stringtranslate.com

Раултелла плантикола

Raoultella planticola на агаре МакКонки , показывая положительный результат (микроорганизм обладает способностью расщеплять лактозу, что определяется по индикатору pH нейтральному красному). Техника штрихования осуществляется с использованием 13 штрихов.

Raoultella planticola — грамотрицательная [10] бактерия рода Raoultella . [5] [11] [12] [13] [14] [15] [16] R. planticola внешне очень похожа на Klebsiella pneumoniae и должна быть идентифицирована на основе особенностей роста или анализа ДНК. Было идентифицировано несколько штаммов. [17] [18]

Инфекция человека

Инфекции редки и в основном наблюдаются у пациентов с ослабленным иммунитетом . [19] [20] [21] Было установлено, что R. planticola осложнила по крайней мере один случай тяжелого панкреатита . [22]

Штаммы

Был обнаружен штамм Raoultella planticola, Cd-1, который растет анаэробно при высоких концентрациях водного кадмия и осаждает нерастворимый сульфид кадмия . Этот штамм был выделен из восстанавливающих отложений солончаков и может быть полезен при биоремедиации кадмия из открытых почв. [23]

Таксономическая реклассификация

Raoultella planticola ранее классифицировалась как часть рода Klebsiella . Она была переклассифицирована вместе с несколькими другими видами Klebsiella в 2001 году. [24]

Генетическая модификация

В конце 1980-х годов R. planticola была генетически модифицирована путем вставки плазмиды из Zymomonas mobilis . Эта плазмида кодирует фермент пируватдекарбоксилазу , которая вместе с алкогольдегидрогеназой , уже присутствующей в бактерии, позволяет ей производить этанол . Бактерия уже производит этанол при метаболизме гексоз и пентоз, но очень неэффективно. R. planticola была выбрана для получения этого гена, поскольку у нее уже были метаболические пути для расщепления пентозных сахаров, таких как ксилоза, которая является основным компонентом сельскохозяйственных и лесных отходов. [25] [26] Результаты показали, что генетически модифицированный штамм мог производить этанол, но погибал при концентрации этанола более 5%. Модифицированный штамм также производил больше этанола при более низком pH (5,4), и производство этанола снижалось по мере увеличения pH. [25]

В начале 1990-х годов биотехнологическая компания решила решить проблему: как безопасно уничтожить остатки урожая. Некоторые остатки урожая содержат патогены растений. Иногда для уничтожения остатков и патогенов используется сжигание, но это пожароопасно и может быть опасно для окружающей среды. Эта компания поняла, что, поскольку R. planticola является агрессивной и распространенной почвенной бактерией, ее можно генетически модифицировать для уничтожения остатков урожая и создания этанола .

Тестирование этого процесса изначально ограничивалось стерильной почвой. Исследования доктора философии, проведенные в Университете штата Орегон под руководством Элейн Ингхэм , получили образец генетически модифицированного организма для оценки экологических эффектов через Немецкий институт биотехнологий и, протестировав его в нестерильной (обычной) почве, обнаружили, что модифицированные бактерии вызвали небольшое количество алкоголя в почве. [27] [28] [29] Хотя этот уровень в несколько сотен раз ниже, чем требуется для воздействия на рост растений, этот факт в сочетании с тем фактом, что R. planticola уже обнаружена растущей в корневых системах всех видов растений повсюду, породили миф о конце света. [30] [28]

Ошибочность утверждений о ГМО

Доктор Ингхэм заявил новозеландской комиссии, что «вероятным результатом разрешения полевых испытаний [с генетически модифицированными бактериями, о которых идет речь] было бы уничтожение наземных растений». [30] [28] [31] Предположение Ингхэма о возможности «глобальной гибели растений» привлекло внимание научного сообщества. Однако они не смогли найти никаких доказательств того, что эти заявления были представлены для научной публикации в рецензируемом журнале, и не было обнаружено никаких доказательств того, что Агентство по охране окружающей среды США или Министерство сельского хозяйства США рассматривали или одобряли какие-либо испытания SDF20. [31] [32] Кроме того, было обнаружено, что SDF20 производит 20 микрограммов на миллилитр алкоголя в почве, что в несколько сотен раз меньше, чем требуется для воздействия на рост растений. [33] [32]

