Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Белок эксцизионной репарации УФ-излучения RAD23 гомолог А — это белок , который у людей кодируется геном RAD23A . [5]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является одним из двух человеческих гомологов Saccharomyces cerevisiae Rad23, белка, участвующего в репарации нуклеотидов (NER). Было показано, что этот белок взаимодействует с 3-метиладенин-ДНК-гликозилазой (MPG) и повышает ее активность, что предполагает его роль в распознавании повреждений ДНК при репарации оснований . Этот белок содержит N-концевой убиквитин-подобный домен, который, как сообщалось, взаимодействует с протеасомой 26S , а также с убиквитин-протеинлигазой E6AP , и, таким образом, предполагает, что этот белок может быть вовлечен в опосредованный убиквитином протеолитический путь в клетках. [6]
Взаимодействия
Было показано, что RAD23A взаимодействует с:
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000179262 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000003813 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ван дер Спек П.Дж., Смит Э.М., Беверлоо Х.Б., Сугасава К., Масутани С., Ханаока Ф., Хоймейкерс Дж.Х., Хагемейер А. (март 1995 г.). «Хромосомная локализация трех генов репарации: гена пигментной ксеродерма группы C и двух человеческих гомологов дрожжей RAD23». Геномика . 23 (3): 651–658. дои : 10.1006/geno.1994.1554. hdl : 1765/3069 . ПМИД 7851894.
- ^ "Ген Энтреза: RAD23A RAD23 гомолог A (S. cerevisiae)".
- ^ Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации ДНК дрожжей RAD23, HHR23A и HHR23B». Hum. Mol. Genet . 9 (12): 1795–803. doi : 10.1093/hmg/9.12.1795 . PMID 10915768.
- ^ Hiyama H, Yokoi M, Masutani C, Sugasawa K, Maekawa T, Tanaka K, Hoeijmakers JH, Hanaoka F (сентябрь 1999 г.). "Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитин-подобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a протеасомы 26 S". J. Biol. Chem . 274 (39): 28019–25. doi : 10.1074/jbc.274.39.28019 . hdl : 1765/9166 . PMID 10488153.
- ^ Mueller TD, Feigon J (сентябрь 2003 г.). «Структурные детерминанты связывания убиквитин-подобных доменов с протеасомой». EMBO J . 22 (18): 4634–45. doi :10.1093/emboj/cdg467. PMC 212733 . PMID 12970176.
- ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С. , Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте белково-белкового взаимодействия человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Дальнейшее чтение
- Eichbaum QG, Beatty DW, Parker MI (1994). «Идентификация сердечных аутоантигенов в библиотеках ДНК человеческого сердца с использованием сывороток острой ревматической лихорадки». J. Autoimmun . 7 (2): 243–261. doi :10.1006/jaut.1994.1019. PMID 8037842.
- Масутани С., Сугасава К., Янагисава Дж., Сонояма Т., Уи М., Эномото Т., Такио К., Танака К., ван дер Спек П.Дж., Бутсма Д. (1994). «Очистка и клонирование эксцизионно-восстановительного комплекса нуклеотидов, включающего белок C пигментной ксеродерма и человеческий гомолог дрожжей RAD23». ЭМБО Дж . 13 (8): 1831–43. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06452.x. ПМК 395023 . ПМИД 8168482.
- van der Spek PJ, Eker A, Rademakers S, Visser C, Sugasawa K, Masutani C, Hanaoka F, Bootsma D, Hoeijmakers JH (1996). "XPC и человеческие гомологи RAD23: внутриклеточная локализация и связь с другими комплексами эксцизионной репарации нуклеотидов". Nucleic Acids Res . 24 (13): 2551–2559. doi :10.1093/nar/24.13.2551. PMC 145966. PMID 8692695 .
- ван дер Спек П.Дж., Виссер К.Э., Ханаока Ф., Смит Б., Хагемейер А., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж.Х. (1996). «Клонирование, сравнительное картирование и экспрессия РНК мышиных гомологов гена эксцизионной репарации нуклеотидов Saccharomyces cerevisiae RAD23». Геномика . 31 (1): 20–27. дои : 10.1006/geno.1996.0004. hdl : 1765/3097 . ПМИД 8808275.
- Li L, Lu X, Peterson C, Legerski R (1997). "XPC взаимодействует как с HHR23B, так и с HHR23A in vivo". Mutat. Res . 383 (3): 197–203. doi :10.1016/s0921-8777(97)00002-5. PMID 9164480.
- Withers-Ward ES, Jowett JB, Stewart SA, Xie YM, Garfinkel A, Shibagaki Y, Chow SA, Shah N, Hanaoka F, Sawitz DG, Armstrong RW, Souza LM, Chen IS (1997). "Вирус иммунодефицита человека типа 1 Vpr взаимодействует с HHR23A, клеточным белком, участвующим в репарации ДНК путем эксцизии нуклеотидов". J. Virol . 71 (12): 9732–42. doi :10.1128/JVI.71.12.9732-9742.1997. PMC 230283 . PMID 9371639.
