Paraburkholderia fungorum (P. fungorum) — это грамотрицательный вид бактерий . [2] который широко используется как полезный микроорганизм в сельском хозяйстве в качестве агента для биоконтроля и биоремедиации. Paraburkholderia fungorum — некоторые из его штаммов могут использовать уран для своего роста и преобразовывать U(VI) в U(IV). [3]
Методология
Геном панголина P. fungorum (панголина Pf) имеет геномный размер приблизительно 7,7 Мб/с с N50 69 666 б/с. Было показано, что панголин Pf является доказательством Paraburkholderia fungorum из основного генома. Филогенетический анализ на основе SNP и анализ ANI, поддерживаемый через функциональный анализ, показали, что наличие значительного количества генов, связанных с реакцией на стресс, вирулентностью, болезнями и защитой. В геноме панголина Pf были идентифицированы различные типы систем секреции, которые являются высокоспециализированными и отвечают за реакцию бактерии на окружающую среду и за физиологические процессы, такие как выживание, адгезия и адаптация.
Панголин Pf также разделяет некоторые общие гены вирулентности с известным патогенным членом Burkholderiales. Эти гены играют важную роль в адгезии, подвижности и инвазии. Добавление этой последовательности генома также важно для будущего сравнительного анализа и функциональной работы P. fungorum.[1]