PROSITE — это база данных белков . [1] [2] Она состоит из записей, описывающих семейства белков , домены и функциональные сайты, а также аминокислотные паттерны и профили в них. Они вручную курируются командой Швейцарского института биоинформатики и тесно интегрированы в аннотацию белков Swiss-Prot . PROSITE была создана в 1988 году Амосом Байрохом , который руководил группой более 20 лет. С июля 2018 года директором PROSITE и Swiss-Prot является Алан Бридж.
Использование PROSITE включает в себя определение возможных функций недавно открытых белков и анализ известных белков на предмет ранее неопределенной активности. Свойства хорошо изученных генов могут быть распространены на биологически родственные организмы, а для различных или плохо известных генов биохимические функции могут быть предсказаны на основе сходства. PROSITE предлагает инструменты для анализа последовательности белка и обнаружения мотива (см. мотив последовательности , шаблоны PROSITE ). Он является частью серверов анализа протеомики ExPASy .
База данных ProRule основана на описаниях доменов PROSITE. [3] Она предоставляет дополнительную информацию о функционально или структурно важных аминокислотах. Правила содержат информацию о биологически значимых остатках, таких как активные сайты, сайты связывания субстрата или кофактора , сайты посттрансляционной модификации или дисульфидные связи, чтобы помочь определить функцию. Они могут автоматически генерировать аннотации на основе мотивов PROSITE.
По состоянию на 26 февраля 2022 года [обновлять]версия 2022_01 содержит 1902 записи документации, 1311 шаблонов, 1336 профилей и 1352 ProRules.