- Schauber C, Chen L, Tongaonkar P, Vega I, Lambertson D, Potts W, Madura K (1998). "Rad23 связывает восстановление ДНК с путем убиквитина/протеасомы". Nature . 391 (6668): 715–718. Bibcode :1998Natur.391..715S. doi :10.1038/35661. PMID 9490418. S2CID 4417020.
- Грагеров А, Кино Т, Ильина-Грагерова Г, Хроусос ГП, Павлакис ГН (1998). "HHR23A, человеческий гомолог белка репарации дрожжей RAD23, специфически взаимодействует с белком Vpr и предотвращает остановку клеточного цикла, но не транскрипционные эффекты Vpr". Вирусология . 245 (2): 323–330. doi : 10.1006/viro.1998.9138 . PMID 9636371.
- Dieckmann T, Withers-Ward ES, Jarosinski MA, Liu CF, Chen IS, Feigon J (1998). «Структура домена UBA белка репарации человеческой ДНК, который взаимодействует с Vpr ВИЧ-1». Nat. Struct. Biol . 5 (12): 1042–1047. doi :10.1038/4220. PMID 9846873. S2CID 30478711.
- Kumar S, Talis AL, Howley PM (1999). «Идентификация HHR23A как субстрата для убиквитинирования, опосредованного белком E6». J. Biol. Chem . 274 (26): 18785–18792. doi : 10.1074/jbc.274.26.18785 . PMID 10373495.
- Hiyama H, Yokoi M, Masutani C, Sugasawa K, Maekawa T, Tanaka K, Hoeijmakers JH, Hanaoka F (1999). "Взаимодействие hHR23 с S5a. Убиквитин-подобный домен hHR23 опосредует взаимодействие с субъединицей S5a протеасомы 26 S". J. Biol. Chem . 274 (39): 28019–28025. doi : 10.1074/jbc.274.39.28019 . hdl : 1765/9166 . PMID 10488153.
- Miao F, Bouziane M, Dammann R, Masutani C, Hanaoka F, Pfeifer G, O'Connor TR (2000). "3-Метиладенин-ДНК-гликозилаза (белок MPG) взаимодействует с белками RAD23 человека". J. Biol. Chem . 275 (37): 28433–28438. doi : 10.1074/jbc.M001064200 . PMID 10854423.
- Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (2000). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации ДНК дрожжей RAD23, HHR23A и HHR23B». Hum. Mol. Genet . 9 (12): 1795–1803. doi : 10.1093/hmg/9.12.1795 . PMID 10915768.
- Withers-Ward ES, Mueller TD, Chen IS, Feigon J (2001). «Биохимический и структурный анализ взаимодействия между доменом UBA(2) белка репарации ДНК HHR23A и Vpr ВИЧ-1». Биохимия . 39 (46): 14103–14112. doi :10.1021/bi0017071. PMID 11087358.
- Zhu Q, Wani G, Wani MA, Wani AA (2001). «Человеческий гомолог дрожжевого белка Rad23 A взаимодействует с p300/циклическим AMP-чувствительным элементом связывания (CREB)-связывающим белком для снижения транскрипционной активности p53». Cancer Res . 61 (1): 64–70. PMID 11196199.
- Mansky LM, Preveral S, Le Rouzic E, Bernard LC, Selig L, Depienne C, Benarous R, Benichou S (2001). «Взаимодействие вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpr с белком репарации ДНК HHR23A не коррелирует с множественными биологическими функциями Vpr». Вирусология . 282 (1): 176–185. doi : 10.1006/viro.2000.0791 . PMID 11259200.
- Гейнор Э.М., Чен И.С. (2001). «Анализ апоптоза, вызванного Vpr ВИЧ-1, и изучение возможной роли белка hHR23A». Exp. Cell Res . 267 (2): 243–257. doi :10.1006/excr.2001.5247. PMID 11426943.
- Chen L, Shinde U, Ortolan TG, Madura K (2002). «Убиквитин-ассоциированные (UBA) домены в Rad23 связывают убиквитин и способствуют ингибированию сборки мультиубиквитиновой цепи». EMBO Rep . 2 (10): 933–938. doi : 10.1093/embo-reports/kve203. PMC 1084081. PMID 11571271.
- Elder RT, Song XQ, Chen M, Hopkins KM, Lieberman HB, Zhao Y (2002). «Участие rhp23, гомолога Schizosaccharomyces pombe генов человеческой HHR23A и Saccharomyces cerevisiae RAD23 в контроле клеточного цикла и убиквитинировании белков». Nucleic Acids Res . 30 (2): 581–591. doi :10.1093/nar/30.2.581. PMC 99819. PMID 11788722 .
Внешние ссылки