LA и др. (2003). «Экспрессия рецепторов фолиевой кислоты и гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина E1 у женщин с опосредованной вирусом папилломы человека трансформацией ткани шейки матки в рак». J. Clin. Pathol . 56 (8): 569–74. doi :10.1136/jcp.56.8.569. PMC  1770025. PMID  12890803 .
• Adams DJ, Beveridge DJ, van der Weyden L, et al. (2004). "HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина". J. Biol. Chem . 278 (45): 44894–903. doi : 10.1074/jbc.M307782200 . PMID  12933794.
• Evans JR, Mitchell SA, Spriggs KA и др. (2003). «Члены семейства поли (rC)-связывающих белков стимулируют активность внутреннего сегмента входа рибосомы c-myc in vitro и in vivo». Oncogene . 22 (39): 8012–20. doi :10.1038/sj.onc.1206645. PMID  12970749. S2CID  24731120.
• Чхеидзе АН, Либхабер СА (2003). «Новый набор сигналов ядерной локализации определяет распределение РНК-связывающих белков альфаСР». Mol. Cell. Biol . 23 (23): 8405–15. doi :10.1128/MCB.23.23.8405-8415.2003. PMC  262676. PMID  14612387 .