Исследовательский проект по синтезу генома человека
С тех пор как в рамках проекта «Геном человека» с 1987 по 2004 год был впервые секвенирован геном человека , что обошлось в 3 миллиарда долларов США, расходы резко упали, превзойдя даже закон Мура , и в 2015 году составили ≈1000 долларов США. Более широкое распространение секвенирования генома привело к получению большего количества данных о вариантах с неопределенной значимостью.
Genome Project - Write (также известный как GP-Write ) — это крупномасштабный совместный исследовательский проект (расширение Genome Projects , нацеленного на чтение геномов с 1984 года), который фокусируется на разработке технологий синтеза и тестирования геномов многих различных видов микробов, растений и животных, включая геном человека в подпроекте, известном как Human Genome Project-Write ( HGP-Write ). [1] [2] [3] [4] [5] [6] Официально анонсированный 2 июня 2016 года, проект использует два десятилетия работы в области синтетической биологии и искусственного синтеза генов .
Недавно созданный проект GP-Write будет управляться Центром передового опыта в области инженерной биологии, [7] американской некоммерческой организацией. Исследователи ожидают, что способность искусственно синтезировать большие части многих геномов приведет ко многим научным и медицинским достижениям. [1] [2] [3] [4] [5] [6]
Наука и развитие
В мае 2021 года GP-write и Twist Bioscience запустили новую платформу САПР для проектирования целых геномов. САПР GP-write автоматизирует рабочие процессы, чтобы обеспечить совместные усилия, критически важные для масштабирования от проектирования плазмид до мегабаз по всем геномам. [8]
Проекты микробного генома - Написать
Технологии создания и тестирования искусственных хромосом дрожжей (YAC), синтетических геномов дрожжей (Sc2.0) [9] и устойчивых к вирусам/фагам бактериальных геномов имеют промышленное, сельскохозяйственное и медицинское применение. [2]
Проект «Геном человека» — Написать
Полная гаплоидная копия генома человека состоит из не менее трех миллиардов пар нуклеотидов ДНК , которые были описаны в программе Human Genome Project - Read (завершено на 95% по состоянию на 2004 год). Среди многих целей GP-Write - создание клеточных линий, устойчивых ко всем вирусам, и линий сборки синтеза для тестирования вариантов неизвестного значения , которые возникают в ходе исследований и диагностического секвенирования геномов человека (которое экспоненциально улучшается по стоимости, качеству и интерпретации). [2]
^ ab Pollack, Andrew (2 июня 2016 г.). «Ученые анонсируют HGP-Write, проект по синтезу человеческого генома». The New York Times . Получено 2 июня 2016 г.
^ abcd Boeke, JD, Черч Г, Хессель А, Келли Нью-Джерси, Аркин А, Кай Ю, Карлсон Р, Чакраварти А, Корниш В.В., Холт Л., Исаакс Ф.Дж., Куикен Т., Ладжуа М., Лессор Т., Луншоф Дж., Маурано М.Т. , Митчелл Л.А., Райн Дж., Россер С., Санджана Н.Е., Сильвер П.А., Валле Д., Ван Х., Уэй Дж.К., Ян Л.; и др. (2 июня 2016 г.). «Проект Геном – Напиши». Наука . 353 (6295): 126–127. Бибкод : 2016Sci...353..126B. doi : 10.1126/science.aaf6850. PMID 27256881. S2CID 206649424. Получено 2 июня 2016 г.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ ab Callaway, Ewen (2 июня 2016 г.). «План синтеза человеческого генома вызывает смешанную реакцию». Scientific American . Получено 2 июня 2016 г. .
^ ab Regalado, Antonio (2 июня 2016 г.). «План по изготовлению генома поднимает вопросы о сконструированных людях». MIT Technology Review . Получено 2 июня 2016 г.
^ ab Akst, Jef (2 июня 2016 г.). ""Human Genome Project-Write" Unveiled". The Scientist . Получено 2 июня 2016 г.
^ ab Opal, Puneet; Kini, Ameet (3 июня 2016 г.). «О дивный новый мир синтетического человеческого генома». Time . Получено 12 июня 2016 г. .
^ "Центр передового опыта в области инженерной биологии" . Получено 2 марта 2017 г.
^ «Платформа САПР, разработанная GP-Write и Twist для запуска крупных геномных проектов». Новости генной инженерии и технологий . 12 мая 2021 г.
^ "Синтетические дрожжевые геномы (Sc2.0)" . Получено 2 марта 2017 г. .
Дальнейшее чтение
МакЭлхени, Виктор К. (2010). Рисование карты жизни: внутри проекта «Геном человека» . Базовые книги . ISBN 978-0-465-03260-0.361 страница. Рассматривает интеллектуальные истоки, историю и мотивы проекта по картированию генома человека; опирается на интервью с ключевыми фигурами.
Жозефина Лильерум, Эрик Галлберг, Энтони С. Форстер (2014). Синтетическая биология. Лабораторное руководство . Мировое научное издательство. ISBN 978-9814579544.{{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
В Wikibooks есть книга по теме: Гены, технологии и политика
Национальный институт исследований генома человека (NHGRI). NHGRI возглавил вклад Национальных институтов здравоохранения в Международный проект генома человека. Этот проект, главной целью которого было секвенирование трех миллиардов пар оснований, составляющих геном человека, был завершен на 95% в апреле 2004 года.
