stringtranslate.com

Численность населения

В популяционной генетике и популяционной экологии размер популяции (обычно обозначается N ) — это счетная величина, представляющая число отдельных организмов в популяции . Размер популяции напрямую связан с объемом генетического дрейфа и является основной причиной таких эффектов, как «бутылочное горлышко» популяции и эффект основателя . [1] Генетический дрейф — это основной источник снижения генетического разнообразия в популяциях, который приводит к фиксации и может потенциально привести к событиям видообразования . [1]

Генетический дрейф

Из пяти условий, необходимых для поддержания равновесия Харди-Вайнберга , бесконечный размер популяции всегда будет нарушен; это означает, что некоторая степень генетического дрейфа всегда имеет место. [1] Меньший размер популяции приводит к увеличению генетического дрейфа , была выдвинута гипотеза, что это дает этим группам эволюционное преимущество для приобретения сложности генома. [2] Альтернативная гипотеза утверждает, что хотя генетический дрейф играет большую роль в развитии сложности в небольших популяциях, отбор является механизмом, с помощью которого большие популяции развивают сложность. [3]

Узкие места в популяции и эффект основателя

Узкие места в популяции возникают, когда численность популяции сокращается на короткий период времени, что приводит к снижению генетического разнообразия в популяции.

Эффект основателя возникает, когда несколько особей из более крупной популяции создают новую популяцию, а также снижает генетическое разнообразие, и был первоначально описан Эрнстом Майром . [4] Эффект основателя является уникальным случаем генетического дрейфа, поскольку меньшая популяция-основатель имеет сниженное генетическое разнообразие, которое будет перемещать аллели внутри популяции быстрее в сторону фиксации .

Моделирование генетического дрейфа

Генетический дрейф обычно моделируется в лабораторных условиях с использованием бактериальных популяций или цифрового моделирования. В цифровых организмах сгенерированная популяция претерпевает эволюцию на основе различных параметров, включая дифференциальную приспособленность, изменчивость и наследственность, заданные для отдельных организмов. [3]

Розен и др. используют отдельные штаммы бактерий на двух разных средах: одна с простыми питательными компонентами, а другая с питательными веществами, которые, как отмечено, помогают популяциям бактерий развиваться более гетерогенно. [2] Также использовалось цифровое моделирование, основанное на бактериальном эксперименте, с различными назначениями приспособленности и эффективными размерами популяции, сопоставимыми с таковыми у бактерий, используемых на основе как малых, так и больших обозначений популяции. [2] Как в простых, так и в сложных средах меньшие популяции демонстрировали большую вариабельность популяции, чем большие популяции, которые не показали значительного разнообразия приспособленности. [2] Меньшие популяции имели повышенную приспособленность и адаптировались быстрее в сложной среде, в то время как большие популяции адаптировались быстрее, чем малые популяции в простой среде. [2] Эти данные показывают, что последствия повышенной изменчивости в малых популяциях зависят от среды: более сложные или сложные среды позволяют дисперсии, присутствующей в малых популяциях, давать большее преимущество. [2] Анализ показывает, что меньшие популяции имеют более значительные уровни приспособленности из-за гетерогенности внутри группы независимо от сложности среды; адаптивные реакции усиливаются в более сложных средах. [2] Адаптации в бесполых популяциях также не ограничиваются мутациями, поскольку генетическая изменчивость внутри этих популяций может управлять адаптацией. [5] Хотя небольшие популяции, как правило, сталкиваются с большими трудностями из-за ограниченного доступа к широко распространенным полезным мутациям, адаптация внутри этих популяций менее предсказуема и позволяет популяциям быть более пластичными в своих реакциях на окружающую среду. [2] Известно, что увеличение приспособленности с течением времени в небольших бесполых популяциях сильно положительно коррелирует с размером популяции и скоростью мутаций, а вероятность фиксации полезной мутации обратно пропорциональна размеру популяции и скорости мутаций. [6]

ЛаБар и Адами используют цифровые гаплоидные организмы для оценки различных стратегий накопления геномной сложности. Это исследование показало, что как дрейф, так и отбор эффективны в малых и больших популяциях соответственно, но этот успех зависит от нескольких факторов. [3] Данные наблюдения за мутациями вставки в этой цифровой системе показывают, что небольшие популяции развивают более крупные размеры генома за счет фиксации вредных мутаций, а большие популяции развивают более крупные размеры генома за счет фиксации полезных мутаций. [3]  Было отмечено, что небольшие популяции имеют преимущество в достижении полной геномной сложности из-за фенотипической сложности, обусловленной дрейфом. [3] При моделировании делеционных мутаций только самые большие популяции имели какое-либо значительное преимущество в приспособленности. [3] Эти моделирования показывают, что меньшие популяции исправляют вредные мутации за счет увеличения генетического дрейфа. [3] Это преимущество, вероятно, ограничено высокими темпами вымирания. [3] Более крупные популяции развивают сложность за счет мутаций, которые увеличивают экспрессию определенных генов; Удаление вредных аллелей не ограничивает разработку более сложных геномов в более крупных группах, и не требовалось большого количества мутаций-вставок, которые приводили к полезным или нефункциональным элементам в геноме. [3] Когда мутации-делеции происходят чаще, самые крупные популяции имеют преимущество, которое предполагает, что более крупные популяции, как правило, имеют эволюционное преимущество для развития новых признаков. [3]