Элейн Ингхэм принесла публичные извинения за подачу ложных заявлений об экологическом влиянии ГМО. [34]

Партия зеленых Новой Зеландии принесла публичные извинения за вводящие в заблуждение заявления и признала, что цитируемое исследование никогда не было опубликовано. [35]

В эпизоде ​​« Пирамида на краю света » телесериала BBC « Доктор Кто » Доктор останавливает генетически модифицированный штамм R. planticola , который вызывает вымирание растений и животных по всему миру, аналогичное сценарию, о котором предполагают некоторые ученые.

Ссылки

  1. ^ Детали записи Namebank. Ubio.org (28.04.2003). Получено 21.10.2011.
  2. ^ Детали записи Namebank. Ubio.org (22.09.2005). Получено 21.10.2011.
  3. ^ Браузер таксономии (Raoultella planticola). Ncbi.nlm.nih.gov. Получено 21 октября 2011 г.
  4. ^ Klebsiella cf. planticola B43 - Энциклопедия жизни. EOL (28.09.2011). Получено 21.10.2011.
  5. ^ ab "Ежегодный контрольный список 2010 года :: Подробности видов". Каталог жизни . Получено 2012-05-07 .
  6. ^ Детали записи Namebank. Ubio.org (28.04.2003). Получено 21.10.2011.
  7. ^ Соглашение об использовании данных — Портал GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Получено 21.10.2011.
  8. ^ Соглашение об использовании данных — Портал GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Получено 21.10.2011.
  9. ^ Raoultella planticola. Thelabrat.com. Получено 21.10.2011.
  10. ^ Бэгли, Сьюзан Т.; Сейдлер, Рамон Дж.; Бреннер, Дон Дж. (март 1981 г.). «Klebsiella planticola sp. nov.: новый вид энтеробактерий, обнаруженный в основном в неклинических условиях». Current Microbiology . 6 (2): 105–109. doi :10.1007/BF01569013. S2CID  19935030.
  11. ^ Raoultella planticola. Zipcodezoo.com (2009-04-06). Получено 2011-10-21.
  12. ^ Соглашение об использовании данных — Портал GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Получено 21.10.2011.
  13. ^ Соглашение об использовании данных — Портал GBIF. Data.gbif.org (22.02.2007). Получено 21.10.2011.
  14. ^ Детали записи Namebank. Ubio.org (22.09.2005). Получено 21.10.2011.
  15. ^ NLBIF: Raoultella planticola (Bagley et al. 1982) Drancourt et al. 2001. Nlbif.nl. Проверено 21 октября 2011 г.
  16. ^ Raoultella planticola - Энциклопедия жизни. EOL. Получено 21.10.2011.
  17. ^ Raoultella planticola (Klebsiella planticola). Uniprot.org. Получено 21 октября 2011 г.
  18. ^ Raoultella planticola Taxon Passport Архивировано 22 июля 2011 г. на Wayback Machine . Информация о штамме. Получено 21 октября 2011 г.
  19. ^ Вестервельд, Д.; Хуссейн, Дж.; Альджаафарех, А.; Атая, А. (2017). «Редкий случай пневмонии Raoultella planticola: новый патоген». Отчеты о случаях респираторной медицины . 21 : 69–70. doi : 10.1016/j.rmcr.2017.03.018. PMC 5382143. PMID  28409111 . 
  20. ^ Хюинь, Джессика; Флит, Джейми; Пэн, Джонатан; Ла, Джули; Уайн, Ахрааз (6 сентября 2018 г.). «Клинический пример бактериемии Raoultella planticola». Официальный журнал Ассоциации медицинской микробиологии и инфекционных заболеваний Канады . 3 (3): 137–140. дои : 10.3138/jammi.2017-0005. ISSN  2371-0888.
  21. ^ Povlow, Michael R; Carrizosa, Jaime; Jones, Adriana (2017-07-24). "Raoultella Planticola: Бактериемия и сепсис у пациента с циррозом". Cureus . 9 (7): e1508. doi : 10.7759/cureus.1508 . ISSN  2168-8184. PMC 5608487 . PMID  28948128. 