Критическая скорость мутации

Критическая скорость мутаций, или порог ошибки , ограничивает количество мутаций, которые могут существовать в самовоспроизводящейся молекуле, прежде чем генетическая информация будет уничтожена в последующих поколениях. [7]

В отличие от результатов предыдущих исследований, [8] было отмечено, что критическая скорость мутаций зависит от размера популяции как в гаплоидных, так и в диплоидных популяциях. [9] Когда популяция насчитывает менее 100 особей, критическая скорость мутаций может быть превышена, но это приведет к потере генетического материала, что приведет к дальнейшему сокращению популяции и вероятности вымирания. [9] Этот «предел скорости» распространен в небольших, адаптированных бесполых популяциях и не зависит от скорости мутаций. [10]

Эффективная численность населения (Н е)

Эффективный размер популяции ( N e ) определяется как «количество размножающихся особей в идеализированной популяции , которая показала бы ту же величину дисперсии частот аллелей при случайном генетическом дрейфе или ту же величину инбридинга, что и рассматриваемая популяция». N e обычно меньше N (абсолютного размера популяции), и это имеет важные приложения в генетике сохранения . [11]

Перенаселение может означать любой случай, когда популяция любого вида животных может превысить пропускную способность его экологической ниши . [12]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Wright S (ноябрь 1929). «Эволюция доминирования». The American Naturalist . 63 (689): 556–561. doi :10.1086/280290. S2CID  85301374.
  2. ^ abcdefgh Rozen DE, Habets MG, Handel A, de Visser JA (март 2008 г.). "Гетерогенные адаптивные траектории малых популяций на сложных ландшафтах приспособленности". PLOS ONE . ​​3 (3): e1715. Bibcode :2008PLoSO...3.1715R. doi : 10.1371/journal.pone.0001715 . PMC 2248617 . PMID  18320036. 
  3. ^ abcdefghij LaBar T, Adami C (декабрь 2016 г.). «Различные эволюционные пути к сложности для малых и больших популяций цифровых организмов». PLOS Computational Biology . 12 (12): e1005066. arXiv : 1604.06299 . Bibcode : 2016PLSCB..12E5066L. doi : 10.1371/journal.pcbi.1005066 . PMC 5140054. PMID  27923053 . 
  4. ^ Provine WB (июль 2004 г.). «Эрнст Майр: Генетика и видообразование». Генетика . 167 (3): 1041–6. doi :10.1093/genetics/167.3.1041. PMC 1470966. PMID  15280221 . 
  5. ^ Lang GI, Botstein D, Desai MM (июль 2011 г.). «Генетическая изменчивость и судьба полезных мутаций в бесполых популяциях». Genetics . 188 (3): 647–61. doi :10.1534/genetics.111.128942. PMC 3176544 . PMID  21546542. 
  6. ^ Gerrish PJ, Lenski RE (1998). «Судьба конкурирующих полезных мутаций в бесполой популяции». Genetica . 102–103 (1–6): 127–44. doi :10.1023/a:1017067816551. PMID  9720276. S2CID  15148583.
  7. ^ Эйген М (октябрь 1971 г.). «Самоорганизация материи и эволюция биологических макромолекул». Die Naturwissenschaften . 58 (10): 465–523. Бибкод : 1971NW.....58..465E. дои : 10.1007/bf00623322. PMID  4942363. S2CID  38296619.
  8. ^ Gillespie JH (ноябрь 2001 г.). «Имеет ли размер популяции вида отношение к его эволюции?». Эволюция; Международный журнал органической эволюции . 55 (11): 2161–9. doi : 10.1111/j.0014-3820.2001.tb00732.x . JSTOR  2680348. PMID  11794777.
  9. ^ ab Aston E, Channon A, Day C, Knight CG (2013-12-27). "Критическая скорость мутаций имеет экспоненциальную зависимость от размера популяции в гаплоидных и диплоидных популяциях". PLOS ONE . ​​8 (12): e83438. Bibcode :2013PLoSO...883438A. doi : 10.1371/journal.pone.0083438 . PMC 3873944 . PMID  24386200. 
  10. ^ Arjan JA, Visser M, Zeyl CW, Gerrish PJ, Blanchard JL, Lenski RE (январь 1999). «Уменьшение отдачи от скорости предложения мутаций в бесполых популяциях». Science . 283 (5400): 404–6. Bibcode :1999Sci...283..404A. doi :10.1126/science.283.5400.404. JSTOR  2896813. PMID  9888858.
  11. ^ Husemann M, Zachos FE, Paxton RJ, Habel JC (октябрь 2016 г.). «Эффективный размер популяции в экологии и эволюции». Наследственность . 117 (4): 191–2. doi :10.1038/hdy.2016.75. PMC 5026761. PMID 27553454  . 
  12. ^ Бюро справочной информации по вопросам народонаселения PRB (декабрь 1988 г.). «Что такое перенаселение?». Population Education Interchange . 17 (4): 1–2. PMID  12281798.