  22. ^ Alves MS, Riley LW, Moreira BM (май 2007 г.). «Случай тяжелого панкреатита, осложненного инфекцией Raoultella planticola». J. Med. Microbiol . 56 (Pt 5): 696–8. doi : 10.1099/jmm.0.46889-0 . PMID  17446297.
  23. ^ Sharma, PK; Balkwill, DL; Frenkel, A.; Vairavamurthy, MA (1 июля 2000 г.). «Новый штамм Klebsiella planticola (Cd-1) растет анаэробно при высоких концентрациях кадмия и осаждает сульфид кадмия». Applied and Environmental Microbiology . 66 (7): 3083–3087. Bibcode :2000ApEnM..66.3083S. doi :10.1128/AEM.66.7.3083-3087.2000. PMC 92115 . PMID  10877810. 
  24. ^ Drancourt, M; Bollet, C; Carta, A; Rousselier, P (2001). «Филогенетический анализ видов Klebsiella очерчивает Klebsiella и raoultella gen. nov., с описанием Raoultella ornithinolytica comb. Nov., Raoultella terrigena comb. Nov. и Raoultella planticola comb. Nov». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Pt 3): 925–32. doi :10.1099/00207713-51-3-925. PMID  11411716.
  25. ^ ab Tolan, JS; Finn, RK (сентябрь 1987 г.). "Ферментация d-ксилозы в этанол генетически модифицированной Klebsiella planticola". Applied and Environmental Microbiology . 53 (9): 2039–44. Bibcode : 1987ApEnM..53.2039T. doi : 10.1128/AEM.53.9.2039-2044.1987. PMC 204054. PMID  16347427 . 
  26. ^ Фельдманн, Сигрун; Шпренгер, Георг А.; Зам, Герман (август 1989 г.). «Производство этанола из ксилозы с помощью мутанта пируват-формиат-лиазы Klebsiella planticola, несущего ген пируват-декарбоксилазы из Zymomonas mobilis». Прикладная микробиология и биотехнология . 31 (2): 152–157. doi :10.1007/BF00262454. S2CID  29865373.
  27. ^ Холмс, Майкл Т. (1995). Экологическая оценка после добавления генетически модифицированной Klebsiella planticola SDF20 в почву (Ph.D.). Университет штата Орегон. hdl :1957/34510.
  28. ^ abc Элейн Ингхэм (зима 1999). "Благие намерения и инженерные организмы, убивающие пшеницу". Синтез/Регенерация . № 18. Получено 24.11.2015 .
  29. ^ Холмс, MT; Ингхэм, ER ; Дойл, JD; Хендрикс, CW (1999-01-03). "Влияние Klebsiella planticola SDF20 на почвенную биоту и рост пшеницы в песчаной почве". Applied Soil Ecology . 11 (1): 67–78. Bibcode : 1999AppSE..11...67H. doi : 10.1016/S0929-1393(98)00129-2.
  30. ^ ab "Klebsiella planticola — генетически измененный монстр, который почти скрылся". Университет штата Сан-Франциско . Получено 24.11.2015 .
  31. ^ ab Fletcher, Liz (2001). «Новозеландский ГМО-провал подрывает зеленое лобби». Nature Biotechnology . 19 (4): 292. doi : 10.1038/86618 . PMID  11283556. S2CID  33027459.
  32. ^ ab "Evidence in Rebuttal - Life Sciences Network" . Получено 5 февраля 2021 г.
  33. ^ Портерфилд, Эндрю (2016-09-06). «Вы слышали о ГМО, которые почти уничтожили всю жизнь?». geneticliteracyproject.org . Genetic Literacy Project . Получено 6 сентября 2016 г. .
  34. ^ Флетчер, Лиз (2001). «Новозеландский ГМО-провал подрывает зеленое лобби». Nature Biotechnology . 19 (4). Nature: 292. doi : 10.1038/86618 . PMID  11283556. S2CID  33027459.
  35. ^ Aotearoa, Green Party of. «Поправка к доказательствам, представленным Королевской комиссии по расследованию генетической модификации». gene.ch. Получено 6 октября 2016 г.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки